Protein–RNA interactions for Protein: Q45VN2

Defa20, Alpha-defensin 20, mousemouse

Predictions only

Length 95 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Defa20Q45VN2 Ssbp4-205ENSMUST00000210369 1828 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Defa20Q45VN2 Ubr3-202ENSMUST00000112251 8081 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Defa20Q45VN2 Mid2-202ENSMUST00000112990 6271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Defa20Q45VN2 Efcc1-202ENSMUST00000159570 2293 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Defa20Q45VN2 Map3k1-201ENSMUST00000109267 6978 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Defa20Q45VN2 Srcap-211ENSMUST00000189136 1960 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Defa20Q45VN2 2210008F06Rik-201ENSMUST00000180805 1082 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Defa20Q45VN2 Hr-203ENSMUST00000161069 5607 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Defa20Q45VN2 Kansl1-204ENSMUST00000106972 5427 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Defa20Q45VN2 Suds3-201ENSMUST00000086471 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Defa20Q45VN2 Pcf11-201ENSMUST00000119954 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Defa20Q45VN2 Slc22a17-208ENSMUST00000228119 2348 ntAPPRIS P1 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Defa20Q45VN2 Hrh3-208ENSMUST00000171736 906 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Defa20Q45VN2 Mtch1-202ENSMUST00000118366 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Defa20Q45VN2 Man2a2-201ENSMUST00000098346 6554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Defa20Q45VN2 C1ql1-201ENSMUST00000057849 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Defa20Q45VN2 Slc22a17-201ENSMUST00000050772 2290 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Defa20Q45VN2 Cited2-201ENSMUST00000038107 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Defa20Q45VN2 Fam149b-202ENSMUST00000051915 1981 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Defa20Q45VN2 Thra-202ENSMUST00000103139 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Defa20Q45VN2 Ccdc122-202ENSMUST00000095625 1195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Defa20Q45VN2 Emid1-201ENSMUST00000062821 1947 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Defa20Q45VN2 Twist1-201ENSMUST00000049089 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Defa20Q45VN2 Srrm2-209ENSMUST00000190686 8864 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Defa20Q45VN2 Nelfe-204ENSMUST00000173357 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Defa20Q45VN2 Fbxo6-201ENSMUST00000030858 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Defa20Q45VN2 E2f5-202ENSMUST00000165922 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Defa20Q45VN2 Smarcad1-201ENSMUST00000031984 5168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Defa20Q45VN2 Hira-201ENSMUST00000004222 4218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Defa20Q45VN2 Lgr4-201ENSMUST00000046548 5060 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Defa20Q45VN2 Eif2ak3-204ENSMUST00000162950 927 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Defa20Q45VN2 Kcnd3-202ENSMUST00000098761 7169 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Defa20Q45VN2 Dazap1-202ENSMUST00000105361 1537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Defa20Q45VN2 Jmy-202ENSMUST00000220513 1843 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Defa20Q45VN2 Rasgrp1-201ENSMUST00000102534 5229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Defa20Q45VN2 Srp9-201ENSMUST00000027792 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Defa20Q45VN2 Mtcl1-201ENSMUST00000086693 7221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Defa20Q45VN2 Syndig1l-201ENSMUST00000095550 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Defa20Q45VN2 Tspan5-201ENSMUST00000029800 6653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Defa20Q45VN2 Usp36-201ENSMUST00000092382 5609 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Defa20Q45VN2 CT030161.2-201ENSMUST00000218666 735 ntTSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Defa20Q45VN2 Rhou-201ENSMUST00000045487 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Defa20Q45VN2 Dlg1-202ENSMUST00000064477 4663 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Defa20Q45VN2 Cobll1-204ENSMUST00000112430 4917 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Defa20Q45VN2 H1f0-201ENSMUST00000180086 2287 ntAPPRIS P1 BASIC15.33■□□□□ 0.05
Defa20Q45VN2 Vdac1-202ENSMUST00000102758 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Defa20Q45VN2 Myh7b-201ENSMUST00000092995 6163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Defa20Q45VN2 Basp1-201ENSMUST00000058845 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Defa20Q45VN2 Pcdh7-201ENSMUST00000068110 5611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Defa20Q45VN2 Tab2-204ENSMUST00000146444 4380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Defa20Q45VN2 Ctage5-218ENSMUST00000177162 2728 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Defa20Q45VN2 Atad2b-201ENSMUST00000045664 8035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Defa20Q45VN2 Babam2-209ENSMUST00000201352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Defa20Q45VN2 Vps37b-201ENSMUST00000040967 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Defa20Q45VN2 Cdr2-201ENSMUST00000033169 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Defa20Q45VN2 Fgf20-201ENSMUST00000034014 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Defa20Q45VN2 Ppp3ca-202ENSMUST00000070198 4758 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Defa20Q45VN2 Fam174a-201ENSMUST00000059975 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Defa20Q45VN2 Agpat5-201ENSMUST00000033847 2841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Defa20Q45VN2 Gm10762-201ENSMUST00000099385 1133 ntAPPRIS P1 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Defa20Q45VN2 Zfp697-201ENSMUST00000056096 5166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Defa20Q45VN2 Ube2h-202ENSMUST00000102993 4657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Defa20Q45VN2 Mmp24-201ENSMUST00000029141 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Defa20Q45VN2 Dnpep-201ENSMUST00000066668 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Defa20Q45VN2 B4galt2-201ENSMUST00000030266 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Defa20Q45VN2 Cdk19-201ENSMUST00000044672 5807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Defa20Q45VN2 Efna2-201ENSMUST00000003154 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Defa20Q45VN2 Amigo1-203ENSMUST00000106659 1360 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Defa20Q45VN2 Pdgfb-201ENSMUST00000000500 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Defa20Q45VN2 Ulk2-201ENSMUST00000004920 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Defa20Q45VN2 Cd320-201ENSMUST00000002379 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Defa20Q45VN2 Arglu1-201ENSMUST00000048545 3197 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Defa20Q45VN2 Ube2i-206ENSMUST00000172618 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Defa20Q45VN2 Zmynd12-201ENSMUST00000094819 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Defa20Q45VN2 Mex3a-201ENSMUST00000172699 5778 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Defa20Q45VN2 Nab1-201ENSMUST00000069792 3874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Defa20Q45VN2 Zswim8-208ENSMUST00000224751 5951 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Defa20Q45VN2 Hnrnpl-201ENSMUST00000038572 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Defa20Q45VN2 Mfhas1-201ENSMUST00000037666 6408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Defa20Q45VN2 Picalm-205ENSMUST00000207225 3489 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Defa20Q45VN2 Slc2a13-202ENSMUST00000109283 6536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Defa20Q45VN2 Stim2-201ENSMUST00000117661 4934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Defa20Q45VN2 Tnrc18-201ENSMUST00000151477 6487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Defa20Q45VN2 Slc39a10-201ENSMUST00000027131 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Defa20Q45VN2 Cachd1-201ENSMUST00000030257 5765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Defa20Q45VN2 Lmo2-203ENSMUST00000111143 1654 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Defa20Q45VN2 Mypop-201ENSMUST00000059331 2173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Defa20Q45VN2 Fmnl2-204ENSMUST00000127122 5508 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Defa20Q45VN2 Kcnq5-203ENSMUST00000115300 6975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Defa20Q45VN2 Kcnc3-203ENSMUST00000207493 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Defa20Q45VN2 Sos2-206ENSMUST00000183277 4512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Defa20Q45VN2 Syndig1l-204ENSMUST00000222422 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Defa20Q45VN2 H3f3aos-201ENSMUST00000097448 2905 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
Defa20Q45VN2 1700028N14Rik-201ENSMUST00000139621 747 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Defa20Q45VN2 Kctd5-201ENSMUST00000017090 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Defa20Q45VN2 Hoxb3os-202ENSMUST00000147410 1945 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Defa20Q45VN2 Ybx3-201ENSMUST00000032309 1853 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Defa20Q45VN2 Nelfe-201ENSMUST00000097343 1607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Defa20Q45VN2 Dleu2-206ENSMUST00000182537 318 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Defa20Q45VN2 Cdh4-201ENSMUST00000000314 6388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.5 ms