Protein–RNA interactions for Protein: Q6P9K9

Nrxn3, Neurexin-3, mousemouse

Predictions only

Length 1,571 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nrxn3Q6P9K9 Hdac3-201ENSMUST00000043498 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.38■■■□□ 2.77
Nrxn3Q6P9K9 Ankrd49-205ENSMUST00000216037 1037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.38■■■□□ 2.77
Nrxn3Q6P9K9 Eif4ebp1-201ENSMUST00000033880 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.38■■■□□ 2.77
Nrxn3Q6P9K9 Gm28417-202ENSMUST00000185881 538 ntTSL 3 BASIC32.37■■■□□ 2.77
Nrxn3Q6P9K9 1700016K19Rik-201ENSMUST00000066408 921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.37■■■□□ 2.77
Nrxn3Q6P9K9 Mtch1-202ENSMUST00000118366 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.37■■■□□ 2.77
Nrxn3Q6P9K9 Jdp2-201ENSMUST00000050687 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.37■■■□□ 2.77
Nrxn3Q6P9K9 Hoxb3-201ENSMUST00000055334 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.37■■■□□ 2.77
Nrxn3Q6P9K9 Gm42501-201ENSMUST00000200220 1026 ntBASIC32.36■■■□□ 2.77
Nrxn3Q6P9K9 AC122379.1-201ENSMUST00000220658 355 ntTSL 3 BASIC32.36■■■□□ 2.77
Nrxn3Q6P9K9 Gm14121-201ENSMUST00000121441 1380 ntBASIC32.35■■■□□ 2.77
Nrxn3Q6P9K9 Hrh3-205ENSMUST00000165762 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.35■■■□□ 2.77
Nrxn3Q6P9K9 Cckbr-202ENSMUST00000181339 1326 ntTSL 1 (best) BASIC32.35■■■□□ 2.77
Nrxn3Q6P9K9 Galnt12-202ENSMUST00000107744 2077 ntTSL 1 (best) BASIC32.35■■■□□ 2.77
Nrxn3Q6P9K9 Shf-203ENSMUST00000110531 1557 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC32.35■■■□□ 2.77
Nrxn3Q6P9K9 Ube2i-206ENSMUST00000172618 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.35■■■□□ 2.77
Nrxn3Q6P9K9 Gm16286-202ENSMUST00000125127 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.34■■■□□ 2.77
Nrxn3Q6P9K9 Ccdc85c-201ENSMUST00000136175 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.34■■■□□ 2.77
Nrxn3Q6P9K9 Pfdn4-204ENSMUST00000109148 736 ntTSL 3 BASIC32.34■■■□□ 2.77
Nrxn3Q6P9K9 Vax1-201ENSMUST00000172821 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.33■■■□□ 2.77
Nrxn3Q6P9K9 Dynlt1f-201ENSMUST00000179554 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.33■■■□□ 2.77
Nrxn3Q6P9K9 Gm9767-201ENSMUST00000041011 1193 ntAPPRIS P1 BASIC32.33■■■□□ 2.77
Nrxn3Q6P9K9 Tmpo-205ENSMUST00000105293 1842 ntTSL 1 (best) BASIC32.33■■■□□ 2.77
Nrxn3Q6P9K9 Ube2k-206ENSMUST00000201984 1449 ntTSL 3 BASIC32.31■■■□□ 2.76
Nrxn3Q6P9K9 Ipmk-203ENSMUST00000121446 1492 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.31■■■□□ 2.76
Nrxn3Q6P9K9 B4galt7-202ENSMUST00000100764 2195 ntTSL 1 (best) BASIC32.3■■■□□ 2.76
Nrxn3Q6P9K9 Gm26533-201ENSMUST00000180550 1790 ntTSL 1 (best) BASIC32.3■■■□□ 2.76
Nrxn3Q6P9K9 Ntn5-203ENSMUST00000183120 1491 ntTSL 1 (best) BASIC32.3■■■□□ 2.76
Nrxn3Q6P9K9 March5-202ENSMUST00000112391 1293 ntTSL 1 (best) BASIC32.3■■■□□ 2.76
Nrxn3Q6P9K9 Eif5a-213ENSMUST00000164359 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.3■■■□□ 2.76
Nrxn3Q6P9K9 Smco4-203ENSMUST00000215907 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.3■■■□□ 2.76
Nrxn3Q6P9K9 Sh3gl3-201ENSMUST00000032874 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.3■■■□□ 2.76
Nrxn3Q6P9K9 Galnt10-202ENSMUST00000108846 1745 ntTSL 1 (best) BASIC32.29■■■□□ 2.76
Nrxn3Q6P9K9 Cyp2r1-202ENSMUST00000119712 917 ntTSL 5 BASIC32.28■■■□□ 2.76
Nrxn3Q6P9K9 Fam168b-204ENSMUST00000170092 941 ntTSL 5 BASIC32.28■■■□□ 2.76
Nrxn3Q6P9K9 Zfp346-203ENSMUST00000159278 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.28■■■□□ 2.76
Nrxn3Q6P9K9 Arhgap39-204ENSMUST00000176219 542 ntTSL 5 BASIC32.28■■■□□ 2.76
Nrxn3Q6P9K9 Gm18755-201ENSMUST00000218030 1099 ntBASIC32.28■■■□□ 2.76
Nrxn3Q6P9K9 Gm26859-201ENSMUST00000181743 1852 ntTSL 5 BASIC32.27■■■□□ 2.76
Nrxn3Q6P9K9 Eed-201ENSMUST00000107234 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.27■■■□□ 2.76
Nrxn3Q6P9K9 Phf23-201ENSMUST00000018716 2006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.27■■■□□ 2.76
Nrxn3Q6P9K9 Fgf8-206ENSMUST00000111928 1056 ntTSL 1 (best) BASIC32.27■■■□□ 2.76
Nrxn3Q6P9K9 Noxo1-201ENSMUST00000019464 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.26■■■□□ 2.76
Nrxn3Q6P9K9 Barx1-201ENSMUST00000021813 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.26■■■□□ 2.76
Nrxn3Q6P9K9 Ctxn1-201ENSMUST00000053252 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.26■■■□□ 2.75
Nrxn3Q6P9K9 Pgp-201ENSMUST00000053024 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.25■■■□□ 2.75
Nrxn3Q6P9K9 Dazap1-201ENSMUST00000092305 1994 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC32.24■■■□□ 2.75
Nrxn3Q6P9K9 Usp2-206ENSMUST00000176416 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.24■■■□□ 2.75
Nrxn3Q6P9K9 Ech1-201ENSMUST00000066264 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.24■■■□□ 2.75
Nrxn3Q6P9K9 Pdf-201ENSMUST00000055316 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.23■■■□□ 2.75
Nrxn3Q6P9K9 Mpnd-208ENSMUST00000159996 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.22■■■□□ 2.75
Nrxn3Q6P9K9 Ythdf1-202ENSMUST00000108876 2272 ntTSL 1 (best) BASIC32.22■■■□□ 2.75
Nrxn3Q6P9K9 Fn1-208ENSMUST00000186940 1350 ntTSL 1 (best) BASIC32.22■■■□□ 2.75
Nrxn3Q6P9K9 Raly-201ENSMUST00000029120 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.21■■■□□ 2.75
Nrxn3Q6P9K9 Kctd6-201ENSMUST00000022272 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.21■■■□□ 2.75
Nrxn3Q6P9K9 Ric1-206ENSMUST00000162184 2157 ntTSL 1 (best) BASIC32.21■■■□□ 2.75
Nrxn3Q6P9K9 AC117245.1-201ENSMUST00000215481 566 ntTSL 3 BASIC32.2■■■□□ 2.75
Nrxn3Q6P9K9 Gm17494-201ENSMUST00000072769 1800 ntTSL 1 (best) BASIC32.2■■■□□ 2.75
Nrxn3Q6P9K9 Pate2-201ENSMUST00000098906 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC32.2■■■□□ 2.74
Nrxn3Q6P9K9 D730045B01Rik-202ENSMUST00000186838 1543 ntTSL 1 (best) BASIC32.19■■■□□ 2.74
Nrxn3Q6P9K9 C1qtnf5-203ENSMUST00000114818 1337 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.19■■■□□ 2.74
Nrxn3Q6P9K9 Adprhl2-201ENSMUST00000102617 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.17■■■□□ 2.74
Nrxn3Q6P9K9 Slc37a3-211ENSMUST00000202749 434 ntTSL 5 BASIC32.17■■■□□ 2.74
Nrxn3Q6P9K9 Arl8a-201ENSMUST00000027684 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.17■■■□□ 2.74
Nrxn3Q6P9K9 A230020J21Rik-202ENSMUST00000192407 1649 ntTSL 2 BASIC32.16■■■□□ 2.74
Nrxn3Q6P9K9 Pfdn2-202ENSMUST00000135941 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.16■■■□□ 2.74
Nrxn3Q6P9K9 Ost4-202ENSMUST00000132253 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.15■■■□□ 2.74
Nrxn3Q6P9K9 Rundc3b-202ENSMUST00000115378 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.15■■■□□ 2.74
Nrxn3Q6P9K9 Rundc3a-201ENSMUST00000006750 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.15■■■□□ 2.74
Nrxn3Q6P9K9 Clk2-201ENSMUST00000090927 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC32.14■■■□□ 2.74
Nrxn3Q6P9K9 Dleu2-201ENSMUST00000180377 1165 ntTSL 1 (best) BASIC32.14■■■□□ 2.74
Nrxn3Q6P9K9 Arpc2-203ENSMUST00000113820 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.14■■■□□ 2.74
Nrxn3Q6P9K9 Bex1-201ENSMUST00000058125 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.13■■■□□ 2.73
Nrxn3Q6P9K9 Cpsf4-205ENSMUST00000160629 1713 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC32.11■■■□□ 2.73
Nrxn3Q6P9K9 Gsc2-201ENSMUST00000012279 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.11■■■□□ 2.73
Nrxn3Q6P9K9 Kcnip3-202ENSMUST00000088538 1296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.11■■■□□ 2.73
Nrxn3Q6P9K9 Esrra-201ENSMUST00000025906 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.1■■■□□ 2.73
Nrxn3Q6P9K9 Dusp15-202ENSMUST00000109811 753 ntTSL 1 (best) BASIC32.09■■■□□ 2.73
Nrxn3Q6P9K9 Ssbp1-203ENSMUST00000117411 933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.09■■■□□ 2.73
Nrxn3Q6P9K9 Copz2-201ENSMUST00000018816 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.09■■■□□ 2.73
Nrxn3Q6P9K9 Socs1-201ENSMUST00000038099 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.09■■■□□ 2.73
Nrxn3Q6P9K9 E130218I03Rik-208ENSMUST00000144222 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.09■■■□□ 2.73
Nrxn3Q6P9K9 Eif5a-210ENSMUST00000108613 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.09■■■□□ 2.73
Nrxn3Q6P9K9 Tmem55b-209ENSMUST00000162957 1465 ntTSL 1 (best) BASIC32.08■■■□□ 2.73
Nrxn3Q6P9K9 H3f3a-207ENSMUST00000162814 724 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC32.08■■■□□ 2.73
Nrxn3Q6P9K9 Gm35161-201ENSMUST00000221765 941 ntTSL 5 BASIC32.07■■■□□ 2.72
Nrxn3Q6P9K9 Tlx2-201ENSMUST00000089641 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.07■■■□□ 2.72
Nrxn3Q6P9K9 Usf1-210ENSMUST00000167546 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.07■■■□□ 2.72
Nrxn3Q6P9K9 Snrpb-201ENSMUST00000103199 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.07■■■□□ 2.72
Nrxn3Q6P9K9 Lrfn1-203ENSMUST00000189877 1852 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC32.07■■■□□ 2.72
Nrxn3Q6P9K9 Metrnl-201ENSMUST00000036742 1401 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.06■■■□□ 2.72
Nrxn3Q6P9K9 Tfpt-204ENSMUST00000155592 1091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.06■■■□□ 2.72
Nrxn3Q6P9K9 Gm26536-201ENSMUST00000181072 1196 ntTSL 1 (best) BASIC32.06■■■□□ 2.72
Nrxn3Q6P9K9 1700065D16Rik-202ENSMUST00000188975 506 ntTSL 3 BASIC32.06■■■□□ 2.72
Nrxn3Q6P9K9 Serp2-204ENSMUST00000228055 705 ntBASIC32.06■■■□□ 2.72
Nrxn3Q6P9K9 Rps2-ps6-201ENSMUST00000095471 855 ntBASIC32.06■■■□□ 2.72
Nrxn3Q6P9K9 Ndfip1-201ENSMUST00000025293 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.05■■■□□ 2.72
Nrxn3Q6P9K9 4930524J08Rik-201ENSMUST00000046721 603 ntAPPRIS P1 BASIC32.04■■■□□ 2.72
Nrxn3Q6P9K9 Mpnd-209ENSMUST00000162883 1400 ntTSL 5 BASIC32.04■■■□□ 2.72
Nrxn3Q6P9K9 Ppp1r3e-202ENSMUST00000177403 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.03■■■□□ 2.72
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.2 ms