Protein–RNA interactions for Protein: Q3UIW8

Rnf224, RING finger protein 224, mousemouse

Predictions only

Length 156 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rnf224Q3UIW8 D030046N08Rik-201ENSMUST00000162318 1570 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Rnf224Q3UIW8 Hagh-201ENSMUST00000024974 1101 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
Rnf224Q3UIW8 Grasp-201ENSMUST00000000543 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Rnf224Q3UIW8 Gm45444-201ENSMUST00000211394 898 ntBASIC21.67■■□□□ 1.06
Rnf224Q3UIW8 Polr1d-201ENSMUST00000050970 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Rnf224Q3UIW8 Rpl34-201ENSMUST00000062601 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Rnf224Q3UIW8 B4galt7-202ENSMUST00000100764 2195 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Rnf224Q3UIW8 AC122379.1-201ENSMUST00000220658 355 ntTSL 3 BASIC21.66■■□□□ 1.06
Rnf224Q3UIW8 Eif4ebp1-201ENSMUST00000033880 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Rnf224Q3UIW8 Gm16286-202ENSMUST00000125127 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Rnf224Q3UIW8 4930597O21Rik-201ENSMUST00000065878 984 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Rnf224Q3UIW8 Nelfe-201ENSMUST00000097343 1607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
Rnf224Q3UIW8 D17Wsu92e-201ENSMUST00000075076 1470 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
Rnf224Q3UIW8 Gm26533-201ENSMUST00000180550 1790 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
Rnf224Q3UIW8 Eid1-201ENSMUST00000164756 1691 ntAPPRIS P1 BASIC21.64■■□□□ 1.05
Rnf224Q3UIW8 Gm16599-201ENSMUST00000148082 1182 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Rnf224Q3UIW8 Gm43592-201ENSMUST00000196922 1165 ntBASIC21.64■■□□□ 1.05
Rnf224Q3UIW8 Dazap1-201ENSMUST00000092305 1994 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Rnf224Q3UIW8 Chrna5-204ENSMUST00000217408 2446 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Rnf224Q3UIW8 Mapkap1-202ENSMUST00000113124 1758 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
Rnf224Q3UIW8 March2-203ENSMUST00000172767 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Rnf224Q3UIW8 Gm42501-201ENSMUST00000200220 1026 ntBASIC21.63■■□□□ 1.05
Rnf224Q3UIW8 Pkig-202ENSMUST00000099105 640 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
Rnf224Q3UIW8 A830010M20Rik-207ENSMUST00000162298 1408 ntTSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
Rnf224Q3UIW8 Dnttip1-201ENSMUST00000017443 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Rnf224Q3UIW8 Hdac3-201ENSMUST00000043498 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Rnf224Q3UIW8 Gm28417-202ENSMUST00000185881 538 ntTSL 3 BASIC21.62■■□□□ 1.05
Rnf224Q3UIW8 Slc37a3-211ENSMUST00000202749 434 ntTSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
Rnf224Q3UIW8 Pcf11-204ENSMUST00000208058 461 ntTSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
Rnf224Q3UIW8 Hoxb3-201ENSMUST00000055334 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Rnf224Q3UIW8 Adgrb2-207ENSMUST00000120204 5170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Rnf224Q3UIW8 Pgls-205ENSMUST00000143441 1062 ntTSL 3 BASIC21.61■■□□□ 1.05
Rnf224Q3UIW8 Phf23-201ENSMUST00000018716 2006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Rnf224Q3UIW8 Mta3-201ENSMUST00000067826 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Rnf224Q3UIW8 Eed-201ENSMUST00000107234 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Rnf224Q3UIW8 Shf-203ENSMUST00000110531 1557 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Rnf224Q3UIW8 Eif5a-213ENSMUST00000164359 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Rnf224Q3UIW8 1700016K19Rik-201ENSMUST00000066408 921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Rnf224Q3UIW8 Esrra-201ENSMUST00000025906 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Rnf224Q3UIW8 Jdp2-201ENSMUST00000050687 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Rnf224Q3UIW8 Cckbr-202ENSMUST00000181339 1326 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Rnf224Q3UIW8 Tmpo-205ENSMUST00000105293 1842 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Rnf224Q3UIW8 Cadm1-206ENSMUST00000143026 1643 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.04
Rnf224Q3UIW8 Pdf-201ENSMUST00000055316 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Rnf224Q3UIW8 Ube2k-206ENSMUST00000201984 1449 ntTSL 3 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Rnf224Q3UIW8 Fads2-201ENSMUST00000025567 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Rnf224Q3UIW8 Ost4-202ENSMUST00000132253 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Rnf224Q3UIW8 Gm20684-201ENSMUST00000176744 380 ntTSL 3 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Rnf224Q3UIW8 Dynlt1f-201ENSMUST00000179554 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Rnf224Q3UIW8 Gm44428-201ENSMUST00000204474 874 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
Rnf224Q3UIW8 Ankrd49-205ENSMUST00000216037 1037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Rnf224Q3UIW8 Nrg3-202ENSMUST00000168810 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Rnf224Q3UIW8 Serp2-204ENSMUST00000228055 705 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
Rnf224Q3UIW8 Lsm4-201ENSMUST00000034311 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Rnf224Q3UIW8 Ech1-201ENSMUST00000066264 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Rnf224Q3UIW8 Dmwd-201ENSMUST00000032570 2494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Rnf224Q3UIW8 Clk2-201ENSMUST00000090927 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Rnf224Q3UIW8 Ebf4-203ENSMUST00000110288 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Rnf224Q3UIW8 AC117245.1-201ENSMUST00000215481 566 ntTSL 3 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Rnf224Q3UIW8 Gm9767-201ENSMUST00000041011 1193 ntAPPRIS P1 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Rnf224Q3UIW8 Pgp-201ENSMUST00000053024 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Rnf224Q3UIW8 Ppp1ca-201ENSMUST00000046094 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Rnf224Q3UIW8 Ipmk-203ENSMUST00000121446 1492 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Rnf224Q3UIW8 Tpst1-201ENSMUST00000040721 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Rnf224Q3UIW8 Raly-201ENSMUST00000029120 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Rnf224Q3UIW8 Ccdc85c-201ENSMUST00000136175 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Rnf224Q3UIW8 Gm17494-201ENSMUST00000072769 1800 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Rnf224Q3UIW8 Ube2i-206ENSMUST00000172618 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Rnf224Q3UIW8 Ctxn1-201ENSMUST00000053252 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Rnf224Q3UIW8 Ppp1r3e-202ENSMUST00000177403 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Rnf224Q3UIW8 Gm26859-201ENSMUST00000181743 1852 ntTSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Rnf224Q3UIW8 Marveld2-202ENSMUST00000163163 2187 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Rnf224Q3UIW8 Hrh3-205ENSMUST00000165762 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
Rnf224Q3UIW8 Cnot6l-203ENSMUST00000122003 2089 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Rnf224Q3UIW8 Arl8a-201ENSMUST00000027684 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
Rnf224Q3UIW8 Sh3gl3-201ENSMUST00000032874 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Rnf224Q3UIW8 March5-202ENSMUST00000112391 1293 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Rnf224Q3UIW8 Arhgap39-204ENSMUST00000176219 542 ntTSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Rnf224Q3UIW8 Smco4-203ENSMUST00000215907 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Rnf224Q3UIW8 Gm18755-201ENSMUST00000218030 1099 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
Rnf224Q3UIW8 Galnt10-202ENSMUST00000108846 1745 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Rnf224Q3UIW8 Zfp346-203ENSMUST00000159278 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Rnf224Q3UIW8 Tlx2-201ENSMUST00000089641 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Rnf224Q3UIW8 Terf2-203ENSMUST00000116425 2471 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Rnf224Q3UIW8 Adprhl2-201ENSMUST00000102617 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Rnf224Q3UIW8 Fn1-208ENSMUST00000186940 1350 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Rnf224Q3UIW8 Snrpb-201ENSMUST00000103199 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Rnf224Q3UIW8 Hoxd8-201ENSMUST00000019749 2634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Rnf224Q3UIW8 C1qtnf5-203ENSMUST00000114818 1337 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Rnf224Q3UIW8 Phf23-205ENSMUST00000135814 2214 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Rnf224Q3UIW8 Dusp15-202ENSMUST00000109811 753 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Rnf224Q3UIW8 Cyp2r1-202ENSMUST00000119712 917 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Rnf224Q3UIW8 Socs1-201ENSMUST00000038099 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Rnf224Q3UIW8 Barx1-201ENSMUST00000021813 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Rnf224Q3UIW8 Lrfn1-203ENSMUST00000189877 1852 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Rnf224Q3UIW8 Dtnb-211ENSMUST00000173240 2218 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Rnf224Q3UIW8 H3f3a-207ENSMUST00000162814 724 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Rnf224Q3UIW8 Gm14121-201ENSMUST00000121441 1380 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
Rnf224Q3UIW8 Kctd6-201ENSMUST00000022272 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Rnf224Q3UIW8 Kcnip3-202ENSMUST00000088538 1296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 176.3 ms