Protein–RNA interactions for Protein: Q8C0R0

Usp37, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 37, mousemouse

Predictions only

Length 979 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp37Q8C0R0 Smagp-202ENSMUST00000172334 952 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
Usp37Q8C0R0 Fads2-201ENSMUST00000025567 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Usp37Q8C0R0 Fam181b-201ENSMUST00000051179 2003 ntAPPRIS P1 BASIC24.84■■□□□ 1.57
Usp37Q8C0R0 Mxra7-201ENSMUST00000021170 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Usp37Q8C0R0 Pom121-201ENSMUST00000111171 5580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Usp37Q8C0R0 Fam174a-201ENSMUST00000059975 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Usp37Q8C0R0 Tbc1d25-203ENSMUST00000143984 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
Usp37Q8C0R0 H2afy-202ENSMUST00000045788 1933 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Usp37Q8C0R0 Upf3a-201ENSMUST00000043767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Usp37Q8C0R0 Slc44a1-203ENSMUST00000107646 1974 ntTSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
Usp37Q8C0R0 Tead1-203ENSMUST00000084705 2543 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Usp37Q8C0R0 Fam212b-202ENSMUST00000098273 1868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.56
Usp37Q8C0R0 Npas1-201ENSMUST00000002053 2091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
Usp37Q8C0R0 Arhgdia-201ENSMUST00000067936 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Usp37Q8C0R0 2510039O18Rik-201ENSMUST00000103232 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Usp37Q8C0R0 Grasp-201ENSMUST00000000543 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Usp37Q8C0R0 Thap8-202ENSMUST00000108187 1184 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
Usp37Q8C0R0 Paqr6-203ENSMUST00000147948 837 ntTSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
Usp37Q8C0R0 Stbd1-202ENSMUST00000200941 523 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Usp37Q8C0R0 Fbl-201ENSMUST00000042405 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Usp37Q8C0R0 Cadps-203ENSMUST00000112658 5458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Usp37Q8C0R0 Spsb3-205ENSMUST00000120943 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Usp37Q8C0R0 Asf1a-205ENSMUST00000219282 1150 ntTSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
Usp37Q8C0R0 Azin2-203ENSMUST00000119354 1921 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Usp37Q8C0R0 Rasgef1c-203ENSMUST00000093142 2216 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Usp37Q8C0R0 Ndufs3-201ENSMUST00000005647 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Usp37Q8C0R0 Tmem192-202ENSMUST00000079896 916 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Usp37Q8C0R0 Rarres1-201ENSMUST00000054825 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Usp37Q8C0R0 Kcnk2-205ENSMUST00000192723 1642 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Usp37Q8C0R0 Vmac-201ENSMUST00000067931 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Usp37Q8C0R0 Gm15918-201ENSMUST00000137259 689 ntTSL 3 BASIC24.77■■□□□ 1.56
Usp37Q8C0R0 Terc-201ENSMUST00000082862 423 ntBASIC24.77■■□□□ 1.56
Usp37Q8C0R0 Ei24-201ENSMUST00000115086 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Usp37Q8C0R0 4930597O21Rik-201ENSMUST00000065878 984 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Usp37Q8C0R0 A830010M20Rik-207ENSMUST00000162298 1408 ntTSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
Usp37Q8C0R0 Gm38287-201ENSMUST00000195193 2051 ntTSL 3 BASIC24.75■■□□□ 1.55
Usp37Q8C0R0 2510046G10Rik-202ENSMUST00000187458 1052 ntBASIC24.75■■□□□ 1.55
Usp37Q8C0R0 Fam126a-206ENSMUST00000197617 2288 ntTSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
Usp37Q8C0R0 Tfeb-202ENSMUST00000086932 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Usp37Q8C0R0 Txndc9-207ENSMUST00000195032 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
Usp37Q8C0R0 Dnajc21-201ENSMUST00000136591 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
Usp37Q8C0R0 Dnajc19-202ENSMUST00000108195 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Usp37Q8C0R0 Hacd1-202ENSMUST00000091429 871 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Usp37Q8C0R0 Rnf39-201ENSMUST00000040498 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Usp37Q8C0R0 Egr4-201ENSMUST00000095759 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Usp37Q8C0R0 Asf1a-201ENSMUST00000020004 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Usp37Q8C0R0 Hook1-201ENSMUST00000030306 5517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Usp37Q8C0R0 Dcun1d5-201ENSMUST00000034499 1122 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Usp37Q8C0R0 St7-205ENSMUST00000081635 2115 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Usp37Q8C0R0 Scn1b-201ENSMUST00000098548 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Usp37Q8C0R0 Hook1-202ENSMUST00000107083 1506 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Usp37Q8C0R0 Maf-201ENSMUST00000069009 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Usp37Q8C0R0 Gm20208-202ENSMUST00000219905 1528 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Usp37Q8C0R0 Crlf2-201ENSMUST00000044579 1323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Usp37Q8C0R0 Sntb1-202ENSMUST00000110200 1225 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Usp37Q8C0R0 Heca-201ENSMUST00000037879 5098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Usp37Q8C0R0 Fam220a-201ENSMUST00000067145 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Usp37Q8C0R0 Ski-201ENSMUST00000030917 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Usp37Q8C0R0 Pura-201ENSMUST00000051301 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
Usp37Q8C0R0 Gas2l1-201ENSMUST00000037146 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
Usp37Q8C0R0 Ppp4r2-201ENSMUST00000063854 4874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Usp37Q8C0R0 Pdpk1-203ENSMUST00000115407 1730 ntTSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
Usp37Q8C0R0 Rpl38-203ENSMUST00000106599 457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Usp37Q8C0R0 Slc50a1-201ENSMUST00000029565 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Usp37Q8C0R0 Prr5-201ENSMUST00000065499 1830 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Usp37Q8C0R0 Fam220a-206ENSMUST00000196487 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Usp37Q8C0R0 Gm9806-201ENSMUST00000051080 552 ntBASIC24.69■■□□□ 1.54
Usp37Q8C0R0 Hecw2-202ENSMUST00000097741 1132 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Usp37Q8C0R0 Rbm45-201ENSMUST00000046389 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Usp37Q8C0R0 Ube2j2-202ENSMUST00000103175 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Usp37Q8C0R0 Kcnj6-201ENSMUST00000095873 1773 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Usp37Q8C0R0 Dleu2-204ENSMUST00000182286 666 ntTSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
Usp37Q8C0R0 Dleu2-213ENSMUST00000183245 637 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Usp37Q8C0R0 4930426D05Rik-204ENSMUST00000144487 1393 ntTSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
Usp37Q8C0R0 Hoxc8-201ENSMUST00000001703 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Usp37Q8C0R0 Scarna2-201ENSMUST00000157560 414 ntBASIC24.67■■□□□ 1.54
Usp37Q8C0R0 Gadd45a-201ENSMUST00000043098 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Usp37Q8C0R0 A530095I07Rik-201ENSMUST00000070942 847 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Usp37Q8C0R0 Gm9910-201ENSMUST00000195385 1550 ntBASIC24.67■■□□□ 1.54
Usp37Q8C0R0 Chrna5-204ENSMUST00000217408 2446 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Usp37Q8C0R0 Hoxb3-201ENSMUST00000055334 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Usp37Q8C0R0 P3h4-201ENSMUST00000066489 2178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Usp37Q8C0R0 A330041J22Rik-201ENSMUST00000150367 1825 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Usp37Q8C0R0 Lgi2-201ENSMUST00000039750 6456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Usp37Q8C0R0 Bin1-202ENSMUST00000091967 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
Usp37Q8C0R0 Ube2k-203ENSMUST00000201266 1449 ntTSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.54
Usp37Q8C0R0 Gm11687-201ENSMUST00000118911 886 ntBASIC24.64■■□□□ 1.54
Usp37Q8C0R0 Gpr25-201ENSMUST00000086395 1077 ntAPPRIS P1 BASIC24.64■■□□□ 1.54
Usp37Q8C0R0 Smox-201ENSMUST00000028806 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
Usp37Q8C0R0 Artn-201ENSMUST00000070816 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Usp37Q8C0R0 Prrx2-201ENSMUST00000041659 1441 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Usp37Q8C0R0 Arpc2-201ENSMUST00000006467 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Usp37Q8C0R0 Cic-202ENSMUST00000163320 6096 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Usp37Q8C0R0 Cic-201ENSMUST00000005578 6099 ntTSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
Usp37Q8C0R0 Eya2-202ENSMUST00000088132 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Usp37Q8C0R0 Gm16286-202ENSMUST00000125127 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Usp37Q8C0R0 Arpc5l-202ENSMUST00000112862 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Usp37Q8C0R0 Smarcc1-201ENSMUST00000088716 5717 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Usp37Q8C0R0 Gm11613-201ENSMUST00000134427 1971 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Usp37Q8C0R0 Card19-201ENSMUST00000048946 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 63.2 ms