Protein–RNA interactions for Protein: Q60867

Neurod1, Neurogenic differentiation factor 1, mousemouse

Predictions only

Length 357 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Neurod1Q60867 Tmem235-201ENSMUST00000093905 1820 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.27■■■□□ 2.92
Neurod1Q60867 Klc1-201ENSMUST00000084941 2504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.27■■■□□ 2.92
Neurod1Q60867 Strn3-202ENSMUST00000169503 2791 ntTSL 1 (best) BASIC33.26■■■□□ 2.92
Neurod1Q60867 Rpl31-203ENSMUST00000179954 630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.26■■■□□ 2.91
Neurod1Q60867 Dbp-204ENSMUST00000211513 1156 ntTSL 5 BASIC33.26■■■□□ 2.91
Neurod1Q60867 Cited2-201ENSMUST00000038107 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.26■■■□□ 2.91
Neurod1Q60867 Pex10-201ENSMUST00000103180 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.26■■■□□ 2.91
Neurod1Q60867 Evl-201ENSMUST00000021689 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.26■■■□□ 2.91
Neurod1Q60867 4931440P22Rik-201ENSMUST00000099076 1786 ntTSL 1 (best) BASIC33.25■■■□□ 2.91
Neurod1Q60867 Gm16764-201ENSMUST00000138891 541 ntTSL 5 BASIC33.25■■■□□ 2.91
Neurod1Q60867 Rab43-202ENSMUST00000032135 1262 ntTSL 1 (best) BASIC33.25■■■□□ 2.91
Neurod1Q60867 Inafm2-201ENSMUST00000149978 3053 ntAPPRIS P1 BASIC33.25■■■□□ 2.91
Neurod1Q60867 Ssbp4-205ENSMUST00000210369 1828 ntTSL 2 BASIC33.25■■■□□ 2.91
Neurod1Q60867 Jmy-202ENSMUST00000220513 1843 ntTSL 1 (best) BASIC33.25■■■□□ 2.91
Neurod1Q60867 Chtf8-205ENSMUST00000176515 694 ntTSL 2 BASIC33.24■■■□□ 2.91
Neurod1Q60867 Gm37136-201ENSMUST00000194368 194 ntBASIC33.24■■■□□ 2.91
Neurod1Q60867 B3gat1-201ENSMUST00000115269 1665 ntTSL 1 (best) BASIC33.23■■■□□ 2.91
Neurod1Q60867 Fbxl14-201ENSMUST00000032094 2963 ntAPPRIS P1 BASIC33.22■■■□□ 2.91
Neurod1Q60867 Evl-202ENSMUST00000077735 2121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.22■■■□□ 2.91
Neurod1Q60867 AC167019.3-201ENSMUST00000228225 1266 ntBASIC33.22■■■□□ 2.91
Neurod1Q60867 Ctage5-211ENSMUST00000176322 2649 ntTSL 5 BASIC33.22■■■□□ 2.91
Neurod1Q60867 Pcsk1n-201ENSMUST00000041096 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.21■■■□□ 2.91
Neurod1Q60867 Kdf1-202ENSMUST00000105901 1699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.21■■■□□ 2.91
Neurod1Q60867 Asf1a-205ENSMUST00000219282 1150 ntTSL 5 BASIC33.21■■■□□ 2.91
Neurod1Q60867 Cpsf4-205ENSMUST00000160629 1713 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC33.2■■■□□ 2.91
Neurod1Q60867 Gm6311-201ENSMUST00000073790 878 ntBASIC33.2■■■□□ 2.91
Neurod1Q60867 Suds3-201ENSMUST00000086471 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.2■■■□□ 2.9
Neurod1Q60867 Vdac1-202ENSMUST00000102758 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.19■■■□□ 2.9
Neurod1Q60867 Gm37847-201ENSMUST00000192163 1497 ntBASIC33.18■■■□□ 2.9
Neurod1Q60867 Gm31748-201ENSMUST00000194938 1497 ntBASIC33.18■■■□□ 2.9
Neurod1Q60867 Zswim6-201ENSMUST00000105097 5456 ntTSL 5 BASIC33.18■■■□□ 2.9
Neurod1Q60867 1110008P14Rik-201ENSMUST00000048792 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.18■■■□□ 2.9
Neurod1Q60867 Whrn-202ENSMUST00000063672 2804 ntTSL 1 (best) BASIC33.17■■■□□ 2.9
Neurod1Q60867 Fam212b-202ENSMUST00000098273 1868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.17■■■□□ 2.9
Neurod1Q60867 Emid1-201ENSMUST00000062821 1947 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.17■■■□□ 2.9
Neurod1Q60867 Gm11613-201ENSMUST00000134427 1971 ntTSL 1 (best) BASIC33.17■■■□□ 2.9
Neurod1Q60867 Barhl1-202ENSMUST00000113847 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.17■■■□□ 2.9
Neurod1Q60867 Phf23-201ENSMUST00000018716 2006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.16■■■□□ 2.9
Neurod1Q60867 Lrp2-202ENSMUST00000092551 2228 ntTSL 1 (best) BASIC33.16■■■□□ 2.9
Neurod1Q60867 Homer1-207ENSMUST00000109494 2468 ntTSL 1 (best) BASIC33.16■■■□□ 2.9
Neurod1Q60867 March9-201ENSMUST00000040307 3037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.15■■■□□ 2.9
Neurod1Q60867 Dnttip1-201ENSMUST00000017443 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.15■■■□□ 2.9
Neurod1Q60867 Gm28592-201ENSMUST00000186844 741 ntTSL 5 BASIC33.15■■■□□ 2.9
Neurod1Q60867 Nt5c3-201ENSMUST00000031793 1676 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.15■■■□□ 2.9
Neurod1Q60867 Upf3a-201ENSMUST00000043767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.15■■■□□ 2.9
Neurod1Q60867 Zswim5-201ENSMUST00000044823 5582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.15■■■□□ 2.9
Neurod1Q60867 Gm4799-201ENSMUST00000095396 657 ntBASIC33.15■■■□□ 2.9
Neurod1Q60867 H3f3aos-201ENSMUST00000097448 2905 ntBASIC33.15■■■□□ 2.9
Neurod1Q60867 Tmem55b-201ENSMUST00000049312 1594 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC33.14■■■□□ 2.9
Neurod1Q60867 Mapk15-201ENSMUST00000089669 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.14■■■□□ 2.9
Neurod1Q60867 Nudt9-201ENSMUST00000031250 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.13■■■□□ 2.89
Neurod1Q60867 Sntb1-202ENSMUST00000110200 1225 ntTSL 1 (best) BASIC33.13■■■□□ 2.89
Neurod1Q60867 Pard6a-203ENSMUST00000211888 1179 ntTSL 1 (best) BASIC33.13■■■□□ 2.89
Neurod1Q60867 Tfeb-202ENSMUST00000086932 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.13■■■□□ 2.89
Neurod1Q60867 Tmem260-210ENSMUST00000227440 2222 ntAPPRIS ALT2 BASIC33.13■■■□□ 2.89
Neurod1Q60867 Mid2-201ENSMUST00000112988 2525 ntTSL 5 BASIC33.12■■■□□ 2.89
Neurod1Q60867 Actr5-201ENSMUST00000045644 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.12■■■□□ 2.89
Neurod1Q60867 Gmeb1-202ENSMUST00000105964 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.12■■■□□ 2.89
Neurod1Q60867 D16Ertd472e-201ENSMUST00000114218 1271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.12■■■□□ 2.89
Neurod1Q60867 Msl1-203ENSMUST00000107485 2091 ntTSL 1 (best) BASIC33.12■■■□□ 2.89
Neurod1Q60867 Artn-201ENSMUST00000070816 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.11■■■□□ 2.89
Neurod1Q60867 Krtap17-1-201ENSMUST00000105049 761 ntAPPRIS P1 BASIC33.1■■■□□ 2.89
Neurod1Q60867 Mad2l2-202ENSMUST00000084129 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.1■■■□□ 2.89
Neurod1Q60867 Hdac3-201ENSMUST00000043498 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.09■■■□□ 2.89
Neurod1Q60867 Vkorc1l1-201ENSMUST00000051758 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.09■■■□□ 2.89
Neurod1Q60867 Apcdd1-201ENSMUST00000096554 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.09■■■□□ 2.89
Neurod1Q60867 Srcap-211ENSMUST00000189136 1960 ntTSL 1 (best) BASIC33.09■■■□□ 2.89
Neurod1Q60867 Armc10-201ENSMUST00000072896 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.08■■■□□ 2.89
Neurod1Q60867 Suv39h2-202ENSMUST00000060618 1831 ntTSL 1 (best) BASIC33.08■■■□□ 2.89
Neurod1Q60867 Ip6k1-208ENSMUST00000176854 2251 ntTSL 1 (best) BASIC33.07■■■□□ 2.88
Neurod1Q60867 Nrarp-201ENSMUST00000104999 2582 ntAPPRIS P1 BASIC33.07■■■□□ 2.88
Neurod1Q60867 B230322F03Rik-201ENSMUST00000181932 1569 ntBASIC33.07■■■□□ 2.88
Neurod1Q60867 Ubac1-201ENSMUST00000036509 1852 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.07■■■□□ 2.88
Neurod1Q60867 Hdac2-201ENSMUST00000019911 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.07■■■□□ 2.88
Neurod1Q60867 Smurf1-201ENSMUST00000085684 5343 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC33.06■■■□□ 2.88
Neurod1Q60867 Rundc3b-202ENSMUST00000115378 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.05■■■□□ 2.88
Neurod1Q60867 Znrf1-207ENSMUST00000173506 1238 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.05■■■□□ 2.88
Neurod1Q60867 Ildr2-203ENSMUST00000192638 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.05■■■□□ 2.88
Neurod1Q60867 Pde6d-201ENSMUST00000027444 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.04■■■□□ 2.88
Neurod1Q60867 Arl8a-201ENSMUST00000027684 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.03■■■□□ 2.88
Neurod1Q60867 Izumo4-205ENSMUST00000218184 1196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.03■■■□□ 2.88
Neurod1Q60867 Notum-202ENSMUST00000106177 2212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.03■■■□□ 2.88
Neurod1Q60867 Efhd1os-201ENSMUST00000138844 332 ntTSL 3 BASIC33.02■■■□□ 2.88
Neurod1Q60867 Mrps15-201ENSMUST00000030675 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.02■■■□□ 2.88
Neurod1Q60867 Smagp-202ENSMUST00000172334 952 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.01■■■□□ 2.87
Neurod1Q60867 Rp9-201ENSMUST00000034763 1134 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.01■■■□□ 2.87
Neurod1Q60867 Rab26-202ENSMUST00000061764 1291 ntTSL 2 BASIC33.01■■■□□ 2.87
Neurod1Q60867 Kcnip2-202ENSMUST00000079431 2302 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC33.01■■■□□ 2.87
Neurod1Q60867 Ube2e3-201ENSMUST00000028398 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33■■■□□ 2.87
Neurod1Q60867 A930035D04Rik-201ENSMUST00000064013 543 ntBASIC33■■■□□ 2.87
Neurod1Q60867 Egr4-201ENSMUST00000095759 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33■■■□□ 2.87
Neurod1Q60867 Azin2-202ENSMUST00000106068 2049 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33■■■□□ 2.87
Neurod1Q60867 Crls1-201ENSMUST00000028835 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33■■■□□ 2.87
Neurod1Q60867 Arhgef25-205ENSMUST00000218654 2475 ntTSL 5 BASIC32.99■■■□□ 2.87
Neurod1Q60867 Gm26917-201ENSMUST00000182520 869 ntTSL 5 BASIC32.99■■■□□ 2.87
Neurod1Q60867 March2-206ENSMUST00000173329 2566 ntTSL 2 BASIC32.99■■■□□ 2.87
Neurod1Q60867 Hccs-201ENSMUST00000033717 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.99■■■□□ 2.87
Neurod1Q60867 Nelfe-202ENSMUST00000165953 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.98■■■□□ 2.87
Neurod1Q60867 Ajap1-201ENSMUST00000105646 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.98■■■□□ 2.87
Neurod1Q60867 Ptx3-201ENSMUST00000029421 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.98■■■□□ 2.87
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.1 ms