Protein–RNA interactions for Protein: Q8C7W7

Dclre1b, 5' exonuclease Apollo, mousemouse

Predictions only

Length 541 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Dclre1bQ8C7W7 Junos-204ENSMUST00000128094 830 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Dclre1bQ8C7W7 Notum-202ENSMUST00000106177 2212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
Dclre1bQ8C7W7 Fam3c-201ENSMUST00000081288 1487 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Dclre1bQ8C7W7 Kmt5a-201ENSMUST00000059580 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Dclre1bQ8C7W7 Mthfd2l-201ENSMUST00000071652 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
Dclre1bQ8C7W7 2310014F06Rik-201ENSMUST00000146145 1567 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Dclre1bQ8C7W7 Dlx2-201ENSMUST00000024159 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Dclre1bQ8C7W7 Arrdc2-201ENSMUST00000002989 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Dclre1bQ8C7W7 Usp48-205ENSMUST00000105840 5741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
Dclre1bQ8C7W7 Tada2b-202ENSMUST00000119916 1321 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
Dclre1bQ8C7W7 Kif1c-205ENSMUST00000152618 1943 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Dclre1bQ8C7W7 Carm1-201ENSMUST00000034703 3220 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
Dclre1bQ8C7W7 Nelfe-204ENSMUST00000173357 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
Dclre1bQ8C7W7 Scn1b-201ENSMUST00000098548 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
Dclre1bQ8C7W7 Mlx-201ENSMUST00000017945 1965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Dclre1bQ8C7W7 2410022M11Rik-201ENSMUST00000186474 1911 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
Dclre1bQ8C7W7 Gm5784-202ENSMUST00000220896 2016 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Dclre1bQ8C7W7 Sorcs2-202ENSMUST00000070720 2089 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Dclre1bQ8C7W7 Wnt5b-203ENSMUST00000119369 2339 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Dclre1bQ8C7W7 Gm527-201ENSMUST00000058135 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Dclre1bQ8C7W7 Syndig1l-204ENSMUST00000222422 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Dclre1bQ8C7W7 Sugct-202ENSMUST00000220514 1351 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Dclre1bQ8C7W7 Gm10499-202ENSMUST00000174778 1698 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Dclre1bQ8C7W7 Gorasp2-205ENSMUST00000133432 1941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Dclre1bQ8C7W7 Grap-201ENSMUST00000004959 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Dclre1bQ8C7W7 Zgpat-202ENSMUST00000108807 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Dclre1bQ8C7W7 Phactr2-202ENSMUST00000105543 2735 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Dclre1bQ8C7W7 Dedd-204ENSMUST00000111300 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Dclre1bQ8C7W7 Agps-202ENSMUST00000111952 2589 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Dclre1bQ8C7W7 Cntln-202ENSMUST00000102819 2239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Dclre1bQ8C7W7 Mtf2-202ENSMUST00000112626 1968 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Dclre1bQ8C7W7 Dbp-201ENSMUST00000080885 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Dclre1bQ8C7W7 Gsx1-201ENSMUST00000065382 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Dclre1bQ8C7W7 Slc44a1-203ENSMUST00000107646 1974 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Dclre1bQ8C7W7 Hspb1-202ENSMUST00000111155 930 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Dclre1bQ8C7W7 Guk1-204ENSMUST00000170202 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Dclre1bQ8C7W7 Dnajc21-201ENSMUST00000136591 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Dclre1bQ8C7W7 Gm37847-201ENSMUST00000192163 1497 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
Dclre1bQ8C7W7 Gm31748-201ENSMUST00000194938 1497 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
Dclre1bQ8C7W7 Particl-201ENSMUST00000205370 1560 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
Dclre1bQ8C7W7 Mlycd-201ENSMUST00000098367 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Dclre1bQ8C7W7 Dhrs13os-201ENSMUST00000150471 2429 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Dclre1bQ8C7W7 Dyrk1b-202ENSMUST00000172467 2523 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Dclre1bQ8C7W7 Dyrk1b-201ENSMUST00000085901 2534 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Dclre1bQ8C7W7 Apcdd1-201ENSMUST00000096554 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Dclre1bQ8C7W7 H2afy-201ENSMUST00000016081 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Dclre1bQ8C7W7 Kras-207ENSMUST00000203147 817 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
Dclre1bQ8C7W7 Spire2-201ENSMUST00000010298 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Dclre1bQ8C7W7 Hif1a-203ENSMUST00000110464 1759 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
Dclre1bQ8C7W7 Tmpo-203ENSMUST00000092219 1854 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
Dclre1bQ8C7W7 BC037034-205ENSMUST00000159649 2093 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
Dclre1bQ8C7W7 Fbxl14-201ENSMUST00000032094 2963 ntAPPRIS P1 BASIC22.83■■□□□ 1.24
Dclre1bQ8C7W7 Amigo1-203ENSMUST00000106659 1360 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Dclre1bQ8C7W7 Gm13042-201ENSMUST00000119244 1955 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
Dclre1bQ8C7W7 Bean1-205ENSMUST00000212979 2131 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Dclre1bQ8C7W7 Tcte3-201ENSMUST00000040746 788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Dclre1bQ8C7W7 Tcte3-202ENSMUST00000097398 632 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Dclre1bQ8C7W7 Dazap1-202ENSMUST00000105361 1537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Dclre1bQ8C7W7 Srcap-210ENSMUST00000188124 2048 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Dclre1bQ8C7W7 Pitx2-202ENSMUST00000042587 2271 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Dclre1bQ8C7W7 Ccnl2-201ENSMUST00000030944 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Dclre1bQ8C7W7 Lor-201ENSMUST00000058150 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Dclre1bQ8C7W7 Aebp2-203ENSMUST00000095350 2575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Dclre1bQ8C7W7 Ubl3-204ENSMUST00000201595 2064 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Dclre1bQ8C7W7 Rhbdl1-201ENSMUST00000026831 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Dclre1bQ8C7W7 Hmx3-201ENSMUST00000046093 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Dclre1bQ8C7W7 Banp-202ENSMUST00000093078 2289 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Dclre1bQ8C7W7 Nrarp-201ENSMUST00000104999 2582 ntAPPRIS P1 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Dclre1bQ8C7W7 Lmo4-201ENSMUST00000120539 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Dclre1bQ8C7W7 Uba52-205ENSMUST00000129909 705 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Dclre1bQ8C7W7 Susd6-203ENSMUST00000220238 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Dclre1bQ8C7W7 Phf2-201ENSMUST00000035540 5494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Dclre1bQ8C7W7 Ing2-201ENSMUST00000080353 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Dclre1bQ8C7W7 Gm43863-201ENSMUST00000203822 1192 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
Dclre1bQ8C7W7 Grb2-201ENSMUST00000021090 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Dclre1bQ8C7W7 Gm20634-201ENSMUST00000090779 2956 ntBASIC22.77■■□□□ 1.23
Dclre1bQ8C7W7 Trim9-208ENSMUST00000221370 2393 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Dclre1bQ8C7W7 Dgat2-201ENSMUST00000033001 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Dclre1bQ8C7W7 Psip1-203ENSMUST00000107215 1898 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Dclre1bQ8C7W7 Cbln2-203ENSMUST00000122464 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Dclre1bQ8C7W7 Vkorc1l1-201ENSMUST00000051758 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Dclre1bQ8C7W7 Foxe1-201ENSMUST00000095097 2804 ntAPPRIS P1 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Dclre1bQ8C7W7 Gm31266-201ENSMUST00000192060 656 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Dclre1bQ8C7W7 Abhd17c-201ENSMUST00000117085 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Dclre1bQ8C7W7 E330009J07Rik-201ENSMUST00000039008 1949 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Dclre1bQ8C7W7 Mgrn1-201ENSMUST00000023159 3293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Dclre1bQ8C7W7 Mgrn1-202ENSMUST00000070658 3290 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Dclre1bQ8C7W7 Dhrs13-201ENSMUST00000021187 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Dclre1bQ8C7W7 Hand2-201ENSMUST00000040104 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Dclre1bQ8C7W7 Rmnd5a-201ENSMUST00000002292 6165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Dclre1bQ8C7W7 Fip1l1-202ENSMUST00000113534 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Dclre1bQ8C7W7 Dnttip1-201ENSMUST00000017443 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Dclre1bQ8C7W7 Hey1-201ENSMUST00000042412 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Dclre1bQ8C7W7 Gm11529-201ENSMUST00000153012 639 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Dclre1bQ8C7W7 Cdv3-205ENSMUST00000189896 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Dclre1bQ8C7W7 Tirap-207ENSMUST00000177129 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Dclre1bQ8C7W7 Gas7-203ENSMUST00000108681 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Dclre1bQ8C7W7 Pdss1-201ENSMUST00000053729 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Dclre1bQ8C7W7 Actr5-201ENSMUST00000045644 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Dclre1bQ8C7W7 Phox2a-201ENSMUST00000008090 1609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.5 ms