Protein–RNA interactions for Protein: Q8BJX2

6820408C15Rik, RIKEN cDNA 6820408C15, mousemouse

Predictions only

Length 354 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
6820408C15RikQ8BJX2 E130304I02Rik-202ENSMUST00000187873 696 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
6820408C15RikQ8BJX2 Gas1-202ENSMUST00000223933 1155 ntAPPRIS P2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
6820408C15RikQ8BJX2 Nrsn1-201ENSMUST00000057866 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
6820408C15RikQ8BJX2 Adgrb1-203ENSMUST00000185682 2744 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
6820408C15RikQ8BJX2 Tspan33-202ENSMUST00000115250 1977 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
6820408C15RikQ8BJX2 Gm11175-201ENSMUST00000116172 543 ntBASIC24.74■■□□□ 1.55
6820408C15RikQ8BJX2 Dleu2-204ENSMUST00000182286 666 ntTSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
6820408C15RikQ8BJX2 Dleu2-213ENSMUST00000183245 637 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
6820408C15RikQ8BJX2 Gpr25-201ENSMUST00000086395 1077 ntAPPRIS P1 BASIC24.74■■□□□ 1.55
6820408C15RikQ8BJX2 4930426D05Rik-204ENSMUST00000144487 1393 ntTSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
6820408C15RikQ8BJX2 Gm9910-201ENSMUST00000195385 1550 ntBASIC24.74■■□□□ 1.55
6820408C15RikQ8BJX2 Ttc9-201ENSMUST00000036116 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
6820408C15RikQ8BJX2 Npas1-201ENSMUST00000002053 2091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
6820408C15RikQ8BJX2 Ica1-201ENSMUST00000038403 2075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
6820408C15RikQ8BJX2 E2f1-201ENSMUST00000000894 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
6820408C15RikQ8BJX2 Nhlrc1-201ENSMUST00000052747 2294 ntAPPRIS P1 BASIC24.73■■□□□ 1.55
6820408C15RikQ8BJX2 Prrx2-201ENSMUST00000041659 1441 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
6820408C15RikQ8BJX2 Mir6538-201ENSMUST00000183713 110 ntBASIC24.73■■□□□ 1.55
6820408C15RikQ8BJX2 Gm16437-201ENSMUST00000025669 507 ntBASIC24.73■■□□□ 1.55
6820408C15RikQ8BJX2 Slc44a1-203ENSMUST00000107646 1974 ntTSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
6820408C15RikQ8BJX2 Zdhhc2-205ENSMUST00000167766 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
6820408C15RikQ8BJX2 St6galnac6-204ENSMUST00000095045 2536 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
6820408C15RikQ8BJX2 Arpc2-201ENSMUST00000006467 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
6820408C15RikQ8BJX2 Gpr27-201ENSMUST00000101122 2388 ntAPPRIS P1 BASIC24.71■■□□□ 1.55
6820408C15RikQ8BJX2 Epop-201ENSMUST00000052281 2314 ntAPPRIS P1 BASIC24.71■■□□□ 1.55
6820408C15RikQ8BJX2 AC125444.1-201ENSMUST00000223536 639 ntAPPRIS P1 BASIC24.71■■□□□ 1.55
6820408C15RikQ8BJX2 Vmac-201ENSMUST00000067931 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
6820408C15RikQ8BJX2 Mxra7-201ENSMUST00000021170 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
6820408C15RikQ8BJX2 Psmg1-201ENSMUST00000023630 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
6820408C15RikQ8BJX2 Hs3st6-201ENSMUST00000044922 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
6820408C15RikQ8BJX2 Runx2os1-201ENSMUST00000097320 792 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
6820408C15RikQ8BJX2 Rasgef1c-203ENSMUST00000093142 2216 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
6820408C15RikQ8BJX2 Ube2j2-202ENSMUST00000103175 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
6820408C15RikQ8BJX2 Hecw2-202ENSMUST00000097741 1132 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
6820408C15RikQ8BJX2 Gm20208-202ENSMUST00000219905 1528 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
6820408C15RikQ8BJX2 Mlf2-202ENSMUST00000180095 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
6820408C15RikQ8BJX2 Asf1a-201ENSMUST00000020004 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
6820408C15RikQ8BJX2 Cadm1-210ENSMUST00000214542 899 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
6820408C15RikQ8BJX2 Hoxb3-201ENSMUST00000055334 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
6820408C15RikQ8BJX2 Ube2k-203ENSMUST00000201266 1449 ntTSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
6820408C15RikQ8BJX2 Ildr2-206ENSMUST00000194964 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
6820408C15RikQ8BJX2 Pdpk1-203ENSMUST00000115407 1730 ntTSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
6820408C15RikQ8BJX2 Fam181b-201ENSMUST00000051179 2003 ntAPPRIS P1 BASIC24.66■■□□□ 1.54
6820408C15RikQ8BJX2 Tbc1d25-203ENSMUST00000143984 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
6820408C15RikQ8BJX2 Vamp4-206ENSMUST00000150040 901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
6820408C15RikQ8BJX2 Id3-201ENSMUST00000008016 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
6820408C15RikQ8BJX2 Rnf19b-201ENSMUST00000030584 2414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
6820408C15RikQ8BJX2 Gm16286-202ENSMUST00000125127 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
6820408C15RikQ8BJX2 Rnf39-201ENSMUST00000040498 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
6820408C15RikQ8BJX2 Rbm45-201ENSMUST00000046389 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
6820408C15RikQ8BJX2 A030005K14Rik-201ENSMUST00000193762 1093 ntAPPRIS P1 BASIC24.64■■□□□ 1.54
6820408C15RikQ8BJX2 Hmox2-202ENSMUST00000118885 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
6820408C15RikQ8BJX2 Smurf1-203ENSMUST00000110677 5420 ntTSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.53
6820408C15RikQ8BJX2 Dnajc21-201ENSMUST00000136591 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
6820408C15RikQ8BJX2 Kcnj6-201ENSMUST00000095873 1773 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
6820408C15RikQ8BJX2 Wbp1-208ENSMUST00000151393 837 ntTSL 3 BASIC24.63■■□□□ 1.53
6820408C15RikQ8BJX2 Fam212b-202ENSMUST00000098273 1868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
6820408C15RikQ8BJX2 Inafm1-201ENSMUST00000169612 1605 ntAPPRIS P1 BASIC24.62■■□□□ 1.53
6820408C15RikQ8BJX2 Unc119-203ENSMUST00000108295 1371 ntTSL 3 BASIC24.62■■□□□ 1.53
6820408C15RikQ8BJX2 Spsb3-205ENSMUST00000120943 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
6820408C15RikQ8BJX2 AC153890.1-201ENSMUST00000220021 2469 ntBASIC24.62■■□□□ 1.53
6820408C15RikQ8BJX2 Gm21989-201ENSMUST00000174530 1609 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
6820408C15RikQ8BJX2 Qdpr-201ENSMUST00000015950 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
6820408C15RikQ8BJX2 Ppp1ca-201ENSMUST00000046094 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
6820408C15RikQ8BJX2 Ei24-201ENSMUST00000115086 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
6820408C15RikQ8BJX2 Fam174a-201ENSMUST00000059975 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
6820408C15RikQ8BJX2 Fam220a-201ENSMUST00000067145 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
6820408C15RikQ8BJX2 Gm16049-201ENSMUST00000155166 616 ntTSL 3 BASIC24.6■■□□□ 1.53
6820408C15RikQ8BJX2 Fam126a-206ENSMUST00000197617 2288 ntTSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
6820408C15RikQ8BJX2 Ethe1-201ENSMUST00000077191 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
6820408C15RikQ8BJX2 Eva1b-202ENSMUST00000106150 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
6820408C15RikQ8BJX2 Hist2h3c1-201ENSMUST00000176059 1820 ntAPPRIS P1 BASIC24.58■■□□□ 1.53
6820408C15RikQ8BJX2 Hist2h3c1-202ENSMUST00000177796 1825 ntBASIC24.58■■□□□ 1.53
6820408C15RikQ8BJX2 Clk2-202ENSMUST00000121212 2154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
6820408C15RikQ8BJX2 Tceal6-201ENSMUST00000033783 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
6820408C15RikQ8BJX2 Dctpp1-201ENSMUST00000035276 676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
6820408C15RikQ8BJX2 2510039O18Rik-201ENSMUST00000103232 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
6820408C15RikQ8BJX2 Tead1-203ENSMUST00000084705 2543 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
6820408C15RikQ8BJX2 Scn1b-201ENSMUST00000098548 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
6820408C15RikQ8BJX2 Psmb8-201ENSMUST00000025196 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
6820408C15RikQ8BJX2 Oaz2-206ENSMUST00000153700 1843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
6820408C15RikQ8BJX2 Cox11-201ENSMUST00000020851 1224 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
6820408C15RikQ8BJX2 Prr5-201ENSMUST00000065499 1830 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
6820408C15RikQ8BJX2 Gm38287-201ENSMUST00000195193 2051 ntTSL 3 BASIC24.54■■□□□ 1.52
6820408C15RikQ8BJX2 Cadm1-206ENSMUST00000143026 1643 ntTSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
6820408C15RikQ8BJX2 Tfeb-202ENSMUST00000086932 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
6820408C15RikQ8BJX2 Egr4-201ENSMUST00000095759 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
6820408C15RikQ8BJX2 Gpr12-201ENSMUST00000036211 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
6820408C15RikQ8BJX2 Nsmce4a-202ENSMUST00000160289 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
6820408C15RikQ8BJX2 Klhl15-203ENSMUST00000113911 1227 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
6820408C15RikQ8BJX2 Pdlim4-201ENSMUST00000018755 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
6820408C15RikQ8BJX2 Srsf2-206ENSMUST00000190993 1326 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
6820408C15RikQ8BJX2 St7-205ENSMUST00000081635 2115 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
6820408C15RikQ8BJX2 Slc16a11-207ENSMUST00000136328 1403 ntTSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
6820408C15RikQ8BJX2 Arhgdia-201ENSMUST00000067936 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
6820408C15RikQ8BJX2 Olfm2-203ENSMUST00000215999 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.51■■□□□ 1.51
6820408C15RikQ8BJX2 B230377A18Rik-202ENSMUST00000192921 1364 ntBASIC24.51■■□□□ 1.51
6820408C15RikQ8BJX2 A330041J22Rik-201ENSMUST00000150367 1825 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
6820408C15RikQ8BJX2 Gm28529-202ENSMUST00000189675 670 ntTSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
6820408C15RikQ8BJX2 Rnaseh2c-201ENSMUST00000025864 1126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 11.1 ms