Protein–RNA interactions for Protein: Q6PHN1

Ccdc57, Coiled-coil domain-containing protein 57, mousemouse

Predictions only

Length 1,016 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc57Q6PHN1 Kmt5a-201ENSMUST00000059580 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Ccdc57Q6PHN1 E130309D02Rik-201ENSMUST00000046418 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Ccdc57Q6PHN1 Esyt2-201ENSMUST00000100986 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Ccdc57Q6PHN1 Rbmxl2-201ENSMUST00000098135 1472 ntAPPRIS P1 BASIC24.52■■□□□ 1.52
Ccdc57Q6PHN1 Msl1-203ENSMUST00000107485 2091 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Ccdc57Q6PHN1 Mid2-201ENSMUST00000112988 2525 ntTSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
Ccdc57Q6PHN1 Gna13-202ENSMUST00000106702 914 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Ccdc57Q6PHN1 Mxd4-202ENSMUST00000119171 1160 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Ccdc57Q6PHN1 Hook1-201ENSMUST00000030306 5517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Ccdc57Q6PHN1 Fam149b-202ENSMUST00000051915 1981 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
Ccdc57Q6PHN1 Phactr2-202ENSMUST00000105543 2735 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Ccdc57Q6PHN1 Ubac1-201ENSMUST00000036509 1852 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Ccdc57Q6PHN1 Ing1-201ENSMUST00000054399 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Ccdc57Q6PHN1 Nxph3-201ENSMUST00000058866 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Ccdc57Q6PHN1 Ube2e3-201ENSMUST00000028398 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Ccdc57Q6PHN1 Tmpo-205ENSMUST00000105293 1842 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Ccdc57Q6PHN1 Dcaf15-201ENSMUST00000041367 2312 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Ccdc57Q6PHN1 6330403L08Rik-202ENSMUST00000187923 5522 ntBASIC24.51■■□□□ 1.51
Ccdc57Q6PHN1 D730045B01Rik-202ENSMUST00000186838 1543 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Ccdc57Q6PHN1 Vkorc1l1-201ENSMUST00000051758 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Ccdc57Q6PHN1 Zfp768-202ENSMUST00000205266 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
Ccdc57Q6PHN1 Gm27021-201ENSMUST00000181333 758 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC24.5■■□□□ 1.51
Ccdc57Q6PHN1 Epb41l4b-201ENSMUST00000030142 3247 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Ccdc57Q6PHN1 Tsen34-211ENSMUST00000205287 1375 ntTSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
Ccdc57Q6PHN1 Pate2-201ENSMUST00000098906 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
Ccdc57Q6PHN1 Rpl31-203ENSMUST00000179954 630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Ccdc57Q6PHN1 Syndig1l-204ENSMUST00000222422 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Ccdc57Q6PHN1 Tspan33-202ENSMUST00000115250 1977 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Ccdc57Q6PHN1 Tsen34-204ENSMUST00000108630 1779 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Ccdc57Q6PHN1 Hrk-201ENSMUST00000054836 5382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Ccdc57Q6PHN1 Sntb1-202ENSMUST00000110200 1225 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Ccdc57Q6PHN1 Gm11175-201ENSMUST00000116172 543 ntBASIC24.47■■□□□ 1.51
Ccdc57Q6PHN1 Fam89b-202ENSMUST00000116558 1189 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Ccdc57Q6PHN1 Gm13889-202ENSMUST00000148314 1240 ntAPPRIS P1 BASIC24.47■■□□□ 1.51
Ccdc57Q6PHN1 Gm19582-201ENSMUST00000187511 841 ntTSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
Ccdc57Q6PHN1 Whrn-202ENSMUST00000063672 2804 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Ccdc57Q6PHN1 Suds3-201ENSMUST00000086471 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Ccdc57Q6PHN1 Shb-201ENSMUST00000061986 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Ccdc57Q6PHN1 Lrp2-202ENSMUST00000092551 2228 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Ccdc57Q6PHN1 Usp21-203ENSMUST00000111306 2185 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Ccdc57Q6PHN1 Usp48-205ENSMUST00000105840 5741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
Ccdc57Q6PHN1 Fam3c-201ENSMUST00000081288 1487 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
Ccdc57Q6PHN1 Foxe1-201ENSMUST00000095097 2804 ntAPPRIS P1 BASIC24.44■■□□□ 1.5
Ccdc57Q6PHN1 Fank1-204ENSMUST00000209511 1392 ntTSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
Ccdc57Q6PHN1 Ccnd3-205ENSMUST00000182209 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Ccdc57Q6PHN1 Sys1-201ENSMUST00000072452 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Ccdc57Q6PHN1 Phf23-202ENSMUST00000101526 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Ccdc57Q6PHN1 Arhgap9-203ENSMUST00000219026 1946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Ccdc57Q6PHN1 Fbxl14-201ENSMUST00000032094 2963 ntAPPRIS P1 BASIC24.43■■□□□ 1.5
Ccdc57Q6PHN1 Gas1-202ENSMUST00000223933 1155 ntAPPRIS P2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
Ccdc57Q6PHN1 Pard6a-201ENSMUST00000093195 1265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Ccdc57Q6PHN1 Lsr-201ENSMUST00000001279 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Ccdc57Q6PHN1 Otulin-201ENSMUST00000059662 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Ccdc57Q6PHN1 Lmo2-203ENSMUST00000111143 1654 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Ccdc57Q6PHN1 Vdac2-201ENSMUST00000022293 1954 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Ccdc57Q6PHN1 Agps-202ENSMUST00000111952 2589 ntTSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
Ccdc57Q6PHN1 C130046K22Rik-201ENSMUST00000129780 727 ntTSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
Ccdc57Q6PHN1 Cadm1-210ENSMUST00000214542 899 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Ccdc57Q6PHN1 Trappc6b-203ENSMUST00000217863 797 ntTSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
Ccdc57Q6PHN1 Mtor-201ENSMUST00000057580 1003 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Ccdc57Q6PHN1 Spsb3-205ENSMUST00000120943 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Ccdc57Q6PHN1 Cadps-203ENSMUST00000112658 5458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Ccdc57Q6PHN1 Pm20d2-202ENSMUST00000119167 1339 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Ccdc57Q6PHN1 Nsun2-208ENSMUST00000176485 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
Ccdc57Q6PHN1 Ubtf-210ENSMUST00000174302 4692 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
Ccdc57Q6PHN1 Chtf8-205ENSMUST00000176515 694 ntTSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
Ccdc57Q6PHN1 Apcdd1-201ENSMUST00000096554 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Ccdc57Q6PHN1 Tgfbrap1-202ENSMUST00000186694 5385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Ccdc57Q6PHN1 Mta3-201ENSMUST00000067826 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
Ccdc57Q6PHN1 Krtap28-13-201ENSMUST00000188005 992 ntAPPRIS P1 BASIC24.39■■□□□ 1.49
Ccdc57Q6PHN1 Med25-205ENSMUST00000207278 2287 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Ccdc57Q6PHN1 Shf-203ENSMUST00000110531 1557 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
Ccdc57Q6PHN1 Suv39h2-202ENSMUST00000060618 1831 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Ccdc57Q6PHN1 Mir6538-201ENSMUST00000183713 110 ntBASIC24.38■■□□□ 1.49
Ccdc57Q6PHN1 Ctdspl-201ENSMUST00000073109 4589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Ccdc57Q6PHN1 Dedd-204ENSMUST00000111300 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Ccdc57Q6PHN1 E130218I03Rik-204ENSMUST00000131447 888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
Ccdc57Q6PHN1 Kcnk12-201ENSMUST00000055221 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Ccdc57Q6PHN1 P4ha3-201ENSMUST00000057023 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Ccdc57Q6PHN1 Hoxb9-201ENSMUST00000000010 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Ccdc57Q6PHN1 Nrarp-201ENSMUST00000104999 2582 ntAPPRIS P1 BASIC24.37■■□□□ 1.49
Ccdc57Q6PHN1 Insm2-201ENSMUST00000051857 2660 ntAPPRIS P1 BASIC24.37■■□□□ 1.49
Ccdc57Q6PHN1 Mapkap1-202ENSMUST00000113124 1758 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
Ccdc57Q6PHN1 Pdss1-201ENSMUST00000053729 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Ccdc57Q6PHN1 Aebp2-203ENSMUST00000095350 2575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Ccdc57Q6PHN1 Smagp-202ENSMUST00000172334 952 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
Ccdc57Q6PHN1 E130304I02Rik-202ENSMUST00000187873 696 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Ccdc57Q6PHN1 Btbd2-202ENSMUST00000126980 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
Ccdc57Q6PHN1 Kcnc3-202ENSMUST00000107907 5281 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
Ccdc57Q6PHN1 Cadm1-209ENSMUST00000152459 1784 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Ccdc57Q6PHN1 Prr5-201ENSMUST00000065499 1830 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Ccdc57Q6PHN1 Cys1-207ENSMUST00000186602 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Ccdc57Q6PHN1 Snx3-203ENSMUST00000105500 753 ntTSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
Ccdc57Q6PHN1 Notum-202ENSMUST00000106177 2212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
Ccdc57Q6PHN1 Pan3-209ENSMUST00000176600 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
Ccdc57Q6PHN1 1810049J17Rik-201ENSMUST00000180521 462 ntAPPRIS P1 BASIC24.33■■□□□ 1.49
Ccdc57Q6PHN1 Zdhhc2-205ENSMUST00000167766 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Ccdc57Q6PHN1 Slc16a11-211ENSMUST00000171032 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
Ccdc57Q6PHN1 Hoxb3os-202ENSMUST00000147410 1945 ntTSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
Ccdc57Q6PHN1 Csrp1-201ENSMUST00000027677 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 56 ms