Protein–RNA interactions for Protein: Q3UEI1

Pde4c, cAMP-specific 3',5'-cyclic phosphodiesterase 4C, mousemouse

Predictions only

Length 686 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pde4cQ3UEI1 Tmem127-202ENSMUST00000174288 842 ntTSL 2 BASIC33.46■■■□□ 2.95
Pde4cQ3UEI1 Lsm4-205ENSMUST00000210987 636 ntTSL 5 BASIC33.46■■■□□ 2.95
Pde4cQ3UEI1 Gm44428-201ENSMUST00000204474 874 ntBASIC33.45■■■□□ 2.95
Pde4cQ3UEI1 Ppp1ca-201ENSMUST00000046094 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.45■■■□□ 2.94
Pde4cQ3UEI1 Nudt3-203ENSMUST00000114886 996 ntTSL 2 BASIC33.43■■■□□ 2.94
Pde4cQ3UEI1 Hopx-203ENSMUST00000120827 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.43■■■□□ 2.94
Pde4cQ3UEI1 Hexdc-202ENSMUST00000106117 2149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.43■■■□□ 2.94
Pde4cQ3UEI1 Fam92a-202ENSMUST00000108285 1639 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC33.42■■■□□ 2.94
Pde4cQ3UEI1 Gm960-202ENSMUST00000177696 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC33.42■■■□□ 2.94
Pde4cQ3UEI1 Gal3st1-202ENSMUST00000078757 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.4■■■□□ 2.94
Pde4cQ3UEI1 Fam89b-203ENSMUST00000161368 1160 ntTSL 1 (best) BASIC33.4■■■□□ 2.94
Pde4cQ3UEI1 Gm2415-202ENSMUST00000134688 401 ntTSL 2 BASIC33.39■■■□□ 2.94
Pde4cQ3UEI1 Acvr2b-201ENSMUST00000035093 1729 ntTSL 5 BASIC33.39■■■□□ 2.94
Pde4cQ3UEI1 Hnrnpul1-202ENSMUST00000108401 1240 ntTSL 1 (best) BASIC33.38■■■□□ 2.93
Pde4cQ3UEI1 Cyp2r1-202ENSMUST00000119712 917 ntTSL 5 BASIC33.38■■■□□ 2.93
Pde4cQ3UEI1 Zc3h6-201ENSMUST00000110319 1484 ntTSL 1 (best) BASIC33.37■■■□□ 2.93
Pde4cQ3UEI1 Hdgf-201ENSMUST00000005017 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.37■■■□□ 2.93
Pde4cQ3UEI1 Gm4419-202ENSMUST00000226239 1431 ntBASIC33.36■■■□□ 2.93
Pde4cQ3UEI1 Hecw2-202ENSMUST00000097741 1132 ntTSL 1 (best) BASIC33.36■■■□□ 2.93
Pde4cQ3UEI1 D17Wsu92e-201ENSMUST00000075076 1470 ntTSL 1 (best) BASIC33.36■■■□□ 2.93
Pde4cQ3UEI1 Gipc1-201ENSMUST00000019577 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.35■■■□□ 2.93
Pde4cQ3UEI1 Tmem42-201ENSMUST00000084733 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.35■■■□□ 2.93
Pde4cQ3UEI1 Gm29735-201ENSMUST00000209599 660 ntAPPRIS P1 BASIC33.34■■■□□ 2.93
Pde4cQ3UEI1 Gm21989-201ENSMUST00000174530 1609 ntTSL 1 (best) BASIC33.34■■■□□ 2.93
Pde4cQ3UEI1 Mypop-203ENSMUST00000131087 1951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.34■■■□□ 2.93
Pde4cQ3UEI1 Mapkap1-202ENSMUST00000113124 1758 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC33.34■■■□□ 2.93
Pde4cQ3UEI1 H2afy-202ENSMUST00000045788 1933 ntTSL 1 (best) BASIC33.34■■■□□ 2.93
Pde4cQ3UEI1 Pdcd4-203ENSMUST00000165617 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.33■■■□□ 2.93
Pde4cQ3UEI1 Ssbp4-205ENSMUST00000210369 1828 ntTSL 2 BASIC33.33■■■□□ 2.93
Pde4cQ3UEI1 Oaz2-206ENSMUST00000153700 1843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC33.32■■■□□ 2.93
Pde4cQ3UEI1 Upp2-202ENSMUST00000071543 2150 ntTSL 1 (best) BASIC33.32■■■□□ 2.92
Pde4cQ3UEI1 Fam50b-202ENSMUST00000221037 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.31■■■□□ 2.92
Pde4cQ3UEI1 Ipmk-203ENSMUST00000121446 1492 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.31■■■□□ 2.92
Pde4cQ3UEI1 Becn1-216ENSMUST00000170502 725 ntTSL 1 (best) BASIC33.3■■■□□ 2.92
Pde4cQ3UEI1 Gm12905-201ENSMUST00000153814 658 ntTSL 2 BASIC33.29■■■□□ 2.92
Pde4cQ3UEI1 Suv39h2-202ENSMUST00000060618 1831 ntTSL 1 (best) BASIC33.29■■■□□ 2.92
Pde4cQ3UEI1 Etfa-201ENSMUST00000034866 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.29■■■□□ 2.92
Pde4cQ3UEI1 Pdgfa-204ENSMUST00000110897 1287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.28■■■□□ 2.92
Pde4cQ3UEI1 Snx21-203ENSMUST00000152471 1243 ntTSL 1 (best) BASIC33.28■■■□□ 2.92
Pde4cQ3UEI1 Foxe3-201ENSMUST00000050940 867 ntAPPRIS P1 BASIC33.28■■■□□ 2.92
Pde4cQ3UEI1 Dexi-201ENSMUST00000038281 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.27■■■□□ 2.92
Pde4cQ3UEI1 Gm22567-201ENSMUST00000175542 342 ntBASIC33.27■■■□□ 2.92
Pde4cQ3UEI1 Trappc6b-207ENSMUST00000218686 785 ntTSL 3 BASIC33.27■■■□□ 2.92
Pde4cQ3UEI1 Coprs-201ENSMUST00000033839 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.27■■■□□ 2.92
Pde4cQ3UEI1 Rnaset2b-201ENSMUST00000089119 1013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.27■■■□□ 2.92
Pde4cQ3UEI1 Crls1-201ENSMUST00000028835 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.27■■■□□ 2.92
Pde4cQ3UEI1 Adap1-201ENSMUST00000110865 2557 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.26■■■□□ 2.92
Pde4cQ3UEI1 Usf1-210ENSMUST00000167546 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.26■■■□□ 2.92
Pde4cQ3UEI1 Eif5a-208ENSMUST00000108611 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.26■■■□□ 2.92
Pde4cQ3UEI1 Gm15546-201ENSMUST00000122095 826 ntBASIC33.26■■■□□ 2.91
Pde4cQ3UEI1 Psip1-203ENSMUST00000107215 1898 ntTSL 1 (best) BASIC33.26■■■□□ 2.91
Pde4cQ3UEI1 Bag1-203ENSMUST00000191273 1348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.26■■■□□ 2.91
Pde4cQ3UEI1 Gm7544-201ENSMUST00000222426 828 ntAPPRIS P1 BASIC33.25■■■□□ 2.91
Pde4cQ3UEI1 Dhrs11-201ENSMUST00000047560 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.25■■■□□ 2.91
Pde4cQ3UEI1 Spryd7-202ENSMUST00000100496 1459 ntTSL 1 (best) BASIC33.25■■■□□ 2.91
Pde4cQ3UEI1 Kctd2-201ENSMUST00000103035 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.24■■■□□ 2.91
Pde4cQ3UEI1 Hras-202ENSMUST00000097957 1199 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.24■■■□□ 2.91
Pde4cQ3UEI1 Pth1r-202ENSMUST00000166716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.23■■■□□ 2.91
Pde4cQ3UEI1 AC161180.1-201ENSMUST00000223439 933 ntAPPRIS P1 BASIC33.23■■■□□ 2.91
Pde4cQ3UEI1 Vdac1-202ENSMUST00000102758 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.23■■■□□ 2.91
Pde4cQ3UEI1 Tirap-205ENSMUST00000176685 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.22■■■□□ 2.91
Pde4cQ3UEI1 Reps1-206ENSMUST00000154718 2402 ntTSL 5 BASIC33.22■■■□□ 2.91
Pde4cQ3UEI1 Dtnb-203ENSMUST00000164578 2355 ntTSL 1 (best) BASIC33.21■■■□□ 2.91
Pde4cQ3UEI1 AC166358.2-201ENSMUST00000223403 734 ntTSL 5 BASIC33.21■■■□□ 2.91
Pde4cQ3UEI1 Gm13238-201ENSMUST00000117655 780 ntBASIC33.2■■■□□ 2.91
Pde4cQ3UEI1 Gm5522-201ENSMUST00000189483 1242 ntBASIC33.19■■■□□ 2.9
Pde4cQ3UEI1 Gm43592-201ENSMUST00000196922 1165 ntBASIC33.19■■■□□ 2.9
Pde4cQ3UEI1 Phf2os1-201ENSMUST00000123212 498 ntTSL 3 BASIC33.16■■■□□ 2.9
Pde4cQ3UEI1 Usp2-206ENSMUST00000176416 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.16■■■□□ 2.9
Pde4cQ3UEI1 Ints11-202ENSMUST00000120794 1884 ntTSL 5 BASIC33.16■■■□□ 2.9
Pde4cQ3UEI1 Sin3b-202ENSMUST00000109950 1024 ntTSL 1 (best) BASIC33.15■■■□□ 2.9
Pde4cQ3UEI1 Dynll1-202ENSMUST00000112090 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.14■■■□□ 2.9
Pde4cQ3UEI1 Lsm4-201ENSMUST00000034311 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.13■■■□□ 2.89
Pde4cQ3UEI1 Kcnk2-205ENSMUST00000192723 1642 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC33.12■■■□□ 2.89
Pde4cQ3UEI1 Ntn5-203ENSMUST00000183120 1491 ntTSL 1 (best) BASIC33.12■■■□□ 2.89
Pde4cQ3UEI1 Hist2h3c1-201ENSMUST00000176059 1820 ntAPPRIS P1 BASIC33.12■■■□□ 2.89
Pde4cQ3UEI1 Hist2h3c1-202ENSMUST00000177796 1825 ntBASIC33.12■■■□□ 2.89
Pde4cQ3UEI1 Thra-202ENSMUST00000103139 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.09■■■□□ 2.89
Pde4cQ3UEI1 Gng12-203ENSMUST00000114224 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC33.09■■■□□ 2.89
Pde4cQ3UEI1 Gng12-206ENSMUST00000114227 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.09■■■□□ 2.89
Pde4cQ3UEI1 St7-208ENSMUST00000115419 2194 ntTSL 1 (best) BASIC33.09■■■□□ 2.89
Pde4cQ3UEI1 Gm6217-201ENSMUST00000222182 829 ntAPPRIS P1 BASIC33.08■■■□□ 2.89
Pde4cQ3UEI1 Hoxd9-201ENSMUST00000059272 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.07■■■□□ 2.88
Pde4cQ3UEI1 Pde8b-204ENSMUST00000159608 2370 ntTSL 5 BASIC33.07■■■□□ 2.88
Pde4cQ3UEI1 Tmem189-201ENSMUST00000006587 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.06■■■□□ 2.88
Pde4cQ3UEI1 Pdpk1-203ENSMUST00000115407 1730 ntTSL 5 BASIC33.06■■■□□ 2.88
Pde4cQ3UEI1 Gm43566-201ENSMUST00000196851 808 ntBASIC33.06■■■□□ 2.88
Pde4cQ3UEI1 H2afj-202ENSMUST00000203982 577 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC33.06■■■□□ 2.88
Pde4cQ3UEI1 Nsd1-203ENSMUST00000224156 1149 ntBASIC33.05■■■□□ 2.88
Pde4cQ3UEI1 Scn1b-201ENSMUST00000098548 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.04■■■□□ 2.88
Pde4cQ3UEI1 Cckbr-202ENSMUST00000181339 1326 ntTSL 1 (best) BASIC33.04■■■□□ 2.88
Pde4cQ3UEI1 Rin3-207ENSMUST00000150795 937 ntTSL 1 (best) BASIC33.04■■■□□ 2.88
Pde4cQ3UEI1 Ube2k-206ENSMUST00000201984 1449 ntTSL 3 BASIC33.03■■■□□ 2.88
Pde4cQ3UEI1 AC117769.4-201ENSMUST00000225679 685 ntBASIC33.03■■■□□ 2.88
Pde4cQ3UEI1 Ak2-201ENSMUST00000030583 986 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC33.03■■■□□ 2.88
Pde4cQ3UEI1 Rbm45-201ENSMUST00000046389 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.03■■■□□ 2.88
Pde4cQ3UEI1 Runx2-211ENSMUST00000162629 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.02■■■□□ 2.88
Pde4cQ3UEI1 Tmx4-202ENSMUST00000110119 596 ntTSL 2 BASIC33.02■■■□□ 2.88
Pde4cQ3UEI1 Dusp2-201ENSMUST00000028846 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.02■■■□□ 2.88
Pde4cQ3UEI1 Jdp2-201ENSMUST00000050687 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.02■■■□□ 2.88
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.6 ms