Protein–RNA interactions for Protein: Q5SSL4

Abr, Active breakpoint cluster region-related protein, mousemouse

Predictions only

Length 859 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AbrQ5SSL4 Ttc9-201ENSMUST00000036116 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
AbrQ5SSL4 Gm10499-202ENSMUST00000174778 1698 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
AbrQ5SSL4 Srarp-201ENSMUST00000094544 905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
AbrQ5SSL4 Fam212b-202ENSMUST00000098273 1868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
AbrQ5SSL4 Deaf1-201ENSMUST00000080553 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
AbrQ5SSL4 Rab26-202ENSMUST00000061764 1291 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
AbrQ5SSL4 Gm12818-201ENSMUST00000117562 1349 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
AbrQ5SSL4 Jmjd6-201ENSMUST00000047616 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
AbrQ5SSL4 Nrsn1-201ENSMUST00000057866 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
AbrQ5SSL4 Rasgef1c-203ENSMUST00000093142 2216 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
AbrQ5SSL4 Efhd1os-201ENSMUST00000138844 332 ntTSL 3 BASIC22.19■■□□□ 1.14
AbrQ5SSL4 Cadps-201ENSMUST00000067491 5421 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
AbrQ5SSL4 Gm38287-201ENSMUST00000195193 2051 ntTSL 3 BASIC22.19■■□□□ 1.14
AbrQ5SSL4 Egr4-201ENSMUST00000095759 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
AbrQ5SSL4 Gm15688-201ENSMUST00000161394 2418 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
AbrQ5SSL4 Tfeb-202ENSMUST00000086932 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
AbrQ5SSL4 Znrf1-207ENSMUST00000173506 1238 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
AbrQ5SSL4 Fam126a-206ENSMUST00000197617 2288 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
AbrQ5SSL4 Smox-201ENSMUST00000028806 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
AbrQ5SSL4 Nelfe-202ENSMUST00000165953 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
AbrQ5SSL4 Cd320-201ENSMUST00000002379 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
AbrQ5SSL4 Pkd1-207ENSMUST00000228550 1050 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
AbrQ5SSL4 Gm9812-201ENSMUST00000061934 968 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
AbrQ5SSL4 Efna3-201ENSMUST00000029673 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
AbrQ5SSL4 Gm9888-201ENSMUST00000150678 965 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
AbrQ5SSL4 Eid1-201ENSMUST00000164756 1691 ntAPPRIS P1 BASIC22.15■■□□□ 1.14
AbrQ5SSL4 Nog-201ENSMUST00000061728 1695 ntAPPRIS P1 BASIC22.15■■□□□ 1.14
AbrQ5SSL4 1110008P14Rik-201ENSMUST00000048792 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
AbrQ5SSL4 Slc44a1-203ENSMUST00000107646 1974 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
AbrQ5SSL4 Dnajc21-201ENSMUST00000136591 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
AbrQ5SSL4 Aspscr1-203ENSMUST00000106158 1690 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.14
AbrQ5SSL4 Azin2-203ENSMUST00000119354 1921 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
AbrQ5SSL4 Mypop-201ENSMUST00000059331 2173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
AbrQ5SSL4 Arx-202ENSMUST00000113947 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
AbrQ5SSL4 Ran-202ENSMUST00000111343 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
AbrQ5SSL4 Neurl4-201ENSMUST00000061837 5188 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
AbrQ5SSL4 Rbm45-201ENSMUST00000046389 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
AbrQ5SSL4 Foxd2-201ENSMUST00000068654 2592 ntAPPRIS P1 BASIC22.13■■□□□ 1.13
AbrQ5SSL4 2510046G10Rik-202ENSMUST00000187458 1052 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
AbrQ5SSL4 Ube2h-201ENSMUST00000094543 975 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
AbrQ5SSL4 Nisch-222ENSMUST00000172142 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
AbrQ5SSL4 Kctd6-201ENSMUST00000022272 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
AbrQ5SSL4 AC122317.2-201ENSMUST00000218708 1248 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
AbrQ5SSL4 Fam220a-201ENSMUST00000067145 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
AbrQ5SSL4 B4galt2-201ENSMUST00000030266 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
AbrQ5SSL4 Paqr6-203ENSMUST00000147948 837 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
AbrQ5SSL4 Gm20512-201ENSMUST00000172483 618 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
AbrQ5SSL4 Ankrd49-205ENSMUST00000216037 1037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
AbrQ5SSL4 Asf1a-205ENSMUST00000219282 1150 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
AbrQ5SSL4 6330403L08Rik-202ENSMUST00000187923 5522 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
AbrQ5SSL4 Kctd2-201ENSMUST00000103035 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
AbrQ5SSL4 Prr5-201ENSMUST00000065499 1830 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
AbrQ5SSL4 Dbndd2-202ENSMUST00000069385 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
AbrQ5SSL4 Ier5l-201ENSMUST00000065134 2683 ntAPPRIS P1 BASIC22.1■■□□□ 1.13
AbrQ5SSL4 Slc22a17-201ENSMUST00000050772 2290 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
AbrQ5SSL4 Ltb4r1-201ENSMUST00000057569 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
AbrQ5SSL4 Sntb1-202ENSMUST00000110200 1225 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
AbrQ5SSL4 Gm11613-201ENSMUST00000134427 1971 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
AbrQ5SSL4 E130309D02Rik-201ENSMUST00000046418 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
AbrQ5SSL4 Kctd15-202ENSMUST00000108069 2407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
AbrQ5SSL4 Artn-201ENSMUST00000070816 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
AbrQ5SSL4 Smagp-202ENSMUST00000172334 952 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
AbrQ5SSL4 Trappc6b-201ENSMUST00000021380 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
AbrQ5SSL4 Tmem192-202ENSMUST00000079896 916 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
AbrQ5SSL4 Scrt2-201ENSMUST00000064061 3395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
AbrQ5SSL4 Gm20208-202ENSMUST00000219905 1528 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
AbrQ5SSL4 Asf1a-201ENSMUST00000020004 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
AbrQ5SSL4 Wnt5b-203ENSMUST00000119369 2339 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
AbrQ5SSL4 Homer3-201ENSMUST00000003669 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
AbrQ5SSL4 Tmem9b-201ENSMUST00000033333 1703 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
AbrQ5SSL4 Rarres1-201ENSMUST00000054825 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
AbrQ5SSL4 AC153911.1-201ENSMUST00000220378 758 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
AbrQ5SSL4 Dcun1d5-201ENSMUST00000034499 1122 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
AbrQ5SSL4 Kcnk2-205ENSMUST00000192723 1642 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
AbrQ5SSL4 2610307P16Rik-205ENSMUST00000148885 1870 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
AbrQ5SSL4 Hoxc8-201ENSMUST00000001703 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
AbrQ5SSL4 A830010M20Rik-207ENSMUST00000162298 1408 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
AbrQ5SSL4 Crlf2-201ENSMUST00000044579 1323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
AbrQ5SSL4 Scarna2-201ENSMUST00000157560 414 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
AbrQ5SSL4 Fbl-201ENSMUST00000042405 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
AbrQ5SSL4 Ndufs3-201ENSMUST00000005647 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
AbrQ5SSL4 Cdkn2c-202ENSMUST00000097921 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
AbrQ5SSL4 A330041J22Rik-201ENSMUST00000150367 1825 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
AbrQ5SSL4 Rnf39-201ENSMUST00000040498 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
AbrQ5SSL4 Pom121-201ENSMUST00000111171 5580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
AbrQ5SSL4 Hook1-202ENSMUST00000107083 1506 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
AbrQ5SSL4 Fads2-201ENSMUST00000025567 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
AbrQ5SSL4 Thap8-202ENSMUST00000108187 1184 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
AbrQ5SSL4 4930597O21Rik-201ENSMUST00000065878 984 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
AbrQ5SSL4 Terc-201ENSMUST00000082862 423 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
AbrQ5SSL4 Hoxb3-202ENSMUST00000093944 3190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
AbrQ5SSL4 Pdpk1-203ENSMUST00000115407 1730 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
AbrQ5SSL4 Camsap1-212ENSMUST00000183461 5090 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
AbrQ5SSL4 Gjd3-201ENSMUST00000062931 837 ntAPPRIS P1 BASIC22.01■■□□□ 1.11
AbrQ5SSL4 Heca-201ENSMUST00000037879 5098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
AbrQ5SSL4 Syndig1l-201ENSMUST00000095550 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
AbrQ5SSL4 Hoxb3-201ENSMUST00000055334 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
AbrQ5SSL4 Gm15918-201ENSMUST00000137259 689 ntTSL 3 BASIC22■■□□□ 1.11
AbrQ5SSL4 Gm16437-201ENSMUST00000025669 507 ntBASIC22■■□□□ 1.11
AbrQ5SSL4 Hecw2-202ENSMUST00000097741 1132 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 11.5 ms