Protein–RNA interactions for Protein: Q3UN04

Usp30, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 30, mousemouse

Predictions only

Length 517 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp30Q3UN04 Htra4-201ENSMUST00000084031 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Usp30Q3UN04 Gm5067-201ENSMUST00000170449 1009 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
Usp30Q3UN04 Ildr2-202ENSMUST00000192426 1238 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Usp30Q3UN04 Bloc1s2-201ENSMUST00000079033 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Usp30Q3UN04 Ppp1ca-201ENSMUST00000046094 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Usp30Q3UN04 Sike1-202ENSMUST00000119450 774 ntTSL 3 BASIC23.05■■□□□ 1.28
Usp30Q3UN04 Sft2d1-210ENSMUST00000154553 1049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Usp30Q3UN04 Rab4a-202ENSMUST00000118535 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Usp30Q3UN04 Nudc-201ENSMUST00000030665 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Usp30Q3UN04 Pdcd4-203ENSMUST00000165617 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Usp30Q3UN04 Gm10420-201ENSMUST00000121713 882 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
Usp30Q3UN04 Gm13594-201ENSMUST00000137582 476 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Usp30Q3UN04 Emc8-208ENSMUST00000181950 747 ntTSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
Usp30Q3UN04 Krtap28-10-201ENSMUST00000188323 957 ntAPPRIS P1 BASIC23.04■■□□□ 1.28
Usp30Q3UN04 Gm44428-201ENSMUST00000204474 874 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
Usp30Q3UN04 Aldoa-214ENSMUST00000207534 741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
Usp30Q3UN04 Ppp1r35-201ENSMUST00000031739 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Usp30Q3UN04 Ube2k-203ENSMUST00000201266 1449 ntTSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
Usp30Q3UN04 Acvr2b-201ENSMUST00000035093 1729 ntTSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
Usp30Q3UN04 Sh3rf1-201ENSMUST00000034060 5479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Usp30Q3UN04 Gm20458-201ENSMUST00000164863 1369 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
Usp30Q3UN04 Cadm1-206ENSMUST00000143026 1643 ntTSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
Usp30Q3UN04 Chrna5-204ENSMUST00000217408 2446 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Usp30Q3UN04 Hecw2-202ENSMUST00000097741 1132 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Usp30Q3UN04 Gm20109-201ENSMUST00000180802 671 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Usp30Q3UN04 Galr3-201ENSMUST00000058004 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Usp30Q3UN04 Fezf2-202ENSMUST00000224023 1917 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
Usp30Q3UN04 Kctd2-201ENSMUST00000103035 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Usp30Q3UN04 Lsm4-205ENSMUST00000210987 636 ntTSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
Usp30Q3UN04 Plekha3-201ENSMUST00000111920 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Usp30Q3UN04 Pde8b-204ENSMUST00000159608 2370 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
Usp30Q3UN04 Gxylt1-202ENSMUST00000057896 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
Usp30Q3UN04 H2afy-202ENSMUST00000045788 1933 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Usp30Q3UN04 Klhl25-205ENSMUST00000206019 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Usp30Q3UN04 Nudt3-203ENSMUST00000114886 996 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
Usp30Q3UN04 Hpf1-204ENSMUST00000146863 531 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
Usp30Q3UN04 Pgls-201ENSMUST00000034264 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Usp30Q3UN04 Cbln1-201ENSMUST00000034076 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Usp30Q3UN04 Gm21989-201ENSMUST00000174530 1609 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Usp30Q3UN04 Btf3l4-203ENSMUST00000102741 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Usp30Q3UN04 Cited1-202ENSMUST00000101336 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Usp30Q3UN04 Shox2-204ENSMUST00000162439 1081 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Usp30Q3UN04 St7-208ENSMUST00000115419 2194 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Usp30Q3UN04 Lin7b-201ENSMUST00000003971 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Usp30Q3UN04 Tmem70-203ENSMUST00000177501 1636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Usp30Q3UN04 Htatsf1-202ENSMUST00000114751 1128 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Usp30Q3UN04 Ubp1-203ENSMUST00000116492 2111 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Usp30Q3UN04 Irf2bp2-201ENSMUST00000054960 5080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
Usp30Q3UN04 Kcnmb4os2-203ENSMUST00000127070 1048 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
Usp30Q3UN04 Gm7276-201ENSMUST00000097520 1252 ntAPPRIS P1 BASIC22.91■■□□□ 1.26
Usp30Q3UN04 Gnaq-201ENSMUST00000025541 5644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Usp30Q3UN04 Oaz2-206ENSMUST00000153700 1843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
Usp30Q3UN04 Emid1-201ENSMUST00000062821 1947 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Usp30Q3UN04 Kcnk2-205ENSMUST00000192723 1642 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Usp30Q3UN04 Ebf4-203ENSMUST00000110288 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
Usp30Q3UN04 Tmpo-203ENSMUST00000092219 1854 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Usp30Q3UN04 Fam92a-208ENSMUST00000177837 1325 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
Usp30Q3UN04 Tm6sf1-201ENSMUST00000041890 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Usp30Q3UN04 Usf1-210ENSMUST00000167546 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.26
Usp30Q3UN04 Nudt6-204ENSMUST00000108118 935 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
Usp30Q3UN04 Nudt6-201ENSMUST00000052645 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Usp30Q3UN04 H1fx-201ENSMUST00000056403 1217 ntAPPRIS P1 BASIC22.89■■□□□ 1.25
Usp30Q3UN04 Nudt6-202ENSMUST00000099130 1070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Usp30Q3UN04 Preb-209ENSMUST00000202567 1869 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Usp30Q3UN04 Glrx3-201ENSMUST00000064404 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Usp30Q3UN04 Neurog2-201ENSMUST00000029587 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Usp30Q3UN04 Hnrnpul1-202ENSMUST00000108401 1240 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Usp30Q3UN04 Cyp2r1-202ENSMUST00000119712 917 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
Usp30Q3UN04 Gm5921-201ENSMUST00000075898 882 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
Usp30Q3UN04 Ankrd28-201ENSMUST00000014640 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Usp30Q3UN04 Srcap-211ENSMUST00000189136 1960 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Usp30Q3UN04 Msto1-202ENSMUST00000126245 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Usp30Q3UN04 D17Wsu92e-201ENSMUST00000075076 1470 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Usp30Q3UN04 Ppcs-201ENSMUST00000030385 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Usp30Q3UN04 Pmvk-201ENSMUST00000029564 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Usp30Q3UN04 Mapkap1-202ENSMUST00000113124 1758 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
Usp30Q3UN04 Pcsk1n-201ENSMUST00000041096 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Usp30Q3UN04 Isoc1-201ENSMUST00000025503 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Usp30Q3UN04 Hist2h3c1-201ENSMUST00000176059 1820 ntAPPRIS P1 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Usp30Q3UN04 Hist2h3c1-202ENSMUST00000177796 1825 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
Usp30Q3UN04 Pdpk1-203ENSMUST00000115407 1730 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Usp30Q3UN04 2410017I17Rik-202ENSMUST00000090537 2053 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Usp30Q3UN04 Frat2-201ENSMUST00000059231 2161 ntAPPRIS P1 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Usp30Q3UN04 Rragc-201ENSMUST00000030399 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Usp30Q3UN04 B230377A18Rik-202ENSMUST00000192921 1364 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
Usp30Q3UN04 Usp2-206ENSMUST00000176416 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Usp30Q3UN04 Foxc1-201ENSMUST00000062292 5844 ntAPPRIS P1 BASIC22.83■■□□□ 1.24
Usp30Q3UN04 Hoxd9-201ENSMUST00000059272 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Usp30Q3UN04 Ipmk-203ENSMUST00000121446 1492 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Usp30Q3UN04 Neurl1b-202ENSMUST00000182897 1231 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Usp30Q3UN04 Cadm1-209ENSMUST00000152459 1784 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Usp30Q3UN04 Ccna1-202ENSMUST00000197238 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Usp30Q3UN04 Tmem11-201ENSMUST00000062677 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Usp30Q3UN04 Lsm4-201ENSMUST00000034311 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Usp30Q3UN04 Kcnj6-201ENSMUST00000095873 1773 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Usp30Q3UN04 Becn1-216ENSMUST00000170502 725 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Usp30Q3UN04 Tm2d2-201ENSMUST00000033961 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Usp30Q3UN04 Dleu7-201ENSMUST00000063169 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Usp30Q3UN04 Jag2-201ENSMUST00000075827 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Usp30Q3UN04 Ntn5-203ENSMUST00000183120 1491 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 13.7 ms