Protein–RNA interactions for Protein: Q3TUA9

Pomk, Protein O-mannose kinase, mousemouse

Predictions only

Length 349 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PomkQ3TUA9 Socs1-201ENSMUST00000038099 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
PomkQ3TUA9 Pgp-201ENSMUST00000053024 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
PomkQ3TUA9 4930527J03Rik-201ENSMUST00000094270 543 ntBASIC25.03■■□□□ 1.6
PomkQ3TUA9 Rab7-204ENSMUST00000113598 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
PomkQ3TUA9 Lsm4-201ENSMUST00000034311 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
PomkQ3TUA9 Adgrb2-207ENSMUST00000120204 5170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
PomkQ3TUA9 Babam2-209ENSMUST00000201352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
PomkQ3TUA9 Cckbr-202ENSMUST00000181339 1326 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
PomkQ3TUA9 Basp1-201ENSMUST00000058845 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
PomkQ3TUA9 Barx1-201ENSMUST00000021813 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
PomkQ3TUA9 Fam196a-201ENSMUST00000171394 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
PomkQ3TUA9 Grb2-202ENSMUST00000106495 2041 ntTSL 5 BASIC24.99■■□□□ 1.59
PomkQ3TUA9 March5-202ENSMUST00000112391 1293 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
PomkQ3TUA9 Kansl2-202ENSMUST00000116400 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
PomkQ3TUA9 D030046N08Rik-201ENSMUST00000162318 1570 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
PomkQ3TUA9 D17Wsu92e-201ENSMUST00000075076 1470 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
PomkQ3TUA9 Ethe1-201ENSMUST00000077191 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
PomkQ3TUA9 Tlx2-201ENSMUST00000089641 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
PomkQ3TUA9 Mapkap1-202ENSMUST00000113124 1758 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
PomkQ3TUA9 Jdp2-201ENSMUST00000050687 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
PomkQ3TUA9 Acot5-201ENSMUST00000046422 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
PomkQ3TUA9 Eif5a-210ENSMUST00000108613 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
PomkQ3TUA9 Ap1ar-210ENSMUST00000200409 2580 ntTSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
PomkQ3TUA9 H3f3a-207ENSMUST00000162814 724 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC24.98■■□□□ 1.59
PomkQ3TUA9 Gm44428-201ENSMUST00000204474 874 ntBASIC24.98■■□□□ 1.59
PomkQ3TUA9 Ctxn1-201ENSMUST00000053252 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
PomkQ3TUA9 Lmo2-202ENSMUST00000111140 1706 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
PomkQ3TUA9 Nrg3-202ENSMUST00000168810 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
PomkQ3TUA9 Fn1-208ENSMUST00000186940 1350 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
PomkQ3TUA9 Odc1-201ENSMUST00000171737 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
PomkQ3TUA9 Dennd1b-209ENSMUST00000200533 1853 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
PomkQ3TUA9 Ccdc136-206ENSMUST00000145310 1703 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.59
PomkQ3TUA9 Nkain1-201ENSMUST00000105993 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
PomkQ3TUA9 Copz2-201ENSMUST00000018816 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
PomkQ3TUA9 Bag2-201ENSMUST00000044691 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
PomkQ3TUA9 Ube2k-206ENSMUST00000201984 1449 ntTSL 3 BASIC24.95■■□□□ 1.58
PomkQ3TUA9 Ech1-201ENSMUST00000066264 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
PomkQ3TUA9 Ccdc9-202ENSMUST00000118976 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
PomkQ3TUA9 Cyp2r1-202ENSMUST00000119712 917 ntTSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
PomkQ3TUA9 Gm16286-202ENSMUST00000125127 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
PomkQ3TUA9 E030037K01Rik-201ENSMUST00000180928 1756 ntBASIC24.93■■□□□ 1.58
PomkQ3TUA9 Msrb1-201ENSMUST00000101800 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
PomkQ3TUA9 Tfpt-204ENSMUST00000155592 1091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
PomkQ3TUA9 Cadm1-206ENSMUST00000143026 1643 ntTSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
PomkQ3TUA9 Ssbp1-203ENSMUST00000117411 933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
PomkQ3TUA9 Fam168b-204ENSMUST00000170092 941 ntTSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
PomkQ3TUA9 4930597O21Rik-201ENSMUST00000065878 984 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
PomkQ3TUA9 A830010M20Rik-207ENSMUST00000162298 1408 ntTSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
PomkQ3TUA9 Fads2-201ENSMUST00000025567 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
PomkQ3TUA9 Hoxb3-201ENSMUST00000055334 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
PomkQ3TUA9 Eid1-201ENSMUST00000164756 1691 ntAPPRIS P1 BASIC24.9■■□□□ 1.58
PomkQ3TUA9 Ppp1ca-201ENSMUST00000046094 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
PomkQ3TUA9 Hoxd8-201ENSMUST00000019749 2634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
PomkQ3TUA9 Zfp346-203ENSMUST00000159278 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.58
PomkQ3TUA9 Etf1-202ENSMUST00000180351 108 ntBASIC24.89■■□□□ 1.58
PomkQ3TUA9 Reps1-206ENSMUST00000154718 2402 ntTSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
PomkQ3TUA9 Rab2a-201ENSMUST00000060232 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
PomkQ3TUA9 Ankrd49-205ENSMUST00000216037 1037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
PomkQ3TUA9 Ncoa7-206ENSMUST00000215725 1445 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
PomkQ3TUA9 Sec61a2-201ENSMUST00000026926 756 ntTSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
PomkQ3TUA9 Ptms-201ENSMUST00000032216 1149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
PomkQ3TUA9 Acbd6-203ENSMUST00000097529 1255 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
PomkQ3TUA9 Gm26533-201ENSMUST00000180550 1790 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
PomkQ3TUA9 Hoxd11-202ENSMUST00000142312 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
PomkQ3TUA9 Arpc2-203ENSMUST00000113820 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
PomkQ3TUA9 Tmem196-202ENSMUST00000183694 845 ntTSL 3 BASIC24.85■■□□□ 1.57
PomkQ3TUA9 Dda1-209ENSMUST00000147642 1865 ntTSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
PomkQ3TUA9 Ipmk-203ENSMUST00000121446 1492 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
PomkQ3TUA9 Gm35161-201ENSMUST00000221765 941 ntTSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
PomkQ3TUA9 Vegfb-201ENSMUST00000025914 1281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
PomkQ3TUA9 Cyp26a1-201ENSMUST00000025946 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
PomkQ3TUA9 Hdac3-201ENSMUST00000043498 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
PomkQ3TUA9 Arhgap39-204ENSMUST00000176219 542 ntTSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
PomkQ3TUA9 Rps2-ps6-201ENSMUST00000095471 855 ntBASIC24.83■■□□□ 1.57
PomkQ3TUA9 Ldb1-206ENSMUST00000152946 2108 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
PomkQ3TUA9 Tmem55b-209ENSMUST00000162957 1465 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
PomkQ3TUA9 Svbp-201ENSMUST00000030395 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
PomkQ3TUA9 C1qtnf5-203ENSMUST00000114818 1337 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
PomkQ3TUA9 Fgf8-206ENSMUST00000111928 1056 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
PomkQ3TUA9 Ebag9-203ENSMUST00000227691 1945 ntAPPRIS P1 BASIC24.79■■□□□ 1.56
PomkQ3TUA9 Usp2-206ENSMUST00000176416 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
PomkQ3TUA9 Ntn5-203ENSMUST00000183120 1491 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
PomkQ3TUA9 Sac3d1-201ENSMUST00000113533 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
PomkQ3TUA9 1700065D16Rik-202ENSMUST00000188975 506 ntTSL 3 BASIC24.78■■□□□ 1.56
PomkQ3TUA9 Hebp2-202ENSMUST00000213153 968 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
PomkQ3TUA9 Ndfip1-201ENSMUST00000025293 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
PomkQ3TUA9 Bex1-201ENSMUST00000058125 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
PomkQ3TUA9 Mpnd-208ENSMUST00000159996 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
PomkQ3TUA9 Aspscr1-201ENSMUST00000026135 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
PomkQ3TUA9 Dusp15-201ENSMUST00000037715 715 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
PomkQ3TUA9 Nt5m-201ENSMUST00000102695 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
PomkQ3TUA9 B430218F22Rik-201ENSMUST00000181168 1495 ntAPPRIS P1 BASIC24.77■■□□□ 1.56
PomkQ3TUA9 Dpf1-204ENSMUST00000108231 2040 ntTSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
PomkQ3TUA9 Tor2a-208ENSMUST00000177382 396 ntTSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
PomkQ3TUA9 Fam96b-201ENSMUST00000093234 639 ntTSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
PomkQ3TUA9 Pgk1-201ENSMUST00000081593 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
PomkQ3TUA9 Prr7-201ENSMUST00000046533 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
PomkQ3TUA9 Galnt12-202ENSMUST00000107744 2077 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
PomkQ3TUA9 Bloc1s4-201ENSMUST00000071949 1273 ntAPPRIS P1 BASIC24.75■■□□□ 1.55
PomkQ3TUA9 Metrnl-201ENSMUST00000036742 1401 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 64.6 ms