Protein–RNA interactions for Protein: Q7TQ40

Zic5, Zinc finger protein ZIC 5, mousemouse

Predictions only

Length 622 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Zic5Q7TQ40 Dlx2-201ENSMUST00000024159 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Zic5Q7TQ40 Gm28052-201ENSMUST00000150388 380 ntTSL 3 BASIC23.52■■□□□ 1.36
Zic5Q7TQ40 Homer3-203ENSMUST00000110124 2445 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
Zic5Q7TQ40 Pex10-201ENSMUST00000103180 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Zic5Q7TQ40 Msi2-202ENSMUST00000107908 695 ntTSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
Zic5Q7TQ40 Wnt5b-203ENSMUST00000119369 2339 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Zic5Q7TQ40 Dnajc21-201ENSMUST00000136591 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
Zic5Q7TQ40 Emc10-202ENSMUST00000118808 1872 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Zic5Q7TQ40 Gm7432-201ENSMUST00000210343 879 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
Zic5Q7TQ40 Fam3c-201ENSMUST00000081288 1487 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Zic5Q7TQ40 Serpinb6a-201ENSMUST00000017188 1504 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Zic5Q7TQ40 Grb2-201ENSMUST00000021090 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Zic5Q7TQ40 Fbxl14-201ENSMUST00000032094 2963 ntAPPRIS P1 BASIC23.49■■□□□ 1.35
Zic5Q7TQ40 Ccdc50-202ENSMUST00000096127 1096 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Zic5Q7TQ40 Rhou-201ENSMUST00000045487 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Zic5Q7TQ40 Cacfd1-203ENSMUST00000114005 1286 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Zic5Q7TQ40 Gm5784-202ENSMUST00000220896 2016 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Zic5Q7TQ40 Sorcs2-202ENSMUST00000070720 2089 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Zic5Q7TQ40 1110065P20Rik-201ENSMUST00000106190 968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
Zic5Q7TQ40 Ppa2-201ENSMUST00000029644 1226 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Zic5Q7TQ40 Gm9887-201ENSMUST00000053451 624 ntAPPRIS P1 BASIC23.47■■□□□ 1.35
Zic5Q7TQ40 Lmo4-201ENSMUST00000120539 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Zic5Q7TQ40 Kif1c-205ENSMUST00000152618 1943 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Zic5Q7TQ40 Flt3l-211ENSMUST00000211429 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Zic5Q7TQ40 Dbp-201ENSMUST00000080885 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Zic5Q7TQ40 Carm1-201ENSMUST00000034703 3220 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Zic5Q7TQ40 Mapkap1-201ENSMUST00000113123 1530 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
Zic5Q7TQ40 Nrarp-201ENSMUST00000104999 2582 ntAPPRIS P1 BASIC23.45■■□□□ 1.34
Zic5Q7TQ40 Actr5-201ENSMUST00000045644 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Zic5Q7TQ40 Ubl3-204ENSMUST00000201595 2064 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
Zic5Q7TQ40 Slc16a11-205ENSMUST00000126388 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
Zic5Q7TQ40 Spire2-201ENSMUST00000010298 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Zic5Q7TQ40 Mlycd-201ENSMUST00000098367 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Zic5Q7TQ40 Ing2-201ENSMUST00000080353 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Zic5Q7TQ40 Gorasp2-205ENSMUST00000133432 1941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Zic5Q7TQ40 Dhrs13os-201ENSMUST00000150471 2429 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Zic5Q7TQ40 Ccnl2-201ENSMUST00000030944 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Zic5Q7TQ40 Syndig1l-204ENSMUST00000222422 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Zic5Q7TQ40 Bean1-205ENSMUST00000212979 2131 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
Zic5Q7TQ40 Zgpat-202ENSMUST00000108807 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Zic5Q7TQ40 Cnnm3-201ENSMUST00000001166 5193 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Zic5Q7TQ40 A030003K21Rik-201ENSMUST00000222600 830 ntAPPRIS P1 BASIC23.42■■□□□ 1.34
Zic5Q7TQ40 Srcap-210ENSMUST00000188124 2048 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Zic5Q7TQ40 Slc44a1-203ENSMUST00000107646 1974 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
Zic5Q7TQ40 Rundc3a-203ENSMUST00000107103 1822 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
Zic5Q7TQ40 Lrrc59-201ENSMUST00000021239 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Zic5Q7TQ40 Gm10499-202ENSMUST00000174778 1698 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Zic5Q7TQ40 Susd6-203ENSMUST00000220238 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Zic5Q7TQ40 Dedd-204ENSMUST00000111300 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Zic5Q7TQ40 Banp-202ENSMUST00000093078 2289 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Zic5Q7TQ40 Hand2-201ENSMUST00000040104 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Zic5Q7TQ40 Cbln2-203ENSMUST00000122464 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
Zic5Q7TQ40 Foxe1-201ENSMUST00000095097 2804 ntAPPRIS P1 BASIC23.39■■□□□ 1.34
Zic5Q7TQ40 Gm37847-201ENSMUST00000192163 1497 ntBASIC23.39■■□□□ 1.34
Zic5Q7TQ40 Gm31748-201ENSMUST00000194938 1497 ntBASIC23.39■■□□□ 1.34
Zic5Q7TQ40 Mlx-201ENSMUST00000017945 1965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Zic5Q7TQ40 Dgat2-201ENSMUST00000033001 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Zic5Q7TQ40 Pitx2-202ENSMUST00000042587 2271 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Zic5Q7TQ40 Aebp2-203ENSMUST00000095350 2575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Zic5Q7TQ40 Tirap-207ENSMUST00000177129 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Zic5Q7TQ40 Esrra-201ENSMUST00000025906 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Zic5Q7TQ40 2410022M11Rik-201ENSMUST00000186474 1911 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
Zic5Q7TQ40 AC117232.3-201ENSMUST00000217817 338 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
Zic5Q7TQ40 Ell2-205ENSMUST00000222194 434 ntTSL 3 BASIC23.37■■□□□ 1.33
Zic5Q7TQ40 Dyrk1b-202ENSMUST00000172467 2523 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Zic5Q7TQ40 Dyrk1b-201ENSMUST00000085901 2534 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Zic5Q7TQ40 Bcl7b-202ENSMUST00000111187 564 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Zic5Q7TQ40 Hmgn3-202ENSMUST00000162246 983 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Zic5Q7TQ40 Pcbd2-201ENSMUST00000021958 544 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Zic5Q7TQ40 Vkorc1l1-201ENSMUST00000051758 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Zic5Q7TQ40 6330420H09Rik-201ENSMUST00000211371 1316 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Zic5Q7TQ40 Adprhl2-201ENSMUST00000102617 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Zic5Q7TQ40 Tmpo-203ENSMUST00000092219 1854 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Zic5Q7TQ40 Gm11599-201ENSMUST00000118720 878 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
Zic5Q7TQ40 Tmbim4-204ENSMUST00000134797 486 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Zic5Q7TQ40 Gna13-202ENSMUST00000106702 914 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Zic5Q7TQ40 Fip1l1-202ENSMUST00000113534 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Zic5Q7TQ40 Gm28592-201ENSMUST00000186844 741 ntTSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
Zic5Q7TQ40 Gas7-203ENSMUST00000108681 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
Zic5Q7TQ40 Particl-201ENSMUST00000205370 1560 ntBASIC23.34■■□□□ 1.33
Zic5Q7TQ40 Rasgef1c-203ENSMUST00000093142 2216 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Zic5Q7TQ40 Cotl1-201ENSMUST00000034285 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Zic5Q7TQ40 Hif1a-203ENSMUST00000110464 1759 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Zic5Q7TQ40 March2-206ENSMUST00000173329 2566 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
Zic5Q7TQ40 Rexo2-210ENSMUST00000217037 609 ntTSL 3 BASIC23.32■■□□□ 1.32
Zic5Q7TQ40 BC037034-205ENSMUST00000159649 2093 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Zic5Q7TQ40 Lor-201ENSMUST00000058150 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Zic5Q7TQ40 Kcnj12-202ENSMUST00000089184 2291 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Zic5Q7TQ40 Rbmxl2-201ENSMUST00000098135 1472 ntAPPRIS P1 BASIC23.31■■□□□ 1.32
Zic5Q7TQ40 Cnot6-201ENSMUST00000020624 2498 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Zic5Q7TQ40 Porcn-201ENSMUST00000077595 1872 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Zic5Q7TQ40 Porcn-204ENSMUST00000089403 1854 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Zic5Q7TQ40 Trim9-208ENSMUST00000221370 2393 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Zic5Q7TQ40 Psip1-203ENSMUST00000107215 1898 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Zic5Q7TQ40 Stambp-207ENSMUST00000206592 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Zic5Q7TQ40 Dmtn-209ENSMUST00000228295 2572 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
Zic5Q7TQ40 Mtf2-202ENSMUST00000112626 1968 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
Zic5Q7TQ40 Gm20634-201ENSMUST00000090779 2956 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
Zic5Q7TQ40 2410017I17Rik-201ENSMUST00000056774 1509 ntTSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
Zic5Q7TQ40 Homer1-207ENSMUST00000109494 2468 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 11 ms