Protein–RNA interactions for Protein: Q8C9S8

Atg4a, Cysteine protease ATG4A, mousemouse

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Length 396 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atg4aQ8C9S8 Trappc6b-203ENSMUST00000217863 797 ntTSL 2 BASIC27.93■■■□□ 2.06
Atg4aQ8C9S8 Gm9812-201ENSMUST00000061934 968 ntBASIC27.93■■■□□ 2.06
Atg4aQ8C9S8 Rnf39-201ENSMUST00000040498 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
Atg4aQ8C9S8 Asf1a-201ENSMUST00000020004 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
Atg4aQ8C9S8 Hgh1-201ENSMUST00000023213 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
Atg4aQ8C9S8 Aspscr1-203ENSMUST00000106158 1690 ntTSL 5 BASIC27.92■■■□□ 2.06
Atg4aQ8C9S8 Kctd6-201ENSMUST00000022272 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
Atg4aQ8C9S8 Srarp-201ENSMUST00000094544 905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
Atg4aQ8C9S8 Cd320-201ENSMUST00000002379 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
Atg4aQ8C9S8 Gm20208-202ENSMUST00000219905 1528 ntTSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
Atg4aQ8C9S8 Gm12818-201ENSMUST00000117562 1349 ntBASIC27.92■■■□□ 2.06
Atg4aQ8C9S8 Eid1-201ENSMUST00000164756 1691 ntAPPRIS P1 BASIC27.91■■■□□ 2.06
Atg4aQ8C9S8 Azin2-203ENSMUST00000119354 1921 ntTSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
Atg4aQ8C9S8 Kcnk2-205ENSMUST00000192723 1642 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
Atg4aQ8C9S8 Olfm2-203ENSMUST00000215999 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC27.91■■■□□ 2.06
Atg4aQ8C9S8 Nnat-208ENSMUST00000173595 927 ntTSL 2 BASIC27.9■■■□□ 2.06
Atg4aQ8C9S8 Gm42699-201ENSMUST00000198104 1657 ntBASIC27.9■■■□□ 2.06
Atg4aQ8C9S8 Tmbim4-204ENSMUST00000134797 486 ntTSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
Atg4aQ8C9S8 Tbr1-202ENSMUST00000102737 1406 ntTSL 2 BASIC27.89■■■□□ 2.06
Atg4aQ8C9S8 Ccsap-201ENSMUST00000034452 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
Atg4aQ8C9S8 Gm16764-201ENSMUST00000138891 541 ntTSL 5 BASIC27.88■■■□□ 2.05
Atg4aQ8C9S8 Pdcd4-201ENSMUST00000025931 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
Atg4aQ8C9S8 Ccdc142-201ENSMUST00000101254 2317 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.87■■■□□ 2.05
Atg4aQ8C9S8 Porcn-201ENSMUST00000077595 1872 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
Atg4aQ8C9S8 Porcn-204ENSMUST00000089403 1854 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
Atg4aQ8C9S8 Efhd2-201ENSMUST00000036854 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
Atg4aQ8C9S8 Gorasp2-205ENSMUST00000133432 1941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
Atg4aQ8C9S8 AC122317.2-201ENSMUST00000218708 1248 ntBASIC27.87■■■□□ 2.05
Atg4aQ8C9S8 4930597O21Rik-201ENSMUST00000065878 984 ntTSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
Atg4aQ8C9S8 Efna3-201ENSMUST00000029673 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
Atg4aQ8C9S8 Ube2g2-204ENSMUST00000174510 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
Atg4aQ8C9S8 Ddx43-201ENSMUST00000113367 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.87■■■□□ 2.05
Atg4aQ8C9S8 Ubp1-204ENSMUST00000214095 2320 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
Atg4aQ8C9S8 Tada2b-202ENSMUST00000119916 1321 ntTSL 5 BASIC27.86■■■□□ 2.05
Atg4aQ8C9S8 Olfm1-201ENSMUST00000028177 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
Atg4aQ8C9S8 2610307P16Rik-205ENSMUST00000148885 1870 ntTSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
Atg4aQ8C9S8 Gm5784-202ENSMUST00000220896 2016 ntTSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
Atg4aQ8C9S8 Gm9888-201ENSMUST00000150678 965 ntTSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
Atg4aQ8C9S8 Chtf8-205ENSMUST00000176515 694 ntTSL 2 BASIC27.84■■■□□ 2.05
Atg4aQ8C9S8 Ip6k1-208ENSMUST00000176854 2251 ntTSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
Atg4aQ8C9S8 Srcap-210ENSMUST00000188124 2048 ntTSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
Atg4aQ8C9S8 St6galnac6-203ENSMUST00000095044 2394 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
Atg4aQ8C9S8 D130020L05Rik-201ENSMUST00000180800 2431 ntTSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
Atg4aQ8C9S8 Prr3-201ENSMUST00000055454 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
Atg4aQ8C9S8 Mlycd-201ENSMUST00000098367 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
Atg4aQ8C9S8 Efhd1os-201ENSMUST00000138844 332 ntTSL 3 BASIC27.79■■■□□ 2.04
Atg4aQ8C9S8 Mppe1-201ENSMUST00000073054 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
Atg4aQ8C9S8 A830010M20Rik-207ENSMUST00000162298 1408 ntTSL 5 BASIC27.78■■■□□ 2.04
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Atg4aQ8C9S8 Scrt2-201ENSMUST00000064061 3395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.78■■■□□ 2.04
Atg4aQ8C9S8 Cbln2-203ENSMUST00000122464 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
Atg4aQ8C9S8 Rpl31-203ENSMUST00000179954 630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
Atg4aQ8C9S8 Mad2l2-202ENSMUST00000084129 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
Atg4aQ8C9S8 Gng3-201ENSMUST00000096259 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
Atg4aQ8C9S8 Kctd5-201ENSMUST00000017090 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
Atg4aQ8C9S8 Dbp-201ENSMUST00000080885 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.04
Atg4aQ8C9S8 Tmem260-210ENSMUST00000227440 2222 ntAPPRIS ALT2 BASIC27.76■■■□□ 2.04
Atg4aQ8C9S8 Hdac1-201ENSMUST00000102597 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
Atg4aQ8C9S8 Pkd1-207ENSMUST00000228550 1050 ntBASIC27.76■■■□□ 2.03
Atg4aQ8C9S8 Fance-203ENSMUST00000114803 1980 ntTSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
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Atg4aQ8C9S8 Fads2-201ENSMUST00000025567 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
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Atg4aQ8C9S8 AC153911.1-201ENSMUST00000220378 758 ntBASIC27.73■■■□□ 2.03
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Atg4aQ8C9S8 Scn1b-201ENSMUST00000098548 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
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Atg4aQ8C9S8 Ctage5-218ENSMUST00000177162 2728 ntTSL 5 BASIC27.72■■■□□ 2.03
Atg4aQ8C9S8 Micu2-201ENSMUST00000022543 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
Atg4aQ8C9S8 2510046G10Rik-202ENSMUST00000187458 1052 ntBASIC27.72■■■□□ 2.03
Atg4aQ8C9S8 Nelfe-202ENSMUST00000165953 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
Atg4aQ8C9S8 Ube2h-201ENSMUST00000094543 975 ntTSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
Atg4aQ8C9S8 Kcnj6-201ENSMUST00000095873 1773 ntTSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
Atg4aQ8C9S8 Vdac2-201ENSMUST00000022293 1954 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.03
Atg4aQ8C9S8 Ube2k-203ENSMUST00000201266 1449 ntTSL 5 BASIC27.7■■■□□ 2.03
Atg4aQ8C9S8 Slc30a3-201ENSMUST00000031037 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
Atg4aQ8C9S8 Nckap5los-201ENSMUST00000159738 1712 ntTSL 2 BASIC27.7■■■□□ 2.02
Atg4aQ8C9S8 Cdr2-201ENSMUST00000033169 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
Atg4aQ8C9S8 Gm20512-201ENSMUST00000172483 618 ntTSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
Atg4aQ8C9S8 Txnrd1-208ENSMUST00000219962 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
Atg4aQ8C9S8 Rarres1-201ENSMUST00000054825 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
Atg4aQ8C9S8 Tmem158-201ENSMUST00000068140 1712 ntAPPRIS P1 BASIC27.67■■■□□ 2.02
Atg4aQ8C9S8 Dcun1d5-201ENSMUST00000034499 1122 ntTSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
Atg4aQ8C9S8 Terc-201ENSMUST00000082862 423 ntBASIC27.67■■■□□ 2.02
Atg4aQ8C9S8 Gm16286-202ENSMUST00000125127 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
Atg4aQ8C9S8 Adgrb1-202ENSMUST00000170845 2704 ntTSL 5 BASIC27.67■■■□□ 2.02
Atg4aQ8C9S8 Hook1-202ENSMUST00000107083 1506 ntTSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
Atg4aQ8C9S8 Hoxb3-201ENSMUST00000055334 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
Atg4aQ8C9S8 Ltb4r1-201ENSMUST00000057569 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
Atg4aQ8C9S8 Trappc6b-201ENSMUST00000021380 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
Atg4aQ8C9S8 Irx1-201ENSMUST00000077337 2373 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
Atg4aQ8C9S8 Asf1a-205ENSMUST00000219282 1150 ntTSL 5 BASIC27.65■■■□□ 2.02
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