Protein–RNA interactions for Protein: Q6KAQ7

Zzz3, ZZ-type zinc finger-containing protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 910 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Zzz3Q6KAQ7 Dnajc21-201ENSMUST00000136591 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Zzz3Q6KAQ7 Etfa-201ENSMUST00000034866 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Zzz3Q6KAQ7 Irx1-201ENSMUST00000077337 2373 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Zzz3Q6KAQ7 Phf23-201ENSMUST00000018716 2006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Zzz3Q6KAQ7 Fam204a-201ENSMUST00000065286 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Zzz3Q6KAQ7 Lor-201ENSMUST00000058150 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Zzz3Q6KAQ7 Fus-204ENSMUST00000121616 1102 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Zzz3Q6KAQ7 Cadm1-210ENSMUST00000214542 899 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Zzz3Q6KAQ7 Gm10499-202ENSMUST00000174778 1698 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.15
Zzz3Q6KAQ7 Hdac1-201ENSMUST00000102597 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Zzz3Q6KAQ7 Chpt1-204ENSMUST00000117579 1043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Zzz3Q6KAQ7 Wnt5b-203ENSMUST00000119369 2339 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Zzz3Q6KAQ7 Coro1b-201ENSMUST00000008893 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Zzz3Q6KAQ7 Rasgef1c-203ENSMUST00000093142 2216 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Zzz3Q6KAQ7 A330041J22Rik-201ENSMUST00000150367 1825 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Zzz3Q6KAQ7 AC167019.3-201ENSMUST00000228225 1266 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
Zzz3Q6KAQ7 Hgh1-201ENSMUST00000023213 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Zzz3Q6KAQ7 Nudt9-201ENSMUST00000031250 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Zzz3Q6KAQ7 Brwd1-203ENSMUST00000113827 2382 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Zzz3Q6KAQ7 Txnrd1-208ENSMUST00000219962 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Zzz3Q6KAQ7 Gm16764-201ENSMUST00000138891 541 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Zzz3Q6KAQ7 Mad2l2-202ENSMUST00000084129 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Zzz3Q6KAQ7 2310061I04Rik-202ENSMUST00000146451 2081 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Zzz3Q6KAQ7 Dennd5a-202ENSMUST00000106722 4862 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Zzz3Q6KAQ7 Ccdc142-201ENSMUST00000101254 2317 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Zzz3Q6KAQ7 Evl-201ENSMUST00000021689 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Zzz3Q6KAQ7 Elf2-204ENSMUST00000108053 2611 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Zzz3Q6KAQ7 Tceal3-202ENSMUST00000113100 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Zzz3Q6KAQ7 Ube2g2-204ENSMUST00000174510 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Zzz3Q6KAQ7 E130304I02Rik-202ENSMUST00000187873 696 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Zzz3Q6KAQ7 Agpat5-201ENSMUST00000033847 2841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Zzz3Q6KAQ7 Upf3a-201ENSMUST00000043767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Zzz3Q6KAQ7 Nek6-202ENSMUST00000112895 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Zzz3Q6KAQ7 Znrf1-207ENSMUST00000173506 1238 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Zzz3Q6KAQ7 Arl8a-201ENSMUST00000027684 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Zzz3Q6KAQ7 Fam220a-201ENSMUST00000067145 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Zzz3Q6KAQ7 Evl-202ENSMUST00000077735 2121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Zzz3Q6KAQ7 Kcnq5-206ENSMUST00000173404 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Zzz3Q6KAQ7 Pdgfb-201ENSMUST00000000500 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Zzz3Q6KAQ7 Hdac3-201ENSMUST00000043498 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Zzz3Q6KAQ7 Gng12-204ENSMUST00000114225 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Zzz3Q6KAQ7 Rundc3b-202ENSMUST00000115378 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Zzz3Q6KAQ7 Cadps-201ENSMUST00000067491 5421 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Zzz3Q6KAQ7 Vdac2-201ENSMUST00000022293 1954 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Zzz3Q6KAQ7 Fance-203ENSMUST00000114803 1980 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Zzz3Q6KAQ7 Gas1-202ENSMUST00000223933 1155 ntAPPRIS P2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Zzz3Q6KAQ7 Tmpo-204ENSMUST00000099355 1953 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Zzz3Q6KAQ7 Vmac-201ENSMUST00000067931 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Zzz3Q6KAQ7 Glrx3-201ENSMUST00000064404 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Zzz3Q6KAQ7 Gipc1-201ENSMUST00000019577 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Zzz3Q6KAQ7 Zswim5-201ENSMUST00000044823 5582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Zzz3Q6KAQ7 Hccs-201ENSMUST00000033717 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Zzz3Q6KAQ7 Mppe1-201ENSMUST00000073054 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Zzz3Q6KAQ7 Gm42699-201ENSMUST00000198104 1657 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
Zzz3Q6KAQ7 Gm5784-202ENSMUST00000220896 2016 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Zzz3Q6KAQ7 Ctnnd2-201ENSMUST00000081728 5944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Zzz3Q6KAQ7 Nrsn1-201ENSMUST00000057866 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Zzz3Q6KAQ7 Efhd1os-201ENSMUST00000138844 332 ntTSL 3 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Zzz3Q6KAQ7 Mir6538-201ENSMUST00000183713 110 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
Zzz3Q6KAQ7 Rab26-202ENSMUST00000061764 1291 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Zzz3Q6KAQ7 H3f3aos-201ENSMUST00000097448 2905 ntBASIC22.08■■□□□ 1.12
Zzz3Q6KAQ7 Npas1-201ENSMUST00000002053 2091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.12
Zzz3Q6KAQ7 Gorasp2-205ENSMUST00000133432 1941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Zzz3Q6KAQ7 Ctage5-211ENSMUST00000176322 2649 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.12
Zzz3Q6KAQ7 Slc44a1-203ENSMUST00000107646 1974 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Zzz3Q6KAQ7 Jmjd6-201ENSMUST00000047616 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Zzz3Q6KAQ7 Stambp-207ENSMUST00000206592 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Zzz3Q6KAQ7 Gm37136-201ENSMUST00000194368 194 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
Zzz3Q6KAQ7 Paqr6-203ENSMUST00000147948 837 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Zzz3Q6KAQ7 Kif1bp-206ENSMUST00000162525 2311 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Zzz3Q6KAQ7 Lsr-201ENSMUST00000001279 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Zzz3Q6KAQ7 Gjd3-201ENSMUST00000062931 837 ntAPPRIS P1 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Zzz3Q6KAQ7 Tmem9b-201ENSMUST00000033333 1703 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Zzz3Q6KAQ7 Srcap-210ENSMUST00000188124 2048 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Zzz3Q6KAQ7 Kdf1-202ENSMUST00000105901 1699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Zzz3Q6KAQ7 Nelfe-202ENSMUST00000165953 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Zzz3Q6KAQ7 Hoxc13-201ENSMUST00000001700 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Zzz3Q6KAQ7 Hs3st6-201ENSMUST00000044922 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Zzz3Q6KAQ7 Trafd1-201ENSMUST00000042312 2503 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Zzz3Q6KAQ7 Arpc2-203ENSMUST00000113820 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Zzz3Q6KAQ7 Gm4419-202ENSMUST00000226239 1431 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
Zzz3Q6KAQ7 Izumo4-205ENSMUST00000218184 1196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Zzz3Q6KAQ7 Zfp768-202ENSMUST00000205266 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Zzz3Q6KAQ7 Hoxb9-201ENSMUST00000000010 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Zzz3Q6KAQ7 Smurf1-201ENSMUST00000085684 5343 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Zzz3Q6KAQ7 Lsm14b-201ENSMUST00000055485 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Zzz3Q6KAQ7 Tmem98-201ENSMUST00000040865 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Zzz3Q6KAQ7 Dnajc19-202ENSMUST00000108195 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Zzz3Q6KAQ7 D16Ertd472e-201ENSMUST00000114218 1271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
Zzz3Q6KAQ7 Znrf2-201ENSMUST00000079869 5886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Zzz3Q6KAQ7 Lrrc75a-201ENSMUST00000057194 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Zzz3Q6KAQ7 Frmd5-201ENSMUST00000110592 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Zzz3Q6KAQ7 Dbndd2-202ENSMUST00000069385 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Zzz3Q6KAQ7 Rpl38-203ENSMUST00000106599 457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Zzz3Q6KAQ7 Lrrc4b-201ENSMUST00000058667 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Zzz3Q6KAQ7 Mtm1-204ENSMUST00000101501 770 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Zzz3Q6KAQ7 Krtap17-1-201ENSMUST00000105049 761 ntAPPRIS P1 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Zzz3Q6KAQ7 A030005K14Rik-201ENSMUST00000193762 1093 ntAPPRIS P1 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Zzz3Q6KAQ7 Ildr2-203ENSMUST00000192638 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Zzz3Q6KAQ7 Micu2-201ENSMUST00000022543 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 59.9 ms