Protein–RNA interactions for Protein: Q5SYH2

Tmem199, Transmembrane protein 199, mousemouse

Predictions only

Length 208 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tmem199Q5SYH2 Sh3gl3-201ENSMUST00000032874 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Tmem199Q5SYH2 Lsm4-201ENSMUST00000034311 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Tmem199Q5SYH2 A930002H24Rik-201ENSMUST00000050753 492 ntAPPRIS P1 BASIC24.5■■□□□ 1.51
Tmem199Q5SYH2 Kctd6-201ENSMUST00000022272 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Tmem199Q5SYH2 Tmx4-202ENSMUST00000110119 596 ntTSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
Tmem199Q5SYH2 Socs2-202ENSMUST00000119917 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Tmem199Q5SYH2 Ybx3-201ENSMUST00000032309 1853 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Tmem199Q5SYH2 Cetn4-201ENSMUST00000071400 1808 ntTSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
Tmem199Q5SYH2 D17Wsu92e-201ENSMUST00000075076 1470 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Tmem199Q5SYH2 Pex10-201ENSMUST00000103180 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Tmem199Q5SYH2 Dnttip1-201ENSMUST00000017443 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Tmem199Q5SYH2 Gm37847-201ENSMUST00000192163 1497 ntBASIC24.47■■□□□ 1.51
Tmem199Q5SYH2 Gm31748-201ENSMUST00000194938 1497 ntBASIC24.47■■□□□ 1.51
Tmem199Q5SYH2 Bag1-203ENSMUST00000191273 1348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Tmem199Q5SYH2 Nsd1-203ENSMUST00000224156 1149 ntBASIC24.47■■□□□ 1.51
Tmem199Q5SYH2 Gmeb1-202ENSMUST00000105964 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Tmem199Q5SYH2 Syce2-202ENSMUST00000136026 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Tmem199Q5SYH2 Dazap1-203ENSMUST00000105362 2081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Tmem199Q5SYH2 0610009L18Rik-201ENSMUST00000143813 619 ntTSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
Tmem199Q5SYH2 Gm43566-201ENSMUST00000196851 808 ntBASIC24.46■■□□□ 1.51
Tmem199Q5SYH2 Ak2-201ENSMUST00000030583 986 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Tmem199Q5SYH2 Mapkap1-202ENSMUST00000113124 1758 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
Tmem199Q5SYH2 Ryk-203ENSMUST00000175883 2505 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
Tmem199Q5SYH2 Gng12-203ENSMUST00000114224 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.45■■□□□ 1.5
Tmem199Q5SYH2 Gng12-206ENSMUST00000114227 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Tmem199Q5SYH2 Papola-211ENSMUST00000166735 1033 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Tmem199Q5SYH2 Gm28417-202ENSMUST00000185881 538 ntTSL 3 BASIC24.45■■□□□ 1.5
Tmem199Q5SYH2 Zxda-201ENSMUST00000117281 2621 ntBASIC24.44■■□□□ 1.5
Tmem199Q5SYH2 Hecw2-202ENSMUST00000097741 1132 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Tmem199Q5SYH2 Dynll1-202ENSMUST00000112090 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
Tmem199Q5SYH2 Gm43592-201ENSMUST00000196922 1165 ntBASIC24.43■■□□□ 1.5
Tmem199Q5SYH2 Foxe3-201ENSMUST00000050940 867 ntAPPRIS P1 BASIC24.43■■□□□ 1.5
Tmem199Q5SYH2 Mapk1-203ENSMUST00000115731 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Tmem199Q5SYH2 Cpsf4-205ENSMUST00000160629 1713 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Tmem199Q5SYH2 Rundc3b-202ENSMUST00000115378 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
Tmem199Q5SYH2 March5-202ENSMUST00000112391 1293 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Tmem199Q5SYH2 Gm13238-201ENSMUST00000117655 780 ntBASIC24.42■■□□□ 1.5
Tmem199Q5SYH2 Hrasls-204ENSMUST00000162747 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Tmem199Q5SYH2 Vax1-201ENSMUST00000172821 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Tmem199Q5SYH2 Syce3-201ENSMUST00000109314 448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Tmem199Q5SYH2 Usf2-203ENSMUST00000162228 960 ntTSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
Tmem199Q5SYH2 1700097N02Rik-201ENSMUST00000188852 845 ntTSL 3 BASIC24.4■■□□□ 1.5
Tmem199Q5SYH2 Arpc2-203ENSMUST00000113820 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Tmem199Q5SYH2 Usp2-206ENSMUST00000176416 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
Tmem199Q5SYH2 Gm28040-202ENSMUST00000184603 890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.49
Tmem199Q5SYH2 Gm45444-201ENSMUST00000211394 898 ntBASIC24.39■■□□□ 1.49
Tmem199Q5SYH2 Ybx3-202ENSMUST00000087865 1684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Tmem199Q5SYH2 H2afj-202ENSMUST00000203982 577 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC24.38■■□□□ 1.49
Tmem199Q5SYH2 Gm45102-201ENSMUST00000207427 857 ntBASIC24.38■■□□□ 1.49
Tmem199Q5SYH2 Srcap-202ENSMUST00000098025 1257 ntTSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
Tmem199Q5SYH2 Ipmk-203ENSMUST00000121446 1492 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
Tmem199Q5SYH2 Rps19-202ENSMUST00000108429 633 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
Tmem199Q5SYH2 Ntn5-203ENSMUST00000183120 1491 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Tmem199Q5SYH2 4921531C22Rik-201ENSMUST00000150145 1905 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Tmem199Q5SYH2 Dhrs11-201ENSMUST00000047560 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Tmem199Q5SYH2 Nr2f6-201ENSMUST00000002466 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Tmem199Q5SYH2 Pth1r-202ENSMUST00000166716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Tmem199Q5SYH2 Usf1-210ENSMUST00000167546 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
Tmem199Q5SYH2 Anxa5-201ENSMUST00000029266 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Tmem199Q5SYH2 Gm21989-201ENSMUST00000174530 1609 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Tmem199Q5SYH2 Jdp2-201ENSMUST00000050687 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Tmem199Q5SYH2 Tsg101-201ENSMUST00000014546 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Tmem199Q5SYH2 Gemin7-203ENSMUST00000119912 653 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.34■■□□□ 1.49
Tmem199Q5SYH2 Gm14117-201ENSMUST00000122417 843 ntBASIC24.34■■□□□ 1.49
Tmem199Q5SYH2 Gm42501-201ENSMUST00000200220 1026 ntBASIC24.33■■□□□ 1.49
Tmem199Q5SYH2 Asph-201ENSMUST00000038564 1174 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Tmem199Q5SYH2 Asph-205ENSMUST00000098275 1007 ntTSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
Tmem199Q5SYH2 Gm10645-201ENSMUST00000098605 1090 ntAPPRIS P1 BASIC24.33■■□□□ 1.49
Tmem199Q5SYH2 Cckbr-202ENSMUST00000181339 1326 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
Tmem199Q5SYH2 Dyrk1a-202ENSMUST00000119878 5759 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
Tmem199Q5SYH2 Fam168b-204ENSMUST00000170092 941 ntTSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
Tmem199Q5SYH2 Fkbp1b-201ENSMUST00000020964 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Tmem199Q5SYH2 A230005M16Rik-201ENSMUST00000137661 1605 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Tmem199Q5SYH2 Gm20684-201ENSMUST00000176744 380 ntTSL 3 BASIC24.31■■□□□ 1.48
Tmem199Q5SYH2 Ube2k-206ENSMUST00000201984 1449 ntTSL 3 BASIC24.31■■□□□ 1.48
Tmem199Q5SYH2 Rpl34-201ENSMUST00000062601 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Tmem199Q5SYH2 Lor-201ENSMUST00000058150 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Tmem199Q5SYH2 Smox-206ENSMUST00000110183 1159 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Tmem199Q5SYH2 Cyp2r1-202ENSMUST00000119712 917 ntTSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
Tmem199Q5SYH2 Eif5a-213ENSMUST00000164359 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
Tmem199Q5SYH2 Oaz2-206ENSMUST00000153700 1843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
Tmem199Q5SYH2 Mpnd-208ENSMUST00000159996 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
Tmem199Q5SYH2 Cdkn2d-203ENSMUST00000215619 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Tmem199Q5SYH2 Gt(ROSA)26Sor-201ENSMUST00000124246 1181 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Tmem199Q5SYH2 Camk2n2-201ENSMUST00000052939 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Tmem199Q5SYH2 Fn1-208ENSMUST00000186940 1350 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Tmem199Q5SYH2 Gsk3a-201ENSMUST00000071739 2260 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
Tmem199Q5SYH2 Zbtb12-201ENSMUST00000052778 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Tmem199Q5SYH2 AC117769.4-201ENSMUST00000225679 685 ntBASIC24.28■■□□□ 1.48
Tmem199Q5SYH2 March2-203ENSMUST00000172767 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Tmem199Q5SYH2 Upp2-202ENSMUST00000071543 2150 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Tmem199Q5SYH2 Ndfip1-201ENSMUST00000025293 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Tmem199Q5SYH2 Caap1-201ENSMUST00000030313 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Tmem199Q5SYH2 Tmem238-201ENSMUST00000168578 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Tmem199Q5SYH2 Arpp19-206ENSMUST00000168301 599 ntTSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
Tmem199Q5SYH2 Vegfb-201ENSMUST00000025914 1281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Tmem199Q5SYH2 Hrh3-205ENSMUST00000165762 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
Tmem199Q5SYH2 Rab40c-201ENSMUST00000026826 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Tmem199Q5SYH2 Ctbp1-201ENSMUST00000079746 2279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Tmem199Q5SYH2 Pcf11-204ENSMUST00000208058 461 ntTSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.7 ms