Protein–RNA interactions for Protein: Q6PJN8

Dalrd3, DALR anticodon-binding domain-containing protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 538 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Dalrd3Q6PJN8 Gt(ROSA)26Sor-201ENSMUST00000124246 1181 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Dalrd3Q6PJN8 Lsm4-201ENSMUST00000034311 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Dalrd3Q6PJN8 Nelfe-201ENSMUST00000097343 1607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
Dalrd3Q6PJN8 Ethe1-201ENSMUST00000077191 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Dalrd3Q6PJN8 Eif4ebp1-201ENSMUST00000033880 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Dalrd3Q6PJN8 Gm26533-201ENSMUST00000180550 1790 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Dalrd3Q6PJN8 Gm45444-201ENSMUST00000211394 898 ntBASIC24.3■■□□□ 1.48
Dalrd3Q6PJN8 Gm17494-201ENSMUST00000072769 1800 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Dalrd3Q6PJN8 Eid1-201ENSMUST00000164756 1691 ntAPPRIS P1 BASIC24.3■■□□□ 1.48
Dalrd3Q6PJN8 A830010M20Rik-207ENSMUST00000162298 1408 ntTSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
Dalrd3Q6PJN8 Gm43592-201ENSMUST00000196922 1165 ntBASIC24.29■■□□□ 1.48
Dalrd3Q6PJN8 Rpl34-201ENSMUST00000062601 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Dalrd3Q6PJN8 Gm16286-202ENSMUST00000125127 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Dalrd3Q6PJN8 Mta3-201ENSMUST00000067826 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Dalrd3Q6PJN8 Shf-203ENSMUST00000110531 1557 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
Dalrd3Q6PJN8 Tmpo-205ENSMUST00000105293 1842 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Dalrd3Q6PJN8 Iffo2-203ENSMUST00000174078 5716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Dalrd3Q6PJN8 Hoxb3-201ENSMUST00000055334 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Dalrd3Q6PJN8 March5-202ENSMUST00000112391 1293 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Dalrd3Q6PJN8 Foxe3-201ENSMUST00000050940 867 ntAPPRIS P1 BASIC24.28■■□□□ 1.48
Dalrd3Q6PJN8 Mtch1-202ENSMUST00000118366 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Dalrd3Q6PJN8 Ppp1ca-201ENSMUST00000046094 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Dalrd3Q6PJN8 Clk2-201ENSMUST00000090927 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Dalrd3Q6PJN8 Dtnb-211ENSMUST00000173240 2218 ntTSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
Dalrd3Q6PJN8 Eif5a-213ENSMUST00000164359 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
Dalrd3Q6PJN8 4930597O21Rik-201ENSMUST00000065878 984 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Dalrd3Q6PJN8 Gm9959-201ENSMUST00000068277 390 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
Dalrd3Q6PJN8 Tmem150b-201ENSMUST00000086363 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Dalrd3Q6PJN8 Cadm1-206ENSMUST00000143026 1643 ntTSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
Dalrd3Q6PJN8 Hdac3-201ENSMUST00000043498 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Dalrd3Q6PJN8 Ppp1cb-206ENSMUST00000202078 383 ntTSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
Dalrd3Q6PJN8 Hagh-201ENSMUST00000024974 1101 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
Dalrd3Q6PJN8 D17Wsu92e-201ENSMUST00000075076 1470 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Dalrd3Q6PJN8 Cdc42ep5-201ENSMUST00000076831 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Dalrd3Q6PJN8 Tmem238-201ENSMUST00000168578 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Dalrd3Q6PJN8 Mapkap1-202ENSMUST00000113124 1758 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
Dalrd3Q6PJN8 Gm20684-201ENSMUST00000176744 380 ntTSL 3 BASIC24.24■■□□□ 1.47
Dalrd3Q6PJN8 Dhrs11-201ENSMUST00000047560 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Dalrd3Q6PJN8 Pdf-201ENSMUST00000055316 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Dalrd3Q6PJN8 March2-203ENSMUST00000172767 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Dalrd3Q6PJN8 Ube2i-206ENSMUST00000172618 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Dalrd3Q6PJN8 Tmem150a-202ENSMUST00000132243 1478 ntTSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
Dalrd3Q6PJN8 Cckbr-202ENSMUST00000181339 1326 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Dalrd3Q6PJN8 Pkig-202ENSMUST00000099105 640 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
Dalrd3Q6PJN8 Ryk-203ENSMUST00000175883 2505 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Dalrd3Q6PJN8 Gm18755-201ENSMUST00000218030 1099 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
Dalrd3Q6PJN8 Nenf-201ENSMUST00000046770 742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Dalrd3Q6PJN8 E030037K01Rik-201ENSMUST00000180928 1756 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
Dalrd3Q6PJN8 Jdp2-201ENSMUST00000050687 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Dalrd3Q6PJN8 Hrh3-205ENSMUST00000165762 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
Dalrd3Q6PJN8 Zfp358-201ENSMUST00000061508 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Dalrd3Q6PJN8 Ctbp1-201ENSMUST00000079746 2279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Dalrd3Q6PJN8 Fn1-208ENSMUST00000186940 1350 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Dalrd3Q6PJN8 Pgls-205ENSMUST00000143441 1062 ntTSL 3 BASIC24.19■■□□□ 1.46
Dalrd3Q6PJN8 Fam168b-204ENSMUST00000170092 941 ntTSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
Dalrd3Q6PJN8 Pcf11-204ENSMUST00000208058 461 ntTSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
Dalrd3Q6PJN8 Pate2-201ENSMUST00000098906 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
Dalrd3Q6PJN8 Gm9767-201ENSMUST00000041011 1193 ntAPPRIS P1 BASIC24.18■■□□□ 1.46
Dalrd3Q6PJN8 Polr1d-201ENSMUST00000050970 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Dalrd3Q6PJN8 Kcnip3-202ENSMUST00000088538 1296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Dalrd3Q6PJN8 D730045B01Rik-202ENSMUST00000186838 1543 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Dalrd3Q6PJN8 Gm43445-201ENSMUST00000198564 2091 ntBASIC24.17■■□□□ 1.46
Dalrd3Q6PJN8 E130218I03Rik-208ENSMUST00000144222 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Dalrd3Q6PJN8 Dnttip1-201ENSMUST00000017443 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Dalrd3Q6PJN8 Ube2k-206ENSMUST00000201984 1449 ntTSL 3 BASIC24.17■■□□□ 1.46
Dalrd3Q6PJN8 Micu3-201ENSMUST00000068999 2219 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
Dalrd3Q6PJN8 Phf23-201ENSMUST00000018716 2006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Dalrd3Q6PJN8 Usp2-206ENSMUST00000176416 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Dalrd3Q6PJN8 Gm16599-201ENSMUST00000148082 1182 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Dalrd3Q6PJN8 Ramp1-202ENSMUST00000165855 852 ntTSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
Dalrd3Q6PJN8 1700016K19Rik-201ENSMUST00000066408 921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Dalrd3Q6PJN8 Barx1-201ENSMUST00000021813 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Dalrd3Q6PJN8 Eed-201ENSMUST00000107234 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
Dalrd3Q6PJN8 Kctd6-201ENSMUST00000022272 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Dalrd3Q6PJN8 Ipmk-203ENSMUST00000121446 1492 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
Dalrd3Q6PJN8 Ntn5-203ENSMUST00000183120 1491 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Dalrd3Q6PJN8 Pfdn4-204ENSMUST00000109148 736 ntTSL 3 BASIC24.13■■□□□ 1.45
Dalrd3Q6PJN8 Pi16-201ENSMUST00000114699 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Dalrd3Q6PJN8 AC117245.1-201ENSMUST00000215481 566 ntTSL 3 BASIC24.13■■□□□ 1.45
Dalrd3Q6PJN8 Vegfb-201ENSMUST00000025914 1281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Dalrd3Q6PJN8 Gm26536-201ENSMUST00000181072 1196 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Dalrd3Q6PJN8 4921531C22Rik-201ENSMUST00000150145 1905 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Dalrd3Q6PJN8 Phf23-205ENSMUST00000135814 2214 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Dalrd3Q6PJN8 Dazap1-201ENSMUST00000092305 1994 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Dalrd3Q6PJN8 Sh3gl3-201ENSMUST00000032874 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Dalrd3Q6PJN8 Arl8a-201ENSMUST00000027684 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Dalrd3Q6PJN8 Ndfip1-201ENSMUST00000025293 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Dalrd3Q6PJN8 Cetn4-201ENSMUST00000071400 1808 ntTSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
Dalrd3Q6PJN8 A230020J21Rik-202ENSMUST00000192407 1649 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
Dalrd3Q6PJN8 Tmem120b-202ENSMUST00000111619 1256 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Dalrd3Q6PJN8 Hecw2-202ENSMUST00000097741 1132 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Dalrd3Q6PJN8 Mir155hg-202ENSMUST00000185662 1362 ntTSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
Dalrd3Q6PJN8 Mpnd-208ENSMUST00000159996 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
Dalrd3Q6PJN8 Lrfn1-203ENSMUST00000189877 1852 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
Dalrd3Q6PJN8 Fam196a-201ENSMUST00000171394 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
Dalrd3Q6PJN8 Dyrk1a-202ENSMUST00000119878 5759 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
Dalrd3Q6PJN8 Marveld2-202ENSMUST00000163163 2187 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Dalrd3Q6PJN8 Ctxn1-201ENSMUST00000053252 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Dalrd3Q6PJN8 Galnt12-201ENSMUST00000045041 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
Dalrd3Q6PJN8 AC122379.1-201ENSMUST00000220658 355 ntTSL 3 BASIC24.07■■□□□ 1.44
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 102.5 ms