Protein–RNA interactions for Protein: Q7TNE1

Sugct, Succinate--hydroxymethylglutarate CoA-transferase, mousemouse

Predictions only

Length 436 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SugctQ7TNE1 Abhd17b-201ENSMUST00000052556 2475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
SugctQ7TNE1 Rnf19b-206ENSMUST00000168461 2532 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.44
SugctQ7TNE1 Tmem200b-201ENSMUST00000094666 1370 ntAPPRIS P1 BASIC24.07■■□□□ 1.44
SugctQ7TNE1 Gfra4-203ENSMUST00000110234 600 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
SugctQ7TNE1 Gfra4-204ENSMUST00000110235 573 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
SugctQ7TNE1 Dnajb2-202ENSMUST00000082158 1253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
SugctQ7TNE1 Kcnc3-206ENSMUST00000208651 2728 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
SugctQ7TNE1 Gm20402-201ENSMUST00000174738 687 ntTSL 3 BASIC24.06■■□□□ 1.44
SugctQ7TNE1 Tcf4-246ENSMUST00000202116 2986 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
SugctQ7TNE1 Nkain2-201ENSMUST00000092602 558 ntBASIC24.06■■□□□ 1.44
SugctQ7TNE1 Vkorc1l1-201ENSMUST00000051758 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
SugctQ7TNE1 Fbxw4-201ENSMUST00000046869 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
SugctQ7TNE1 Fank1-204ENSMUST00000209511 1392 ntTSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
SugctQ7TNE1 Cbln2-203ENSMUST00000122464 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
SugctQ7TNE1 Sh3rf1-201ENSMUST00000034060 5479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
SugctQ7TNE1 Porcn-201ENSMUST00000077595 1872 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
SugctQ7TNE1 Porcn-204ENSMUST00000089403 1854 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
SugctQ7TNE1 Gm7432-201ENSMUST00000210343 879 ntBASIC24.03■■□□□ 1.44
SugctQ7TNE1 Lrrc59-201ENSMUST00000021239 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
SugctQ7TNE1 Spsb3-202ENSMUST00000068508 2004 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
SugctQ7TNE1 Gm17641-201ENSMUST00000166328 2350 ntBASIC24.02■■□□□ 1.44
SugctQ7TNE1 Ctage5-203ENSMUST00000170992 2785 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
SugctQ7TNE1 Capza2-201ENSMUST00000015877 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
SugctQ7TNE1 1700003F12Rik-202ENSMUST00000109709 704 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.02■■□□□ 1.44
SugctQ7TNE1 Glrx2-205ENSMUST00000145571 758 ntTSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
SugctQ7TNE1 AC163623.1-201ENSMUST00000213738 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.02■■□□□ 1.44
SugctQ7TNE1 1700003F12Rik-201ENSMUST00000045116 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
SugctQ7TNE1 Pgbd5-204ENSMUST00000140012 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
SugctQ7TNE1 Insc-208ENSMUST00000169913 2321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
SugctQ7TNE1 Slc1a5-201ENSMUST00000108496 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
SugctQ7TNE1 Sorcs2-202ENSMUST00000070720 2089 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
SugctQ7TNE1 St6galnac6-205ENSMUST00000113290 2402 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
SugctQ7TNE1 Kctd5-201ENSMUST00000017090 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
SugctQ7TNE1 Trim3-202ENSMUST00000106789 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
SugctQ7TNE1 2410022M11Rik-201ENSMUST00000186474 1911 ntBASIC24■■□□□ 1.43
SugctQ7TNE1 Scn1b-201ENSMUST00000098548 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
SugctQ7TNE1 Pou4f1-201ENSMUST00000053016 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
SugctQ7TNE1 Ccnl2-201ENSMUST00000030944 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
SugctQ7TNE1 Dbndd2-202ENSMUST00000069385 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
SugctQ7TNE1 Phlda3-201ENSMUST00000038945 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
SugctQ7TNE1 Rfxap-201ENSMUST00000044373 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
SugctQ7TNE1 Gtpbp2-201ENSMUST00000024748 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
SugctQ7TNE1 Nsun2-208ENSMUST00000176485 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
SugctQ7TNE1 Gm4419-202ENSMUST00000226239 1431 ntBASIC23.99■■□□□ 1.43
SugctQ7TNE1 Bean1-205ENSMUST00000212979 2131 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
SugctQ7TNE1 Rnf39-201ENSMUST00000040498 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
SugctQ7TNE1 Lrrc14-201ENSMUST00000036423 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
SugctQ7TNE1 Arhgef25-205ENSMUST00000218654 2475 ntTSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
SugctQ7TNE1 Abhd17c-201ENSMUST00000117085 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
SugctQ7TNE1 Ltk-201ENSMUST00000028759 3080 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
SugctQ7TNE1 Mast2-203ENSMUST00000106485 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
SugctQ7TNE1 Mast2-204ENSMUST00000106486 5723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
SugctQ7TNE1 Igfbp3-201ENSMUST00000020702 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
SugctQ7TNE1 Spats2-201ENSMUST00000063517 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
SugctQ7TNE1 Ccnyl1-203ENSMUST00000187170 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
SugctQ7TNE1 Arpc2-203ENSMUST00000113820 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
SugctQ7TNE1 Fbxl14-201ENSMUST00000032094 2963 ntAPPRIS P1 BASIC23.96■■□□□ 1.43
SugctQ7TNE1 Phf23-202ENSMUST00000101526 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
SugctQ7TNE1 Pcbd2-201ENSMUST00000021958 544 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
SugctQ7TNE1 Ptx3-201ENSMUST00000029421 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
SugctQ7TNE1 Klhl22-201ENSMUST00000117192 2754 ntTSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
SugctQ7TNE1 Med25-205ENSMUST00000207278 2287 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
SugctQ7TNE1 Insm2-201ENSMUST00000051857 2660 ntAPPRIS P1 BASIC23.94■■□□□ 1.42
SugctQ7TNE1 Ube2e3-201ENSMUST00000028398 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
SugctQ7TNE1 Foxo6-201ENSMUST00000102656 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
SugctQ7TNE1 Dbp-201ENSMUST00000080885 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
SugctQ7TNE1 Flot2-201ENSMUST00000072289 2621 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
SugctQ7TNE1 Adgrb1-202ENSMUST00000170845 2704 ntTSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
SugctQ7TNE1 Gng3-201ENSMUST00000096259 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
SugctQ7TNE1 Kctd2-201ENSMUST00000103035 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
SugctQ7TNE1 Tmem70-203ENSMUST00000177501 1636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
SugctQ7TNE1 Ubl3-204ENSMUST00000201595 2064 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
SugctQ7TNE1 Homer3-203ENSMUST00000110124 2445 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
SugctQ7TNE1 Impdh1-201ENSMUST00000078155 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
SugctQ7TNE1 Iscu-203ENSMUST00000112312 1116 ntTSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
SugctQ7TNE1 Slc17a7-201ENSMUST00000085374 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
SugctQ7TNE1 E330009J07Rik-201ENSMUST00000039008 1949 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
SugctQ7TNE1 Mef2a-203ENSMUST00000076325 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
SugctQ7TNE1 Rcor3-207ENSMUST00000192866 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
SugctQ7TNE1 1110065P20Rik-201ENSMUST00000106190 968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
SugctQ7TNE1 Smarcad1-211ENSMUST00000204696 734 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
SugctQ7TNE1 Grb2-201ENSMUST00000021090 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
SugctQ7TNE1 Mlycd-201ENSMUST00000098367 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
SugctQ7TNE1 Acvr2b-201ENSMUST00000035093 1729 ntTSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
SugctQ7TNE1 Tirap-207ENSMUST00000177129 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
SugctQ7TNE1 Purg-202ENSMUST00000078058 1795 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
SugctQ7TNE1 B230322F03Rik-201ENSMUST00000181932 1569 ntBASIC23.89■■□□□ 1.41
SugctQ7TNE1 Mta3-204ENSMUST00000112352 2674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
SugctQ7TNE1 Carm1-201ENSMUST00000034703 3220 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
SugctQ7TNE1 Phactr2-202ENSMUST00000105543 2735 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
SugctQ7TNE1 Manf-202ENSMUST00000159283 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
SugctQ7TNE1 Nckap5los-201ENSMUST00000159738 1712 ntTSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
SugctQ7TNE1 Bcl7b-202ENSMUST00000111187 564 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
SugctQ7TNE1 Hmgn3-202ENSMUST00000162246 983 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
SugctQ7TNE1 Gm28592-201ENSMUST00000186844 741 ntTSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
SugctQ7TNE1 Gm37136-201ENSMUST00000194368 194 ntBASIC23.88■■□□□ 1.41
SugctQ7TNE1 Terf2-204ENSMUST00000133925 2666 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
SugctQ7TNE1 Otud5-204ENSMUST00000115667 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
SugctQ7TNE1 Klc1-201ENSMUST00000084941 2504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
SugctQ7TNE1 Brf1-201ENSMUST00000011302 2615 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 10 ms