Protein–RNA interactions for Protein: Q60692

Psmb6, Proteasome subunit beta type-6, mousemouse

Predictions only

Length 238 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Psmb6Q60692 Homer3-203ENSMUST00000110124 2445 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Psmb6Q60692 Fam149b-202ENSMUST00000051915 1981 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.5
Psmb6Q60692 Sys1-201ENSMUST00000072452 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Psmb6Q60692 B3gat1-203ENSMUST00000159799 2021 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Psmb6Q60692 Fbxl14-201ENSMUST00000032094 2963 ntAPPRIS P1 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Psmb6Q60692 Phactr2-202ENSMUST00000105543 2735 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Psmb6Q60692 Zfp131-205ENSMUST00000223812 663 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
Psmb6Q60692 Atn1-201ENSMUST00000088357 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Psmb6Q60692 Mfn1-201ENSMUST00000091257 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Psmb6Q60692 Slc22a17-208ENSMUST00000228119 2348 ntAPPRIS P1 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Psmb6Q60692 Sugct-202ENSMUST00000220514 1351 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Psmb6Q60692 Pex10-201ENSMUST00000103180 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Psmb6Q60692 Cotl1-201ENSMUST00000034285 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Psmb6Q60692 Lrrc14-201ENSMUST00000036423 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Psmb6Q60692 Fam3c-201ENSMUST00000081288 1487 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Psmb6Q60692 Arrdc2-201ENSMUST00000002989 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Psmb6Q60692 March2-205ENSMUST00000173015 1418 ntTSL 3 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Psmb6Q60692 Mthfd2l-201ENSMUST00000071652 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Psmb6Q60692 Scn1b-201ENSMUST00000098548 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Psmb6Q60692 Notum-202ENSMUST00000106177 2212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Psmb6Q60692 Dedd-201ENSMUST00000064950 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Psmb6Q60692 Zcchc2-201ENSMUST00000118196 5796 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Psmb6Q60692 Tdp2-203ENSMUST00000223804 1136 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
Psmb6Q60692 Gm5784-202ENSMUST00000220896 2016 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Psmb6Q60692 Wnt5b-203ENSMUST00000119369 2339 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Psmb6Q60692 Fam193a-202ENSMUST00000180376 5536 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Psmb6Q60692 Magi2-201ENSMUST00000088516 4843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Psmb6Q60692 Apcdd1-201ENSMUST00000096554 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Psmb6Q60692 Syndig1l-204ENSMUST00000222422 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Psmb6Q60692 2310014F06Rik-201ENSMUST00000146145 1567 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Psmb6Q60692 Dlx2-201ENSMUST00000024159 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Psmb6Q60692 2410022M11Rik-201ENSMUST00000186474 1911 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
Psmb6Q60692 Epb41l4b-201ENSMUST00000030142 3247 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Psmb6Q60692 Agps-202ENSMUST00000111952 2589 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Psmb6Q60692 Slc16a11-205ENSMUST00000126388 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Psmb6Q60692 Kif1c-205ENSMUST00000152618 1943 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Psmb6Q60692 Qk-201ENSMUST00000042296 6718 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Psmb6Q60692 Nrarp-201ENSMUST00000104999 2582 ntAPPRIS P1 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Psmb6Q60692 Fam102b-202ENSMUST00000171143 5702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Psmb6Q60692 Gorasp2-205ENSMUST00000133432 1941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Psmb6Q60692 Gm10499-202ENSMUST00000174778 1698 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Psmb6Q60692 Dhrs13os-201ENSMUST00000150471 2429 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Psmb6Q60692 Tmpo-203ENSMUST00000092219 1854 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Psmb6Q60692 Grb2-201ENSMUST00000021090 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Psmb6Q60692 Sorcs2-202ENSMUST00000070720 2089 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Psmb6Q60692 1700069B07Rik-202ENSMUST00000191155 939 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
Psmb6Q60692 Gm37847-201ENSMUST00000192163 1497 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
Psmb6Q60692 Gm31748-201ENSMUST00000194938 1497 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
Psmb6Q60692 Slc44a1-203ENSMUST00000107646 1974 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Psmb6Q60692 Mlx-201ENSMUST00000017945 1965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Psmb6Q60692 Zgpat-202ENSMUST00000108807 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Psmb6Q60692 Ing2-201ENSMUST00000080353 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Psmb6Q60692 Pard6a-205ENSMUST00000212430 1261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Psmb6Q60692 Dazap1-202ENSMUST00000105361 1537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Psmb6Q60692 Particl-201ENSMUST00000205370 1560 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
Psmb6Q60692 Dedd-204ENSMUST00000111300 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Psmb6Q60692 Mtf2-202ENSMUST00000112626 1968 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Psmb6Q60692 Grap-201ENSMUST00000004959 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Psmb6Q60692 Hmx3-201ENSMUST00000046093 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Psmb6Q60692 Amigo1-203ENSMUST00000106659 1360 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Psmb6Q60692 BC037032-205ENSMUST00000187080 508 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Psmb6Q60692 Rfwd2-201ENSMUST00000076894 5116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Psmb6Q60692 Dyrk1b-202ENSMUST00000172467 2523 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Psmb6Q60692 Dyrk1b-201ENSMUST00000085901 2534 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Psmb6Q60692 Cntln-202ENSMUST00000102819 2239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Psmb6Q60692 Il3ra-201ENSMUST00000090591 1614 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Psmb6Q60692 Bean1-205ENSMUST00000212979 2131 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Psmb6Q60692 Mlycd-201ENSMUST00000098367 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Psmb6Q60692 Adgrb1-201ENSMUST00000042035 6228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Psmb6Q60692 H2afy-201ENSMUST00000016081 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Psmb6Q60692 Srcap-210ENSMUST00000188124 2048 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Psmb6Q60692 Lor-201ENSMUST00000058150 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Psmb6Q60692 Pitx2-202ENSMUST00000042587 2271 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Psmb6Q60692 Dnajc21-201ENSMUST00000136591 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.49
Psmb6Q60692 Aebp2-203ENSMUST00000095350 2575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Psmb6Q60692 Dbp-201ENSMUST00000080885 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Psmb6Q60692 Gm9397-201ENSMUST00000200125 605 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
Psmb6Q60692 Ccnl2-201ENSMUST00000030944 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Psmb6Q60692 Tmcc1-202ENSMUST00000088896 5838 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Psmb6Q60692 Sel1l3-201ENSMUST00000031090 4512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Psmb6Q60692 Gm43863-201ENSMUST00000203822 1192 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
Psmb6Q60692 Cpsf4-201ENSMUST00000070487 1606 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Psmb6Q60692 Spire2-201ENSMUST00000010298 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Psmb6Q60692 Foxe1-201ENSMUST00000095097 2804 ntAPPRIS P1 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Psmb6Q60692 Mprip-204ENSMUST00000116371 8766 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Psmb6Q60692 Eid2-201ENSMUST00000059596 1392 ntAPPRIS P1 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Psmb6Q60692 Lmo4-201ENSMUST00000120539 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Psmb6Q60692 Gm13042-201ENSMUST00000119244 1955 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
Psmb6Q60692 Nckap1-201ENSMUST00000028386 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Psmb6Q60692 Psip1-203ENSMUST00000107215 1898 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Psmb6Q60692 Ammecr1-201ENSMUST00000041317 5437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Psmb6Q60692 Ubl3-204ENSMUST00000201595 2064 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Psmb6Q60692 Hif1a-203ENSMUST00000110464 1759 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Psmb6Q60692 Rhbdl1-201ENSMUST00000026831 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Psmb6Q60692 Arglu1-201ENSMUST00000048545 3197 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Psmb6Q60692 Fam91a1-201ENSMUST00000037270 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Psmb6Q60692 Gm24970-201ENSMUST00000175582 82 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
Psmb6Q60692 Dapk1-202ENSMUST00000077453 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Psmb6Q60692 Nckap1-202ENSMUST00000111760 4597 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Psmb6Q60692 BC037034-205ENSMUST00000159649 2093 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 10.3 ms