Protein–RNA interactions for Protein: Q8BP86

Snapc4, snRNA-activating protein complex subunit 4, mousemouse

Predictions only

Length 1,333 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Snapc4Q8BP86 Pcf11-204ENSMUST00000208058 461 ntTSL 5 BASIC29.51■■■□□ 2.32
Snapc4Q8BP86 Mapkap1-202ENSMUST00000113124 1758 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC29.51■■■□□ 2.31
Snapc4Q8BP86 A830010M20Rik-207ENSMUST00000162298 1408 ntTSL 5 BASIC29.51■■■□□ 2.31
Snapc4Q8BP86 Gm44428-201ENSMUST00000204474 874 ntBASIC29.5■■■□□ 2.31
Snapc4Q8BP86 Nelfe-201ENSMUST00000097343 1607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.5■■■□□ 2.31
Snapc4Q8BP86 AC122379.1-201ENSMUST00000220658 355 ntTSL 3 BASIC29.49■■■□□ 2.31
Snapc4Q8BP86 Gm16599-201ENSMUST00000148082 1182 ntTSL 1 (best) BASIC29.48■■■□□ 2.31
Snapc4Q8BP86 Eif5a-213ENSMUST00000164359 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.48■■■□□ 2.31
Snapc4Q8BP86 Gm16286-202ENSMUST00000125127 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.48■■■□□ 2.31
Snapc4Q8BP86 Eid1-201ENSMUST00000164756 1691 ntAPPRIS P1 BASIC29.48■■■□□ 2.31
Snapc4Q8BP86 Fads2-201ENSMUST00000025567 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.48■■■□□ 2.31
Snapc4Q8BP86 Dnttip1-201ENSMUST00000017443 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.47■■■□□ 2.31
Snapc4Q8BP86 Gm20684-201ENSMUST00000176744 380 ntTSL 3 BASIC29.47■■■□□ 2.31
Snapc4Q8BP86 Mtch1-202ENSMUST00000118366 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.47■■■□□ 2.31
Snapc4Q8BP86 Cadm1-206ENSMUST00000143026 1643 ntTSL 5 BASIC29.46■■■□□ 2.31
Snapc4Q8BP86 Gm26533-201ENSMUST00000180550 1790 ntTSL 1 (best) BASIC29.46■■■□□ 2.31
Snapc4Q8BP86 Ankrd49-205ENSMUST00000216037 1037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.45■■■□□ 2.31
Snapc4Q8BP86 Lsm4-201ENSMUST00000034311 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.31
Snapc4Q8BP86 Cckbr-202ENSMUST00000181339 1326 ntTSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.31
Snapc4Q8BP86 Ppp1ca-201ENSMUST00000046094 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.31
Snapc4Q8BP86 Hoxb3-201ENSMUST00000055334 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.31
Snapc4Q8BP86 Ywhaz-204ENSMUST00000110362 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.3
Snapc4Q8BP86 Pdf-201ENSMUST00000055316 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.3
Snapc4Q8BP86 1700016K19Rik-201ENSMUST00000066408 921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.3
Snapc4Q8BP86 Noxo1-201ENSMUST00000019464 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.44■■■□□ 2.3
Snapc4Q8BP86 Ric1-206ENSMUST00000162184 2157 ntTSL 1 (best) BASIC29.44■■■□□ 2.3
Snapc4Q8BP86 Eif4ebp1-201ENSMUST00000033880 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.44■■■□□ 2.3
Snapc4Q8BP86 Jdp2-201ENSMUST00000050687 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.44■■■□□ 2.3
Snapc4Q8BP86 Tmeff1-201ENSMUST00000030032 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.44■■■□□ 2.3
Snapc4Q8BP86 Ythdf1-202ENSMUST00000108876 2272 ntTSL 1 (best) BASIC29.43■■■□□ 2.3
Snapc4Q8BP86 Hdac3-201ENSMUST00000043498 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.43■■■□□ 2.3
Snapc4Q8BP86 Gm9767-201ENSMUST00000041011 1193 ntAPPRIS P1 BASIC29.43■■■□□ 2.3
Snapc4Q8BP86 Mta3-201ENSMUST00000067826 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.42■■■□□ 2.3
Snapc4Q8BP86 Hrh3-205ENSMUST00000165762 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.42■■■□□ 2.3
Snapc4Q8BP86 Ccdc85c-201ENSMUST00000136175 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.42■■■□□ 2.3
Snapc4Q8BP86 March5-202ENSMUST00000112391 1293 ntTSL 1 (best) BASIC29.42■■■□□ 2.3
Snapc4Q8BP86 B4galt7-202ENSMUST00000100764 2195 ntTSL 1 (best) BASIC29.41■■■□□ 2.3
Snapc4Q8BP86 AC117245.1-201ENSMUST00000215481 566 ntTSL 3 BASIC29.41■■■□□ 2.3
Snapc4Q8BP86 Gm18755-201ENSMUST00000218030 1099 ntBASIC29.41■■■□□ 2.3
Snapc4Q8BP86 Ube2k-206ENSMUST00000201984 1449 ntTSL 3 BASIC29.4■■■□□ 2.3
Snapc4Q8BP86 Shf-203ENSMUST00000110531 1557 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC29.4■■■□□ 2.3
Snapc4Q8BP86 Tmpo-205ENSMUST00000105293 1842 ntTSL 1 (best) BASIC29.4■■■□□ 2.3
Snapc4Q8BP86 Slc37a3-211ENSMUST00000202749 434 ntTSL 5 BASIC29.39■■■□□ 2.3
Snapc4Q8BP86 Dynlt1f-201ENSMUST00000179554 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.38■■■□□ 2.29
Snapc4Q8BP86 Fn1-208ENSMUST00000186940 1350 ntTSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
Snapc4Q8BP86 Ipmk-203ENSMUST00000121446 1492 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.36■■■□□ 2.29
Snapc4Q8BP86 Phf23-201ENSMUST00000018716 2006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
Snapc4Q8BP86 Ost4-202ENSMUST00000132253 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
Snapc4Q8BP86 Pgp-201ENSMUST00000053024 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
Snapc4Q8BP86 Serp2-204ENSMUST00000228055 705 ntBASIC29.35■■■□□ 2.29
Snapc4Q8BP86 Ctxn1-201ENSMUST00000053252 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
Snapc4Q8BP86 Barx1-201ENSMUST00000021813 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
Snapc4Q8BP86 Ube2i-206ENSMUST00000172618 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
Snapc4Q8BP86 Fam168b-204ENSMUST00000170092 941 ntTSL 5 BASIC29.33■■■□□ 2.29
Snapc4Q8BP86 Smco4-203ENSMUST00000215907 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.33■■■□□ 2.29
Snapc4Q8BP86 Kcnip3-202ENSMUST00000088538 1296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.33■■■□□ 2.29
Snapc4Q8BP86 Snrpb-201ENSMUST00000103199 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.32■■■□□ 2.28
Snapc4Q8BP86 Dusp15-202ENSMUST00000109811 753 ntTSL 1 (best) BASIC29.32■■■□□ 2.28
Snapc4Q8BP86 Zfp346-203ENSMUST00000159278 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.32■■■□□ 2.28
Snapc4Q8BP86 Ech1-201ENSMUST00000066264 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.32■■■□□ 2.28
Snapc4Q8BP86 Eed-201ENSMUST00000107234 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
Snapc4Q8BP86 Dazap1-201ENSMUST00000092305 1994 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
Snapc4Q8BP86 Arhgap39-204ENSMUST00000176219 542 ntTSL 5 BASIC29.3■■■□□ 2.28
Snapc4Q8BP86 Sh3gl3-201ENSMUST00000032874 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
Snapc4Q8BP86 Socs1-201ENSMUST00000038099 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
Snapc4Q8BP86 Apcdd1-202ENSMUST00000163716 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
Snapc4Q8BP86 Gm17494-201ENSMUST00000072769 1800 ntTSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
Snapc4Q8BP86 Tlx2-201ENSMUST00000089641 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
Snapc4Q8BP86 Usp2-206ENSMUST00000176416 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
Snapc4Q8BP86 Ntn5-203ENSMUST00000183120 1491 ntTSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
Snapc4Q8BP86 Kctd6-201ENSMUST00000022272 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
Snapc4Q8BP86 Cyp2r1-202ENSMUST00000119712 917 ntTSL 5 BASIC29.27■■■□□ 2.28
Snapc4Q8BP86 H3f3a-207ENSMUST00000162814 724 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC29.27■■■□□ 2.28
Snapc4Q8BP86 Arl8a-201ENSMUST00000027684 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.27
Snapc4Q8BP86 Gm14121-201ENSMUST00000121441 1380 ntBASIC29.26■■■□□ 2.27
Snapc4Q8BP86 Esrra-201ENSMUST00000025906 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.27
Snapc4Q8BP86 AC153504.1-201ENSMUST00000218379 2290 ntBASIC29.25■■■□□ 2.27
Snapc4Q8BP86 C1qtnf5-203ENSMUST00000114818 1337 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.25■■■□□ 2.27
Snapc4Q8BP86 Ap1ar-210ENSMUST00000200409 2580 ntTSL 5 BASIC29.25■■■□□ 2.27
Snapc4Q8BP86 Mpnd-208ENSMUST00000159996 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.25■■■□□ 2.27
Snapc4Q8BP86 Raly-201ENSMUST00000029120 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.24■■■□□ 2.27
Snapc4Q8BP86 Clk2-201ENSMUST00000090927 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
Snapc4Q8BP86 Cnot6l-203ENSMUST00000122003 2089 ntTSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
Snapc4Q8BP86 Pate2-201ENSMUST00000098906 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.23■■■□□ 2.27
Snapc4Q8BP86 D730045B01Rik-202ENSMUST00000186838 1543 ntTSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
Snapc4Q8BP86 Galnt10-202ENSMUST00000108846 1745 ntTSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
Snapc4Q8BP86 Dleu2-201ENSMUST00000180377 1165 ntTSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
Snapc4Q8BP86 Copz2-201ENSMUST00000018816 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
Snapc4Q8BP86 Tmem55b-209ENSMUST00000162957 1465 ntTSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
Snapc4Q8BP86 Adprhl2-201ENSMUST00000102617 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
Snapc4Q8BP86 Fgf8-206ENSMUST00000111928 1056 ntTSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
Snapc4Q8BP86 Vegfb-201ENSMUST00000025914 1281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
Snapc4Q8BP86 4930527J03Rik-201ENSMUST00000094270 543 ntBASIC29.21■■■□□ 2.27
Snapc4Q8BP86 Eif5a-210ENSMUST00000108613 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
Snapc4Q8BP86 Rundc3b-202ENSMUST00000115378 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.2■■■□□ 2.26
Snapc4Q8BP86 Gm35161-201ENSMUST00000221765 941 ntTSL 5 BASIC29.2■■■□□ 2.26
Snapc4Q8BP86 Marveld2-202ENSMUST00000163163 2187 ntTSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
Snapc4Q8BP86 A230020J21Rik-202ENSMUST00000192407 1649 ntTSL 2 BASIC29.19■■■□□ 2.26
Snapc4Q8BP86 1700065D16Rik-202ENSMUST00000188975 506 ntTSL 3 BASIC29.19■■■□□ 2.26
Snapc4Q8BP86 Ndfip1-201ENSMUST00000025293 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 62.1 ms