Protein–RNA interactions for Protein: Q69ZJ7

Ric1, RAB6A-GEF complex partner protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,422 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ric1Q69ZJ7 Acvr2b-202ENSMUST00000165044 2093 ntTSL 2 BASIC29.15■■■□□ 2.26
Ric1Q69ZJ7 Anxa5-201ENSMUST00000029266 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
Ric1Q69ZJ7 Hnrnpul1-202ENSMUST00000108401 1240 ntTSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
Ric1Q69ZJ7 Gm44428-201ENSMUST00000204474 874 ntBASIC29.15■■■□□ 2.26
Ric1Q69ZJ7 Trappc6b-207ENSMUST00000218686 785 ntTSL 3 BASIC29.15■■■□□ 2.26
Ric1Q69ZJ7 Rnaset2b-201ENSMUST00000089119 1013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
Ric1Q69ZJ7 E2f5-201ENSMUST00000029069 1779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
Ric1Q69ZJ7 H1fx-201ENSMUST00000056403 1217 ntAPPRIS P1 BASIC29.14■■■□□ 2.26
Ric1Q69ZJ7 Bcl7b-201ENSMUST00000031692 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.26
Ric1Q69ZJ7 Det1-201ENSMUST00000032839 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
Ric1Q69ZJ7 Gm22567-201ENSMUST00000175542 342 ntBASIC29.13■■■□□ 2.25
Ric1Q69ZJ7 Hoxb3-201ENSMUST00000055334 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
Ric1Q69ZJ7 Gm20458-201ENSMUST00000164863 1369 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.13■■■□□ 2.25
Ric1Q69ZJ7 Fam89b-203ENSMUST00000161368 1160 ntTSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
Ric1Q69ZJ7 D17Wsu92e-201ENSMUST00000075076 1470 ntTSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
Ric1Q69ZJ7 Gm16286-202ENSMUST00000125127 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
Ric1Q69ZJ7 Zbtb12-201ENSMUST00000052778 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
Ric1Q69ZJ7 Tmem42-201ENSMUST00000084733 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
Ric1Q69ZJ7 Eif5a-208ENSMUST00000108611 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
Ric1Q69ZJ7 Mapkap1-202ENSMUST00000113124 1758 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC29.1■■■□□ 2.25
Ric1Q69ZJ7 Becn1-216ENSMUST00000170502 725 ntTSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
Ric1Q69ZJ7 Gm29735-201ENSMUST00000209599 660 ntAPPRIS P1 BASIC29.1■■■□□ 2.25
Ric1Q69ZJ7 Lor-201ENSMUST00000058150 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
Ric1Q69ZJ7 Dexi-201ENSMUST00000038281 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
Ric1Q69ZJ7 Gmeb1-202ENSMUST00000105964 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
Ric1Q69ZJ7 Cyp2r1-202ENSMUST00000119712 917 ntTSL 5 BASIC29.07■■■□□ 2.24
Ric1Q69ZJ7 Coprs-201ENSMUST00000033839 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
Ric1Q69ZJ7 Foxe3-201ENSMUST00000050940 867 ntAPPRIS P1 BASIC29.06■■■□□ 2.24
Ric1Q69ZJ7 Pdgfa-204ENSMUST00000110897 1287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.05■■■□□ 2.24
Ric1Q69ZJ7 Gm15546-201ENSMUST00000122095 826 ntBASIC29.05■■■□□ 2.24
Ric1Q69ZJ7 Gm5522-201ENSMUST00000189483 1242 ntBASIC29.05■■■□□ 2.24
Ric1Q69ZJ7 AC161180.1-201ENSMUST00000223439 933 ntAPPRIS P1 BASIC29.05■■■□□ 2.24
Ric1Q69ZJ7 Gm4419-202ENSMUST00000226239 1431 ntBASIC29.05■■■□□ 2.24
Ric1Q69ZJ7 Wdr34-201ENSMUST00000113711 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
Ric1Q69ZJ7 Ppp1r14c-202ENSMUST00000217573 2013 ntTSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
Ric1Q69ZJ7 Snx21-203ENSMUST00000152471 1243 ntTSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
Ric1Q69ZJ7 Hras-202ENSMUST00000097957 1199 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.03■■■□□ 2.24
Ric1Q69ZJ7 Cdc14b-207ENSMUST00000221634 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
Ric1Q69ZJ7 Ybx3-202ENSMUST00000087865 1684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.24
Ric1Q69ZJ7 Spryd7-202ENSMUST00000100496 1459 ntTSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
Ric1Q69ZJ7 Zc3h6-201ENSMUST00000110319 1484 ntTSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
Ric1Q69ZJ7 Jmy-202ENSMUST00000220513 1843 ntTSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
Ric1Q69ZJ7 Fam50b-202ENSMUST00000221037 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
Ric1Q69ZJ7 Dhrs11-201ENSMUST00000047560 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
Ric1Q69ZJ7 B3gat1-201ENSMUST00000115269 1665 ntTSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
Ric1Q69ZJ7 Gm43566-201ENSMUST00000196851 808 ntBASIC28.99■■■□□ 2.23
Ric1Q69ZJ7 AC166358.2-201ENSMUST00000223403 734 ntTSL 5 BASIC28.99■■■□□ 2.23
Ric1Q69ZJ7 Bag1-203ENSMUST00000191273 1348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
Ric1Q69ZJ7 Fezf2-202ENSMUST00000224023 1917 ntBASIC28.98■■■□□ 2.23
Ric1Q69ZJ7 Gm12905-201ENSMUST00000153814 658 ntTSL 2 BASIC28.98■■■□□ 2.23
Ric1Q69ZJ7 Gm7544-201ENSMUST00000222426 828 ntAPPRIS P1 BASIC28.98■■■□□ 2.23
Ric1Q69ZJ7 Gal3st1-202ENSMUST00000078757 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
Ric1Q69ZJ7 Sin3b-202ENSMUST00000109950 1024 ntTSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
Ric1Q69ZJ7 Dtnb-203ENSMUST00000164578 2355 ntTSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
Ric1Q69ZJ7 Arhgap22-201ENSMUST00000111955 2148 ntTSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
Ric1Q69ZJ7 Lsm4-201ENSMUST00000034311 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
Ric1Q69ZJ7 Ipmk-203ENSMUST00000121446 1492 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.96■■■□□ 2.23
Ric1Q69ZJ7 Etfa-201ENSMUST00000034866 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
Ric1Q69ZJ7 Dynll1-202ENSMUST00000112090 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.95■■■□□ 2.23
Ric1Q69ZJ7 AC102554.1-201ENSMUST00000216236 537 ntTSL 5 BASIC28.95■■■□□ 2.23
Ric1Q69ZJ7 Acvr2b-201ENSMUST00000035093 1729 ntTSL 5 BASIC28.95■■■□□ 2.23
Ric1Q69ZJ7 Gng12-203ENSMUST00000114224 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.94■■■□□ 2.22
Ric1Q69ZJ7 Gng12-206ENSMUST00000114227 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
Ric1Q69ZJ7 Gm43592-201ENSMUST00000196922 1165 ntBASIC28.94■■■□□ 2.22
Ric1Q69ZJ7 Gm21989-201ENSMUST00000174530 1609 ntTSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
Ric1Q69ZJ7 Kctd2-201ENSMUST00000103035 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
Ric1Q69ZJ7 Usp2-206ENSMUST00000176416 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
Ric1Q69ZJ7 Ntn5-203ENSMUST00000183120 1491 ntTSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
Ric1Q69ZJ7 Gipc1-201ENSMUST00000019577 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
Ric1Q69ZJ7 Hecw2-202ENSMUST00000097741 1132 ntTSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
Ric1Q69ZJ7 Fam92a-202ENSMUST00000108285 1639 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC28.92■■■□□ 2.22
Ric1Q69ZJ7 Usf1-210ENSMUST00000167546 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.91■■■□□ 2.22
Ric1Q69ZJ7 Hoxb3os-202ENSMUST00000147410 1945 ntTSL 5 BASIC28.91■■■□□ 2.22
Ric1Q69ZJ7 Ssbp4-205ENSMUST00000210369 1828 ntTSL 2 BASIC28.9■■■□□ 2.22
Ric1Q69ZJ7 Klhl25-205ENSMUST00000206019 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
Ric1Q69ZJ7 Phf2os1-201ENSMUST00000123212 498 ntTSL 3 BASIC28.9■■■□□ 2.22
Ric1Q69ZJ7 Casd1-204ENSMUST00000181734 1063 ntTSL 5 BASIC28.9■■■□□ 2.22
Ric1Q69ZJ7 Gm45444-201ENSMUST00000211394 898 ntBASIC28.89■■■□□ 2.22
Ric1Q69ZJ7 A930002H24Rik-201ENSMUST00000050753 492 ntAPPRIS P1 BASIC28.89■■■□□ 2.22
Ric1Q69ZJ7 H2afy-202ENSMUST00000045788 1933 ntTSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
Ric1Q69ZJ7 Gm6217-201ENSMUST00000222182 829 ntAPPRIS P1 BASIC28.88■■■□□ 2.21
Ric1Q69ZJ7 Gm13238-201ENSMUST00000117655 780 ntBASIC28.87■■■□□ 2.21
Ric1Q69ZJ7 AC164424.2-201ENSMUST00000223281 725 ntTSL 3 BASIC28.86■■■□□ 2.21
Ric1Q69ZJ7 H2afj-202ENSMUST00000203982 577 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC28.86■■■□□ 2.21
Ric1Q69ZJ7 Oaz2-206ENSMUST00000153700 1843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.85■■■□□ 2.21
Ric1Q69ZJ7 2410017I17Rik-202ENSMUST00000090537 2053 ntTSL 2 BASIC28.85■■■□□ 2.21
Ric1Q69ZJ7 Ak2-201ENSMUST00000030583 986 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
Ric1Q69ZJ7 Mpnd-208ENSMUST00000159996 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.84■■■□□ 2.21
Ric1Q69ZJ7 Tmx4-202ENSMUST00000110119 596 ntTSL 2 BASIC28.83■■■□□ 2.21
Ric1Q69ZJ7 Ubp1-203ENSMUST00000116492 2111 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
Ric1Q69ZJ7 Tmem55b-206ENSMUST00000161166 1445 ntTSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
Ric1Q69ZJ7 Sarnp-203ENSMUST00000219512 953 ntTSL 3 BASIC28.81■■■□□ 2.2
Ric1Q69ZJ7 Ablim1-208ENSMUST00000111544 2231 ntTSL 5 BASIC28.79■■■□□ 2.2
Ric1Q69ZJ7 Nsd1-203ENSMUST00000224156 1149 ntBASIC28.79■■■□□ 2.2
Ric1Q69ZJ7 March5-202ENSMUST00000112391 1293 ntTSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
Ric1Q69ZJ7 Gsc2-201ENSMUST00000012279 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
Ric1Q69ZJ7 Fam98c-209ENSMUST00000164589 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.78■■■□□ 2.2
Ric1Q69ZJ7 Neurog2-201ENSMUST00000029587 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
Ric1Q69ZJ7 Pdcd4-203ENSMUST00000165617 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
Ric1Q69ZJ7 Pcf11-204ENSMUST00000208058 461 ntTSL 5 BASIC28.77■■■□□ 2.2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.9 ms