Protein–RNA interactions for Protein: Q8CDD9

Lrif1, Ligand-dependent nuclear receptor-interacting factor 1, mousemouse

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Length 755 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lrif1Q8CDD9 Slc22a17-208ENSMUST00000228119 2348 ntAPPRIS P1 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Lrif1Q8CDD9 March9-201ENSMUST00000040307 3037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Lrif1Q8CDD9 Arglu1-201ENSMUST00000048545 3197 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Lrif1Q8CDD9 Ubl3-204ENSMUST00000201595 2064 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Lrif1Q8CDD9 Gas7-203ENSMUST00000108681 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Lrif1Q8CDD9 Stard10-203ENSMUST00000164479 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Lrif1Q8CDD9 Cops6-202ENSMUST00000110951 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Lrif1Q8CDD9 Adprhl2-201ENSMUST00000102617 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Lrif1Q8CDD9 Gm10499-202ENSMUST00000174778 1698 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Lrif1Q8CDD9 Hand2-201ENSMUST00000040104 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Lrif1Q8CDD9 Dbp-201ENSMUST00000080885 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Lrif1Q8CDD9 Rpsa-204ENSMUST00000217317 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Lrif1Q8CDD9 Bckdhb-206ENSMUST00000190637 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Lrif1Q8CDD9 Ccnl2-201ENSMUST00000030944 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Lrif1Q8CDD9 Ube2e2-205ENSMUST00000150727 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Lrif1Q8CDD9 Hmx3-201ENSMUST00000046093 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Lrif1Q8CDD9 Usp12-201ENSMUST00000085614 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Lrif1Q8CDD9 Foxe1-201ENSMUST00000095097 2804 ntAPPRIS P1 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Lrif1Q8CDD9 Tirap-207ENSMUST00000177129 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Lrif1Q8CDD9 Bcl7c-207ENSMUST00000207019 654 ntTSL 3 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Lrif1Q8CDD9 Zgpat-202ENSMUST00000108807 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Lrif1Q8CDD9 A530058N18Rik-203ENSMUST00000135729 1405 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Lrif1Q8CDD9 Capza2-201ENSMUST00000015877 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Lrif1Q8CDD9 Zxdc-201ENSMUST00000045740 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Lrif1Q8CDD9 Epb41l4b-201ENSMUST00000030142 3247 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Lrif1Q8CDD9 Mlycd-201ENSMUST00000098367 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Lrif1Q8CDD9 2410017I17Rik-201ENSMUST00000056774 1509 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
Lrif1Q8CDD9 Qk-202ENSMUST00000097414 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Lrif1Q8CDD9 Tmpo-203ENSMUST00000092219 1854 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Lrif1Q8CDD9 Psip1-203ENSMUST00000107215 1898 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Lrif1Q8CDD9 Cbln2-203ENSMUST00000122464 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Lrif1Q8CDD9 Dgat2-201ENSMUST00000033001 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Lrif1Q8CDD9 Zfyve21-201ENSMUST00000021714 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Lrif1Q8CDD9 Dnttip1-201ENSMUST00000017443 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Lrif1Q8CDD9 Rasgef1c-203ENSMUST00000093142 2216 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Lrif1Q8CDD9 Msi2-202ENSMUST00000107908 695 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Lrif1Q8CDD9 Bod1-202ENSMUST00000109415 799 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Lrif1Q8CDD9 Naa20-201ENSMUST00000002805 1172 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Lrif1Q8CDD9 Dnajb2-202ENSMUST00000082158 1253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Lrif1Q8CDD9 Spire2-201ENSMUST00000010298 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Lrif1Q8CDD9 2410022M11Rik-201ENSMUST00000186474 1911 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
Lrif1Q8CDD9 Particl-201ENSMUST00000205370 1560 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
Lrif1Q8CDD9 Zdhhc2-202ENSMUST00000128166 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Lrif1Q8CDD9 Gm20634-201ENSMUST00000090779 2956 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
Lrif1Q8CDD9 Susd6-203ENSMUST00000220238 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Lrif1Q8CDD9 Banp-202ENSMUST00000093078 2289 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Lrif1Q8CDD9 Gm6277-202ENSMUST00000224036 2779 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
Lrif1Q8CDD9 March2-206ENSMUST00000173329 2566 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Lrif1Q8CDD9 Lor-201ENSMUST00000058150 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Lrif1Q8CDD9 Pitx2-202ENSMUST00000042587 2271 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Lrif1Q8CDD9 4930542C12Rik-201ENSMUST00000171096 1203 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
Lrif1Q8CDD9 Stambp-207ENSMUST00000206592 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Lrif1Q8CDD9 Triobp-201ENSMUST00000109687 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Lrif1Q8CDD9 Gm31266-201ENSMUST00000192060 656 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Lrif1Q8CDD9 Gskip-202ENSMUST00000222284 1064 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Lrif1Q8CDD9 Tceal5-201ENSMUST00000066819 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Lrif1Q8CDD9 Dyrk1b-202ENSMUST00000172467 2523 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Lrif1Q8CDD9 Dyrk1b-201ENSMUST00000085901 2534 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Lrif1Q8CDD9 Pdss1-201ENSMUST00000053729 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Lrif1Q8CDD9 Tsc22d1-204ENSMUST00000110888 4999 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Lrif1Q8CDD9 Aebp2-203ENSMUST00000095350 2575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Lrif1Q8CDD9 Rfxap-201ENSMUST00000044373 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Lrif1Q8CDD9 Homer1-207ENSMUST00000109494 2468 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Lrif1Q8CDD9 Gm42809-201ENSMUST00000198429 1138 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
Lrif1Q8CDD9 Nkain2-201ENSMUST00000092602 558 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
Lrif1Q8CDD9 Slc15a4-201ENSMUST00000031367 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Lrif1Q8CDD9 Osbpl1a-209ENSMUST00000122175 1203 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Lrif1Q8CDD9 Mlx-201ENSMUST00000017945 1965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Lrif1Q8CDD9 Cnot6-201ENSMUST00000020624 2498 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Lrif1Q8CDD9 Amigo1-201ENSMUST00000050909 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Lrif1Q8CDD9 Flot2-201ENSMUST00000072289 2621 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Lrif1Q8CDD9 Ccdc50-202ENSMUST00000096127 1096 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Lrif1Q8CDD9 Abhd17c-201ENSMUST00000117085 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Lrif1Q8CDD9 Dedd-204ENSMUST00000111300 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Lrif1Q8CDD9 AC163623.1-201ENSMUST00000213738 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Lrif1Q8CDD9 Arf6-201ENSMUST00000050063 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Lrif1Q8CDD9 Ppp4c-211ENSMUST00000206570 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Lrif1Q8CDD9 Pdcd4-203ENSMUST00000165617 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Lrif1Q8CDD9 Cys1-203ENSMUST00000156453 1732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Lrif1Q8CDD9 Fip1l1-202ENSMUST00000113534 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Lrif1Q8CDD9 Gnpnat1-201ENSMUST00000046191 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Lrif1Q8CDD9 Porcn-201ENSMUST00000077595 1872 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Lrif1Q8CDD9 Porcn-204ENSMUST00000089403 1854 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Lrif1Q8CDD9 Phox2a-201ENSMUST00000008090 1609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Lrif1Q8CDD9 Gna13-202ENSMUST00000106702 914 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Lrif1Q8CDD9 Endog-201ENSMUST00000015481 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Lrif1Q8CDD9 Gpr137c-205ENSMUST00000227009 771 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Lrif1Q8CDD9 Zfp513-201ENSMUST00000031562 2213 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Lrif1Q8CDD9 Scn1b-201ENSMUST00000098548 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Lrif1Q8CDD9 Kcnj12-202ENSMUST00000089184 2291 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Lrif1Q8CDD9 Dmtn-209ENSMUST00000228295 2572 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
Lrif1Q8CDD9 P2rx2-205ENSMUST00000200037 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Lrif1Q8CDD9 Antxr1-204ENSMUST00000204805 2156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Lrif1Q8CDD9 Slc16a11-205ENSMUST00000126388 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Lrif1Q8CDD9 Inafm2-201ENSMUST00000149978 3053 ntAPPRIS P1 BASIC22.27■■□□□ 1.15
Lrif1Q8CDD9 Gm9887-201ENSMUST00000053451 624 ntAPPRIS P1 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Lrif1Q8CDD9 Bckdhb-201ENSMUST00000034801 1472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Lrif1Q8CDD9 Trim9-208ENSMUST00000221370 2393 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Lrif1Q8CDD9 Rbmxl2-201ENSMUST00000098135 1472 ntAPPRIS P1 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Lrif1Q8CDD9 2310061I04Rik-202ENSMUST00000146451 2081 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
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