Protein–RNA interactions for Protein: Q504N7

Pyrin and HIN domain-containing protein 1-like, mousemouse

Predictions only

Length 393 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q504N7 Ccsap-201ENSMUST00000034452 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Q504N7 B4galt2-201ENSMUST00000030266 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Q504N7 Homer3-201ENSMUST00000003669 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Q504N7 Ppp1r3e-201ENSMUST00000168622 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
Q504N7 Pds5a-209ENSMUST00000201948 8934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
Q504N7 Gtpbp2-201ENSMUST00000024748 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Q504N7 Dnpep-201ENSMUST00000066668 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Q504N7 Hdac2-201ENSMUST00000019911 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Q504N7 Emid1-201ENSMUST00000062821 1947 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Q504N7 Mtch1-202ENSMUST00000118366 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Q504N7 Trappc6b-203ENSMUST00000217863 797 ntTSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
Q504N7 Papd7-202ENSMUST00000198607 4750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Q504N7 Magi3-201ENSMUST00000064371 6640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Q504N7 Acot5-201ENSMUST00000046422 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Q504N7 2410017I17Rik-201ENSMUST00000056774 1509 ntTSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
Q504N7 Nelfe-201ENSMUST00000097343 1607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
Q504N7 Atp2b2-208ENSMUST00000205052 5658 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Q504N7 Slc1a5-201ENSMUST00000108496 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Q504N7 Ihh-201ENSMUST00000164097 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Q504N7 Ptpn18-206ENSMUST00000188972 414 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Q504N7 Gm38287-201ENSMUST00000195193 2051 ntTSL 3 BASIC19.04■□□□□ 0.64
Q504N7 Ei24-201ENSMUST00000115086 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Q504N7 Ccsap-202ENSMUST00000122421 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Q504N7 Vdac1-202ENSMUST00000102758 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Q504N7 Gemin7-202ENSMUST00000117222 1023 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
Q504N7 Actr3b-202ENSMUST00000128727 2031 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Q504N7 Ube2i-206ENSMUST00000172618 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Q504N7 Gm28513-201ENSMUST00000191474 613 ntTSL 3 BASIC19.04■□□□□ 0.64
Q504N7 Magi3-202ENSMUST00000121198 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
Q504N7 Tdp2-201ENSMUST00000038039 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Q504N7 Hoxd9-201ENSMUST00000059272 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Q504N7 Tmbim4-204ENSMUST00000134797 486 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Q504N7 Fam212b-202ENSMUST00000098273 1868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Q504N7 Shf-203ENSMUST00000110531 1557 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
Q504N7 Rcor3-207ENSMUST00000192866 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
Q504N7 Ube2j2-205ENSMUST00000105583 1434 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Q504N7 Clip1-205ENSMUST00000111566 6133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Q504N7 Macrod2-206ENSMUST00000110064 4883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
Q504N7 Osbp-201ENSMUST00000025590 4578 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
Q504N7 Mgrn1-201ENSMUST00000023159 3293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Q504N7 Mgrn1-202ENSMUST00000070658 3290 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Q504N7 2610307P16Rik-205ENSMUST00000148885 1870 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Q504N7 Dusp7-201ENSMUST00000172306 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Q504N7 D730045B01Rik-202ENSMUST00000186838 1543 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Q504N7 Chpt1-204ENSMUST00000117579 1043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Q504N7 2310014F06Rik-201ENSMUST00000146145 1567 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Q504N7 Pate2-201ENSMUST00000098906 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
Q504N7 Adra1d-201ENSMUST00000103184 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Q504N7 D030046N08Rik-201ENSMUST00000162318 1570 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Q504N7 Hcn4-201ENSMUST00000034889 6118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Q504N7 Mta3-201ENSMUST00000067826 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Q504N7 Fus-204ENSMUST00000121616 1102 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Q504N7 Olfm1-201ENSMUST00000028177 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Q504N7 Fam220a-201ENSMUST00000067145 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Q504N7 Krtap28-13-201ENSMUST00000188005 992 ntAPPRIS P1 BASIC18.98■□□□□ 0.63
Q504N7 Pdcd4-201ENSMUST00000025931 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Q504N7 Slc25a33-201ENSMUST00000105686 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Q504N7 Osbpl10-207ENSMUST00000183104 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
Q504N7 Cadm1-202ENSMUST00000085909 2126 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Q504N7 1110008P14Rik-201ENSMUST00000048792 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Q504N7 Zcrb1-201ENSMUST00000076070 877 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Q504N7 Ubp1-204ENSMUST00000214095 2320 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Q504N7 Epop-201ENSMUST00000052281 2314 ntAPPRIS P1 BASIC18.97■□□□□ 0.63
Q504N7 Ccna1-202ENSMUST00000197238 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
Q504N7 Vps37b-201ENSMUST00000040967 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Q504N7 Fam204a-201ENSMUST00000065286 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Q504N7 Phox2a-201ENSMUST00000008090 1609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Q504N7 Il17rd-202ENSMUST00000223942 2186 ntBASIC18.96■□□□□ 0.63
Q504N7 Hoxb3-202ENSMUST00000093944 3190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
Q504N7 Tceal3-202ENSMUST00000113100 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Q504N7 Dbp-204ENSMUST00000211513 1156 ntTSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
Q504N7 Tceal3-201ENSMUST00000060904 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Q504N7 Gm20634-201ENSMUST00000090779 2956 ntBASIC18.96■□□□□ 0.63
Q504N7 H1f0-201ENSMUST00000180086 2287 ntAPPRIS P1 BASIC18.96■□□□□ 0.63
Q504N7 Mras-201ENSMUST00000035045 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Q504N7 Magi2-205ENSMUST00000197354 4785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
Q504N7 Foxd1-201ENSMUST00000105098 5064 ntAPPRIS P1 BASIC18.96■□□□□ 0.63
Q504N7 Plvap-201ENSMUST00000048452 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Q504N7 E130218I03Rik-208ENSMUST00000144222 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Q504N7 Efna2-201ENSMUST00000003154 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Q504N7 Tfeb-202ENSMUST00000086932 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Q504N7 Irak1-202ENSMUST00000068286 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Q504N7 Chtf8-205ENSMUST00000176515 694 ntTSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
Q504N7 Cenpb-201ENSMUST00000089510 4886 ntAPPRIS P1 BASIC18.94■□□□□ 0.62
Q504N7 Atn1-201ENSMUST00000088357 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Q504N7 St7-205ENSMUST00000081635 2115 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Q504N7 Adcy9-203ENSMUST00000120080 4974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Q504N7 Tbc1d2b-201ENSMUST00000041767 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Q504N7 Rpl31-203ENSMUST00000179954 630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Q504N7 Efhd2-201ENSMUST00000036854 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Q504N7 Sel1l3-201ENSMUST00000031090 4512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Q504N7 Tmpo-205ENSMUST00000105293 1842 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Q504N7 Jak2-202ENSMUST00000065796 5030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
Q504N7 Tsen34-201ENSMUST00000038521 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
Q504N7 Ybx3-201ENSMUST00000032309 1853 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Q504N7 Artn-201ENSMUST00000070816 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Q504N7 1700026D11Rik-201ENSMUST00000126910 2033 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Q504N7 Pard6a-201ENSMUST00000093195 1265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Q504N7 Egr4-201ENSMUST00000095759 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Q504N7 Pptc7-201ENSMUST00000053426 4644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.1 ms