Protein–RNA interactions for Protein: Q8BL06

Usp54, Inactive ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 54, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,588 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp54Q8BL06 Jmy-202ENSMUST00000220513 1843 ntTSL 1 (best) BASIC33.61■■■□□ 2.97
Usp54Q8BL06 Dhrs11-201ENSMUST00000047560 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.6■■■□□ 2.97
Usp54Q8BL06 Fam89b-203ENSMUST00000161368 1160 ntTSL 1 (best) BASIC33.6■■■□□ 2.97
Usp54Q8BL06 Cdc14b-207ENSMUST00000221634 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.59■■■□□ 2.97
Usp54Q8BL06 Lsm4-205ENSMUST00000210987 636 ntTSL 5 BASIC33.59■■■□□ 2.97
Usp54Q8BL06 Hras-202ENSMUST00000097957 1199 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.59■■■□□ 2.97
Usp54Q8BL06 Dexi-201ENSMUST00000038281 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.58■■■□□ 2.97
Usp54Q8BL06 Fam50b-202ENSMUST00000221037 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.58■■■□□ 2.97
Usp54Q8BL06 Snx21-203ENSMUST00000152471 1243 ntTSL 1 (best) BASIC33.58■■■□□ 2.97
Usp54Q8BL06 Gm44428-201ENSMUST00000204474 874 ntBASIC33.58■■■□□ 2.97
Usp54Q8BL06 Gm29735-201ENSMUST00000209599 660 ntAPPRIS P1 BASIC33.58■■■□□ 2.97
Usp54Q8BL06 H1fx-201ENSMUST00000056403 1217 ntAPPRIS P1 BASIC33.58■■■□□ 2.97
Usp54Q8BL06 Klhl35-201ENSMUST00000037359 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.58■■■□□ 2.97
Usp54Q8BL06 Ybx3-202ENSMUST00000087865 1684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.58■■■□□ 2.97
Usp54Q8BL06 Acvr2b-202ENSMUST00000165044 2093 ntTSL 2 BASIC33.58■■■□□ 2.97
Usp54Q8BL06 Becn1-216ENSMUST00000170502 725 ntTSL 1 (best) BASIC33.56■■■□□ 2.96
Usp54Q8BL06 Spryd7-202ENSMUST00000100496 1459 ntTSL 1 (best) BASIC33.56■■■□□ 2.96
Usp54Q8BL06 Gm20458-201ENSMUST00000164863 1369 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.55■■■□□ 2.96
Usp54Q8BL06 Acvr2b-201ENSMUST00000035093 1729 ntTSL 5 BASIC33.54■■■□□ 2.96
Usp54Q8BL06 AC161180.1-201ENSMUST00000223439 933 ntAPPRIS P1 BASIC33.54■■■□□ 2.96
Usp54Q8BL06 Cldnd1-201ENSMUST00000023426 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.54■■■□□ 2.96
Usp54Q8BL06 Gal3st1-202ENSMUST00000078757 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.54■■■□□ 2.96
Usp54Q8BL06 Cyp2r1-202ENSMUST00000119712 917 ntTSL 5 BASIC33.53■■■□□ 2.96
Usp54Q8BL06 Fam92a-202ENSMUST00000108285 1639 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC33.52■■■□□ 2.96
Usp54Q8BL06 Kctd2-201ENSMUST00000103035 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.52■■■□□ 2.96
Usp54Q8BL06 Gm5522-201ENSMUST00000189483 1242 ntBASIC33.52■■■□□ 2.96
Usp54Q8BL06 Gm21989-201ENSMUST00000174530 1609 ntTSL 1 (best) BASIC33.52■■■□□ 2.96
Usp54Q8BL06 Ipmk-203ENSMUST00000121446 1492 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.51■■■□□ 2.96
Usp54Q8BL06 Gm4419-202ENSMUST00000226239 1431 ntBASIC33.51■■■□□ 2.95
Usp54Q8BL06 Arl2bp-201ENSMUST00000034228 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.51■■■□□ 2.95
Usp54Q8BL06 Tmem42-201ENSMUST00000084733 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.5■■■□□ 2.95
Usp54Q8BL06 Gsk3a-202ENSMUST00000108411 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.5■■■□□ 2.95
Usp54Q8BL06 Bag1-203ENSMUST00000191273 1348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.5■■■□□ 2.95
Usp54Q8BL06 Ssx2ip-202ENSMUST00000106149 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.49■■■□□ 2.95
Usp54Q8BL06 Eif5a-208ENSMUST00000108611 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.49■■■□□ 2.95
Usp54Q8BL06 B3gat1-201ENSMUST00000115269 1665 ntTSL 1 (best) BASIC33.48■■■□□ 2.95
Usp54Q8BL06 H2afy-202ENSMUST00000045788 1933 ntTSL 1 (best) BASIC33.48■■■□□ 2.95
Usp54Q8BL06 Gipc1-201ENSMUST00000019577 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.48■■■□□ 2.95
Usp54Q8BL06 Dynll1-202ENSMUST00000112090 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.47■■■□□ 2.95
Usp54Q8BL06 Gm7544-201ENSMUST00000222426 828 ntAPPRIS P1 BASIC33.47■■■□□ 2.95
Usp54Q8BL06 AC166358.2-201ENSMUST00000223403 734 ntTSL 5 BASIC33.46■■■□□ 2.95
Usp54Q8BL06 Ssbp4-205ENSMUST00000210369 1828 ntTSL 2 BASIC33.45■■■□□ 2.95
Usp54Q8BL06 Gm15546-201ENSMUST00000122095 826 ntBASIC33.44■■■□□ 2.94
Usp54Q8BL06 Oaz2-206ENSMUST00000153700 1843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC33.44■■■□□ 2.94
Usp54Q8BL06 Ntn5-203ENSMUST00000183120 1491 ntTSL 1 (best) BASIC33.43■■■□□ 2.94
Usp54Q8BL06 Pdgfa-204ENSMUST00000110897 1287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.43■■■□□ 2.94
Usp54Q8BL06 Gm12905-201ENSMUST00000153814 658 ntTSL 2 BASIC33.43■■■□□ 2.94
Usp54Q8BL06 H2afj-202ENSMUST00000203982 577 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC33.43■■■□□ 2.94
Usp54Q8BL06 Hecw2-202ENSMUST00000097741 1132 ntTSL 1 (best) BASIC33.43■■■□□ 2.94
Usp54Q8BL06 Gm6217-201ENSMUST00000222182 829 ntAPPRIS P1 BASIC33.43■■■□□ 2.94
Usp54Q8BL06 Usf1-210ENSMUST00000167546 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.42■■■□□ 2.94
Usp54Q8BL06 Usp2-206ENSMUST00000176416 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.42■■■□□ 2.94
Usp54Q8BL06 Etfa-201ENSMUST00000034866 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.42■■■□□ 2.94
Usp54Q8BL06 Pdcd4-203ENSMUST00000165617 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.42■■■□□ 2.94
Usp54Q8BL06 Gm13238-201ENSMUST00000117655 780 ntBASIC33.41■■■□□ 2.94
Usp54Q8BL06 Hexdc-202ENSMUST00000106117 2149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.41■■■□□ 2.94
Usp54Q8BL06 Kdm2a-203ENSMUST00000116571 2413 ntTSL 1 (best) BASIC33.41■■■□□ 2.94
Usp54Q8BL06 Phf2os1-201ENSMUST00000123212 498 ntTSL 3 BASIC33.4■■■□□ 2.94
Usp54Q8BL06 AC102554.1-201ENSMUST00000216236 537 ntTSL 5 BASIC33.4■■■□□ 2.94
Usp54Q8BL06 Amer2-203ENSMUST00000225247 2662 ntBASIC33.4■■■□□ 2.94
Usp54Q8BL06 Gm43566-201ENSMUST00000196851 808 ntBASIC33.39■■■□□ 2.94
Usp54Q8BL06 Gm960-202ENSMUST00000177696 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC33.37■■■□□ 2.93
Usp54Q8BL06 Gm43592-201ENSMUST00000196922 1165 ntBASIC33.37■■■□□ 2.93
Usp54Q8BL06 Mypop-203ENSMUST00000131087 1951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.36■■■□□ 2.93
Usp54Q8BL06 Psip1-203ENSMUST00000107215 1898 ntTSL 1 (best) BASIC33.35■■■□□ 2.93
Usp54Q8BL06 Gng12-203ENSMUST00000114224 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC33.35■■■□□ 2.93
Usp54Q8BL06 Gng12-206ENSMUST00000114227 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.35■■■□□ 2.93
Usp54Q8BL06 Lsm4-201ENSMUST00000034311 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.35■■■□□ 2.93
Usp54Q8BL06 Hdgf-201ENSMUST00000005017 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.34■■■□□ 2.93
Usp54Q8BL06 Ak2-201ENSMUST00000030583 986 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC33.34■■■□□ 2.93
Usp54Q8BL06 Sin3b-202ENSMUST00000109950 1024 ntTSL 1 (best) BASIC33.33■■■□□ 2.93
Usp54Q8BL06 AC164424.2-201ENSMUST00000223281 725 ntTSL 3 BASIC33.33■■■□□ 2.93
Usp54Q8BL06 Vdac1-202ENSMUST00000102758 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.32■■■□□ 2.92
Usp54Q8BL06 Suv39h2-202ENSMUST00000060618 1831 ntTSL 1 (best) BASIC33.31■■■□□ 2.92
Usp54Q8BL06 Gm45444-201ENSMUST00000211394 898 ntBASIC33.3■■■□□ 2.92
Usp54Q8BL06 Jdp2-201ENSMUST00000050687 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.29■■■□□ 2.92
Usp54Q8BL06 Arhgap39-204ENSMUST00000176219 542 ntTSL 5 BASIC33.29■■■□□ 2.92
Usp54Q8BL06 Hist2h3c1-201ENSMUST00000176059 1820 ntAPPRIS P1 BASIC33.28■■■□□ 2.92
Usp54Q8BL06 Hist2h3c1-202ENSMUST00000177796 1825 ntBASIC33.28■■■□□ 2.92
Usp54Q8BL06 Tmx4-202ENSMUST00000110119 596 ntTSL 2 BASIC33.27■■■□□ 2.92
Usp54Q8BL06 Casd1-204ENSMUST00000181734 1063 ntTSL 5 BASIC33.27■■■□□ 2.92
Usp54Q8BL06 Thra-202ENSMUST00000103139 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.26■■■□□ 2.92
Usp54Q8BL06 Crls1-201ENSMUST00000028835 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.26■■■□□ 2.91
Usp54Q8BL06 Mpnd-208ENSMUST00000159996 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.25■■■□□ 2.91
Usp54Q8BL06 Rin3-207ENSMUST00000150795 937 ntTSL 1 (best) BASIC33.24■■■□□ 2.91
Usp54Q8BL06 Ube2k-206ENSMUST00000201984 1449 ntTSL 3 BASIC33.24■■■□□ 2.91
Usp54Q8BL06 Syce2-202ENSMUST00000136026 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.24■■■□□ 2.91
Usp54Q8BL06 Unc119-201ENSMUST00000002127 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.23■■■□□ 2.91
Usp54Q8BL06 Sarnp-203ENSMUST00000219512 953 ntTSL 3 BASIC33.23■■■□□ 2.91
Usp54Q8BL06 Tirap-205ENSMUST00000176685 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.22■■■□□ 2.91
Usp54Q8BL06 Tmem11-201ENSMUST00000062677 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.22■■■□□ 2.91
Usp54Q8BL06 Pcf11-204ENSMUST00000208058 461 ntTSL 5 BASIC33.21■■■□□ 2.91
Usp54Q8BL06 Dtnb-203ENSMUST00000164578 2355 ntTSL 1 (best) BASIC33.21■■■□□ 2.91
Usp54Q8BL06 Gm16599-201ENSMUST00000148082 1182 ntTSL 1 (best) BASIC33.21■■■□□ 2.91
Usp54Q8BL06 Kcnk2-205ENSMUST00000192723 1642 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC33.2■■■□□ 2.91
Usp54Q8BL06 Dusp2-201ENSMUST00000028846 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.2■■■□□ 2.91
Usp54Q8BL06 Scn1b-201ENSMUST00000098548 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.2■■■□□ 2.91
Usp54Q8BL06 Gm20208-202ENSMUST00000219905 1528 ntTSL 1 (best) BASIC33.2■■■□□ 2.9
Usp54Q8BL06 Gsc2-201ENSMUST00000012279 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.19■■■□□ 2.9
Usp54Q8BL06 Upp2-202ENSMUST00000071543 2150 ntTSL 1 (best) BASIC33.19■■■□□ 2.9
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 69.4 ms