Protein–RNA interactions for Protein: Q80UP5

Ankrd13a, Ankyrin repeat domain-containing protein 13A, mousemouse

Predictions only

Length 588 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ankrd13aQ80UP5 2410017I17Rik-202ENSMUST00000090537 2053 ntTSL 2 BASIC27.14■■□□□ 1.94
Ankrd13aQ80UP5 Gxylt1-202ENSMUST00000057896 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.13■■□□□ 1.93
Ankrd13aQ80UP5 Tm6sf1-201ENSMUST00000041890 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
Ankrd13aQ80UP5 Emid1-201ENSMUST00000062821 1947 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
Ankrd13aQ80UP5 Btf3l4-203ENSMUST00000102741 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
Ankrd13aQ80UP5 Etfa-201ENSMUST00000034866 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
Ankrd13aQ80UP5 Pde8b-204ENSMUST00000159608 2370 ntTSL 5 BASIC27.11■■□□□ 1.93
Ankrd13aQ80UP5 Gm10420-201ENSMUST00000121713 882 ntBASIC27.11■■□□□ 1.93
Ankrd13aQ80UP5 Shox2-204ENSMUST00000162439 1081 ntTSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
Ankrd13aQ80UP5 Pgls-201ENSMUST00000034264 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
Ankrd13aQ80UP5 Gm7276-201ENSMUST00000097520 1252 ntAPPRIS P1 BASIC27.1■■□□□ 1.93
Ankrd13aQ80UP5 H2afy-202ENSMUST00000045788 1933 ntTSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
Ankrd13aQ80UP5 Gm4419-202ENSMUST00000226239 1431 ntBASIC27.09■■□□□ 1.93
Ankrd13aQ80UP5 Ubp1-203ENSMUST00000116492 2111 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
Ankrd13aQ80UP5 Hecw2-202ENSMUST00000097741 1132 ntTSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
Ankrd13aQ80UP5 Suds3-201ENSMUST00000086471 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
Ankrd13aQ80UP5 Hpf1-204ENSMUST00000146863 531 ntTSL 2 BASIC27.08■■□□□ 1.93
Ankrd13aQ80UP5 Aldoa-214ENSMUST00000207534 741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.08■■□□□ 1.93
Ankrd13aQ80UP5 Ppp1ca-201ENSMUST00000046094 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
Ankrd13aQ80UP5 Csnk1g2-201ENSMUST00000079773 2348 ntTSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
Ankrd13aQ80UP5 Preb-209ENSMUST00000202567 1869 ntTSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
Ankrd13aQ80UP5 Fezf2-202ENSMUST00000224023 1917 ntBASIC27.07■■□□□ 1.92
Ankrd13aQ80UP5 Nucks1-203ENSMUST00000189946 2375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
Ankrd13aQ80UP5 Gm20458-201ENSMUST00000164863 1369 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.06■■□□□ 1.92
Ankrd13aQ80UP5 Cadm1-206ENSMUST00000143026 1643 ntTSL 5 BASIC27.05■■□□□ 1.92
Ankrd13aQ80UP5 Gm21989-201ENSMUST00000174530 1609 ntTSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
Ankrd13aQ80UP5 Neurog2-201ENSMUST00000029587 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
Ankrd13aQ80UP5 Kctd2-201ENSMUST00000103035 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
Ankrd13aQ80UP5 Msto1-202ENSMUST00000126245 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
Ankrd13aQ80UP5 Pcsk1n-201ENSMUST00000041096 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
Ankrd13aQ80UP5 Oaz2-206ENSMUST00000153700 1843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.02■■□□□ 1.92
Ankrd13aQ80UP5 Nudt6-204ENSMUST00000108118 935 ntTSL 5 BASIC27.02■■□□□ 1.92
Ankrd13aQ80UP5 Nudt6-201ENSMUST00000052645 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
Ankrd13aQ80UP5 Nudt6-202ENSMUST00000099130 1070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
Ankrd13aQ80UP5 Srcap-211ENSMUST00000189136 1960 ntTSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
Ankrd13aQ80UP5 Gm44428-201ENSMUST00000204474 874 ntBASIC27■■□□□ 1.91
Ankrd13aQ80UP5 Arhgap22-201ENSMUST00000111955 2148 ntTSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
Ankrd13aQ80UP5 Dleu7-201ENSMUST00000063169 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
Ankrd13aQ80UP5 Nudt3-203ENSMUST00000114886 996 ntTSL 2 BASIC26.98■■□□□ 1.91
Ankrd13aQ80UP5 Cited1-202ENSMUST00000101336 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
Ankrd13aQ80UP5 H1fx-201ENSMUST00000056403 1217 ntAPPRIS P1 BASIC26.97■■□□□ 1.91
Ankrd13aQ80UP5 Rgs7-206ENSMUST00000194555 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
Ankrd13aQ80UP5 Lsm4-205ENSMUST00000210987 636 ntTSL 5 BASIC26.96■■□□□ 1.91
Ankrd13aQ80UP5 Htatsf1-202ENSMUST00000114751 1128 ntTSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
Ankrd13aQ80UP5 Lin7b-201ENSMUST00000003971 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
Ankrd13aQ80UP5 Galr3-201ENSMUST00000058004 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
Ankrd13aQ80UP5 Rbm45-201ENSMUST00000046389 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
Ankrd13aQ80UP5 Ppcs-201ENSMUST00000030385 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
Ankrd13aQ80UP5 Hoxd9-201ENSMUST00000059272 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
Ankrd13aQ80UP5 Usf1-210ENSMUST00000167546 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.94■■□□□ 1.9
Ankrd13aQ80UP5 Fam149b-203ENSMUST00000090499 2370 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
Ankrd13aQ80UP5 D17Wsu92e-201ENSMUST00000075076 1470 ntTSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
Ankrd13aQ80UP5 Fam92a-208ENSMUST00000177837 1325 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.92■■□□□ 1.9
Ankrd13aQ80UP5 Tm2d2-201ENSMUST00000033961 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
Ankrd13aQ80UP5 Frat2-201ENSMUST00000059231 2161 ntAPPRIS P1 BASIC26.92■■□□□ 1.9
Ankrd13aQ80UP5 Upf3a-201ENSMUST00000043767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
Ankrd13aQ80UP5 Mnx1-201ENSMUST00000001608 2018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.91■■□□□ 1.9
Ankrd13aQ80UP5 Kcnmb4os2-203ENSMUST00000127070 1048 ntTSL 2 BASIC26.91■■□□□ 1.9
Ankrd13aQ80UP5 Hist2h3c1-201ENSMUST00000176059 1820 ntAPPRIS P1 BASIC26.9■■□□□ 1.9
Ankrd13aQ80UP5 Hist2h3c1-202ENSMUST00000177796 1825 ntBASIC26.9■■□□□ 1.9
Ankrd13aQ80UP5 Reep6-202ENSMUST00000105354 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
Ankrd13aQ80UP5 Reep6-205ENSMUST00000105358 2208 ntTSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
Ankrd13aQ80UP5 Vmac-201ENSMUST00000067931 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
Ankrd13aQ80UP5 Tmpo-203ENSMUST00000092219 1854 ntTSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
Ankrd13aQ80UP5 Mapkap1-202ENSMUST00000113124 1758 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.9■■□□□ 1.9
Ankrd13aQ80UP5 Glrx3-201ENSMUST00000064404 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
Ankrd13aQ80UP5 Ipmk-203ENSMUST00000121446 1492 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.9■■□□□ 1.9
Ankrd13aQ80UP5 Hnrnpul1-202ENSMUST00000108401 1240 ntTSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
Ankrd13aQ80UP5 Pdpk1-203ENSMUST00000115407 1730 ntTSL 5 BASIC26.9■■□□□ 1.9
Ankrd13aQ80UP5 Cyp2r1-202ENSMUST00000119712 917 ntTSL 5 BASIC26.89■■□□□ 1.9
Ankrd13aQ80UP5 Neurl1b-202ENSMUST00000182897 1231 ntTSL 5 BASIC26.89■■□□□ 1.9
Ankrd13aQ80UP5 Gm5921-201ENSMUST00000075898 882 ntBASIC26.89■■□□□ 1.9
Ankrd13aQ80UP5 Kcnk2-205ENSMUST00000192723 1642 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
Ankrd13aQ80UP5 Gng12-204ENSMUST00000114225 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.89
Ankrd13aQ80UP5 5031425E22Rik-201ENSMUST00000101522 2110 ntBASIC26.88■■□□□ 1.89
Ankrd13aQ80UP5 Cited4-201ENSMUST00000094814 1249 ntAPPRIS P1 BASIC26.88■■□□□ 1.89
Ankrd13aQ80UP5 Gfra4-206ENSMUST00000110240 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
Ankrd13aQ80UP5 Zc3h6-201ENSMUST00000110319 1484 ntTSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
Ankrd13aQ80UP5 Gm20208-202ENSMUST00000219905 1528 ntTSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
Ankrd13aQ80UP5 Rcor2-201ENSMUST00000066646 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
Ankrd13aQ80UP5 Cadm1-209ENSMUST00000152459 1784 ntTSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
Ankrd13aQ80UP5 Pmvk-201ENSMUST00000029564 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
Ankrd13aQ80UP5 Efna2-201ENSMUST00000003154 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
Ankrd13aQ80UP5 Scn1b-201ENSMUST00000098548 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
Ankrd13aQ80UP5 Tmem70-203ENSMUST00000177501 1636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
Ankrd13aQ80UP5 Fam50b-202ENSMUST00000221037 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
Ankrd13aQ80UP5 Fam89b-203ENSMUST00000161368 1160 ntTSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
Ankrd13aQ80UP5 Foxe3-201ENSMUST00000050940 867 ntAPPRIS P1 BASIC26.82■■□□□ 1.88
Ankrd13aQ80UP5 Ppp1r14c-202ENSMUST00000217573 2013 ntTSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
Ankrd13aQ80UP5 Ccna1-202ENSMUST00000197238 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.82■■□□□ 1.88
Ankrd13aQ80UP5 Usp2-206ENSMUST00000176416 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
Ankrd13aQ80UP5 Npas1-201ENSMUST00000002053 2091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.81■■□□□ 1.88
Ankrd13aQ80UP5 Dlg1-203ENSMUST00000100001 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.81■■□□□ 1.88
Ankrd13aQ80UP5 Paqr3-202ENSMUST00000112968 1875 ntTSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
Ankrd13aQ80UP5 Rcan1-202ENSMUST00000060005 2324 ntTSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
Ankrd13aQ80UP5 Jmjd6-201ENSMUST00000047616 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
Ankrd13aQ80UP5 AC122428.3-201ENSMUST00000215551 2290 ntBASIC26.8■■□□□ 1.88
Ankrd13aQ80UP5 Cys1-207ENSMUST00000186602 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
Ankrd13aQ80UP5 2310061I04Rik-202ENSMUST00000146451 2081 ntTSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
Ankrd13aQ80UP5 Becn1-216ENSMUST00000170502 725 ntTSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 56.5 ms