Protein–RNA interactions for Protein: Q6A068

Cdc5l, Cell division cycle 5-like protein, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 802 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cdc5lQ6A068 Rgs7-206ENSMUST00000194555 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
Cdc5lQ6A068 H2afy-202ENSMUST00000045788 1933 ntTSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
Cdc5lQ6A068 A030014E15Rik-201ENSMUST00000223400 796 ntAPPRIS P1 BASIC27.48■■□□□ 1.99
Cdc5lQ6A068 Gm26711-201ENSMUST00000180866 1833 ntTSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
Cdc5lQ6A068 Mnx1-201ENSMUST00000001608 2018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.48■■□□□ 1.99
Cdc5lQ6A068 Htra4-201ENSMUST00000084031 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
Cdc5lQ6A068 Kctd2-201ENSMUST00000103035 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
Cdc5lQ6A068 Csnk1g2-201ENSMUST00000079773 2348 ntTSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
Cdc5lQ6A068 Reep6-202ENSMUST00000105354 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
Cdc5lQ6A068 Reep6-205ENSMUST00000105358 2208 ntTSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
Cdc5lQ6A068 Vegfa-211ENSMUST00000167860 975 ntTSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
Cdc5lQ6A068 Slc35a2-211ENSMUST00000208640 486 ntTSL 5 BASIC27.47■■□□□ 1.99
Cdc5lQ6A068 Vegfa-212ENSMUST00000214739 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
Cdc5lQ6A068 Vegfa-213ENSMUST00000217017 1179 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
Cdc5lQ6A068 Rpl35-201ENSMUST00000080861 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
Cdc5lQ6A068 Ppp1ca-201ENSMUST00000046094 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
Cdc5lQ6A068 Ipmk-202ENSMUST00000118381 1323 ntTSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
Cdc5lQ6A068 Hecw2-202ENSMUST00000097741 1132 ntTSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
Cdc5lQ6A068 Tmpo-203ENSMUST00000092219 1854 ntTSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.99
Cdc5lQ6A068 Tmem170b-202ENSMUST00000221694 602 ntTSL 3 BASIC27.45■■□□□ 1.98
Cdc5lQ6A068 Cadm1-206ENSMUST00000143026 1643 ntTSL 5 BASIC27.43■■□□□ 1.98
Cdc5lQ6A068 Trnau1ap-203ENSMUST00000105962 961 ntTSL 5 BASIC27.43■■□□□ 1.98
Cdc5lQ6A068 Gm13594-201ENSMUST00000137582 476 ntTSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
Cdc5lQ6A068 Cbr3-201ENSMUST00000039620 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
Cdc5lQ6A068 A830092H15Rik-201ENSMUST00000099182 1229 ntBASIC27.41■■□□□ 1.98
Cdc5lQ6A068 Gm21989-201ENSMUST00000174530 1609 ntTSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
Cdc5lQ6A068 Tmem70-203ENSMUST00000177501 1636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
Cdc5lQ6A068 Nudc-201ENSMUST00000030665 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
Cdc5lQ6A068 Gm44428-201ENSMUST00000204474 874 ntBASIC27.4■■□□□ 1.98
Cdc5lQ6A068 Fam149b-201ENSMUST00000037698 924 ntTSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
Cdc5lQ6A068 Ccna1-202ENSMUST00000197238 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.4■■□□□ 1.98
Cdc5lQ6A068 Cadm1-209ENSMUST00000152459 1784 ntTSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
Cdc5lQ6A068 Glrx3-201ENSMUST00000064404 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
Cdc5lQ6A068 Gm20458-201ENSMUST00000164863 1369 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.39■■□□□ 1.98
Cdc5lQ6A068 Slc39a13-203ENSMUST00000111436 1291 ntTSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
Cdc5lQ6A068 Ildr2-202ENSMUST00000192426 1238 ntTSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
Cdc5lQ6A068 Rab4a-202ENSMUST00000118535 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
Cdc5lQ6A068 Kcnk2-205ENSMUST00000192723 1642 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
Cdc5lQ6A068 Oaz2-206ENSMUST00000153700 1843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.36■■□□□ 1.97
Cdc5lQ6A068 Gm5067-201ENSMUST00000170449 1009 ntBASIC27.35■■□□□ 1.97
Cdc5lQ6A068 Ddrgk1-201ENSMUST00000089559 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
Cdc5lQ6A068 Paqr3-202ENSMUST00000112968 1875 ntTSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
Cdc5lQ6A068 Gm10420-201ENSMUST00000121713 882 ntBASIC27.34■■□□□ 1.97
Cdc5lQ6A068 Sft2d1-210ENSMUST00000154553 1049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
Cdc5lQ6A068 Gm20109-201ENSMUST00000180802 671 ntTSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
Cdc5lQ6A068 Ebf4-203ENSMUST00000110288 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.34■■□□□ 1.97
Cdc5lQ6A068 Hoxd9-201ENSMUST00000059272 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
Cdc5lQ6A068 Suds3-201ENSMUST00000086471 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
Cdc5lQ6A068 Fam149b-203ENSMUST00000090499 2370 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
Cdc5lQ6A068 Krtap28-10-201ENSMUST00000188323 957 ntAPPRIS P1 BASIC27.33■■□□□ 1.97
Cdc5lQ6A068 Galr3-201ENSMUST00000058004 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
Cdc5lQ6A068 Gdf7-202ENSMUST00000220073 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
Cdc5lQ6A068 5031425E22Rik-201ENSMUST00000101522 2110 ntBASIC27.32■■□□□ 1.96
Cdc5lQ6A068 Nudt3-203ENSMUST00000114886 996 ntTSL 2 BASIC27.32■■□□□ 1.96
Cdc5lQ6A068 Emc8-208ENSMUST00000181950 747 ntTSL 2 BASIC27.32■■□□□ 1.96
Cdc5lQ6A068 Aldoa-214ENSMUST00000207534 741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.32■■□□□ 1.96
Cdc5lQ6A068 Bloc1s2-201ENSMUST00000079033 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
Cdc5lQ6A068 Adra1d-201ENSMUST00000103184 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
Cdc5lQ6A068 Pdpk1-203ENSMUST00000115407 1730 ntTSL 5 BASIC27.31■■□□□ 1.96
Cdc5lQ6A068 Lsm4-205ENSMUST00000210987 636 ntTSL 5 BASIC27.31■■□□□ 1.96
Cdc5lQ6A068 Lemd2-201ENSMUST00000055117 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
Cdc5lQ6A068 Usf1-210ENSMUST00000167546 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.3■■□□□ 1.96
Cdc5lQ6A068 Hist2h3c1-201ENSMUST00000176059 1820 ntAPPRIS P1 BASIC27.3■■□□□ 1.96
Cdc5lQ6A068 Hist2h3c1-202ENSMUST00000177796 1825 ntBASIC27.3■■□□□ 1.96
Cdc5lQ6A068 Cys1-207ENSMUST00000186602 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
Cdc5lQ6A068 Gng12-204ENSMUST00000114225 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
Cdc5lQ6A068 Rcan1-202ENSMUST00000060005 2324 ntTSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
Cdc5lQ6A068 AC122428.3-201ENSMUST00000215551 2290 ntBASIC27.28■■□□□ 1.96
Cdc5lQ6A068 Gm20208-202ENSMUST00000219905 1528 ntTSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
Cdc5lQ6A068 Hpf1-204ENSMUST00000146863 531 ntTSL 2 BASIC27.27■■□□□ 1.96
Cdc5lQ6A068 Gm7276-201ENSMUST00000097520 1252 ntAPPRIS P1 BASIC27.27■■□□□ 1.96
Cdc5lQ6A068 Upf3a-201ENSMUST00000043767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
Cdc5lQ6A068 Rbm45-201ENSMUST00000046389 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
Cdc5lQ6A068 Clptm1l-201ENSMUST00000022102 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
Cdc5lQ6A068 Sike1-202ENSMUST00000119450 774 ntTSL 3 BASIC27.26■■□□□ 1.95
Cdc5lQ6A068 Ppp1r35-201ENSMUST00000031739 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
Cdc5lQ6A068 Jmjd6-201ENSMUST00000047616 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
Cdc5lQ6A068 Efna2-201ENSMUST00000003154 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
Cdc5lQ6A068 Chrna5-204ENSMUST00000217408 2446 ntTSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
Cdc5lQ6A068 Btf3l4-203ENSMUST00000102741 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
Cdc5lQ6A068 Vmac-201ENSMUST00000067931 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
Cdc5lQ6A068 Htatsf1-202ENSMUST00000114751 1128 ntTSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
Cdc5lQ6A068 Sox3-201ENSMUST00000135107 2065 ntAPPRIS P1 BASIC27.23■■□□□ 1.95
Cdc5lQ6A068 Fus-201ENSMUST00000077609 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
Cdc5lQ6A068 Kcnj6-201ENSMUST00000095873 1773 ntTSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
Cdc5lQ6A068 Cited2-201ENSMUST00000038107 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
Cdc5lQ6A068 Cyp2r1-202ENSMUST00000119712 917 ntTSL 5 BASIC27.23■■□□□ 1.95
Cdc5lQ6A068 Pgls-201ENSMUST00000034264 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
Cdc5lQ6A068 D17Wsu92e-201ENSMUST00000075076 1470 ntTSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
Cdc5lQ6A068 Asf1a-201ENSMUST00000020004 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
Cdc5lQ6A068 Shox2-204ENSMUST00000162439 1081 ntTSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
Cdc5lQ6A068 Cpe-201ENSMUST00000048967 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
Cdc5lQ6A068 Npas1-201ENSMUST00000002053 2091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.21■■□□□ 1.95
Cdc5lQ6A068 Hnrnpul1-202ENSMUST00000108401 1240 ntTSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
Cdc5lQ6A068 Mapkap1-202ENSMUST00000113124 1758 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.21■■□□□ 1.95
Cdc5lQ6A068 Kif1c-205ENSMUST00000152618 1943 ntTSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
Cdc5lQ6A068 B230377A18Rik-202ENSMUST00000192921 1364 ntBASIC27.21■■□□□ 1.95
Cdc5lQ6A068 Rcor2-201ENSMUST00000066646 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
Cdc5lQ6A068 Lin7b-201ENSMUST00000003971 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
Cdc5lQ6A068 2310061I04Rik-202ENSMUST00000146451 2081 ntTSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 79.4 ms