Protein–RNA interactions for Protein: Q66X19

Nlrp4e, NACHT, LRR and PYD domains-containing protein 4E, mousemouse

Predictions only

Length 978 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nlrp4eQ66X19 Gipc1-201ENSMUST00000019577 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
Nlrp4eQ66X19 Ptx3-201ENSMUST00000029421 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Nlrp4eQ66X19 Ccdc142-201ENSMUST00000101254 2317 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
Nlrp4eQ66X19 Glrx2-205ENSMUST00000145571 758 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
Nlrp4eQ66X19 Slc22a17-208ENSMUST00000228119 2348 ntAPPRIS P1 BASIC23.32■■□□□ 1.32
Nlrp4eQ66X19 Dnajc21-201ENSMUST00000136591 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
Nlrp4eQ66X19 Arl8a-201ENSMUST00000027684 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Nlrp4eQ66X19 Ell2-205ENSMUST00000222194 434 ntTSL 3 BASIC23.31■■□□□ 1.32
Nlrp4eQ66X19 Insc-208ENSMUST00000169913 2321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
Nlrp4eQ66X19 Sox1-201ENSMUST00000180353 4832 ntAPPRIS P1 BASIC23.3■■□□□ 1.32
Nlrp4eQ66X19 Gm42699-201ENSMUST00000198104 1657 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
Nlrp4eQ66X19 Gm6821-201ENSMUST00000107540 542 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
Nlrp4eQ66X19 Strn3-202ENSMUST00000169503 2791 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Nlrp4eQ66X19 Pou4f1-201ENSMUST00000053016 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Nlrp4eQ66X19 Zfp768-202ENSMUST00000205266 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
Nlrp4eQ66X19 Phf23-202ENSMUST00000101526 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Nlrp4eQ66X19 Gm37136-201ENSMUST00000194368 194 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
Nlrp4eQ66X19 Wnt5b-203ENSMUST00000119369 2339 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Nlrp4eQ66X19 Traf3ip1-203ENSMUST00000189341 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
Nlrp4eQ66X19 Rpl19-ps4-201ENSMUST00000167150 625 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
Nlrp4eQ66X19 Glrx3-201ENSMUST00000064404 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Nlrp4eQ66X19 Hoxb9-201ENSMUST00000000010 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Nlrp4eQ66X19 Ildr2-203ENSMUST00000192638 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Nlrp4eQ66X19 Kras-201ENSMUST00000032399 4678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Nlrp4eQ66X19 Arpc2-203ENSMUST00000113820 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Nlrp4eQ66X19 Gm4419-202ENSMUST00000226239 1431 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
Nlrp4eQ66X19 Tceal5-201ENSMUST00000066819 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Nlrp4eQ66X19 Rcor3-207ENSMUST00000192866 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
Nlrp4eQ66X19 Upf3a-201ENSMUST00000043767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Nlrp4eQ66X19 Fam89b-202ENSMUST00000116558 1189 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Nlrp4eQ66X19 Phlda3-201ENSMUST00000038945 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Nlrp4eQ66X19 Homer3-206ENSMUST00000140212 2608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Nlrp4eQ66X19 Dbndd2-202ENSMUST00000069385 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Nlrp4eQ66X19 Ccnyl1-203ENSMUST00000187170 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
Nlrp4eQ66X19 Arhgef25-205ENSMUST00000218654 2475 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
Nlrp4eQ66X19 H3f3aos-201ENSMUST00000097448 2905 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
Nlrp4eQ66X19 Gm5784-202ENSMUST00000220896 2016 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Nlrp4eQ66X19 2310061I04Rik-202ENSMUST00000146451 2081 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Nlrp4eQ66X19 Rasgef1c-203ENSMUST00000093142 2216 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Nlrp4eQ66X19 Hook1-201ENSMUST00000030306 5517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Nlrp4eQ66X19 B230322F03Rik-201ENSMUST00000181932 1569 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
Nlrp4eQ66X19 Tmem70-203ENSMUST00000177501 1636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Nlrp4eQ66X19 Dvl1-208ENSMUST00000168552 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Nlrp4eQ66X19 Gm11529-201ENSMUST00000153012 639 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Nlrp4eQ66X19 Gorasp2-205ENSMUST00000133432 1941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Nlrp4eQ66X19 Ctage5-203ENSMUST00000170992 2785 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Nlrp4eQ66X19 St6galnac6-205ENSMUST00000113290 2402 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
Nlrp4eQ66X19 Frmd5-201ENSMUST00000110592 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
Nlrp4eQ66X19 Ube2e3-201ENSMUST00000028398 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Nlrp4eQ66X19 Nrsn1-201ENSMUST00000057866 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Nlrp4eQ66X19 Gng12-204ENSMUST00000114225 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Nlrp4eQ66X19 Trim3-202ENSMUST00000106789 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Nlrp4eQ66X19 Nsun2-208ENSMUST00000176485 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
Nlrp4eQ66X19 Slc44a1-203ENSMUST00000107646 1974 ntTSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
Nlrp4eQ66X19 Pan3-201ENSMUST00000031651 5048 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
Nlrp4eQ66X19 Mthfd2l-201ENSMUST00000071652 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
Nlrp4eQ66X19 Luc7l3-203ENSMUST00000107821 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
Nlrp4eQ66X19 Fbxw4-201ENSMUST00000046869 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Nlrp4eQ66X19 Jmjd6-201ENSMUST00000047616 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Nlrp4eQ66X19 Cadps-203ENSMUST00000112658 5458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Nlrp4eQ66X19 Spsb3-202ENSMUST00000068508 2004 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Nlrp4eQ66X19 Otulin-201ENSMUST00000059662 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Nlrp4eQ66X19 Onecut3-201ENSMUST00000051773 4776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Nlrp4eQ66X19 Purg-202ENSMUST00000078058 1795 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Nlrp4eQ66X19 Srcap-210ENSMUST00000188124 2048 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Nlrp4eQ66X19 Kcnc3-203ENSMUST00000207493 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
Nlrp4eQ66X19 Scn1b-201ENSMUST00000098548 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Nlrp4eQ66X19 Impdh1-201ENSMUST00000078155 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Nlrp4eQ66X19 Nt5c3-201ENSMUST00000031793 1676 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Nlrp4eQ66X19 Mapk15-201ENSMUST00000089669 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Nlrp4eQ66X19 Otud5-204ENSMUST00000115667 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
Nlrp4eQ66X19 Gm29254-202ENSMUST00000189302 883 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Nlrp4eQ66X19 Cib1-201ENSMUST00000065163 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Nlrp4eQ66X19 Klhl22-201ENSMUST00000117192 2754 ntTSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
Nlrp4eQ66X19 Habp4-201ENSMUST00000021929 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Nlrp4eQ66X19 Mef2a-203ENSMUST00000076325 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Nlrp4eQ66X19 Npas1-201ENSMUST00000002053 2091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
Nlrp4eQ66X19 Tcf4-246ENSMUST00000202116 2986 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
Nlrp4eQ66X19 Nkx2-4-201ENSMUST00000067020 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
Nlrp4eQ66X19 Gm15156-201ENSMUST00000148217 417 ntTSL 3 BASIC23.14■■□□□ 1.29
Nlrp4eQ66X19 Sorcs2-202ENSMUST00000070720 2089 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Nlrp4eQ66X19 1110065P20Rik-201ENSMUST00000106190 968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
Nlrp4eQ66X19 Cacfd1-203ENSMUST00000114005 1286 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Nlrp4eQ66X19 Gm8503-201ENSMUST00000118131 455 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
Nlrp4eQ66X19 Mtor-201ENSMUST00000057580 1003 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Nlrp4eQ66X19 Foxo6-201ENSMUST00000102656 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Nlrp4eQ66X19 2410022M11Rik-201ENSMUST00000186474 1911 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
Nlrp4eQ66X19 Lrrc14-201ENSMUST00000036423 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Nlrp4eQ66X19 A230020J21Rik-202ENSMUST00000192407 1649 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
Nlrp4eQ66X19 Gsx1-201ENSMUST00000065382 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Nlrp4eQ66X19 Cbln2-203ENSMUST00000122464 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Nlrp4eQ66X19 4930542C12Rik-201ENSMUST00000171096 1203 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
Nlrp4eQ66X19 Rnf39-201ENSMUST00000040498 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Nlrp4eQ66X19 Med25-205ENSMUST00000207278 2287 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Nlrp4eQ66X19 Usp21-203ENSMUST00000111306 2185 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Nlrp4eQ66X19 Stambp-207ENSMUST00000206592 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Nlrp4eQ66X19 Vmac-201ENSMUST00000067931 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Nlrp4eQ66X19 Spats2-201ENSMUST00000063517 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Nlrp4eQ66X19 Tmem98-201ENSMUST00000040865 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Nlrp4eQ66X19 Homer3-203ENSMUST00000110124 2445 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 92.5 ms