Protein–RNA interactions for Protein: Q3TXX3

Zfyve27, Protrudin, mousemouse

Predictions only

Length 415 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Zfyve27Q3TXX3 Odc1-201ENSMUST00000171737 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
Zfyve27Q3TXX3 Pcf11-205ENSMUST00000208255 1720 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
Zfyve27Q3TXX3 Zfp703-201ENSMUST00000127097 587 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
Zfyve27Q3TXX3 Gm27040-201ENSMUST00000181984 504 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
Zfyve27Q3TXX3 1700026D11Rik-201ENSMUST00000126910 2033 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Zfyve27Q3TXX3 Six3-201ENSMUST00000162695 2838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
Zfyve27Q3TXX3 AC154454.1-201ENSMUST00000225253 216 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
Zfyve27Q3TXX3 Pkd1-207ENSMUST00000228550 1050 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
Zfyve27Q3TXX3 P3h4-201ENSMUST00000066489 2178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Zfyve27Q3TXX3 Smarcc1-201ENSMUST00000088716 5717 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Zfyve27Q3TXX3 Gm7332-201ENSMUST00000118351 454 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
Zfyve27Q3TXX3 Gm15039-201ENSMUST00000118914 875 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
Zfyve27Q3TXX3 4933429H19Rik-202ENSMUST00000187361 995 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
Zfyve27Q3TXX3 Cacfd1-204ENSMUST00000114006 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Zfyve27Q3TXX3 Taf4-204ENSMUST00000227325 4380 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
Zfyve27Q3TXX3 Cadm1-202ENSMUST00000085909 2126 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Zfyve27Q3TXX3 Kcnc3-203ENSMUST00000207493 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
Zfyve27Q3TXX3 Homer3-201ENSMUST00000003669 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Zfyve27Q3TXX3 Rnaset2a-201ENSMUST00000097420 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Zfyve27Q3TXX3 Vps37b-201ENSMUST00000040967 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Zfyve27Q3TXX3 Cadps-204ENSMUST00000177814 5461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
Zfyve27Q3TXX3 P3h3-201ENSMUST00000023958 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Zfyve27Q3TXX3 Gm17641-201ENSMUST00000166328 2350 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
Zfyve27Q3TXX3 Rarres1-201ENSMUST00000054825 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Zfyve27Q3TXX3 H2afy-202ENSMUST00000045788 1933 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Zfyve27Q3TXX3 Ppp2r3d-202ENSMUST00000180270 450 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Zfyve27Q3TXX3 Habp4-201ENSMUST00000021929 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
Zfyve27Q3TXX3 Paqr3-202ENSMUST00000112968 1875 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Zfyve27Q3TXX3 Rnf19b-206ENSMUST00000168461 2532 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
Zfyve27Q3TXX3 Cdc14b-207ENSMUST00000221634 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Zfyve27Q3TXX3 Mospd3-201ENSMUST00000037620 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Zfyve27Q3TXX3 Cic-202ENSMUST00000163320 6096 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Zfyve27Q3TXX3 Cic-201ENSMUST00000005578 6099 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
Zfyve27Q3TXX3 Gpr25-201ENSMUST00000086395 1077 ntAPPRIS P1 BASIC23.38■■□□□ 1.33
Zfyve27Q3TXX3 Hoxb3-202ENSMUST00000093944 3190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
Zfyve27Q3TXX3 Ctdspl-201ENSMUST00000073109 4589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Zfyve27Q3TXX3 Pdgfb-201ENSMUST00000000500 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Zfyve27Q3TXX3 Kctd15-202ENSMUST00000108069 2407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
Zfyve27Q3TXX3 Sox3-201ENSMUST00000135107 2065 ntAPPRIS P1 BASIC23.37■■□□□ 1.33
Zfyve27Q3TXX3 Ran-202ENSMUST00000111343 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Zfyve27Q3TXX3 Tceal6-201ENSMUST00000033783 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Zfyve27Q3TXX3 Deaf1-201ENSMUST00000080553 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Zfyve27Q3TXX3 Dvl1-208ENSMUST00000168552 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Zfyve27Q3TXX3 Ltk-201ENSMUST00000028759 3080 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Zfyve27Q3TXX3 Pmvk-201ENSMUST00000029564 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Zfyve27Q3TXX3 Efcc1-202ENSMUST00000159570 2293 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
Zfyve27Q3TXX3 Pcgf5-210ENSMUST00000225411 1626 ntAPPRIS P5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
Zfyve27Q3TXX3 Mpp6-202ENSMUST00000036236 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Zfyve27Q3TXX3 Dennd5a-201ENSMUST00000080437 5004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Zfyve27Q3TXX3 B4galt2-201ENSMUST00000030266 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Zfyve27Q3TXX3 Mir3960-201ENSMUST00000198213 73 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
Zfyve27Q3TXX3 A830092H15Rik-201ENSMUST00000099182 1229 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
Zfyve27Q3TXX3 Lmo2-202ENSMUST00000111140 1706 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Zfyve27Q3TXX3 Crlf2-201ENSMUST00000044579 1323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Zfyve27Q3TXX3 Fra10ac1-201ENSMUST00000067167 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Zfyve27Q3TXX3 Ctage5-218ENSMUST00000177162 2728 ntTSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
Zfyve27Q3TXX3 Arf6-201ENSMUST00000050063 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Zfyve27Q3TXX3 Nisch-201ENSMUST00000022469 5559 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
Zfyve27Q3TXX3 Ccdc9-201ENSMUST00000041010 2379 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Zfyve27Q3TXX3 Lrfn1-203ENSMUST00000189877 1852 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
Zfyve27Q3TXX3 Cbr3-201ENSMUST00000039620 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Zfyve27Q3TXX3 Ndufs3-201ENSMUST00000005647 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Zfyve27Q3TXX3 A930035D04Rik-201ENSMUST00000064013 543 ntBASIC23.33■■□□□ 1.33
Zfyve27Q3TXX3 Bloc1s2-201ENSMUST00000079033 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Zfyve27Q3TXX3 Pdcd4-201ENSMUST00000025931 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Zfyve27Q3TXX3 Fam174a-201ENSMUST00000059975 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
Zfyve27Q3TXX3 H1f0-201ENSMUST00000180086 2287 ntAPPRIS P1 BASIC23.33■■□□□ 1.32
Zfyve27Q3TXX3 Gm45364-201ENSMUST00000210883 159 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
Zfyve27Q3TXX3 Siva1-201ENSMUST00000021728 924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Zfyve27Q3TXX3 Ptpn4-203ENSMUST00000163435 2365 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Zfyve27Q3TXX3 Pou6f1-202ENSMUST00000073837 4953 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Zfyve27Q3TXX3 Ildr2-206ENSMUST00000194964 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Zfyve27Q3TXX3 Babam2-209ENSMUST00000201352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Zfyve27Q3TXX3 Ubtf-210ENSMUST00000174302 4692 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
Zfyve27Q3TXX3 Tmem98-201ENSMUST00000040865 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Zfyve27Q3TXX3 Phf14-203ENSMUST00000115511 3336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
Zfyve27Q3TXX3 Hmx3-201ENSMUST00000046093 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Zfyve27Q3TXX3 Hmox2-202ENSMUST00000118885 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Zfyve27Q3TXX3 Lmo4-201ENSMUST00000120539 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Zfyve27Q3TXX3 Gm27502-201ENSMUST00000183495 199 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
Zfyve27Q3TXX3 Tead1-203ENSMUST00000084705 2543 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Zfyve27Q3TXX3 Gm20512-201ENSMUST00000172483 618 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Zfyve27Q3TXX3 Pxmp2-201ENSMUST00000031472 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Zfyve27Q3TXX3 Ccnd3-205ENSMUST00000182209 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Zfyve27Q3TXX3 Ubp1-204ENSMUST00000214095 2320 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Zfyve27Q3TXX3 Zcchc11-201ENSMUST00000043368 6054 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
Zfyve27Q3TXX3 Kdf1-202ENSMUST00000105901 1699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Zfyve27Q3TXX3 Tmem55b-201ENSMUST00000049312 1594 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Zfyve27Q3TXX3 Kif1bp-206ENSMUST00000162525 2311 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
Zfyve27Q3TXX3 E2f5-201ENSMUST00000029069 1779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Zfyve27Q3TXX3 Nsmce4a-202ENSMUST00000160289 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Zfyve27Q3TXX3 Gm9888-201ENSMUST00000150678 965 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Zfyve27Q3TXX3 Slc22a17-208ENSMUST00000228119 2348 ntAPPRIS P1 BASIC23.27■■□□□ 1.32
Zfyve27Q3TXX3 Trappc6b-201ENSMUST00000021380 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Zfyve27Q3TXX3 Cutc-201ENSMUST00000026199 1298 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Zfyve27Q3TXX3 Arglu1-201ENSMUST00000048545 3197 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
Zfyve27Q3TXX3 Msl2-202ENSMUST00000189616 2612 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
Zfyve27Q3TXX3 Ei24-201ENSMUST00000115086 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Zfyve27Q3TXX3 Psmg1-201ENSMUST00000023630 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Zfyve27Q3TXX3 Nelfe-201ENSMUST00000097343 1607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 62.8 ms