Protein–RNA interactions for Protein: Q3TTY5

Krt2, Keratin, type II cytoskeletal 2 epidermal, mousemouse

Predictions only

Length 707 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Krt2Q3TTY5 Trim33-201ENSMUST00000029444 8875 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Krt2Q3TTY5 Trafd1-201ENSMUST00000042312 2503 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Krt2Q3TTY5 2310061I04Rik-202ENSMUST00000146451 2081 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Krt2Q3TTY5 2700081O15Rik-202ENSMUST00000159348 4989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
Krt2Q3TTY5 Ddx43-201ENSMUST00000113367 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.08
Krt2Q3TTY5 Ildr2-203ENSMUST00000192638 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
Krt2Q3TTY5 Endog-201ENSMUST00000015481 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Krt2Q3TTY5 Lsm4-204ENSMUST00000210071 575 ntTSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
Krt2Q3TTY5 Kcnc3-206ENSMUST00000208651 2728 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
Krt2Q3TTY5 Gmeb1-202ENSMUST00000105964 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Krt2Q3TTY5 Dbndd2-202ENSMUST00000069385 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Krt2Q3TTY5 Ppp4c-211ENSMUST00000206570 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Krt2Q3TTY5 Gm14121-201ENSMUST00000121441 1380 ntBASIC21.81■■□□□ 1.08
Krt2Q3TTY5 Micu2-201ENSMUST00000022543 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Krt2Q3TTY5 Zfp768-202ENSMUST00000205266 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
Krt2Q3TTY5 Eml4-201ENSMUST00000049503 5109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Krt2Q3TTY5 Hoxb9-201ENSMUST00000000010 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Krt2Q3TTY5 Nxph3-201ENSMUST00000058866 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Krt2Q3TTY5 Ppp1cc-202ENSMUST00000102528 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Krt2Q3TTY5 Nrsn1-201ENSMUST00000057866 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Krt2Q3TTY5 Armc10-201ENSMUST00000072896 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Krt2Q3TTY5 Srcap-210ENSMUST00000188124 2048 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Krt2Q3TTY5 Scx-201ENSMUST00000043089 1136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Krt2Q3TTY5 Cetn4-202ENSMUST00000075537 762 ntTSL 3 BASIC21.79■■□□□ 1.08
Krt2Q3TTY5 Arl5a-201ENSMUST00000036541 5239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Krt2Q3TTY5 Glrx3-201ENSMUST00000064404 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Krt2Q3TTY5 Yy1-201ENSMUST00000021692 6178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Krt2Q3TTY5 Phf23-201ENSMUST00000018716 2006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Krt2Q3TTY5 Traf3ip1-203ENSMUST00000189341 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
Krt2Q3TTY5 Rnf19b-206ENSMUST00000168461 2532 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
Krt2Q3TTY5 Strn3-202ENSMUST00000169503 2791 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Krt2Q3TTY5 2410022M11Rik-201ENSMUST00000186474 1911 ntBASIC21.78■■□□□ 1.08
Krt2Q3TTY5 3110021N24Rik-201ENSMUST00000178992 1812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
Krt2Q3TTY5 Frmd5-201ENSMUST00000110592 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
Krt2Q3TTY5 Ptx3-201ENSMUST00000029421 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Krt2Q3TTY5 Gipc1-201ENSMUST00000019577 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Krt2Q3TTY5 Fbxw4-201ENSMUST00000046869 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Krt2Q3TTY5 Gemin7-202ENSMUST00000117222 1023 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
Krt2Q3TTY5 Pm20d2-202ENSMUST00000119167 1339 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.07
Krt2Q3TTY5 Abhd17b-201ENSMUST00000052556 2475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.07
Krt2Q3TTY5 Vkorc1l1-201ENSMUST00000051758 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Krt2Q3TTY5 Upf3a-201ENSMUST00000043767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Krt2Q3TTY5 Kcnc3-201ENSMUST00000107906 5062 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Krt2Q3TTY5 Slc1a5-201ENSMUST00000108496 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Krt2Q3TTY5 Dcbld2-201ENSMUST00000046663 6561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Krt2Q3TTY5 Gm17641-201ENSMUST00000166328 2350 ntBASIC21.75■■□□□ 1.07
Krt2Q3TTY5 Gng12-204ENSMUST00000114225 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Krt2Q3TTY5 Map2k7-207ENSMUST00000110999 1578 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Krt2Q3TTY5 Mthfd2l-201ENSMUST00000071652 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
Krt2Q3TTY5 Npas1-201ENSMUST00000002053 2091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
Krt2Q3TTY5 Pgbd5-204ENSMUST00000140012 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
Krt2Q3TTY5 4932443I19Rik-201ENSMUST00000166277 799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Krt2Q3TTY5 2810459M11Rik-201ENSMUST00000027429 1225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Krt2Q3TTY5 Nkain2-201ENSMUST00000092602 558 ntBASIC21.73■■□□□ 1.07
Krt2Q3TTY5 Spsb3-202ENSMUST00000068508 2004 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Krt2Q3TTY5 Stambp-207ENSMUST00000206592 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Krt2Q3TTY5 Gtpbp2-201ENSMUST00000024748 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Krt2Q3TTY5 Bod1-202ENSMUST00000109415 799 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
Krt2Q3TTY5 AC163623.1-201ENSMUST00000213738 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.72■■□□□ 1.07
Krt2Q3TTY5 Dnajb2-202ENSMUST00000082158 1253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
Krt2Q3TTY5 Abhd17c-201ENSMUST00000117085 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Krt2Q3TTY5 Trim3-202ENSMUST00000106789 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Krt2Q3TTY5 Jmjd6-201ENSMUST00000047616 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Krt2Q3TTY5 Hdac3-201ENSMUST00000043498 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Krt2Q3TTY5 Tcf4-246ENSMUST00000202116 2986 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Krt2Q3TTY5 Arl8a-201ENSMUST00000027684 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Krt2Q3TTY5 Gm12523-201ENSMUST00000148844 599 ntTSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
Krt2Q3TTY5 Rpl19-ps4-201ENSMUST00000167150 625 ntBASIC21.71■■□□□ 1.07
Krt2Q3TTY5 AC150314.2-201ENSMUST00000214135 834 ntTSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
Krt2Q3TTY5 Phf23-202ENSMUST00000101526 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Krt2Q3TTY5 Rnf39-201ENSMUST00000040498 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Krt2Q3TTY5 Stat5b-201ENSMUST00000004143 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Krt2Q3TTY5 Vmac-201ENSMUST00000067931 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Krt2Q3TTY5 Snx3-203ENSMUST00000105500 753 ntTSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
Krt2Q3TTY5 Ankrd60-202ENSMUST00000119453 1084 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
Krt2Q3TTY5 Uba52-207ENSMUST00000140679 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
Krt2Q3TTY5 Insc-208ENSMUST00000169913 2321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
Krt2Q3TTY5 Tmem200b-201ENSMUST00000094666 1370 ntAPPRIS P1 BASIC21.7■■□□□ 1.06
Krt2Q3TTY5 Capza2-201ENSMUST00000015877 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Krt2Q3TTY5 Tmem70-203ENSMUST00000177501 1636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Krt2Q3TTY5 Tmem9b-201ENSMUST00000033333 1703 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Krt2Q3TTY5 Dvl1-208ENSMUST00000168552 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Krt2Q3TTY5 2010300C02Rik-203ENSMUST00000162875 4634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Krt2Q3TTY5 Dpy19l1-206ENSMUST00000170356 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
Krt2Q3TTY5 Gm4419-202ENSMUST00000226239 1431 ntBASIC21.68■■□□□ 1.06
Krt2Q3TTY5 Taf4-204ENSMUST00000227325 4380 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
Krt2Q3TTY5 Cbln2-203ENSMUST00000122464 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Krt2Q3TTY5 Sorcs2-202ENSMUST00000070720 2089 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Krt2Q3TTY5 Rfxap-201ENSMUST00000044373 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Krt2Q3TTY5 Arhgef25-205ENSMUST00000218654 2475 ntTSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
Krt2Q3TTY5 Spats2-201ENSMUST00000063517 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Krt2Q3TTY5 Nsun2-208ENSMUST00000176485 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
Krt2Q3TTY5 Gm31266-201ENSMUST00000192060 656 ntTSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
Krt2Q3TTY5 Syde2-201ENSMUST00000039517 5495 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Krt2Q3TTY5 Ctage5-203ENSMUST00000170992 2785 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Krt2Q3TTY5 St6galnac6-205ENSMUST00000113290 2402 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
Krt2Q3TTY5 Arpc2-203ENSMUST00000113820 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Krt2Q3TTY5 Eif5a-201ENSMUST00000043419 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Krt2Q3TTY5 Porcn-201ENSMUST00000077595 1872 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Krt2Q3TTY5 Porcn-204ENSMUST00000089403 1854 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.6 ms