Protein–RNA interactions for Protein: Q61412

Vsx2, Visual system homeobox 2, mousemouse

Predictions only

Length 361 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vsx2Q61412 Smagp-202ENSMUST00000172334 952 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Vsx2Q61412 Mir3960-201ENSMUST00000198213 73 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
Vsx2Q61412 Hoxd9-201ENSMUST00000059272 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Vsx2Q61412 Arl8a-201ENSMUST00000027684 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Vsx2Q61412 Phf2-201ENSMUST00000035540 5494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Vsx2Q61412 Gm38287-201ENSMUST00000195193 2051 ntTSL 3 BASIC21.95■■□□□ 1.11
Vsx2Q61412 Fam220a-204ENSMUST00000119488 2202 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Vsx2Q61412 Fam220a-209ENSMUST00000200267 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Vsx2Q61412 Gm28592-201ENSMUST00000186844 741 ntTSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
Vsx2Q61412 Efna2-201ENSMUST00000003154 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Vsx2Q61412 Dyrk2-201ENSMUST00000004281 6129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Vsx2Q61412 Fam212b-202ENSMUST00000098273 1868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Vsx2Q61412 Epop-201ENSMUST00000052281 2314 ntAPPRIS P1 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Vsx2Q61412 Pde8b-204ENSMUST00000159608 2370 ntTSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Vsx2Q61412 Zcchc14-201ENSMUST00000046386 7444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Vsx2Q61412 Nkx2-4-201ENSMUST00000067020 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Vsx2Q61412 St7-205ENSMUST00000081635 2115 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Vsx2Q61412 Wnt2-201ENSMUST00000010941 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Vsx2Q61412 Azin2-202ENSMUST00000106068 2049 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
Vsx2Q61412 Foxa2-202ENSMUST00000109964 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Vsx2Q61412 Nelfe-202ENSMUST00000165953 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Vsx2Q61412 Ccna1-202ENSMUST00000197238 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
Vsx2Q61412 AC154454.1-201ENSMUST00000225253 216 ntBASIC21.93■■□□□ 1.1
Vsx2Q61412 Pdcd4-201ENSMUST00000025931 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Vsx2Q61412 Tbr1-202ENSMUST00000102737 1406 ntTSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Vsx2Q61412 Gm13889-201ENSMUST00000099689 1386 ntBASIC21.92■■□□□ 1.1
Vsx2Q61412 Gm40983-202ENSMUST00000222598 1198 ntTSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Vsx2Q61412 Tfeb-202ENSMUST00000086932 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Vsx2Q61412 Lgi2-201ENSMUST00000039750 6456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Vsx2Q61412 Pard6a-203ENSMUST00000211888 1179 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Vsx2Q61412 Map2k7-201ENSMUST00000003027 1626 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Vsx2Q61412 Ubp1-204ENSMUST00000214095 2320 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Vsx2Q61412 Paqr6-203ENSMUST00000147948 837 ntTSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
Vsx2Q61412 Cnep1r1-201ENSMUST00000095214 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
Vsx2Q61412 Ccsap-202ENSMUST00000122421 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
Vsx2Q61412 Fam92a-202ENSMUST00000108285 1639 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
Vsx2Q61412 Gm45364-201ENSMUST00000210883 159 ntBASIC21.89■■□□□ 1.09
Vsx2Q61412 Atp5j-201ENSMUST00000023608 809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Vsx2Q61412 Srarp-201ENSMUST00000094544 905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Vsx2Q61412 Slc25a33-201ENSMUST00000105686 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Vsx2Q61412 Kcnq5-206ENSMUST00000173404 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
Vsx2Q61412 A230005M16Rik-201ENSMUST00000137661 1605 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Vsx2Q61412 Psip1-203ENSMUST00000107215 1898 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Vsx2Q61412 Egr4-201ENSMUST00000095759 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Vsx2Q61412 Ctage5-218ENSMUST00000177162 2728 ntTSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
Vsx2Q61412 Pkd1-207ENSMUST00000228550 1050 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
Vsx2Q61412 Rab21-201ENSMUST00000020343 4602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Vsx2Q61412 Sdccag3-202ENSMUST00000077983 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Vsx2Q61412 Ltb4r1-201ENSMUST00000057569 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Vsx2Q61412 Cln6-201ENSMUST00000034776 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Vsx2Q61412 D030046N08Rik-201ENSMUST00000162318 1570 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Vsx2Q61412 Bag2-201ENSMUST00000044691 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Vsx2Q61412 Fam181b-201ENSMUST00000051179 2003 ntAPPRIS P1 BASIC21.85■■□□□ 1.09
Vsx2Q61412 Artn-201ENSMUST00000070816 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Vsx2Q61412 Plpp2-204ENSMUST00000166804 1566 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Vsx2Q61412 Nnat-208ENSMUST00000173595 927 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
Vsx2Q61412 C1galt1-201ENSMUST00000040159 6092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Vsx2Q61412 Pdcd4-203ENSMUST00000165617 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Vsx2Q61412 Osbpl10-207ENSMUST00000183104 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
Vsx2Q61412 Gm11175-201ENSMUST00000116172 543 ntBASIC21.83■■□□□ 1.09
Vsx2Q61412 Gm9888-201ENSMUST00000150678 965 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Vsx2Q61412 Gm26533-201ENSMUST00000180550 1790 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Vsx2Q61412 Etfa-201ENSMUST00000034866 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
Vsx2Q61412 Gm12818-201ENSMUST00000117562 1349 ntBASIC21.82■■□□□ 1.08
Vsx2Q61412 Arpc2-203ENSMUST00000113820 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Vsx2Q61412 Cadm1-209ENSMUST00000152459 1784 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Vsx2Q61412 A230020J21Rik-202ENSMUST00000192407 1649 ntTSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
Vsx2Q61412 Dnajc19-202ENSMUST00000108195 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Vsx2Q61412 Mapk1-201ENSMUST00000023462 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Vsx2Q61412 Efhd2-201ENSMUST00000036854 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Vsx2Q61412 Gm11613-201ENSMUST00000134427 1971 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Vsx2Q61412 Smox-201ENSMUST00000028806 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Vsx2Q61412 Sh3d21-202ENSMUST00000097891 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Vsx2Q61412 Fbl-201ENSMUST00000042405 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Vsx2Q61412 Tmem192-202ENSMUST00000079896 916 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Vsx2Q61412 2610307P16Rik-205ENSMUST00000148885 1870 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Vsx2Q61412 Il17rd-202ENSMUST00000223942 2186 ntBASIC21.81■■□□□ 1.08
Vsx2Q61412 Sh3gl3-201ENSMUST00000032874 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Vsx2Q61412 Tbc1d25-203ENSMUST00000143984 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
Vsx2Q61412 Lor-201ENSMUST00000058150 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Vsx2Q61412 Dennd5a-201ENSMUST00000080437 5004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Vsx2Q61412 Gjd3-201ENSMUST00000062931 837 ntAPPRIS P1 BASIC21.8■■□□□ 1.08
Vsx2Q61412 Taf4-201ENSMUST00000041618 4416 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Vsx2Q61412 Hoxc13-201ENSMUST00000001700 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Vsx2Q61412 Arhgap9-203ENSMUST00000219026 1946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Vsx2Q61412 Ppp4c-201ENSMUST00000032936 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Vsx2Q61412 Rpl38-203ENSMUST00000106599 457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Vsx2Q61412 Scarna2-201ENSMUST00000157560 414 ntBASIC21.79■■□□□ 1.08
Vsx2Q61412 Gm20512-201ENSMUST00000172483 618 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Vsx2Q61412 Gipc1-201ENSMUST00000019577 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Vsx2Q61412 Thap8-202ENSMUST00000108187 1184 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
Vsx2Q61412 Cadm1-210ENSMUST00000214542 899 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Vsx2Q61412 Crct1-201ENSMUST00000029521 718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Vsx2Q61412 Dcun1d5-201ENSMUST00000034499 1122 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Vsx2Q61412 Cys1-207ENSMUST00000186602 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Vsx2Q61412 Rarres1-201ENSMUST00000054825 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Vsx2Q61412 Tspan33-202ENSMUST00000115250 1977 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Vsx2Q61412 2510046G10Rik-202ENSMUST00000187458 1052 ntBASIC21.77■■□□□ 1.08
Vsx2Q61412 Fam149b-203ENSMUST00000090499 2370 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Vsx2Q61412 St6galnac6-203ENSMUST00000095044 2394 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 76.5 ms