Protein–RNA interactions for Protein: Q6P1D7

Slx4, Structure-specific endonuclease subunit SLX4, mousemouse

Predictions only

Length 1,565 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Slx4Q6P1D7 Gng12-203ENSMUST00000114224 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC36.38■■■■□ 3.41
Slx4Q6P1D7 Gng12-206ENSMUST00000114227 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.38■■■■□ 3.41
Slx4Q6P1D7 Syce2-202ENSMUST00000136026 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC36.37■■■■□ 3.41
Slx4Q6P1D7 Dhrs11-201ENSMUST00000047560 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.37■■■■□ 3.41
Slx4Q6P1D7 Lsm4-205ENSMUST00000210987 636 ntTSL 5 BASIC36.36■■■■□ 3.41
Slx4Q6P1D7 Adprhl2-201ENSMUST00000102617 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.36■■■■□ 3.41
Slx4Q6P1D7 Sh3gl3-201ENSMUST00000032874 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.36■■■■□ 3.41
Slx4Q6P1D7 Eid1-201ENSMUST00000164756 1691 ntAPPRIS P1 BASIC36.36■■■■□ 3.41
Slx4Q6P1D7 Dynll1-202ENSMUST00000112090 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC36.36■■■■□ 3.41
Slx4Q6P1D7 D17Wsu92e-201ENSMUST00000075076 1470 ntTSL 1 (best) BASIC36.35■■■■□ 3.41
Slx4Q6P1D7 Socs2-202ENSMUST00000119917 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.35■■■■□ 3.41
Slx4Q6P1D7 Mt2-201ENSMUST00000034214 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.35■■■■□ 3.41
Slx4Q6P1D7 Ppp1ca-201ENSMUST00000046094 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.35■■■■□ 3.41
Slx4Q6P1D7 Cldnd1-201ENSMUST00000023426 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.34■■■■□ 3.41
Slx4Q6P1D7 Hexdc-202ENSMUST00000106117 2149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC36.33■■■■□ 3.41
Slx4Q6P1D7 Mapkap1-202ENSMUST00000113124 1758 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC36.33■■■■□ 3.41
Slx4Q6P1D7 Reps1-206ENSMUST00000154718 2402 ntTSL 5 BASIC36.32■■■■□ 3.41
Slx4Q6P1D7 Fads2-201ENSMUST00000025567 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.32■■■■□ 3.4
Slx4Q6P1D7 Pth1r-202ENSMUST00000166716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.32■■■■□ 3.4
Slx4Q6P1D7 Arl2bp-201ENSMUST00000034228 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.32■■■■□ 3.4
Slx4Q6P1D7 A930002H24Rik-201ENSMUST00000050753 492 ntAPPRIS P1 BASIC36.32■■■■□ 3.4
Slx4Q6P1D7 Papola-211ENSMUST00000166735 1033 ntTSL 1 (best) BASIC36.31■■■■□ 3.4
Slx4Q6P1D7 Cadm1-206ENSMUST00000143026 1643 ntTSL 5 BASIC36.31■■■■□ 3.4
Slx4Q6P1D7 Esrra-201ENSMUST00000025906 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.3■■■■□ 3.4
Slx4Q6P1D7 Asph-201ENSMUST00000038564 1174 ntTSL 1 (best) BASIC36.29■■■■□ 3.4
Slx4Q6P1D7 Asph-205ENSMUST00000098275 1007 ntTSL 5 BASIC36.29■■■■□ 3.4
Slx4Q6P1D7 Upp2-202ENSMUST00000071543 2150 ntTSL 1 (best) BASIC36.29■■■■□ 3.4
Slx4Q6P1D7 Ak2-201ENSMUST00000030583 986 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC36.28■■■■□ 3.4
Slx4Q6P1D7 Bag1-203ENSMUST00000191273 1348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.28■■■■□ 3.4
Slx4Q6P1D7 Rps24-207ENSMUST00000224568 714 ntBASIC36.27■■■■□ 3.4
Slx4Q6P1D7 Gemin7-203ENSMUST00000119912 653 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC36.27■■■■□ 3.4
Slx4Q6P1D7 Scand1-201ENSMUST00000079125 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.27■■■■□ 3.4
Slx4Q6P1D7 Gm20458-201ENSMUST00000164863 1369 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC36.26■■■■□ 3.4
Slx4Q6P1D7 Gm26533-201ENSMUST00000180550 1790 ntTSL 1 (best) BASIC36.26■■■■□ 3.4
Slx4Q6P1D7 Hoxb3-201ENSMUST00000055334 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.26■■■■□ 3.4
Slx4Q6P1D7 Gm15820-201ENSMUST00000201566 728 ntBASIC36.26■■■■□ 3.39
Slx4Q6P1D7 Ankrd49-205ENSMUST00000216037 1037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC36.26■■■■□ 3.39
Slx4Q6P1D7 Ssx2ip-202ENSMUST00000106149 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.25■■■■□ 3.39
Slx4Q6P1D7 Fam98c-209ENSMUST00000164589 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC36.24■■■■□ 3.39
Slx4Q6P1D7 1700097N02Rik-201ENSMUST00000188852 845 ntTSL 3 BASIC36.24■■■■□ 3.39
Slx4Q6P1D7 Arl8a-201ENSMUST00000027684 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.24■■■■□ 3.39
Slx4Q6P1D7 Wdr34-201ENSMUST00000113711 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.24■■■■□ 3.39
Slx4Q6P1D7 Amer2-203ENSMUST00000225247 2662 ntBASIC36.24■■■■□ 3.39
Slx4Q6P1D7 Gm45444-201ENSMUST00000211394 898 ntBASIC36.23■■■■□ 3.39
Slx4Q6P1D7 Gm16286-202ENSMUST00000125127 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.23■■■■□ 3.39
Slx4Q6P1D7 Bcl7b-201ENSMUST00000031692 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC36.23■■■■□ 3.39
Slx4Q6P1D7 Gm44428-201ENSMUST00000204474 874 ntBASIC36.23■■■■□ 3.39
Slx4Q6P1D7 Tmx4-202ENSMUST00000110119 596 ntTSL 2 BASIC36.21■■■■□ 3.39
Slx4Q6P1D7 Gm43592-201ENSMUST00000196922 1165 ntBASIC36.21■■■■□ 3.39
Slx4Q6P1D7 Camk2n2-201ENSMUST00000052939 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.21■■■■□ 3.39
Slx4Q6P1D7 Marveld2-202ENSMUST00000163163 2187 ntTSL 1 (best) BASIC36.21■■■■□ 3.39
Slx4Q6P1D7 E130218I03Rik-208ENSMUST00000144222 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.21■■■■□ 3.39
Slx4Q6P1D7 Hrasls-204ENSMUST00000162747 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.2■■■■□ 3.39
Slx4Q6P1D7 Syce3-201ENSMUST00000109314 448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.19■■■■□ 3.38
Slx4Q6P1D7 Rundc3b-202ENSMUST00000115378 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC36.19■■■■□ 3.38
Slx4Q6P1D7 Pcf11-204ENSMUST00000208058 461 ntTSL 5 BASIC36.19■■■■□ 3.38
Slx4Q6P1D7 Pex10-201ENSMUST00000103180 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.18■■■■□ 3.38
Slx4Q6P1D7 Gsk3a-202ENSMUST00000108411 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC36.18■■■■□ 3.38
Slx4Q6P1D7 Cyp2r1-202ENSMUST00000119712 917 ntTSL 5 BASIC36.18■■■■□ 3.38
Slx4Q6P1D7 Gm45102-201ENSMUST00000207427 857 ntBASIC36.16■■■■□ 3.38
Slx4Q6P1D7 Zbtb12-201ENSMUST00000052778 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.16■■■■□ 3.38
Slx4Q6P1D7 Kctd6-201ENSMUST00000022272 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.16■■■■□ 3.38
Slx4Q6P1D7 E2f5-201ENSMUST00000029069 1779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC36.16■■■■□ 3.38
Slx4Q6P1D7 Adap1-201ENSMUST00000110865 2557 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC36.16■■■■□ 3.38
Slx4Q6P1D7 A230020J21Rik-202ENSMUST00000192407 1649 ntTSL 2 BASIC36.15■■■■□ 3.38
Slx4Q6P1D7 Acvr2b-202ENSMUST00000165044 2093 ntTSL 2 BASIC36.15■■■■□ 3.38
Slx4Q6P1D7 Hdgf-201ENSMUST00000005017 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.15■■■■□ 3.38
Slx4Q6P1D7 Gm14117-201ENSMUST00000122417 843 ntBASIC36.15■■■■□ 3.38
Slx4Q6P1D7 Ipmk-203ENSMUST00000121446 1492 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC36.14■■■■□ 3.38
Slx4Q6P1D7 Tsg101-201ENSMUST00000014546 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.13■■■■□ 3.37
Slx4Q6P1D7 Klhl35-201ENSMUST00000037359 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.13■■■■□ 3.37
Slx4Q6P1D7 Mypop-203ENSMUST00000131087 1951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC36.12■■■■□ 3.37
Slx4Q6P1D7 Smox-206ENSMUST00000110183 1159 ntTSL 1 (best) BASIC36.12■■■■□ 3.37
Slx4Q6P1D7 Ablim1-208ENSMUST00000111544 2231 ntTSL 5 BASIC36.11■■■■□ 3.37
Slx4Q6P1D7 Tmem238-201ENSMUST00000168578 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.11■■■■□ 3.37
Slx4Q6P1D7 Gm16599-201ENSMUST00000148082 1182 ntTSL 1 (best) BASIC36.1■■■■□ 3.37
Slx4Q6P1D7 Nsd1-203ENSMUST00000224156 1149 ntBASIC36.1■■■■□ 3.37
Slx4Q6P1D7 Dnttip1-201ENSMUST00000017443 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.1■■■■□ 3.37
Slx4Q6P1D7 Gm26536-201ENSMUST00000181072 1196 ntTSL 1 (best) BASIC36.1■■■■□ 3.37
Slx4Q6P1D7 Mpv17l2-201ENSMUST00000038626 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.1■■■■□ 3.37
Slx4Q6P1D7 Lsm4-201ENSMUST00000034311 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.09■■■■□ 3.37
Slx4Q6P1D7 Gm960-202ENSMUST00000177696 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC36.08■■■■□ 3.37
Slx4Q6P1D7 Cdc14b-207ENSMUST00000221634 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.08■■■■□ 3.37
Slx4Q6P1D7 Pde6d-203ENSMUST00000146220 879 ntTSL 2 BASIC36.07■■■■□ 3.37
Slx4Q6P1D7 Gt(ROSA)26Sor-201ENSMUST00000124246 1181 ntTSL 1 (best) BASIC36.06■■■■□ 3.36
Slx4Q6P1D7 Cdkn2d-203ENSMUST00000215619 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.06■■■■□ 3.36
Slx4Q6P1D7 Ntn5-203ENSMUST00000183120 1491 ntTSL 1 (best) BASIC36.05■■■■□ 3.36
Slx4Q6P1D7 Arpp19-206ENSMUST00000168301 599 ntTSL 5 BASIC36.05■■■■□ 3.36
Slx4Q6P1D7 Ppp1cb-206ENSMUST00000202078 383 ntTSL 5 BASIC36.05■■■■□ 3.36
Slx4Q6P1D7 March2-203ENSMUST00000172767 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.05■■■■□ 3.36
Slx4Q6P1D7 Jdp2-201ENSMUST00000050687 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.05■■■■□ 3.36
Slx4Q6P1D7 Arhgap39-204ENSMUST00000176219 542 ntTSL 5 BASIC36.04■■■■□ 3.36
Slx4Q6P1D7 Gm28040-202ENSMUST00000184603 890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC36.03■■■■□ 3.36
Slx4Q6P1D7 Lor-201ENSMUST00000058150 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.02■■■■□ 3.36
Slx4Q6P1D7 0610009L18Rik-201ENSMUST00000143813 619 ntTSL 2 BASIC36.02■■■■□ 3.36
Slx4Q6P1D7 Ube2k-206ENSMUST00000201984 1449 ntTSL 3 BASIC36.01■■■■□ 3.36
Slx4Q6P1D7 Ccdc9-202ENSMUST00000118976 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.01■■■■□ 3.35
Slx4Q6P1D7 Pgls-205ENSMUST00000143441 1062 ntTSL 3 BASIC36.01■■■■□ 3.35
Slx4Q6P1D7 Srcap-202ENSMUST00000098025 1257 ntTSL 5 BASIC36.01■■■■□ 3.35
Slx4Q6P1D7 Usp2-206ENSMUST00000176416 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36■■■■□ 3.35
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 52.1 ms