Protein–RNA interactions for Protein: Q6PDZ2

Taf1c, TATA box-binding protein-associated factor RNA polymerase I subunit C, mousemouse

Predictions only

Length 836 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Taf1cQ6PDZ2 Upf3a-201ENSMUST00000043767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Taf1cQ6PDZ2 Kctd6-201ENSMUST00000022272 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Taf1cQ6PDZ2 Mir6538-201ENSMUST00000183713 110 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
Taf1cQ6PDZ2 AC153911.1-201ENSMUST00000220378 758 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
Taf1cQ6PDZ2 Hoxc13-201ENSMUST00000001700 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Taf1cQ6PDZ2 Cln6-201ENSMUST00000034776 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Taf1cQ6PDZ2 Gm11687-201ENSMUST00000118911 886 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
Taf1cQ6PDZ2 Ankrd49-205ENSMUST00000216037 1037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
Taf1cQ6PDZ2 Kif1c-205ENSMUST00000152618 1943 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Taf1cQ6PDZ2 Efcc1-202ENSMUST00000159570 2293 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.26
Taf1cQ6PDZ2 Vmac-201ENSMUST00000067931 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
Taf1cQ6PDZ2 Jmjd6-201ENSMUST00000047616 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Taf1cQ6PDZ2 Tmem70-203ENSMUST00000177501 1636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Taf1cQ6PDZ2 Sdccag3-202ENSMUST00000077983 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Taf1cQ6PDZ2 Eya2-202ENSMUST00000088132 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Taf1cQ6PDZ2 2310061I04Rik-202ENSMUST00000146451 2081 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Taf1cQ6PDZ2 Slc25a33-201ENSMUST00000105686 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Taf1cQ6PDZ2 Kctd2-201ENSMUST00000103035 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Taf1cQ6PDZ2 A030005K14Rik-201ENSMUST00000193762 1093 ntAPPRIS P1 BASIC22.87■■□□□ 1.25
Taf1cQ6PDZ2 4930597O21Rik-201ENSMUST00000065878 984 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Taf1cQ6PDZ2 A830010M20Rik-207ENSMUST00000162298 1408 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
Taf1cQ6PDZ2 Prrx2-201ENSMUST00000041659 1441 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Taf1cQ6PDZ2 Gm9910-201ENSMUST00000195385 1550 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
Taf1cQ6PDZ2 Unc119-203ENSMUST00000108295 1371 ntTSL 3 BASIC22.87■■□□□ 1.25
Taf1cQ6PDZ2 Gm15688-201ENSMUST00000161394 2418 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Taf1cQ6PDZ2 A530095I07Rik-201ENSMUST00000070942 847 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Taf1cQ6PDZ2 Terc-201ENSMUST00000082862 423 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
Taf1cQ6PDZ2 Hoxd9-201ENSMUST00000059272 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Taf1cQ6PDZ2 Npas1-201ENSMUST00000002053 2091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Taf1cQ6PDZ2 Hacd1-202ENSMUST00000091429 871 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Taf1cQ6PDZ2 Fads2-201ENSMUST00000025567 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Taf1cQ6PDZ2 Eva1b-202ENSMUST00000106150 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Taf1cQ6PDZ2 AC158592.1-201ENSMUST00000215560 1113 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Taf1cQ6PDZ2 Prph-202ENSMUST00000047104 1865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Taf1cQ6PDZ2 Lpcat4-201ENSMUST00000028554 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Taf1cQ6PDZ2 Gm10499-202ENSMUST00000174778 1698 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
Taf1cQ6PDZ2 Tspan33-202ENSMUST00000115250 1977 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Taf1cQ6PDZ2 Tsen34-204ENSMUST00000108630 1779 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Taf1cQ6PDZ2 Hdac2-201ENSMUST00000019911 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Taf1cQ6PDZ2 Ildr2-206ENSMUST00000194964 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Taf1cQ6PDZ2 AC125444.1-201ENSMUST00000223536 639 ntAPPRIS P1 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Taf1cQ6PDZ2 Rbm45-201ENSMUST00000046389 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Taf1cQ6PDZ2 Hoxb3-201ENSMUST00000055334 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Taf1cQ6PDZ2 Ier5l-201ENSMUST00000065134 2683 ntAPPRIS P1 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Taf1cQ6PDZ2 Ei24-201ENSMUST00000115086 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Taf1cQ6PDZ2 2510039O18Rik-201ENSMUST00000103232 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Taf1cQ6PDZ2 Nrsn1-201ENSMUST00000057866 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Taf1cQ6PDZ2 Gpr25-201ENSMUST00000086395 1077 ntAPPRIS P1 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Taf1cQ6PDZ2 Gm20208-202ENSMUST00000219905 1528 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Taf1cQ6PDZ2 Mxra7-201ENSMUST00000021170 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Taf1cQ6PDZ2 Vamp4-206ENSMUST00000150040 901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Taf1cQ6PDZ2 Gm16049-201ENSMUST00000155166 616 ntTSL 3 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Taf1cQ6PDZ2 Dleu2-204ENSMUST00000182286 666 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Taf1cQ6PDZ2 Dleu2-213ENSMUST00000183245 637 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Taf1cQ6PDZ2 Runx2os1-201ENSMUST00000097320 792 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Taf1cQ6PDZ2 Rasgef1c-203ENSMUST00000093142 2216 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Taf1cQ6PDZ2 Txndc9-207ENSMUST00000195032 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Taf1cQ6PDZ2 Mlf2-202ENSMUST00000180095 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Taf1cQ6PDZ2 Slc16a11-201ENSMUST00000094055 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Taf1cQ6PDZ2 4930426D05Rik-204ENSMUST00000144487 1393 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Taf1cQ6PDZ2 Gm16286-202ENSMUST00000125127 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Taf1cQ6PDZ2 Psmg1-201ENSMUST00000023630 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Taf1cQ6PDZ2 Zdhhc2-205ENSMUST00000167766 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Taf1cQ6PDZ2 Kcnk2-205ENSMUST00000192723 1642 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Taf1cQ6PDZ2 Psmb8-201ENSMUST00000025196 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Taf1cQ6PDZ2 Nisch-222ENSMUST00000172142 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Taf1cQ6PDZ2 Kcnq5-206ENSMUST00000173404 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Taf1cQ6PDZ2 Hmox2-202ENSMUST00000118885 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Taf1cQ6PDZ2 Slc50a1-201ENSMUST00000029565 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Taf1cQ6PDZ2 Tceal6-201ENSMUST00000033783 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Taf1cQ6PDZ2 Id3-201ENSMUST00000008016 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Taf1cQ6PDZ2 Ube2k-203ENSMUST00000201266 1449 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Taf1cQ6PDZ2 Ttc9-201ENSMUST00000036116 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Taf1cQ6PDZ2 Fam220a-204ENSMUST00000119488 2202 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Taf1cQ6PDZ2 Fam220a-209ENSMUST00000200267 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Taf1cQ6PDZ2 Epop-201ENSMUST00000052281 2314 ntAPPRIS P1 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Taf1cQ6PDZ2 Hecw2-202ENSMUST00000097741 1132 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Taf1cQ6PDZ2 Arpc2-201ENSMUST00000006467 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Taf1cQ6PDZ2 Asf1a-201ENSMUST00000020004 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Taf1cQ6PDZ2 Ankrd28-201ENSMUST00000014640 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Taf1cQ6PDZ2 Slc44a1-203ENSMUST00000107646 1974 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Taf1cQ6PDZ2 Tbc1d25-203ENSMUST00000143984 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Taf1cQ6PDZ2 Slc22a17-201ENSMUST00000050772 2290 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Taf1cQ6PDZ2 Gm21989-201ENSMUST00000174530 1609 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Taf1cQ6PDZ2 Dctpp1-201ENSMUST00000035276 676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Taf1cQ6PDZ2 Rnf149-201ENSMUST00000062525 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Taf1cQ6PDZ2 Pdpk1-203ENSMUST00000115407 1730 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Taf1cQ6PDZ2 Ethe1-201ENSMUST00000077191 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Taf1cQ6PDZ2 Vegfb-202ENSMUST00000130048 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Taf1cQ6PDZ2 Zfp91-201ENSMUST00000038627 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Taf1cQ6PDZ2 Dnajc21-201ENSMUST00000136591 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Taf1cQ6PDZ2 Inafm1-201ENSMUST00000169612 1605 ntAPPRIS P1 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Taf1cQ6PDZ2 Wbp1-208ENSMUST00000151393 837 ntTSL 3 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Taf1cQ6PDZ2 Gm28529-202ENSMUST00000189675 670 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Taf1cQ6PDZ2 Cox11-201ENSMUST00000020851 1224 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Taf1cQ6PDZ2 Fra10ac1-201ENSMUST00000067167 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Taf1cQ6PDZ2 Fam181b-201ENSMUST00000051179 2003 ntAPPRIS P1 BASIC22.7■■□□□ 1.23
Taf1cQ6PDZ2 Fam220a-201ENSMUST00000067145 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
Taf1cQ6PDZ2 Spsb3-205ENSMUST00000120943 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Taf1cQ6PDZ2 Gm38287-201ENSMUST00000195193 2051 ntTSL 3 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 46.9 ms