Protein–RNA interactions for Protein: Q8BJ73

Rspo4, R-spondin-4, mousemouse

Predictions only

Length 228 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rspo4Q8BJ73 Cadm1-206ENSMUST00000143026 1643 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Rspo4Q8BJ73 Smox-205ENSMUST00000110182 985 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Rspo4Q8BJ73 Tmpo-205ENSMUST00000105293 1842 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Rspo4Q8BJ73 Rpl34-201ENSMUST00000062601 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Rspo4Q8BJ73 Ppp1ca-201ENSMUST00000046094 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Rspo4Q8BJ73 Bag2-201ENSMUST00000044691 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Rspo4Q8BJ73 Mapkap1-202ENSMUST00000113124 1758 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Rspo4Q8BJ73 Ppp1cb-206ENSMUST00000202078 383 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Rspo4Q8BJ73 Dhrs11-201ENSMUST00000047560 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Rspo4Q8BJ73 Foxe3-201ENSMUST00000050940 867 ntAPPRIS P1 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Rspo4Q8BJ73 Camk2n2-201ENSMUST00000052939 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Rspo4Q8BJ73 Eid1-201ENSMUST00000164756 1691 ntAPPRIS P1 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Rspo4Q8BJ73 Cckbr-202ENSMUST00000181339 1326 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Rspo4Q8BJ73 Dazap1-203ENSMUST00000105362 2081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Rspo4Q8BJ73 Shf-203ENSMUST00000110531 1557 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Rspo4Q8BJ73 March5-202ENSMUST00000112391 1293 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Rspo4Q8BJ73 Vax1-201ENSMUST00000172821 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Rspo4Q8BJ73 D17Wsu92e-201ENSMUST00000075076 1470 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Rspo4Q8BJ73 Pgls-205ENSMUST00000143441 1062 ntTSL 3 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Rspo4Q8BJ73 Ube2i-206ENSMUST00000172618 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Rspo4Q8BJ73 Adap1-201ENSMUST00000110865 2557 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Rspo4Q8BJ73 Tmem238-201ENSMUST00000168578 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Rspo4Q8BJ73 Pate2-201ENSMUST00000098906 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Rspo4Q8BJ73 Hdac3-201ENSMUST00000043498 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Rspo4Q8BJ73 Gm16286-202ENSMUST00000125127 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Rspo4Q8BJ73 March2-203ENSMUST00000172767 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Rspo4Q8BJ73 Mtch1-202ENSMUST00000118366 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Rspo4Q8BJ73 Apcdd1-202ENSMUST00000163716 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Rspo4Q8BJ73 Hagh-201ENSMUST00000024974 1101 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Rspo4Q8BJ73 Gm9959-201ENSMUST00000068277 390 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
Rspo4Q8BJ73 D730045B01Rik-202ENSMUST00000186838 1543 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Rspo4Q8BJ73 Zfp131-206ENSMUST00000223813 2561 ntAPPRIS P3 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Rspo4Q8BJ73 Gm26533-201ENSMUST00000180550 1790 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Rspo4Q8BJ73 Gm20684-201ENSMUST00000176744 380 ntTSL 3 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Rspo4Q8BJ73 Pcf11-204ENSMUST00000208058 461 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Rspo4Q8BJ73 E030037K01Rik-201ENSMUST00000180928 1756 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
Rspo4Q8BJ73 Hoxb3-201ENSMUST00000055334 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Rspo4Q8BJ73 Eif5a-213ENSMUST00000164359 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Rspo4Q8BJ73 Fam168b-204ENSMUST00000170092 941 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Rspo4Q8BJ73 Gm18755-201ENSMUST00000218030 1099 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
Rspo4Q8BJ73 Nenf-201ENSMUST00000046770 742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Rspo4Q8BJ73 Tmem150b-201ENSMUST00000086363 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Rspo4Q8BJ73 Gm17494-201ENSMUST00000072769 1800 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Rspo4Q8BJ73 Pkig-202ENSMUST00000099105 640 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Rspo4Q8BJ73 Gm14121-201ENSMUST00000121441 1380 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
Rspo4Q8BJ73 Galnt10-202ENSMUST00000108846 1745 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Rspo4Q8BJ73 Hrh3-205ENSMUST00000165762 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Rspo4Q8BJ73 Gm26536-201ENSMUST00000181072 1196 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Rspo4Q8BJ73 Polr1d-201ENSMUST00000050970 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Rspo4Q8BJ73 Cdc42ep5-201ENSMUST00000076831 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Rspo4Q8BJ73 Pfdn2-202ENSMUST00000135941 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Rspo4Q8BJ73 Fn1-208ENSMUST00000186940 1350 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Rspo4Q8BJ73 Dnttip1-201ENSMUST00000017443 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Rspo4Q8BJ73 Jdp2-201ENSMUST00000050687 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Rspo4Q8BJ73 Pth1r-202ENSMUST00000166716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Rspo4Q8BJ73 Gm9767-201ENSMUST00000041011 1193 ntAPPRIS P1 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Rspo4Q8BJ73 Mogs-201ENSMUST00000032114 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Rspo4Q8BJ73 Kctd6-201ENSMUST00000022272 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Rspo4Q8BJ73 Ube2k-206ENSMUST00000201984 1449 ntTSL 3 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Rspo4Q8BJ73 Raly-201ENSMUST00000029120 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Rspo4Q8BJ73 E130218I03Rik-208ENSMUST00000144222 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Rspo4Q8BJ73 Pdf-201ENSMUST00000055316 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Rspo4Q8BJ73 Ipmk-203ENSMUST00000121446 1492 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Rspo4Q8BJ73 Tmem150a-202ENSMUST00000132243 1478 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Rspo4Q8BJ73 Ntn5-203ENSMUST00000183120 1491 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Rspo4Q8BJ73 Zfp358-201ENSMUST00000061508 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Rspo4Q8BJ73 Cyp2r1-202ENSMUST00000119712 917 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Rspo4Q8BJ73 Gm16599-201ENSMUST00000148082 1182 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Rspo4Q8BJ73 Usp2-206ENSMUST00000176416 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Rspo4Q8BJ73 Vegfb-201ENSMUST00000025914 1281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Rspo4Q8BJ73 Sh3gl3-201ENSMUST00000032874 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Rspo4Q8BJ73 Barx1-201ENSMUST00000021813 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Rspo4Q8BJ73 Kcnip3-202ENSMUST00000088538 1296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Rspo4Q8BJ73 Mpnd-208ENSMUST00000159996 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Rspo4Q8BJ73 Upp2-202ENSMUST00000071543 2150 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Rspo4Q8BJ73 Eed-201ENSMUST00000107234 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Rspo4Q8BJ73 Phf23-201ENSMUST00000018716 2006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Rspo4Q8BJ73 Clk2-201ENSMUST00000090927 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Rspo4Q8BJ73 Lrfn1-203ENSMUST00000189877 1852 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Rspo4Q8BJ73 Ndfip1-201ENSMUST00000025293 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Rspo4Q8BJ73 1700016K19Rik-201ENSMUST00000066408 921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Rspo4Q8BJ73 Mir155hg-202ENSMUST00000185662 1362 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Rspo4Q8BJ73 Arl8a-201ENSMUST00000027684 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Rspo4Q8BJ73 Tmem120b-202ENSMUST00000111619 1256 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Rspo4Q8BJ73 Pfdn4-204ENSMUST00000109148 736 ntTSL 3 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Rspo4Q8BJ73 Zfp346-203ENSMUST00000159278 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Rspo4Q8BJ73 A230020J21Rik-202ENSMUST00000192407 1649 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Rspo4Q8BJ73 Dazap1-201ENSMUST00000092305 1994 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Rspo4Q8BJ73 Micu3-201ENSMUST00000068999 2219 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Rspo4Q8BJ73 Zxda-201ENSMUST00000117281 2621 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
Rspo4Q8BJ73 Adprhl2-201ENSMUST00000102617 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Rspo4Q8BJ73 Pi16-201ENSMUST00000114699 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Rspo4Q8BJ73 AC117245.1-201ENSMUST00000215481 566 ntTSL 3 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Rspo4Q8BJ73 Hecw2-202ENSMUST00000097741 1132 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Rspo4Q8BJ73 Rundc3b-202ENSMUST00000115378 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Rspo4Q8BJ73 Gm6206-201ENSMUST00000133472 2199 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
Rspo4Q8BJ73 Ccdc85c-201ENSMUST00000136175 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Rspo4Q8BJ73 Arhgap39-204ENSMUST00000176219 542 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Rspo4Q8BJ73 AC122379.1-201ENSMUST00000220658 355 ntTSL 3 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Rspo4Q8BJ73 Usf1-210ENSMUST00000167546 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 63.8 ms