Protein–RNA interactions for Protein: Q56A10

Znf608, Zinc finger protein 608, mousemouse

Predictions only

Length 1,511 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Znf608Q56A10 Gm43592-201ENSMUST00000196922 1165 ntBASIC35.45■■■■□ 3.27
Znf608Q56A10 Gm17494-201ENSMUST00000072769 1800 ntTSL 1 (best) BASIC35.45■■■■□ 3.27
Znf608Q56A10 Gm16286-202ENSMUST00000125127 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.45■■■■□ 3.27
Znf608Q56A10 Tmpo-205ENSMUST00000105293 1842 ntTSL 1 (best) BASIC35.44■■■■□ 3.26
Znf608Q56A10 Rps19-202ENSMUST00000108429 633 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC35.44■■■■□ 3.26
Znf608Q56A10 Gm26533-201ENSMUST00000180550 1790 ntTSL 1 (best) BASIC35.44■■■■□ 3.26
Znf608Q56A10 Mir155hg-202ENSMUST00000185662 1362 ntTSL 5 BASIC35.44■■■■□ 3.26
Znf608Q56A10 Ppp1ca-201ENSMUST00000046094 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.44■■■■□ 3.26
Znf608Q56A10 Cadm1-206ENSMUST00000143026 1643 ntTSL 5 BASIC35.43■■■■□ 3.26
Znf608Q56A10 Tpst1-201ENSMUST00000040721 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.43■■■■□ 3.26
Znf608Q56A10 Dmwd-201ENSMUST00000032570 2494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC35.43■■■■□ 3.26
Znf608Q56A10 Esrra-201ENSMUST00000025906 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.42■■■■□ 3.26
Znf608Q56A10 Nenf-201ENSMUST00000046770 742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.42■■■■□ 3.26
Znf608Q56A10 Polr1d-201ENSMUST00000050970 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.42■■■■□ 3.26
Znf608Q56A10 Ppp1r3e-202ENSMUST00000177403 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC35.42■■■■□ 3.26
Znf608Q56A10 March2-203ENSMUST00000172767 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.42■■■■□ 3.26
Znf608Q56A10 Dnttip1-201ENSMUST00000017443 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.42■■■■□ 3.26
Znf608Q56A10 Gm14121-201ENSMUST00000121441 1380 ntBASIC35.41■■■■□ 3.26
Znf608Q56A10 Cnot6l-203ENSMUST00000122003 2089 ntTSL 1 (best) BASIC35.41■■■■□ 3.26
Znf608Q56A10 Sh3gl3-201ENSMUST00000032874 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.41■■■■□ 3.26
Znf608Q56A10 Pfdn4-204ENSMUST00000109148 736 ntTSL 3 BASIC35.41■■■■□ 3.26
Znf608Q56A10 Pgls-205ENSMUST00000143441 1062 ntTSL 3 BASIC35.41■■■■□ 3.26
Znf608Q56A10 Rpl34-201ENSMUST00000062601 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.41■■■■□ 3.26
Znf608Q56A10 Fkbp1b-201ENSMUST00000020964 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.4■■■■□ 3.26
Znf608Q56A10 Ramp1-202ENSMUST00000165855 852 ntTSL 2 BASIC35.37■■■■□ 3.25
Znf608Q56A10 Hagh-201ENSMUST00000024974 1101 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC35.37■■■■□ 3.25
Znf608Q56A10 Cdc42ep5-201ENSMUST00000076831 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.37■■■■□ 3.25
Znf608Q56A10 Adprhl2-201ENSMUST00000102617 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.37■■■■□ 3.25
Znf608Q56A10 Jdp2-201ENSMUST00000050687 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.36■■■■□ 3.25
Znf608Q56A10 Fads2-201ENSMUST00000025567 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.36■■■■□ 3.25
Znf608Q56A10 Gm44428-201ENSMUST00000204474 874 ntBASIC35.36■■■■□ 3.25
Znf608Q56A10 Ipmk-203ENSMUST00000121446 1492 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC35.35■■■■□ 3.25
Znf608Q56A10 Ankrd49-205ENSMUST00000216037 1037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC35.34■■■■□ 3.25
Znf608Q56A10 AC122379.1-201ENSMUST00000220658 355 ntTSL 3 BASIC35.34■■■■□ 3.25
Znf608Q56A10 Pfdn2-202ENSMUST00000135941 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.34■■■■□ 3.25
Znf608Q56A10 Pkig-202ENSMUST00000099105 640 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC35.33■■■■□ 3.25
Znf608Q56A10 Vax1-201ENSMUST00000172821 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.32■■■■□ 3.25
Znf608Q56A10 Arhgap39-204ENSMUST00000176219 542 ntTSL 5 BASIC35.32■■■■□ 3.25
Znf608Q56A10 1700016K19Rik-201ENSMUST00000066408 921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.32■■■■□ 3.25
Znf608Q56A10 Ube2k-206ENSMUST00000201984 1449 ntTSL 3 BASIC35.32■■■■□ 3.25
Znf608Q56A10 Arl8a-201ENSMUST00000027684 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.32■■■■□ 3.25
Znf608Q56A10 Gm20684-201ENSMUST00000176744 380 ntTSL 3 BASIC35.32■■■■□ 3.24
Znf608Q56A10 Lsm4-201ENSMUST00000034311 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.32■■■■□ 3.24
Znf608Q56A10 Dynlt1f-201ENSMUST00000179554 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.3■■■■□ 3.24
Znf608Q56A10 Ech1-201ENSMUST00000066264 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.3■■■■□ 3.24
Znf608Q56A10 Dtnb-211ENSMUST00000173240 2218 ntTSL 5 BASIC35.29■■■■□ 3.24
Znf608Q56A10 Lrfn1-203ENSMUST00000189877 1852 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC35.29■■■■□ 3.24
Znf608Q56A10 Phf23-205ENSMUST00000135814 2214 ntTSL 1 (best) BASIC35.29■■■■□ 3.24
Znf608Q56A10 Cyp2r1-202ENSMUST00000119712 917 ntTSL 5 BASIC35.27■■■■□ 3.24
Znf608Q56A10 Gm28417-202ENSMUST00000185881 538 ntTSL 3 BASIC35.27■■■■□ 3.24
Znf608Q56A10 Cckbr-202ENSMUST00000181339 1326 ntTSL 1 (best) BASIC35.27■■■■□ 3.24
Znf608Q56A10 Rundc3b-202ENSMUST00000115378 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC35.26■■■■□ 3.24
Znf608Q56A10 Zfp346-203ENSMUST00000159278 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC35.26■■■■□ 3.23
Znf608Q56A10 Gm9767-201ENSMUST00000041011 1193 ntAPPRIS P1 BASIC35.26■■■■□ 3.23
Znf608Q56A10 Brsk2-203ENSMUST00000078200 2363 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC35.26■■■■□ 3.23
Znf608Q56A10 Marveld2-202ENSMUST00000163163 2187 ntTSL 1 (best) BASIC35.25■■■■□ 3.23
Znf608Q56A10 C1qtnf5-203ENSMUST00000114818 1337 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC35.25■■■■□ 3.23
Znf608Q56A10 D730045B01Rik-202ENSMUST00000186838 1543 ntTSL 1 (best) BASIC35.24■■■■□ 3.23
Znf608Q56A10 Smco4-203ENSMUST00000215907 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.24■■■■□ 3.23
Znf608Q56A10 Pgp-201ENSMUST00000053024 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.24■■■■□ 3.23
Znf608Q56A10 Ctxn1-201ENSMUST00000053252 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.24■■■■□ 3.23
Znf608Q56A10 Hrh3-205ENSMUST00000165762 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC35.24■■■■□ 3.23
Znf608Q56A10 Gm42501-201ENSMUST00000200220 1026 ntBASIC35.23■■■■□ 3.23
Znf608Q56A10 Kctd6-201ENSMUST00000022272 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.23■■■■□ 3.23
Znf608Q56A10 Pate2-201ENSMUST00000098906 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC35.23■■■■□ 3.23
Znf608Q56A10 Hoxd8-201ENSMUST00000019749 2634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC35.22■■■■□ 3.23
Znf608Q56A10 Fgf8-206ENSMUST00000111928 1056 ntTSL 1 (best) BASIC35.22■■■■□ 3.23
Znf608Q56A10 Slc37a3-211ENSMUST00000202749 434 ntTSL 5 BASIC35.22■■■■□ 3.23
Znf608Q56A10 Eif5a-213ENSMUST00000164359 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC35.22■■■■□ 3.23
Znf608Q56A10 Ccdc85c-201ENSMUST00000136175 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC35.21■■■■□ 3.23
Znf608Q56A10 Ntn5-203ENSMUST00000183120 1491 ntTSL 1 (best) BASIC35.2■■■■□ 3.22
Znf608Q56A10 A230020J21Rik-202ENSMUST00000192407 1649 ntTSL 2 BASIC35.19■■■■□ 3.22
Znf608Q56A10 Traf4-201ENSMUST00000017530 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.19■■■■□ 3.22
Znf608Q56A10 Rnf220-212ENSMUST00000221654 1949 ntTSL 1 (best) BASIC35.17■■■■□ 3.22
Znf608Q56A10 Usp2-206ENSMUST00000176416 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.17■■■■□ 3.22
Znf608Q56A10 March5-202ENSMUST00000112391 1293 ntTSL 1 (best) BASIC35.16■■■■□ 3.22
Znf608Q56A10 Pdf-201ENSMUST00000055316 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.15■■■■□ 3.22
Znf608Q56A10 Ost4-202ENSMUST00000132253 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.15■■■■□ 3.22
Znf608Q56A10 Ybx3-201ENSMUST00000032309 1853 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC35.14■■■■□ 3.22
Znf608Q56A10 Zfp358-201ENSMUST00000061508 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.14■■■■□ 3.22
Znf608Q56A10 AC117245.1-201ENSMUST00000215481 566 ntTSL 3 BASIC35.12■■■■□ 3.21
Znf608Q56A10 Gm18755-201ENSMUST00000218030 1099 ntBASIC35.12■■■■□ 3.21
Znf608Q56A10 Fn1-208ENSMUST00000186940 1350 ntTSL 1 (best) BASIC35.11■■■■□ 3.21
Znf608Q56A10 Barx1-201ENSMUST00000021813 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.11■■■■□ 3.21
Znf608Q56A10 Mpnd-208ENSMUST00000159996 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC35.11■■■■□ 3.21
Znf608Q56A10 E130218I03Rik-208ENSMUST00000144222 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.1■■■■□ 3.21
Znf608Q56A10 Bex1-201ENSMUST00000058125 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.1■■■■□ 3.21
Znf608Q56A10 Gmeb1-202ENSMUST00000105964 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.09■■■■□ 3.21
Znf608Q56A10 Lor-201ENSMUST00000058150 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.09■■■■□ 3.21
Znf608Q56A10 Fam168b-204ENSMUST00000170092 941 ntTSL 5 BASIC35.09■■■■□ 3.21
Znf608Q56A10 E2f5-201ENSMUST00000029069 1779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC35.08■■■■□ 3.21
Znf608Q56A10 Gm21989-201ENSMUST00000174530 1609 ntTSL 1 (best) BASIC35.08■■■■□ 3.21
Znf608Q56A10 Tlx2-201ENSMUST00000089641 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.07■■■■□ 3.21
Znf608Q56A10 Pex10-201ENSMUST00000103180 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.07■■■■□ 3.21
Znf608Q56A10 Arpc2-203ENSMUST00000113820 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.07■■■■□ 3.2
Znf608Q56A10 Ssbp1-203ENSMUST00000117411 933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.06■■■■□ 3.2
Znf608Q56A10 Usf1-210ENSMUST00000167546 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC35.06■■■■□ 3.2
Znf608Q56A10 Cpsf4-205ENSMUST00000160629 1713 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC35.06■■■■□ 3.2
Znf608Q56A10 Dusp2-201ENSMUST00000028846 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.03■■■■□ 3.2
Znf608Q56A10 Eif5a-210ENSMUST00000108613 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.03■■■■□ 3.2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.4 ms