Protein–RNA interactions for Protein: Q80UU2

Rpp38, Ribonuclease P protein subunit p38, mousemouse

Predictions only

Length 280 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rpp38Q80UU2 Eid1-201ENSMUST00000164756 1691 ntAPPRIS P1 BASIC22.88■■□□□ 1.25
Rpp38Q80UU2 E130309D02Rik-201ENSMUST00000046418 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Rpp38Q80UU2 Srarp-201ENSMUST00000094544 905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Rpp38Q80UU2 Gm20208-202ENSMUST00000219905 1528 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Rpp38Q80UU2 Aspscr1-203ENSMUST00000106158 1690 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
Rpp38Q80UU2 Irak1-207ENSMUST00000114360 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Rpp38Q80UU2 Ube2g2-204ENSMUST00000174510 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Rpp38Q80UU2 Rbm45-201ENSMUST00000046389 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Rpp38Q80UU2 Ankrd49-205ENSMUST00000216037 1037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
Rpp38Q80UU2 AC153911.1-201ENSMUST00000220378 758 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
Rpp38Q80UU2 2610307P16Rik-205ENSMUST00000148885 1870 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Rpp38Q80UU2 Fads2-201ENSMUST00000025567 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Rpp38Q80UU2 Porcn-201ENSMUST00000077595 1872 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Rpp38Q80UU2 Porcn-204ENSMUST00000089403 1854 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Rpp38Q80UU2 Gorasp2-205ENSMUST00000133432 1941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Rpp38Q80UU2 Tmbim4-204ENSMUST00000134797 486 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Rpp38Q80UU2 Chtf8-205ENSMUST00000176515 694 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
Rpp38Q80UU2 Gm9888-201ENSMUST00000150678 965 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Rpp38Q80UU2 Ube2h-201ENSMUST00000094543 975 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Rpp38Q80UU2 Cd320-201ENSMUST00000002379 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Rpp38Q80UU2 Shb-201ENSMUST00000061986 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Rpp38Q80UU2 Azin2-203ENSMUST00000119354 1921 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Rpp38Q80UU2 Stambp-207ENSMUST00000206592 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Rpp38Q80UU2 Hgh1-201ENSMUST00000023213 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Rpp38Q80UU2 Fance-203ENSMUST00000114803 1980 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Rpp38Q80UU2 Olfm2-203ENSMUST00000215999 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Rpp38Q80UU2 Ier5l-201ENSMUST00000065134 2683 ntAPPRIS P1 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Rpp38Q80UU2 Cdkn2c-202ENSMUST00000097921 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Rpp38Q80UU2 Mad2l2-202ENSMUST00000084129 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Rpp38Q80UU2 A830010M20Rik-207ENSMUST00000162298 1408 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Rpp38Q80UU2 Rragc-201ENSMUST00000030399 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Rpp38Q80UU2 Foxn3-209ENSMUST00000177451 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Rpp38Q80UU2 Sh3d21-202ENSMUST00000097891 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Rpp38Q80UU2 E130218I03Rik-204ENSMUST00000131447 888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Rpp38Q80UU2 Pkd1-207ENSMUST00000228550 1050 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
Rpp38Q80UU2 Ddx43-201ENSMUST00000113367 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Rpp38Q80UU2 Syndig1l-201ENSMUST00000095550 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Rpp38Q80UU2 Gng3-201ENSMUST00000096259 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Rpp38Q80UU2 Efhd1os-201ENSMUST00000138844 332 ntTSL 3 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Rpp38Q80UU2 Gm16764-201ENSMUST00000138891 541 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Rpp38Q80UU2 Efhd2-201ENSMUST00000036854 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Rpp38Q80UU2 Slc22a17-201ENSMUST00000050772 2290 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Rpp38Q80UU2 Nisch-222ENSMUST00000172142 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Rpp38Q80UU2 Pdpk1-203ENSMUST00000115407 1730 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Rpp38Q80UU2 Gm5784-202ENSMUST00000220896 2016 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Rpp38Q80UU2 Tada2b-202ENSMUST00000119916 1321 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Rpp38Q80UU2 Nckap5los-201ENSMUST00000159738 1712 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.23
Rpp38Q80UU2 Gm20512-201ENSMUST00000172483 618 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Rpp38Q80UU2 Irf2bp2-201ENSMUST00000054960 5080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Rpp38Q80UU2 Kcnj6-201ENSMUST00000095873 1773 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Rpp38Q80UU2 Dbp-201ENSMUST00000080885 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Rpp38Q80UU2 Tmem158-201ENSMUST00000068140 1712 ntAPPRIS P1 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Rpp38Q80UU2 Rab26-202ENSMUST00000061764 1291 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Rpp38Q80UU2 Terc-201ENSMUST00000082862 423 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
Rpp38Q80UU2 Foxd2-201ENSMUST00000068654 2592 ntAPPRIS P1 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Rpp38Q80UU2 Plin1-206ENSMUST00000205915 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Rpp38Q80UU2 Rpl31-203ENSMUST00000179954 630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Rpp38Q80UU2 Srcap-210ENSMUST00000188124 2048 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Rpp38Q80UU2 Mppe1-201ENSMUST00000073054 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Rpp38Q80UU2 Ube2k-203ENSMUST00000201266 1449 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Rpp38Q80UU2 Znrf1-207ENSMUST00000173506 1238 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Rpp38Q80UU2 Trappc6b-201ENSMUST00000021380 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Rpp38Q80UU2 Gm6311-201ENSMUST00000073790 878 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
Rpp38Q80UU2 St6galnac6-203ENSMUST00000095044 2394 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Rpp38Q80UU2 Cbln2-203ENSMUST00000122464 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Rpp38Q80UU2 Ccsap-201ENSMUST00000034452 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Rpp38Q80UU2 Hdac1-201ENSMUST00000102597 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Rpp38Q80UU2 Mlycd-201ENSMUST00000098367 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Rpp38Q80UU2 Dbp-204ENSMUST00000211513 1156 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Rpp38Q80UU2 D130020L05Rik-201ENSMUST00000180800 2431 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Rpp38Q80UU2 Nelfe-202ENSMUST00000165953 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Rpp38Q80UU2 2410022M11Rik-201ENSMUST00000186474 1911 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
Rpp38Q80UU2 Ccdc142-201ENSMUST00000101254 2317 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Rpp38Q80UU2 Vps37b-201ENSMUST00000040967 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Rpp38Q80UU2 Paqr6-203ENSMUST00000147948 837 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Rpp38Q80UU2 2510046G10Rik-202ENSMUST00000187458 1052 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
Rpp38Q80UU2 Plvap-201ENSMUST00000048452 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Rpp38Q80UU2 Ubp1-204ENSMUST00000214095 2320 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Rpp38Q80UU2 Pdcd4-201ENSMUST00000025931 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Rpp38Q80UU2 Slc30a3-201ENSMUST00000031037 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Rpp38Q80UU2 Prr5-202ENSMUST00000171460 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Rpp38Q80UU2 Hecw2-202ENSMUST00000097741 1132 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Rpp38Q80UU2 H1f0-201ENSMUST00000180086 2287 ntAPPRIS P1 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Rpp38Q80UU2 Ltb4r1-201ENSMUST00000057569 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Rpp38Q80UU2 Rarres1-201ENSMUST00000054825 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Rpp38Q80UU2 Hacd1-202ENSMUST00000091429 871 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Rpp38Q80UU2 Wnt2-201ENSMUST00000010941 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Rpp38Q80UU2 Il17rd-202ENSMUST00000223942 2186 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
Rpp38Q80UU2 Vdac2-201ENSMUST00000022293 1954 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Rpp38Q80UU2 Tmem192-202ENSMUST00000079896 916 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Rpp38Q80UU2 Gm16286-202ENSMUST00000125127 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Rpp38Q80UU2 Arx-202ENSMUST00000113947 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Rpp38Q80UU2 Hook1-202ENSMUST00000107083 1506 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Rpp38Q80UU2 E330009J07Rik-201ENSMUST00000039008 1949 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Rpp38Q80UU2 Ndufs3-201ENSMUST00000005647 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Rpp38Q80UU2 A530095I07Rik-201ENSMUST00000070942 847 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Rpp38Q80UU2 Ip6k1-208ENSMUST00000176854 2251 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Rpp38Q80UU2 Tmem260-210ENSMUST00000227440 2222 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Rpp38Q80UU2 Fam120a-201ENSMUST00000060805 5105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Rpp38Q80UU2 Hoxb3-201ENSMUST00000055334 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.9 ms