Protein–RNA interactions for Protein: Q5NCI0

Urgcp, Up-regulator of cell proliferation, mousemouse

Predictions only

Length 926 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UrgcpQ5NCI0 Acvr2b-201ENSMUST00000035093 1729 ntTSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
UrgcpQ5NCI0 Slc30a2-203ENSMUST00000105873 1224 ntTSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
UrgcpQ5NCI0 Gm39157-201ENSMUST00000212322 1180 ntTSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
UrgcpQ5NCI0 Kiss1-201ENSMUST00000007433 779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
UrgcpQ5NCI0 Inafm1-201ENSMUST00000169612 1605 ntAPPRIS P1 BASIC24.2■■□□□ 1.46
UrgcpQ5NCI0 Mbd3-203ENSMUST00000105348 1222 ntTSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
UrgcpQ5NCI0 Mrpl23-201ENSMUST00000038675 692 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
UrgcpQ5NCI0 Hecw2-202ENSMUST00000097741 1132 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
UrgcpQ5NCI0 Csnk1g2-201ENSMUST00000079773 2348 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
UrgcpQ5NCI0 Tmpo-203ENSMUST00000092219 1854 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
UrgcpQ5NCI0 Kctd2-201ENSMUST00000103035 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
UrgcpQ5NCI0 Tmem240-202ENSMUST00000147721 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
UrgcpQ5NCI0 Slc35a2-211ENSMUST00000208640 486 ntTSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
UrgcpQ5NCI0 Srsf2-206ENSMUST00000190993 1326 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
UrgcpQ5NCI0 Ethe1-201ENSMUST00000077191 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
UrgcpQ5NCI0 Ube2k-203ENSMUST00000201266 1449 ntTSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
UrgcpQ5NCI0 Cadm1-209ENSMUST00000152459 1784 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
UrgcpQ5NCI0 Ppp1ca-201ENSMUST00000046094 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
UrgcpQ5NCI0 Ccna1-202ENSMUST00000197238 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
UrgcpQ5NCI0 Paqr3-202ENSMUST00000112968 1875 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
UrgcpQ5NCI0 Gm27040-201ENSMUST00000181984 504 ntTSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
UrgcpQ5NCI0 Rab4b-201ENSMUST00000093040 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
UrgcpQ5NCI0 Hnrnpk-210ENSMUST00000176558 1053 ntTSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
UrgcpQ5NCI0 Ppa2-203ENSMUST00000122334 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
UrgcpQ5NCI0 Tmem70-203ENSMUST00000177501 1636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
UrgcpQ5NCI0 Ppp2r3d-202ENSMUST00000180270 450 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
UrgcpQ5NCI0 AC151971.4-201ENSMUST00000214717 704 ntBASIC24.13■■□□□ 1.45
UrgcpQ5NCI0 H2afy-202ENSMUST00000045788 1933 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
UrgcpQ5NCI0 Glrx3-201ENSMUST00000064404 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
UrgcpQ5NCI0 Gm21989-201ENSMUST00000174530 1609 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
UrgcpQ5NCI0 Fam168b-201ENSMUST00000047534 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
UrgcpQ5NCI0 Gm26711-201ENSMUST00000180866 1833 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
UrgcpQ5NCI0 Suds3-201ENSMUST00000086471 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
UrgcpQ5NCI0 A030014E15Rik-201ENSMUST00000223400 796 ntAPPRIS P1 BASIC24.1■■□□□ 1.45
UrgcpQ5NCI0 Dennd5a-202ENSMUST00000106722 4862 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
UrgcpQ5NCI0 Adra1d-201ENSMUST00000103184 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
UrgcpQ5NCI0 Tmem170b-202ENSMUST00000221694 602 ntTSL 3 BASIC24.09■■□□□ 1.45
UrgcpQ5NCI0 Fam149b-203ENSMUST00000090499 2370 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
UrgcpQ5NCI0 Cadm1-206ENSMUST00000143026 1643 ntTSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
UrgcpQ5NCI0 Gm20458-201ENSMUST00000164863 1369 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
UrgcpQ5NCI0 Gm44428-201ENSMUST00000204474 874 ntBASIC24.08■■□□□ 1.45
UrgcpQ5NCI0 Rcan1-202ENSMUST00000060005 2324 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
UrgcpQ5NCI0 Rcor2-201ENSMUST00000066646 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
UrgcpQ5NCI0 5031425E22Rik-201ENSMUST00000101522 2110 ntBASIC24.08■■□□□ 1.45
UrgcpQ5NCI0 Rpl35-201ENSMUST00000080861 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
UrgcpQ5NCI0 AC122428.3-201ENSMUST00000215551 2290 ntBASIC24.07■■□□□ 1.44
UrgcpQ5NCI0 Sos2-201ENSMUST00000035773 5607 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
UrgcpQ5NCI0 Trnau1ap-203ENSMUST00000105962 961 ntTSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
UrgcpQ5NCI0 Gm13594-201ENSMUST00000137582 476 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
UrgcpQ5NCI0 Clptm1l-201ENSMUST00000022102 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
UrgcpQ5NCI0 Plekha3-201ENSMUST00000111920 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
UrgcpQ5NCI0 Jag2-201ENSMUST00000075827 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
UrgcpQ5NCI0 Nudc-201ENSMUST00000030665 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
UrgcpQ5NCI0 Pdpk1-203ENSMUST00000115407 1730 ntTSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
UrgcpQ5NCI0 Mef2a-201ENSMUST00000032776 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
UrgcpQ5NCI0 Vegfa-211ENSMUST00000167860 975 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
UrgcpQ5NCI0 Vegfa-212ENSMUST00000214739 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
UrgcpQ5NCI0 Vegfa-213ENSMUST00000217017 1179 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
UrgcpQ5NCI0 Oaz2-206ENSMUST00000153700 1843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
UrgcpQ5NCI0 Ipmk-202ENSMUST00000118381 1323 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
UrgcpQ5NCI0 Hoxd9-201ENSMUST00000059272 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
UrgcpQ5NCI0 Kcnk2-205ENSMUST00000192723 1642 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
UrgcpQ5NCI0 Efna2-201ENSMUST00000003154 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
UrgcpQ5NCI0 Cys1-207ENSMUST00000186602 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
UrgcpQ5NCI0 A830092H15Rik-201ENSMUST00000099182 1229 ntBASIC24.02■■□□□ 1.44
UrgcpQ5NCI0 Fus-201ENSMUST00000077609 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
UrgcpQ5NCI0 Rab4a-202ENSMUST00000118535 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
UrgcpQ5NCI0 Hist2h3c1-201ENSMUST00000176059 1820 ntAPPRIS P1 BASIC24.01■■□□□ 1.43
UrgcpQ5NCI0 Hist2h3c1-202ENSMUST00000177796 1825 ntBASIC24.01■■□□□ 1.43
UrgcpQ5NCI0 Gng12-204ENSMUST00000114225 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
UrgcpQ5NCI0 Gm5067-201ENSMUST00000170449 1009 ntBASIC24.01■■□□□ 1.43
UrgcpQ5NCI0 Ildr2-202ENSMUST00000192426 1238 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
UrgcpQ5NCI0 Galr3-201ENSMUST00000058004 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
UrgcpQ5NCI0 Cited2-201ENSMUST00000038107 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
UrgcpQ5NCI0 Sox3-201ENSMUST00000135107 2065 ntAPPRIS P1 BASIC24.01■■□□□ 1.43
UrgcpQ5NCI0 Usf1-210ENSMUST00000167546 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
UrgcpQ5NCI0 Rbm45-201ENSMUST00000046389 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
UrgcpQ5NCI0 Gm20208-202ENSMUST00000219905 1528 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
UrgcpQ5NCI0 Fam149b-201ENSMUST00000037698 924 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
UrgcpQ5NCI0 Cbr3-201ENSMUST00000039620 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
UrgcpQ5NCI0 Upf3a-201ENSMUST00000043767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
UrgcpQ5NCI0 Cpe-201ENSMUST00000048967 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
UrgcpQ5NCI0 Crim1-201ENSMUST00000112498 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
UrgcpQ5NCI0 Nudt3-203ENSMUST00000114886 996 ntTSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
UrgcpQ5NCI0 Gm10420-201ENSMUST00000121713 882 ntBASIC23.99■■□□□ 1.43
UrgcpQ5NCI0 Lsm4-205ENSMUST00000210987 636 ntTSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
UrgcpQ5NCI0 Emc8-208ENSMUST00000181950 747 ntTSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
UrgcpQ5NCI0 Tsc22d1-204ENSMUST00000110888 4999 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
UrgcpQ5NCI0 Slc39a13-203ENSMUST00000111436 1291 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
UrgcpQ5NCI0 Gm20109-201ENSMUST00000180802 671 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
UrgcpQ5NCI0 Krtap28-10-201ENSMUST00000188323 957 ntAPPRIS P1 BASIC23.97■■□□□ 1.43
UrgcpQ5NCI0 Jmjd6-201ENSMUST00000047616 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
UrgcpQ5NCI0 Bloc1s2-201ENSMUST00000079033 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
UrgcpQ5NCI0 Kcnj6-201ENSMUST00000095873 1773 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
UrgcpQ5NCI0 Vmac-201ENSMUST00000067931 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
UrgcpQ5NCI0 Npas1-201ENSMUST00000002053 2091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
UrgcpQ5NCI0 B230377A18Rik-202ENSMUST00000192921 1364 ntBASIC23.95■■□□□ 1.42
UrgcpQ5NCI0 Hrk-201ENSMUST00000054836 5382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
UrgcpQ5NCI0 Kif1c-205ENSMUST00000152618 1943 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
UrgcpQ5NCI0 Sft2d1-210ENSMUST00000154553 1049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.1 ms