Protein–RNA interactions for Protein: Q3TNA1

Xylb, Xylulose kinase, mousemouse

Predictions only

Length 551 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
XylbQ3TNA1 Pde6d-201ENSMUST00000027444 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
XylbQ3TNA1 Sox1-201ENSMUST00000180353 4832 ntAPPRIS P1 BASIC20■□□□□ 0.79
XylbQ3TNA1 Gm17641-201ENSMUST00000166328 2350 ntBASIC20■□□□□ 0.79
XylbQ3TNA1 C2cd4b-201ENSMUST00000171652 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
XylbQ3TNA1 Zfyve21-201ENSMUST00000021714 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
XylbQ3TNA1 Upf3a-201ENSMUST00000043767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
XylbQ3TNA1 Sh3gl3-201ENSMUST00000032874 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
XylbQ3TNA1 Ccdc9-201ENSMUST00000041010 2379 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
XylbQ3TNA1 Slc16a11-211ENSMUST00000171032 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
XylbQ3TNA1 Ptpn4-203ENSMUST00000163435 2365 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
XylbQ3TNA1 Wnt2-201ENSMUST00000010941 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
XylbQ3TNA1 Ran-202ENSMUST00000111343 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
XylbQ3TNA1 Tceal3-202ENSMUST00000113100 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
XylbQ3TNA1 Habp4-201ENSMUST00000021929 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
XylbQ3TNA1 Foxa2-202ENSMUST00000109964 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
XylbQ3TNA1 Npas1-201ENSMUST00000002053 2091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
XylbQ3TNA1 Kat2b-201ENSMUST00000000724 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
XylbQ3TNA1 Nek6-202ENSMUST00000112895 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
XylbQ3TNA1 2610307P16Rik-205ENSMUST00000148885 1870 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
XylbQ3TNA1 1700084E18Rik-202ENSMUST00000205624 729 ntBASIC19.97■□□□□ 0.79
XylbQ3TNA1 Gm7432-201ENSMUST00000210343 879 ntBASIC19.97■□□□□ 0.79
XylbQ3TNA1 A330041J22Rik-201ENSMUST00000150367 1825 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
XylbQ3TNA1 Acvr2b-201ENSMUST00000035093 1729 ntTSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
XylbQ3TNA1 Slc44a1-203ENSMUST00000107646 1974 ntTSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
XylbQ3TNA1 Map2k7-201ENSMUST00000003027 1626 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
XylbQ3TNA1 Ctnnd2-201ENSMUST00000081728 5944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
XylbQ3TNA1 Rundc3b-202ENSMUST00000115378 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
XylbQ3TNA1 Ctdspl-201ENSMUST00000073109 4589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
XylbQ3TNA1 Scn1b-201ENSMUST00000098548 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
XylbQ3TNA1 Gm13889-202ENSMUST00000148314 1240 ntAPPRIS P1 BASIC19.95■□□□□ 0.78
XylbQ3TNA1 Vmac-201ENSMUST00000067931 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
XylbQ3TNA1 E130309D02Rik-201ENSMUST00000046418 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
XylbQ3TNA1 Rnf19b-206ENSMUST00000168461 2532 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
XylbQ3TNA1 Dvl1-208ENSMUST00000168552 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
XylbQ3TNA1 Bag2-201ENSMUST00000044691 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
XylbQ3TNA1 Gm28513-201ENSMUST00000191474 613 ntTSL 3 BASIC19.94■□□□□ 0.78
XylbQ3TNA1 Rexo2-210ENSMUST00000217037 609 ntTSL 3 BASIC19.94■□□□□ 0.78
XylbQ3TNA1 Plpp2-204ENSMUST00000166804 1566 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
XylbQ3TNA1 Rhou-201ENSMUST00000045487 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
XylbQ3TNA1 Wnt5b-203ENSMUST00000119369 2339 ntTSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
XylbQ3TNA1 Coro1b-201ENSMUST00000008893 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
XylbQ3TNA1 Dtnbp1-202ENSMUST00000110128 1305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
XylbQ3TNA1 Crim1-201ENSMUST00000112498 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
XylbQ3TNA1 Gm42699-201ENSMUST00000198104 1657 ntBASIC19.93■□□□□ 0.78
XylbQ3TNA1 Sh3d21-202ENSMUST00000097891 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
XylbQ3TNA1 Kctd2-201ENSMUST00000103035 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
XylbQ3TNA1 Rnf39-201ENSMUST00000040498 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
XylbQ3TNA1 Hrk-201ENSMUST00000054836 5382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
XylbQ3TNA1 Hspb1-202ENSMUST00000111155 930 ntTSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
XylbQ3TNA1 Efhd2-201ENSMUST00000036854 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
XylbQ3TNA1 Ube2g2-204ENSMUST00000174510 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
XylbQ3TNA1 Cadm1-202ENSMUST00000085909 2126 ntTSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
XylbQ3TNA1 Fance-203ENSMUST00000114803 1980 ntTSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
XylbQ3TNA1 Nnat-208ENSMUST00000173595 927 ntTSL 2 BASIC19.9■□□□□ 0.78
XylbQ3TNA1 Sos2-201ENSMUST00000035773 5607 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.9■□□□□ 0.78
XylbQ3TNA1 Cnep1r1-201ENSMUST00000095214 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
XylbQ3TNA1 Gm26533-201ENSMUST00000180550 1790 ntTSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
XylbQ3TNA1 Azin2-202ENSMUST00000106068 2049 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.9■□□□□ 0.78
XylbQ3TNA1 Tmem143-201ENSMUST00000069772 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
XylbQ3TNA1 P3h3-201ENSMUST00000023958 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.78
XylbQ3TNA1 Gm11599-201ENSMUST00000118720 878 ntBASIC19.89■□□□□ 0.77
XylbQ3TNA1 Gm26917-201ENSMUST00000182520 869 ntTSL 5 BASIC19.89■□□□□ 0.77
XylbQ3TNA1 Gm40983-202ENSMUST00000222598 1198 ntTSL 5 BASIC19.89■□□□□ 0.77
XylbQ3TNA1 Ybx3-202ENSMUST00000087865 1684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
XylbQ3TNA1 Gm13889-201ENSMUST00000099689 1386 ntBASIC19.89■□□□□ 0.77
XylbQ3TNA1 Foxd2-201ENSMUST00000068654 2592 ntAPPRIS P1 BASIC19.89■□□□□ 0.77
XylbQ3TNA1 Camsap1-212ENSMUST00000183461 5090 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.89■□□□□ 0.77
XylbQ3TNA1 Plvap-201ENSMUST00000048452 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
XylbQ3TNA1 A930035D04Rik-201ENSMUST00000064013 543 ntBASIC19.88■□□□□ 0.77
XylbQ3TNA1 Gm4799-201ENSMUST00000095396 657 ntBASIC19.88■□□□□ 0.77
XylbQ3TNA1 Vps37b-201ENSMUST00000040967 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
XylbQ3TNA1 Shb-201ENSMUST00000061986 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
XylbQ3TNA1 Msl2-202ENSMUST00000189616 2612 ntTSL 5 BASIC19.88■□□□□ 0.77
XylbQ3TNA1 Pdcd4-201ENSMUST00000025931 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
XylbQ3TNA1 H1f0-201ENSMUST00000180086 2287 ntAPPRIS P1 BASIC19.87■□□□□ 0.77
XylbQ3TNA1 6330420H09Rik-201ENSMUST00000211371 1316 ntTSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
XylbQ3TNA1 Gorasp2-205ENSMUST00000133432 1941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
XylbQ3TNA1 Fus-204ENSMUST00000121616 1102 ntTSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
XylbQ3TNA1 Hoxb3-202ENSMUST00000093944 3190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.87■□□□□ 0.77
XylbQ3TNA1 Ubp1-204ENSMUST00000214095 2320 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
XylbQ3TNA1 Il17rd-202ENSMUST00000223942 2186 ntBASIC19.85■□□□□ 0.77
XylbQ3TNA1 Neurl4-201ENSMUST00000061837 5188 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.85■□□□□ 0.77
XylbQ3TNA1 Hgh1-201ENSMUST00000023213 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
XylbQ3TNA1 Ppp4c-201ENSMUST00000032936 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
XylbQ3TNA1 St6galnac6-203ENSMUST00000095044 2394 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
XylbQ3TNA1 Tceal3-201ENSMUST00000060904 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
XylbQ3TNA1 Tmem9b-201ENSMUST00000033333 1703 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
XylbQ3TNA1 Taf4-201ENSMUST00000041618 4416 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
XylbQ3TNA1 D130020L05Rik-201ENSMUST00000180800 2431 ntTSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
XylbQ3TNA1 Kdf1-202ENSMUST00000105901 1699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
XylbQ3TNA1 Ltk-201ENSMUST00000028759 3080 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
XylbQ3TNA1 Pdgfb-201ENSMUST00000000500 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
XylbQ3TNA1 Hdac1-201ENSMUST00000102597 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
XylbQ3TNA1 Arglu1-201ENSMUST00000048545 3197 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.82■□□□□ 0.76
XylbQ3TNA1 Igfbp3-201ENSMUST00000020702 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
XylbQ3TNA1 Asf1a-201ENSMUST00000020004 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
XylbQ3TNA1 Gm5784-202ENSMUST00000220896 2016 ntTSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
XylbQ3TNA1 Rab43-202ENSMUST00000032135 1262 ntTSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
XylbQ3TNA1 Kif1bp-206ENSMUST00000162525 2311 ntTSL 5 BASIC19.82■□□□□ 0.76
XylbQ3TNA1 Ube2e2-205ENSMUST00000150727 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 205.8 ms