Protein–RNA interactions for Protein: Q5F4S9

Trpm3, Transient receptor potential cation channel, subfamily M, member 3, mousemouse

Predictions only

Length 1,721 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trpm3Q5F4S9 Fus-201ENSMUST00000077609 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.76■■■□□ 2.35
Trpm3Q5F4S9 Pdlim4-201ENSMUST00000018755 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.75■■■□□ 2.35
Trpm3Q5F4S9 Glrx3-201ENSMUST00000064404 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.73■■■□□ 2.35
Trpm3Q5F4S9 Zfp703-201ENSMUST00000127097 587 ntTSL 2 BASIC29.73■■■□□ 2.35
Trpm3Q5F4S9 Gm13256-201ENSMUST00000131297 520 ntTSL 3 BASIC29.73■■■□□ 2.35
Trpm3Q5F4S9 Emc8-208ENSMUST00000181950 747 ntTSL 2 BASIC29.73■■■□□ 2.35
Trpm3Q5F4S9 Kiss1-201ENSMUST00000007433 779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.73■■■□□ 2.35
Trpm3Q5F4S9 Gm26711-201ENSMUST00000180866 1833 ntTSL 1 (best) BASIC29.71■■■□□ 2.35
Trpm3Q5F4S9 Srsf2-206ENSMUST00000190993 1326 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.71■■■□□ 2.35
Trpm3Q5F4S9 Jmjd6-201ENSMUST00000047616 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.71■■■□□ 2.35
Trpm3Q5F4S9 Bloc1s2-201ENSMUST00000079033 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.7■■■□□ 2.34
Trpm3Q5F4S9 Qdpr-201ENSMUST00000015950 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.7■■■□□ 2.34
Trpm3Q5F4S9 Ipmk-202ENSMUST00000118381 1323 ntTSL 1 (best) BASIC29.69■■■□□ 2.34
Trpm3Q5F4S9 Gng12-204ENSMUST00000114225 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.69■■■□□ 2.34
Trpm3Q5F4S9 Mnx1-201ENSMUST00000001608 2018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.69■■■□□ 2.34
Trpm3Q5F4S9 Siva1-201ENSMUST00000021728 924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.68■■■□□ 2.34
Trpm3Q5F4S9 Clptm1l-201ENSMUST00000022102 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.68■■■□□ 2.34
Trpm3Q5F4S9 Cadm1-209ENSMUST00000152459 1784 ntTSL 1 (best) BASIC29.68■■■□□ 2.34
Trpm3Q5F4S9 Gm16286-202ENSMUST00000125127 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.67■■■□□ 2.34
Trpm3Q5F4S9 Cadm1-206ENSMUST00000143026 1643 ntTSL 5 BASIC29.66■■■□□ 2.34
Trpm3Q5F4S9 Sox3-201ENSMUST00000135107 2065 ntAPPRIS P1 BASIC29.66■■■□□ 2.34
Trpm3Q5F4S9 Adra1d-201ENSMUST00000103184 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.66■■■□□ 2.34
Trpm3Q5F4S9 Ccna1-202ENSMUST00000197238 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.65■■■□□ 2.34
Trpm3Q5F4S9 Gm13594-201ENSMUST00000137582 476 ntTSL 1 (best) BASIC29.65■■■□□ 2.34
Trpm3Q5F4S9 Kiss1-202ENSMUST00000178033 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.63■■■□□ 2.33
Trpm3Q5F4S9 Pgls-201ENSMUST00000034264 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.62■■■□□ 2.33
Trpm3Q5F4S9 Rnaset2b-201ENSMUST00000089119 1013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.62■■■□□ 2.33
Trpm3Q5F4S9 Gm7276-201ENSMUST00000097520 1252 ntAPPRIS P1 BASIC29.62■■■□□ 2.33
Trpm3Q5F4S9 Ube2j2-202ENSMUST00000103175 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.62■■■□□ 2.33
Trpm3Q5F4S9 Mef2a-201ENSMUST00000032776 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.6■■■□□ 2.33
Trpm3Q5F4S9 Gm20208-202ENSMUST00000219905 1528 ntTSL 1 (best) BASIC29.6■■■□□ 2.33
Trpm3Q5F4S9 Gm21989-201ENSMUST00000174530 1609 ntTSL 1 (best) BASIC29.6■■■□□ 2.33
Trpm3Q5F4S9 Cited2-201ENSMUST00000038107 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.59■■■□□ 2.33
Trpm3Q5F4S9 Hoxd9-201ENSMUST00000059272 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.59■■■□□ 2.33
Trpm3Q5F4S9 Kcnk2-205ENSMUST00000192723 1642 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.59■■■□□ 2.33
Trpm3Q5F4S9 Mbd3-203ENSMUST00000105348 1222 ntTSL 5 BASIC29.59■■■□□ 2.33
Trpm3Q5F4S9 Nudt3-203ENSMUST00000114886 996 ntTSL 2 BASIC29.59■■■□□ 2.33
Trpm3Q5F4S9 Krtap28-10-201ENSMUST00000188323 957 ntAPPRIS P1 BASIC29.59■■■□□ 2.33
Trpm3Q5F4S9 AC122428.3-201ENSMUST00000215551 2290 ntBASIC29.58■■■□□ 2.33
Trpm3Q5F4S9 Csrp1-201ENSMUST00000027677 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.58■■■□□ 2.33
Trpm3Q5F4S9 Csrp1-202ENSMUST00000097561 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.58■■■□□ 2.33
Trpm3Q5F4S9 Ube2k-203ENSMUST00000201266 1449 ntTSL 5 BASIC29.58■■■□□ 2.33
Trpm3Q5F4S9 Slc35a2-211ENSMUST00000208640 486 ntTSL 5 BASIC29.58■■■□□ 2.33
Trpm3Q5F4S9 Cys1-207ENSMUST00000186602 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.58■■■□□ 2.33
Trpm3Q5F4S9 Vmac-201ENSMUST00000067931 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.58■■■□□ 2.33
Trpm3Q5F4S9 Cited1-202ENSMUST00000101336 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.57■■■□□ 2.32
Trpm3Q5F4S9 Efna2-201ENSMUST00000003154 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.56■■■□□ 2.32
Trpm3Q5F4S9 Suds3-201ENSMUST00000086471 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.56■■■□□ 2.32
Trpm3Q5F4S9 Kif1c-205ENSMUST00000152618 1943 ntTSL 1 (best) BASIC29.56■■■□□ 2.32
Trpm3Q5F4S9 Mogs-201ENSMUST00000032114 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.56■■■□□ 2.32
Trpm3Q5F4S9 Aldoa-214ENSMUST00000207534 741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.56■■■□□ 2.32
Trpm3Q5F4S9 Rcan1-202ENSMUST00000060005 2324 ntTSL 1 (best) BASIC29.56■■■□□ 2.32
Trpm3Q5F4S9 Tmpo-203ENSMUST00000092219 1854 ntTSL 1 (best) BASIC29.55■■■□□ 2.32
Trpm3Q5F4S9 Nudt6-204ENSMUST00000108118 935 ntTSL 5 BASIC29.55■■■□□ 2.32
Trpm3Q5F4S9 Tmem170b-202ENSMUST00000221694 602 ntTSL 3 BASIC29.55■■■□□ 2.32
Trpm3Q5F4S9 Pxmp2-201ENSMUST00000031472 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.55■■■□□ 2.32
Trpm3Q5F4S9 Nudt6-201ENSMUST00000052645 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.55■■■□□ 2.32
Trpm3Q5F4S9 Nudt6-202ENSMUST00000099130 1070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.55■■■□□ 2.32
Trpm3Q5F4S9 Rbm45-201ENSMUST00000046389 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.55■■■□□ 2.32
Trpm3Q5F4S9 Cyp2r1-202ENSMUST00000119712 917 ntTSL 5 BASIC29.54■■■□□ 2.32
Trpm3Q5F4S9 Oaz2-206ENSMUST00000153700 1843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC29.53■■■□□ 2.32
Trpm3Q5F4S9 D17Wsu92e-201ENSMUST00000075076 1470 ntTSL 1 (best) BASIC29.53■■■□□ 2.32
Trpm3Q5F4S9 Plekha3-201ENSMUST00000111920 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.53■■■□□ 2.32
Trpm3Q5F4S9 Rab4a-202ENSMUST00000118535 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.53■■■□□ 2.32
Trpm3Q5F4S9 Gm5812-201ENSMUST00000061073 957 ntBASIC29.53■■■□□ 2.32
Trpm3Q5F4S9 Fam149b-203ENSMUST00000090499 2370 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.53■■■□□ 2.32
Trpm3Q5F4S9 Upf3a-201ENSMUST00000043767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.52■■■□□ 2.32
Trpm3Q5F4S9 Zfp422-201ENSMUST00000057540 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.51■■■□□ 2.32
Trpm3Q5F4S9 Tmem70-203ENSMUST00000177501 1636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.51■■■□□ 2.31
Trpm3Q5F4S9 Gm20109-201ENSMUST00000180802 671 ntTSL 1 (best) BASIC29.51■■■□□ 2.31
Trpm3Q5F4S9 Arhgap9-203ENSMUST00000219026 1946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.51■■■□□ 2.31
Trpm3Q5F4S9 Ctbp1-211ENSMUST00000202868 2436 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.5■■■□□ 2.31
Trpm3Q5F4S9 Hecw2-202ENSMUST00000097741 1132 ntTSL 1 (best) BASIC29.5■■■□□ 2.31
Trpm3Q5F4S9 Gm44428-201ENSMUST00000204474 874 ntBASIC29.49■■■□□ 2.31
Trpm3Q5F4S9 Hist2h3c1-201ENSMUST00000176059 1820 ntAPPRIS P1 BASIC29.49■■■□□ 2.31
Trpm3Q5F4S9 Hist2h3c1-202ENSMUST00000177796 1825 ntBASIC29.49■■■□□ 2.31
Trpm3Q5F4S9 Rpl35-201ENSMUST00000080861 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.48■■■□□ 2.31
Trpm3Q5F4S9 Pdpk1-203ENSMUST00000115407 1730 ntTSL 5 BASIC29.48■■■□□ 2.31
Trpm3Q5F4S9 Mapkap1-202ENSMUST00000113124 1758 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC29.48■■■□□ 2.31
Trpm3Q5F4S9 Trnau1ap-203ENSMUST00000105962 961 ntTSL 5 BASIC29.48■■■□□ 2.31
Trpm3Q5F4S9 Gm22567-201ENSMUST00000175542 342 ntBASIC29.48■■■□□ 2.31
Trpm3Q5F4S9 Sft2d1-210ENSMUST00000154553 1049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.47■■■□□ 2.31
Trpm3Q5F4S9 Trappc6b-207ENSMUST00000218686 785 ntTSL 3 BASIC29.47■■■□□ 2.31
Trpm3Q5F4S9 Gm10499-202ENSMUST00000174778 1698 ntTSL 1 (best) BASIC29.46■■■□□ 2.31
Trpm3Q5F4S9 2810002D19Rik-201ENSMUST00000152313 2040 ntTSL 1 (best) BASIC29.46■■■□□ 2.31
Trpm3Q5F4S9 Igfbp3-202ENSMUST00000135887 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.46■■■□□ 2.31
Trpm3Q5F4S9 Gm10420-201ENSMUST00000121713 882 ntBASIC29.46■■■□□ 2.31
Trpm3Q5F4S9 Usf1-210ENSMUST00000167546 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.46■■■□□ 2.31
Trpm3Q5F4S9 2310061I04Rik-202ENSMUST00000146451 2081 ntTSL 1 (best) BASIC29.46■■■□□ 2.31
Trpm3Q5F4S9 Asf1a-201ENSMUST00000020004 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.31
Trpm3Q5F4S9 Cpe-201ENSMUST00000048967 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.31
Trpm3Q5F4S9 Tmem106c-201ENSMUST00000064200 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.3
Trpm3Q5F4S9 Neurl1b-202ENSMUST00000182897 1231 ntTSL 5 BASIC29.45■■■□□ 2.3
Trpm3Q5F4S9 Galr3-201ENSMUST00000058004 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.3
Trpm3Q5F4S9 Nrsn1-201ENSMUST00000057866 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.3
Trpm3Q5F4S9 Actr3b-202ENSMUST00000128727 2031 ntTSL 1 (best) BASIC29.44■■■□□ 2.3
Trpm3Q5F4S9 Tmem11-201ENSMUST00000062677 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.44■■■□□ 2.3
Trpm3Q5F4S9 Terf2-203ENSMUST00000116425 2471 ntTSL 1 (best) BASIC29.44■■■□□ 2.3
Trpm3Q5F4S9 Kcnmb4os2-203ENSMUST00000127070 1048 ntTSL 2 BASIC29.44■■■□□ 2.3
Trpm3Q5F4S9 Sec24d-208ENSMUST00000200333 307 ntTSL 1 (best) BASIC29.44■■■□□ 2.3
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.9 ms