Protein–RNA interactions for Protein: Q3ULQ2

Pin1rt1, Peptidyl-prolyl cis-trans isomerase, mousemouse

Predictions only

Length 159 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pin1rt1Q3ULQ2 Gm27021-201ENSMUST00000181333 758 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Pin1rt1Q3ULQ2 Gm5784-202ENSMUST00000220896 2016 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Pin1rt1Q3ULQ2 Nudt9-201ENSMUST00000031250 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Pin1rt1Q3ULQ2 Smurf1-203ENSMUST00000110677 5420 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Pin1rt1Q3ULQ2 Slc44a1-203ENSMUST00000107646 1974 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Pin1rt1Q3ULQ2 Gorasp2-205ENSMUST00000133432 1941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Pin1rt1Q3ULQ2 C2cd4b-201ENSMUST00000171652 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Pin1rt1Q3ULQ2 Lsr-201ENSMUST00000001279 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Pin1rt1Q3ULQ2 Iars2-202ENSMUST00000110974 2431 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Pin1rt1Q3ULQ2 Rexo2-210ENSMUST00000217037 609 ntTSL 3 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Pin1rt1Q3ULQ2 AC131739.1-201ENSMUST00000221692 1245 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
Pin1rt1Q3ULQ2 3110021N24Rik-201ENSMUST00000178992 1812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
Pin1rt1Q3ULQ2 Znrf2-201ENSMUST00000079869 5886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Pin1rt1Q3ULQ2 Phf23-201ENSMUST00000018716 2006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Pin1rt1Q3ULQ2 Gm15156-201ENSMUST00000148217 417 ntTSL 3 BASIC21.31■■□□□ 1
Pin1rt1Q3ULQ2 Gm13889-202ENSMUST00000148314 1240 ntAPPRIS P1 BASIC21.31■■□□□ 1
Pin1rt1Q3ULQ2 Trafd1-201ENSMUST00000042312 2503 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Pin1rt1Q3ULQ2 Lsm14b-201ENSMUST00000055485 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Pin1rt1Q3ULQ2 Glrx3-201ENSMUST00000064404 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Pin1rt1Q3ULQ2 H3f3aos-201ENSMUST00000097448 2905 ntBASIC21.3■■□□□ 1
Pin1rt1Q3ULQ2 Gm11599-201ENSMUST00000118720 878 ntBASIC21.3■■□□□ 1
Pin1rt1Q3ULQ2 Nrsn1-201ENSMUST00000057866 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Pin1rt1Q3ULQ2 Scn1b-201ENSMUST00000098548 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Pin1rt1Q3ULQ2 Gng12-204ENSMUST00000114225 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Pin1rt1Q3ULQ2 Hoxb9-201ENSMUST00000000010 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Pin1rt1Q3ULQ2 Gipc1-201ENSMUST00000019577 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Pin1rt1Q3ULQ2 Ddx43-201ENSMUST00000113367 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
Pin1rt1Q3ULQ2 Upf3a-201ENSMUST00000043767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Pin1rt1Q3ULQ2 Dbndd2-202ENSMUST00000069385 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Pin1rt1Q3ULQ2 Srcap-210ENSMUST00000188124 2048 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Pin1rt1Q3ULQ2 Nxph3-201ENSMUST00000058866 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Pin1rt1Q3ULQ2 Zfp768-202ENSMUST00000205266 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
Pin1rt1Q3ULQ2 Ildr2-203ENSMUST00000192638 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Pin1rt1Q3ULQ2 Armc10-201ENSMUST00000072896 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Pin1rt1Q3ULQ2 Gm2018-201ENSMUST00000140754 478 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
Pin1rt1Q3ULQ2 P3h3-201ENSMUST00000023958 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Pin1rt1Q3ULQ2 Frmd5-201ENSMUST00000110592 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.27■□□□□ 0.99
Pin1rt1Q3ULQ2 Arl8a-201ENSMUST00000027684 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Pin1rt1Q3ULQ2 Stambp-207ENSMUST00000206592 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Pin1rt1Q3ULQ2 Gm17110-201ENSMUST00000171248 735 ntTSL 3 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Pin1rt1Q3ULQ2 Traf3ip1-203ENSMUST00000189341 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Pin1rt1Q3ULQ2 Fam89a-201ENSMUST00000055257 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Pin1rt1Q3ULQ2 Hdac3-201ENSMUST00000043498 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Pin1rt1Q3ULQ2 Npas1-201ENSMUST00000002053 2091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Pin1rt1Q3ULQ2 Jmjd6-201ENSMUST00000047616 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Pin1rt1Q3ULQ2 Strn3-202ENSMUST00000169503 2791 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Pin1rt1Q3ULQ2 2410022M11Rik-201ENSMUST00000186474 1911 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
Pin1rt1Q3ULQ2 Micu2-201ENSMUST00000022543 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Pin1rt1Q3ULQ2 Mthfd2l-201ENSMUST00000071652 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Pin1rt1Q3ULQ2 Ppp1cc-202ENSMUST00000102528 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Pin1rt1Q3ULQ2 Fbxw4-201ENSMUST00000046869 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Pin1rt1Q3ULQ2 Gm4419-202ENSMUST00000226239 1431 ntBASIC21.24■□□□□ 0.99
Pin1rt1Q3ULQ2 Pcbd2-201ENSMUST00000021958 544 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Pin1rt1Q3ULQ2 Vmac-201ENSMUST00000067931 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Pin1rt1Q3ULQ2 Tmem9b-201ENSMUST00000033333 1703 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Pin1rt1Q3ULQ2 Usp12-201ENSMUST00000085614 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Pin1rt1Q3ULQ2 Rnf19b-206ENSMUST00000168461 2532 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Pin1rt1Q3ULQ2 Cbln2-203ENSMUST00000122464 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Pin1rt1Q3ULQ2 Kcnc3-206ENSMUST00000208651 2728 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Pin1rt1Q3ULQ2 Rnf39-201ENSMUST00000040498 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Pin1rt1Q3ULQ2 Ptx3-201ENSMUST00000029421 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Pin1rt1Q3ULQ2 Porcn-201ENSMUST00000077595 1872 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Pin1rt1Q3ULQ2 Porcn-204ENSMUST00000089403 1854 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Pin1rt1Q3ULQ2 Phf23-202ENSMUST00000101526 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Pin1rt1Q3ULQ2 Abhd17b-201ENSMUST00000052556 2475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
Pin1rt1Q3ULQ2 Tmem70-203ENSMUST00000177501 1636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Pin1rt1Q3ULQ2 1700003F12Rik-202ENSMUST00000109709 704 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.2■□□□□ 0.98
Pin1rt1Q3ULQ2 Fam89b-202ENSMUST00000116558 1189 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Pin1rt1Q3ULQ2 1700003F12Rik-201ENSMUST00000045116 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Pin1rt1Q3ULQ2 Gm17641-201ENSMUST00000166328 2350 ntBASIC21.2■□□□□ 0.98
Pin1rt1Q3ULQ2 Spsb3-202ENSMUST00000068508 2004 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Pin1rt1Q3ULQ2 Sorcs2-202ENSMUST00000070720 2089 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Pin1rt1Q3ULQ2 Arpc2-203ENSMUST00000113820 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Pin1rt1Q3ULQ2 Chpt1-204ENSMUST00000117579 1043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Pin1rt1Q3ULQ2 Rcor3-207ENSMUST00000192866 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
Pin1rt1Q3ULQ2 Abhd17c-201ENSMUST00000117085 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Pin1rt1Q3ULQ2 Ptpn18-206ENSMUST00000188972 414 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Pin1rt1Q3ULQ2 Rfxap-201ENSMUST00000044373 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Pin1rt1Q3ULQ2 6330420H09Rik-201ENSMUST00000211371 1316 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Pin1rt1Q3ULQ2 Foxk2-201ENSMUST00000106113 5029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Pin1rt1Q3ULQ2 Ccnyl1-203ENSMUST00000187170 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
Pin1rt1Q3ULQ2 Insc-208ENSMUST00000169913 2321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
Pin1rt1Q3ULQ2 Pom121-201ENSMUST00000111171 5580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Pin1rt1Q3ULQ2 Dvl1-208ENSMUST00000168552 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Pin1rt1Q3ULQ2 Capza2-201ENSMUST00000015877 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Pin1rt1Q3ULQ2 Nsun2-208ENSMUST00000176485 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
Pin1rt1Q3ULQ2 Bean1-205ENSMUST00000212979 2131 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
Pin1rt1Q3ULQ2 Hmgn3-202ENSMUST00000162246 983 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Pin1rt1Q3ULQ2 Arhgef25-205ENSMUST00000218654 2475 ntTSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
Pin1rt1Q3ULQ2 E330009J07Rik-201ENSMUST00000039008 1949 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Pin1rt1Q3ULQ2 Kctd2-201ENSMUST00000103035 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Pin1rt1Q3ULQ2 Gm37136-201ENSMUST00000194368 194 ntBASIC21.15■□□□□ 0.98
Pin1rt1Q3ULQ2 Purg-202ENSMUST00000078058 1795 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Pin1rt1Q3ULQ2 Slc1a5-201ENSMUST00000108496 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
Pin1rt1Q3ULQ2 Neurl4-201ENSMUST00000061837 5188 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.98
Pin1rt1Q3ULQ2 Lrrc14-201ENSMUST00000036423 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
Pin1rt1Q3ULQ2 Ctnnd2-201ENSMUST00000081728 5944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
Pin1rt1Q3ULQ2 Dbp-201ENSMUST00000080885 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Pin1rt1Q3ULQ2 Nckap5los-201ENSMUST00000159738 1712 ntTSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.97
Pin1rt1Q3ULQ2 Tcf4-246ENSMUST00000202116 2986 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.4 ms