Protein–RNA interactions for Protein: Q8BG26

Rusc1, RUN and SH3 domain-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 893 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rusc1Q8BG26 Vegfa-211ENSMUST00000167860 975 ntTSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
Rusc1Q8BG26 Vegfa-212ENSMUST00000214739 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
Rusc1Q8BG26 Vegfa-213ENSMUST00000217017 1179 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
Rusc1Q8BG26 Srcap-211ENSMUST00000189136 1960 ntTSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
Rusc1Q8BG26 Suds3-201ENSMUST00000086471 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
Rusc1Q8BG26 Ethe1-201ENSMUST00000077191 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
Rusc1Q8BG26 Ube2j2-202ENSMUST00000103175 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
Rusc1Q8BG26 Ipmk-202ENSMUST00000118381 1323 ntTSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
Rusc1Q8BG26 Mbd3-203ENSMUST00000105348 1222 ntTSL 5 BASIC25.63■■□□□ 1.69
Rusc1Q8BG26 Trnau1ap-203ENSMUST00000105962 961 ntTSL 5 BASIC25.63■■□□□ 1.69
Rusc1Q8BG26 Hnrnpk-210ENSMUST00000176558 1053 ntTSL 2 BASIC25.63■■□□□ 1.69
Rusc1Q8BG26 Gdf7-202ENSMUST00000220073 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
Rusc1Q8BG26 H2afy-202ENSMUST00000045788 1933 ntTSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
Rusc1Q8BG26 Cxxc4-203ENSMUST00000181904 5694 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.62■■□□□ 1.69
Rusc1Q8BG26 Fam149b-201ENSMUST00000037698 924 ntTSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
Rusc1Q8BG26 Cbr3-201ENSMUST00000039620 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
Rusc1Q8BG26 Rpl35-201ENSMUST00000080861 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
Rusc1Q8BG26 Ube2k-203ENSMUST00000201266 1449 ntTSL 5 BASIC25.62■■□□□ 1.69
Rusc1Q8BG26 Mnx1-201ENSMUST00000001608 2018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.61■■□□□ 1.69
Rusc1Q8BG26 Gm13594-201ENSMUST00000137582 476 ntTSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
Rusc1Q8BG26 Tmem170b-202ENSMUST00000221694 602 ntTSL 3 BASIC25.6■■□□□ 1.69
Rusc1Q8BG26 A030014E15Rik-201ENSMUST00000223400 796 ntAPPRIS P1 BASIC25.6■■□□□ 1.69
Rusc1Q8BG26 Frat2-201ENSMUST00000059231 2161 ntAPPRIS P1 BASIC25.6■■□□□ 1.69
Rusc1Q8BG26 Clptm1l-201ENSMUST00000022102 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
Rusc1Q8BG26 Slc35a2-211ENSMUST00000208640 486 ntTSL 5 BASIC25.59■■□□□ 1.69
Rusc1Q8BG26 Ddrgk1-201ENSMUST00000089559 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
Rusc1Q8BG26 Slc39a13-203ENSMUST00000111436 1291 ntTSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
Rusc1Q8BG26 Nudc-201ENSMUST00000030665 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
Rusc1Q8BG26 A830092H15Rik-201ENSMUST00000099182 1229 ntBASIC25.56■■□□□ 1.68
Rusc1Q8BG26 Kctd2-201ENSMUST00000103035 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
Rusc1Q8BG26 Zfp422-201ENSMUST00000057540 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
Rusc1Q8BG26 Hecw2-202ENSMUST00000097741 1132 ntTSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
Rusc1Q8BG26 Kansl2-201ENSMUST00000023727 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.55■■□□□ 1.68
Rusc1Q8BG26 Rab4a-202ENSMUST00000118535 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
Rusc1Q8BG26 Ildr2-202ENSMUST00000192426 1238 ntTSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
Rusc1Q8BG26 Bloc1s2-201ENSMUST00000079033 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
Rusc1Q8BG26 Ppp1ca-201ENSMUST00000046094 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
Rusc1Q8BG26 Xkr7-201ENSMUST00000037235 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Rusc1Q8BG26 Fam149b-203ENSMUST00000090499 2370 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Rusc1Q8BG26 Gm21989-201ENSMUST00000174530 1609 ntTSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Rusc1Q8BG26 Tmpo-203ENSMUST00000092219 1854 ntTSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Rusc1Q8BG26 Ryk-201ENSMUST00000035142 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Rusc1Q8BG26 E2f6-201ENSMUST00000020908 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Rusc1Q8BG26 Cadm1-206ENSMUST00000143026 1643 ntTSL 5 BASIC25.52■■□□□ 1.68
Rusc1Q8BG26 Kcna7-201ENSMUST00000107774 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
Rusc1Q8BG26 Gm20109-201ENSMUST00000180802 671 ntTSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
Rusc1Q8BG26 Krtap28-10-201ENSMUST00000188323 957 ntAPPRIS P1 BASIC25.52■■□□□ 1.68
Rusc1Q8BG26 Oaz2-206ENSMUST00000153700 1843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.51■■□□□ 1.67
Rusc1Q8BG26 Sft2d1-210ENSMUST00000154553 1049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
Rusc1Q8BG26 Gm20458-201ENSMUST00000164863 1369 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.5■■□□□ 1.67
Rusc1Q8BG26 Gm5067-201ENSMUST00000170449 1009 ntBASIC25.5■■□□□ 1.67
Rusc1Q8BG26 5031425E22Rik-201ENSMUST00000101522 2110 ntBASIC25.49■■□□□ 1.67
Rusc1Q8BG26 Igfbp3-202ENSMUST00000135887 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Rusc1Q8BG26 Sike1-202ENSMUST00000119450 774 ntTSL 3 BASIC25.49■■□□□ 1.67
Rusc1Q8BG26 Hoxd9-201ENSMUST00000059272 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Rusc1Q8BG26 Upf3a-201ENSMUST00000043767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Rusc1Q8BG26 Adgrb1-203ENSMUST00000185682 2744 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Rusc1Q8BG26 Cadm1-209ENSMUST00000152459 1784 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Rusc1Q8BG26 Ctbp1-211ENSMUST00000202868 2436 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Rusc1Q8BG26 Gpr27-201ENSMUST00000101122 2388 ntAPPRIS P1 BASIC25.48■■□□□ 1.67
Rusc1Q8BG26 Gm10420-201ENSMUST00000121713 882 ntBASIC25.48■■□□□ 1.67
Rusc1Q8BG26 Gm7276-201ENSMUST00000097520 1252 ntAPPRIS P1 BASIC25.48■■□□□ 1.67
Rusc1Q8BG26 Ccna1-202ENSMUST00000197238 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
Rusc1Q8BG26 Glrx3-201ENSMUST00000064404 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Rusc1Q8BG26 Paqr3-202ENSMUST00000112968 1875 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Rusc1Q8BG26 Panx2-202ENSMUST00000161372 2314 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Rusc1Q8BG26 Gm44428-201ENSMUST00000204474 874 ntBASIC25.47■■□□□ 1.67
Rusc1Q8BG26 Aldoa-214ENSMUST00000207534 741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
Rusc1Q8BG26 Vmac-201ENSMUST00000067931 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Rusc1Q8BG26 Emc8-208ENSMUST00000181950 747 ntTSL 2 BASIC25.46■■□□□ 1.67
Rusc1Q8BG26 Ppp1r35-201ENSMUST00000031739 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Rusc1Q8BG26 Dlg1-203ENSMUST00000100001 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
Rusc1Q8BG26 Kcnk2-205ENSMUST00000192723 1642 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.67
Rusc1Q8BG26 Gng12-204ENSMUST00000114225 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.67
Rusc1Q8BG26 Rbm45-201ENSMUST00000046389 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.67
Rusc1Q8BG26 AC122428.3-201ENSMUST00000215551 2290 ntBASIC25.45■■□□□ 1.66
Rusc1Q8BG26 Btf3l4-203ENSMUST00000102741 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Rusc1Q8BG26 Shox2-204ENSMUST00000162439 1081 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Rusc1Q8BG26 Tmem70-203ENSMUST00000177501 1636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Rusc1Q8BG26 Cited2-203ENSMUST00000219558 2411 ntAPPRIS P1 BASIC25.44■■□□□ 1.66
Rusc1Q8BG26 Ebf4-203ENSMUST00000110288 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
Rusc1Q8BG26 Nudt3-203ENSMUST00000114886 996 ntTSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
Rusc1Q8BG26 Hpf1-204ENSMUST00000146863 531 ntTSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
Rusc1Q8BG26 Cys1-207ENSMUST00000186602 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Rusc1Q8BG26 Pdpk1-203ENSMUST00000115407 1730 ntTSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
Rusc1Q8BG26 Usf1-210ENSMUST00000167546 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
Rusc1Q8BG26 Hist2h3c1-201ENSMUST00000176059 1820 ntAPPRIS P1 BASIC25.42■■□□□ 1.66
Rusc1Q8BG26 Hist2h3c1-202ENSMUST00000177796 1825 ntBASIC25.42■■□□□ 1.66
Rusc1Q8BG26 Efna2-201ENSMUST00000003154 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Rusc1Q8BG26 Pgls-201ENSMUST00000034264 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Rusc1Q8BG26 E2f1-201ENSMUST00000000894 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Rusc1Q8BG26 Lsm4-205ENSMUST00000210987 636 ntTSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
Rusc1Q8BG26 Galr3-201ENSMUST00000058004 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Rusc1Q8BG26 Gm20208-202ENSMUST00000219905 1528 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Rusc1Q8BG26 Maf-201ENSMUST00000069009 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Rusc1Q8BG26 Npas1-201ENSMUST00000002053 2091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
Rusc1Q8BG26 Adra1d-201ENSMUST00000103184 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
Rusc1Q8BG26 Slc39a13-201ENSMUST00000073575 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
Rusc1Q8BG26 Jmjd6-201ENSMUST00000047616 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
Rusc1Q8BG26 Cited2-201ENSMUST00000038107 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 13 ms