Protein–RNA interactions for Protein: Q8CBF3

Ephb1, Ephrin type-B receptor 1, mousemouse

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Length 984 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ephb1Q8CBF3 D16Ertd472e-201ENSMUST00000114218 1271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
Ephb1Q8CBF3 Nkx2-4-201ENSMUST00000067020 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Ephb1Q8CBF3 Ski-201ENSMUST00000030917 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Ephb1Q8CBF3 Atp5j-201ENSMUST00000023608 809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Ephb1Q8CBF3 Pdcd4-203ENSMUST00000165617 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Ephb1Q8CBF3 Fam220a-201ENSMUST00000067145 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Ephb1Q8CBF3 Fam149b-203ENSMUST00000090499 2370 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Ephb1Q8CBF3 Gal3st1-202ENSMUST00000078757 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Ephb1Q8CBF3 Tmbim4-204ENSMUST00000134797 486 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Ephb1Q8CBF3 Izumo4-205ENSMUST00000218184 1196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
Ephb1Q8CBF3 Ctage5-218ENSMUST00000177162 2728 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.28
Ephb1Q8CBF3 Ubp1-204ENSMUST00000214095 2320 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
Ephb1Q8CBF3 Actr3b-202ENSMUST00000128727 2031 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
Ephb1Q8CBF3 Tgfbrap1-202ENSMUST00000186694 5385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
Ephb1Q8CBF3 Ccnyl1-203ENSMUST00000187170 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.28
Ephb1Q8CBF3 Gm40983-202ENSMUST00000222598 1198 ntTSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
Ephb1Q8CBF3 Usp48-205ENSMUST00000105840 5741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
Ephb1Q8CBF3 Arpc2-203ENSMUST00000113820 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Ephb1Q8CBF3 Chtf8-205ENSMUST00000176515 694 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
Ephb1Q8CBF3 Tmpo-203ENSMUST00000092219 1854 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Ephb1Q8CBF3 Cys1-207ENSMUST00000186602 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Ephb1Q8CBF3 Gipc1-201ENSMUST00000019577 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Ephb1Q8CBF3 Cnep1r1-201ENSMUST00000095214 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Ephb1Q8CBF3 Azin2-202ENSMUST00000106068 2049 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
Ephb1Q8CBF3 Gm13889-201ENSMUST00000099689 1386 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
Ephb1Q8CBF3 Mir3960-201ENSMUST00000198213 73 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
Ephb1Q8CBF3 Rp9-201ENSMUST00000034763 1134 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Ephb1Q8CBF3 Gm6311-201ENSMUST00000073790 878 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
Ephb1Q8CBF3 Kcnc3-202ENSMUST00000107907 5281 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
Ephb1Q8CBF3 Taf4-201ENSMUST00000041618 4416 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Ephb1Q8CBF3 Kcnc3-206ENSMUST00000208651 2728 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
Ephb1Q8CBF3 Dbp-204ENSMUST00000211513 1156 ntTSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
Ephb1Q8CBF3 Mrps15-201ENSMUST00000030675 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Ephb1Q8CBF3 A230020J21Rik-202ENSMUST00000192407 1649 ntTSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
Ephb1Q8CBF3 Ppp4r2-201ENSMUST00000063854 4874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Ephb1Q8CBF3 Cadm1-202ENSMUST00000085909 2126 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Ephb1Q8CBF3 Gm38287-201ENSMUST00000195193 2051 ntTSL 3 BASIC23.02■■□□□ 1.28
Ephb1Q8CBF3 Plpp2-204ENSMUST00000166804 1566 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Ephb1Q8CBF3 Nnat-208ENSMUST00000173595 927 ntTSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
Ephb1Q8CBF3 AC154454.1-201ENSMUST00000225253 216 ntBASIC23.02■■□□□ 1.28
Ephb1Q8CBF3 Bag2-201ENSMUST00000044691 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Ephb1Q8CBF3 Brwd1-203ENSMUST00000113827 2382 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Ephb1Q8CBF3 Gtpbp2-201ENSMUST00000024748 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Ephb1Q8CBF3 Hdac2-201ENSMUST00000019911 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Ephb1Q8CBF3 Rpl31-203ENSMUST00000179954 630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Ephb1Q8CBF3 D030046N08Rik-201ENSMUST00000162318 1570 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Ephb1Q8CBF3 Eml4-202ENSMUST00000096766 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Ephb1Q8CBF3 Slc1a5-201ENSMUST00000108496 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Ephb1Q8CBF3 Gm26533-201ENSMUST00000180550 1790 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Ephb1Q8CBF3 Ran-202ENSMUST00000111343 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Ephb1Q8CBF3 Lor-201ENSMUST00000058150 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Ephb1Q8CBF3 Sox1-201ENSMUST00000180353 4832 ntAPPRIS P1 BASIC22.99■■□□□ 1.27
Ephb1Q8CBF3 Mad2l2-202ENSMUST00000084129 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Ephb1Q8CBF3 Arhgap9-203ENSMUST00000219026 1946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Ephb1Q8CBF3 2810002D19Rik-201ENSMUST00000152313 2040 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Ephb1Q8CBF3 Efna2-201ENSMUST00000003154 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Ephb1Q8CBF3 Tbr1-202ENSMUST00000102737 1406 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
Ephb1Q8CBF3 Sh3gl3-201ENSMUST00000032874 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Ephb1Q8CBF3 Gm16764-201ENSMUST00000138891 541 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
Ephb1Q8CBF3 1110008P14Rik-201ENSMUST00000048792 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Ephb1Q8CBF3 Slc16a11-201ENSMUST00000094055 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Ephb1Q8CBF3 2610307P16Rik-205ENSMUST00000148885 1870 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Ephb1Q8CBF3 Il17rd-202ENSMUST00000223942 2186 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
Ephb1Q8CBF3 Mapkap1-202ENSMUST00000113124 1758 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
Ephb1Q8CBF3 Fam212b-202ENSMUST00000098273 1868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Ephb1Q8CBF3 Rab26-202ENSMUST00000061764 1291 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
Ephb1Q8CBF3 Pdgfb-201ENSMUST00000000500 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Ephb1Q8CBF3 Man1a-201ENSMUST00000003843 5137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Ephb1Q8CBF3 Gm4419-202ENSMUST00000226239 1431 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
Ephb1Q8CBF3 Phf2-201ENSMUST00000035540 5494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Ephb1Q8CBF3 St7-205ENSMUST00000081635 2115 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Ephb1Q8CBF3 Slc25a33-201ENSMUST00000105686 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Ephb1Q8CBF3 E130218I03Rik-204ENSMUST00000131447 888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
Ephb1Q8CBF3 Efhd2-201ENSMUST00000036854 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Ephb1Q8CBF3 St6galnac6-203ENSMUST00000095044 2394 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Ephb1Q8CBF3 Hoxd9-201ENSMUST00000059272 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Ephb1Q8CBF3 Efhd1os-201ENSMUST00000138844 332 ntTSL 3 BASIC22.94■■□□□ 1.26
Ephb1Q8CBF3 Znrf1-207ENSMUST00000173506 1238 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
Ephb1Q8CBF3 Gm45364-201ENSMUST00000210883 159 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
Ephb1Q8CBF3 Pkd1-207ENSMUST00000228550 1050 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
Ephb1Q8CBF3 Tfeb-202ENSMUST00000086932 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Ephb1Q8CBF3 Elf2-203ENSMUST00000108051 2514 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Ephb1Q8CBF3 Rundc3b-202ENSMUST00000115378 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
Ephb1Q8CBF3 Arhgef26-201ENSMUST00000079300 5638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Ephb1Q8CBF3 Nelfe-202ENSMUST00000165953 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Ephb1Q8CBF3 Ppp4c-201ENSMUST00000032936 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Ephb1Q8CBF3 Epop-201ENSMUST00000052281 2314 ntAPPRIS P1 BASIC22.92■■□□□ 1.26
Ephb1Q8CBF3 Sh3d21-202ENSMUST00000097891 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Ephb1Q8CBF3 Fam204a-201ENSMUST00000065286 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Ephb1Q8CBF3 Gm12818-201ENSMUST00000117562 1349 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
Ephb1Q8CBF3 Srarp-201ENSMUST00000094544 905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Ephb1Q8CBF3 Cln6-201ENSMUST00000034776 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Ephb1Q8CBF3 Sdccag3-202ENSMUST00000077983 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Ephb1Q8CBF3 Glrx3-201ENSMUST00000064404 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Ephb1Q8CBF3 Yy1-201ENSMUST00000021692 6178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Ephb1Q8CBF3 Csrp1-201ENSMUST00000027677 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
Ephb1Q8CBF3 Csrp1-202ENSMUST00000097561 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
Ephb1Q8CBF3 Gm9888-201ENSMUST00000150678 965 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Ephb1Q8CBF3 Smagp-202ENSMUST00000172334 952 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
Ephb1Q8CBF3 Ube2h-201ENSMUST00000094543 975 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.9 ms