Protein–RNA interactions for Protein: Q85ZW5

H2-M10.6, Histocompatibility 2, M region locus 10.6, mousemouse

Predictions only

Length 330 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
H2-M10.6Q85ZW5 Evx2-202ENSMUST00000173623 1428 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
H2-M10.6Q85ZW5 Irak1-202ENSMUST00000068286 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
H2-M10.6Q85ZW5 Uba52-207ENSMUST00000140679 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
H2-M10.6Q85ZW5 Ptx3-201ENSMUST00000029421 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
H2-M10.6Q85ZW5 Txnrd1-208ENSMUST00000219962 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
H2-M10.6Q85ZW5 Ltk-201ENSMUST00000028759 3080 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
H2-M10.6Q85ZW5 Insc-208ENSMUST00000169913 2321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
H2-M10.6Q85ZW5 Mfn1-201ENSMUST00000091257 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
H2-M10.6Q85ZW5 Fam149b-203ENSMUST00000090499 2370 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
H2-M10.6Q85ZW5 Trim3-202ENSMUST00000106789 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
H2-M10.6Q85ZW5 Shb-201ENSMUST00000061986 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
H2-M10.6Q85ZW5 Endog-201ENSMUST00000015481 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
H2-M10.6Q85ZW5 Ppp4c-211ENSMUST00000206570 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
H2-M10.6Q85ZW5 Fam126a-206ENSMUST00000197617 2288 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
H2-M10.6Q85ZW5 Gm9939-201ENSMUST00000067161 1154 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
H2-M10.6Q85ZW5 Map3k10-204ENSMUST00000138243 1621 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
H2-M10.6Q85ZW5 Acot5-201ENSMUST00000046422 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
H2-M10.6Q85ZW5 Slc16a11-211ENSMUST00000171032 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
H2-M10.6Q85ZW5 Mprip-204ENSMUST00000116371 8766 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
H2-M10.6Q85ZW5 Ctage5-203ENSMUST00000170992 2785 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
H2-M10.6Q85ZW5 Nckap1-202ENSMUST00000111760 4597 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
H2-M10.6Q85ZW5 H3f3aos-201ENSMUST00000097448 2905 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
H2-M10.6Q85ZW5 Eif5a-201ENSMUST00000043419 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
H2-M10.6Q85ZW5 Ildr2-203ENSMUST00000192638 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
H2-M10.6Q85ZW5 Hccs-201ENSMUST00000033717 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
H2-M10.6Q85ZW5 Klhl22-201ENSMUST00000117192 2754 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
H2-M10.6Q85ZW5 Ube2q1-201ENSMUST00000038356 3077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
H2-M10.6Q85ZW5 Vdac2-201ENSMUST00000022293 1954 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
H2-M10.6Q85ZW5 Bod1-202ENSMUST00000109415 799 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
H2-M10.6Q85ZW5 Strn3-202ENSMUST00000169503 2791 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
H2-M10.6Q85ZW5 Armc10-201ENSMUST00000072896 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
H2-M10.6Q85ZW5 Rfwd2-201ENSMUST00000076894 5116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
H2-M10.6Q85ZW5 Dapk1-202ENSMUST00000077453 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
H2-M10.6Q85ZW5 Cib1-201ENSMUST00000065163 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
H2-M10.6Q85ZW5 Dnajb2-202ENSMUST00000082158 1253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
H2-M10.6Q85ZW5 Zxdc-201ENSMUST00000045740 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
H2-M10.6Q85ZW5 Tcf4-246ENSMUST00000202116 2986 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
H2-M10.6Q85ZW5 Serpinb6a-201ENSMUST00000017188 1504 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
H2-M10.6Q85ZW5 St6galnac6-205ENSMUST00000113290 2402 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
H2-M10.6Q85ZW5 Nkain2-201ENSMUST00000092602 558 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
H2-M10.6Q85ZW5 Vkorc1l1-201ENSMUST00000051758 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
H2-M10.6Q85ZW5 Dirc2-201ENSMUST00000023554 5395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
H2-M10.6Q85ZW5 Dvl1-208ENSMUST00000168552 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
H2-M10.6Q85ZW5 Carm1-201ENSMUST00000034703 3220 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
H2-M10.6Q85ZW5 Ihh-201ENSMUST00000164097 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
H2-M10.6Q85ZW5 Sel1l3-201ENSMUST00000031090 4512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
H2-M10.6Q85ZW5 Hp1bp3-205ENSMUST00000105827 5155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
H2-M10.6Q85ZW5 Fance-203ENSMUST00000114803 1980 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
H2-M10.6Q85ZW5 Mxra7-201ENSMUST00000021170 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
H2-M10.6Q85ZW5 Nxph3-201ENSMUST00000058866 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
H2-M10.6Q85ZW5 Foxo6-201ENSMUST00000102656 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
H2-M10.6Q85ZW5 Pex10-201ENSMUST00000103180 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
H2-M10.6Q85ZW5 Traf3ip1-203ENSMUST00000189341 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
H2-M10.6Q85ZW5 Gm6821-201ENSMUST00000107540 542 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
H2-M10.6Q85ZW5 Gm31266-201ENSMUST00000192060 656 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
H2-M10.6Q85ZW5 AC163623.1-201ENSMUST00000213738 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.41■□□□□ 0.54
H2-M10.6Q85ZW5 AC117232.3-201ENSMUST00000217817 338 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
H2-M10.6Q85ZW5 Mxi1-202ENSMUST00000025998 4996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
H2-M10.6Q85ZW5 Lsr-201ENSMUST00000001279 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
H2-M10.6Q85ZW5 Aspscr1-202ENSMUST00000103016 1689 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
H2-M10.6Q85ZW5 Zfp768-202ENSMUST00000205266 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
H2-M10.6Q85ZW5 2310014F06Rik-201ENSMUST00000146145 1567 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
H2-M10.6Q85ZW5 Ammecr1-201ENSMUST00000041317 5437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
H2-M10.6Q85ZW5 Hmx3-201ENSMUST00000046093 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
H2-M10.6Q85ZW5 Tmcc1-202ENSMUST00000088896 5838 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
H2-M10.6Q85ZW5 Gm42809-201ENSMUST00000198429 1138 ntBASIC18.39■□□□□ 0.53
H2-M10.6Q85ZW5 Impdh1-201ENSMUST00000078155 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
H2-M10.6Q85ZW5 Slc17a7-201ENSMUST00000085374 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
H2-M10.6Q85ZW5 Ube2g2-204ENSMUST00000174510 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
H2-M10.6Q85ZW5 Ttc9-201ENSMUST00000036116 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
H2-M10.6Q85ZW5 Gm26617-201ENSMUST00000180381 4429 ntTSL 3 BASIC18.38■□□□□ 0.53
H2-M10.6Q85ZW5 Lmo4-201ENSMUST00000120539 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
H2-M10.6Q85ZW5 Rundc3a-203ENSMUST00000107103 1822 ntTSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
H2-M10.6Q85ZW5 Hs2st1-201ENSMUST00000043325 6177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
H2-M10.6Q85ZW5 1810049J17Rik-201ENSMUST00000180521 462 ntAPPRIS P1 BASIC18.38■□□□□ 0.53
H2-M10.6Q85ZW5 AY074887-201ENSMUST00000054018 769 ntAPPRIS P1 BASIC18.38■□□□□ 0.53
H2-M10.6Q85ZW5 Upf3a-201ENSMUST00000043767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
H2-M10.6Q85ZW5 Msl2-202ENSMUST00000189616 2612 ntTSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
H2-M10.6Q85ZW5 Dync1i1-203ENSMUST00000115556 2718 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
H2-M10.6Q85ZW5 Fam91a1-201ENSMUST00000037270 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
H2-M10.6Q85ZW5 Osbp-201ENSMUST00000025590 4578 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
H2-M10.6Q85ZW5 Arhgef25-205ENSMUST00000218654 2475 ntTSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
H2-M10.6Q85ZW5 Phf23-202ENSMUST00000101526 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
H2-M10.6Q85ZW5 Hgh1-201ENSMUST00000023213 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
H2-M10.6Q85ZW5 Ccdc9-201ENSMUST00000041010 2379 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
H2-M10.6Q85ZW5 Hoxb9-201ENSMUST00000000010 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
H2-M10.6Q85ZW5 Gskip-202ENSMUST00000222284 1064 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
H2-M10.6Q85ZW5 Map3k15-201ENSMUST00000033665 4348 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
H2-M10.6Q85ZW5 Mras-201ENSMUST00000035045 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
H2-M10.6Q85ZW5 Prph-202ENSMUST00000047104 1865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
H2-M10.6Q85ZW5 Tmem143-201ENSMUST00000069772 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
H2-M10.6Q85ZW5 Gm37847-201ENSMUST00000192163 1497 ntBASIC18.34■□□□□ 0.53
H2-M10.6Q85ZW5 Gm31748-201ENSMUST00000194938 1497 ntBASIC18.34■□□□□ 0.53
H2-M10.6Q85ZW5 Rbmxl2-201ENSMUST00000098135 1472 ntAPPRIS P1 BASIC18.34■□□□□ 0.53
H2-M10.6Q85ZW5 Gm8503-201ENSMUST00000118131 455 ntBASIC18.34■□□□□ 0.53
H2-M10.6Q85ZW5 Gm20402-201ENSMUST00000174738 687 ntTSL 3 BASIC18.34■□□□□ 0.53
H2-M10.6Q85ZW5 Ccdc142-201ENSMUST00000101254 2317 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
H2-M10.6Q85ZW5 Mppe1-201ENSMUST00000073054 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
H2-M10.6Q85ZW5 Mapk15-201ENSMUST00000089669 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
H2-M10.6Q85ZW5 Coro1b-201ENSMUST00000008893 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 10.4 ms