Protein–RNA interactions for Protein: Q3TLP5

Echdc2, Enoyl-CoA hydratase domain-containing protein 2, mitochondrial, mousemouse

Predictions only

Length 296 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Echdc2Q3TLP5 Cadm1-206ENSMUST00000143026 1643 ntTSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
Echdc2Q3TLP5 Psip1-203ENSMUST00000107215 1898 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Echdc2Q3TLP5 Gm4419-202ENSMUST00000226239 1431 ntBASIC24.75■■□□□ 1.55
Echdc2Q3TLP5 Vdac1-202ENSMUST00000102758 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Echdc2Q3TLP5 Gm44428-201ENSMUST00000204474 874 ntBASIC24.74■■□□□ 1.55
Echdc2Q3TLP5 Lin7b-201ENSMUST00000003971 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Echdc2Q3TLP5 Hecw2-202ENSMUST00000097741 1132 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Echdc2Q3TLP5 Acvr2b-201ENSMUST00000035093 1729 ntTSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
Echdc2Q3TLP5 Tirap-205ENSMUST00000176685 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Echdc2Q3TLP5 Pdcd4-203ENSMUST00000165617 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Echdc2Q3TLP5 Ppcs-201ENSMUST00000030385 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Echdc2Q3TLP5 Dleu7-201ENSMUST00000063169 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Echdc2Q3TLP5 Kcnmb4os2-203ENSMUST00000127070 1048 ntTSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
Echdc2Q3TLP5 Galr3-201ENSMUST00000058004 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Echdc2Q3TLP5 Zfp131-206ENSMUST00000223813 2561 ntAPPRIS P3 BASIC24.73■■□□□ 1.55
Echdc2Q3TLP5 Ints11-202ENSMUST00000120794 1884 ntTSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
Echdc2Q3TLP5 Ccdc9-202ENSMUST00000118976 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Echdc2Q3TLP5 Lsm4-205ENSMUST00000210987 636 ntTSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
Echdc2Q3TLP5 Pmvk-201ENSMUST00000029564 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Echdc2Q3TLP5 H1fx-201ENSMUST00000056403 1217 ntAPPRIS P1 BASIC24.72■■□□□ 1.55
Echdc2Q3TLP5 Fam92a-208ENSMUST00000177837 1325 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
Echdc2Q3TLP5 Nudt3-203ENSMUST00000114886 996 ntTSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
Echdc2Q3TLP5 Gm5921-201ENSMUST00000075898 882 ntBASIC24.7■■□□□ 1.54
Echdc2Q3TLP5 Gm21989-201ENSMUST00000174530 1609 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Echdc2Q3TLP5 Htatsf1-202ENSMUST00000114751 1128 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Echdc2Q3TLP5 Cited4-201ENSMUST00000094814 1249 ntAPPRIS P1 BASIC24.69■■□□□ 1.54
Echdc2Q3TLP5 H2afy-202ENSMUST00000045788 1933 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Echdc2Q3TLP5 Thra-202ENSMUST00000103139 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Echdc2Q3TLP5 Kctd2-201ENSMUST00000103035 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Echdc2Q3TLP5 Tm2d2-201ENSMUST00000033961 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Echdc2Q3TLP5 Oaz2-206ENSMUST00000153700 1843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
Echdc2Q3TLP5 Neurl1b-202ENSMUST00000182897 1231 ntTSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
Echdc2Q3TLP5 St7-208ENSMUST00000115419 2194 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
Echdc2Q3TLP5 D17Wsu92e-201ENSMUST00000075076 1470 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
Echdc2Q3TLP5 Pde8b-204ENSMUST00000159608 2370 ntTSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
Echdc2Q3TLP5 Hnrnpul1-202ENSMUST00000108401 1240 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Echdc2Q3TLP5 Usf1-210ENSMUST00000167546 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
Echdc2Q3TLP5 Klhl25-205ENSMUST00000206019 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Echdc2Q3TLP5 Gfra4-206ENSMUST00000110240 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Echdc2Q3TLP5 Gm5812-201ENSMUST00000061073 957 ntBASIC24.62■■□□□ 1.53
Echdc2Q3TLP5 Mapkap1-202ENSMUST00000113124 1758 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
Echdc2Q3TLP5 Cyp2r1-202ENSMUST00000119712 917 ntTSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
Echdc2Q3TLP5 Fam89b-203ENSMUST00000161368 1160 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Echdc2Q3TLP5 Gxylt1-202ENSMUST00000057896 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
Echdc2Q3TLP5 H2-Q5-202ENSMUST00000172979 998 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
Echdc2Q3TLP5 Ipmk-203ENSMUST00000121446 1492 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
Echdc2Q3TLP5 Uncx-201ENSMUST00000172997 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Echdc2Q3TLP5 Faim-202ENSMUST00000112911 803 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
Echdc2Q3TLP5 Sec24d-208ENSMUST00000200333 307 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Echdc2Q3TLP5 Emid1-201ENSMUST00000062821 1947 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Echdc2Q3TLP5 Zc3h6-201ENSMUST00000110319 1484 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
Echdc2Q3TLP5 Becn1-216ENSMUST00000170502 725 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Echdc2Q3TLP5 Fam50b-202ENSMUST00000221037 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Echdc2Q3TLP5 Hopx-203ENSMUST00000120827 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Echdc2Q3TLP5 Tmem127-202ENSMUST00000174288 842 ntTSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
Echdc2Q3TLP5 Tmem42-201ENSMUST00000084733 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Echdc2Q3TLP5 Hist2h3c1-201ENSMUST00000176059 1820 ntAPPRIS P1 BASIC24.56■■□□□ 1.52
Echdc2Q3TLP5 Hist2h3c1-202ENSMUST00000177796 1825 ntBASIC24.56■■□□□ 1.52
Echdc2Q3TLP5 Kcnk2-205ENSMUST00000192723 1642 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Echdc2Q3TLP5 AC161180.1-201ENSMUST00000223439 933 ntAPPRIS P1 BASIC24.55■■□□□ 1.52
Echdc2Q3TLP5 Usp2-206ENSMUST00000176416 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Echdc2Q3TLP5 Pdpk1-203ENSMUST00000115407 1730 ntTSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
Echdc2Q3TLP5 Tm6sf1-201ENSMUST00000041890 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Echdc2Q3TLP5 Pxmp2-201ENSMUST00000031472 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Echdc2Q3TLP5 Bag1-203ENSMUST00000191273 1348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Echdc2Q3TLP5 Hoxd9-201ENSMUST00000059272 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Echdc2Q3TLP5 Preb-209ENSMUST00000202567 1869 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Echdc2Q3TLP5 Foxe3-201ENSMUST00000050940 867 ntAPPRIS P1 BASIC24.52■■□□□ 1.52
Echdc2Q3TLP5 Fezf2-202ENSMUST00000224023 1917 ntBASIC24.52■■□□□ 1.52
Echdc2Q3TLP5 Isoc1-201ENSMUST00000025503 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Echdc2Q3TLP5 Tmem70-203ENSMUST00000177501 1636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Echdc2Q3TLP5 Glrx3-201ENSMUST00000064404 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Echdc2Q3TLP5 Gm2415-202ENSMUST00000134688 401 ntTSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
Echdc2Q3TLP5 Tmpo-203ENSMUST00000092219 1854 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Echdc2Q3TLP5 Nucks1-203ENSMUST00000189946 2375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Echdc2Q3TLP5 Rbm45-201ENSMUST00000046389 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Echdc2Q3TLP5 Snx21-203ENSMUST00000152471 1243 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Echdc2Q3TLP5 Gm29735-201ENSMUST00000209599 660 ntAPPRIS P1 BASIC24.5■■□□□ 1.51
Echdc2Q3TLP5 Lsm4-201ENSMUST00000034311 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Echdc2Q3TLP5 Msto1-202ENSMUST00000126245 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Echdc2Q3TLP5 Ubp1-203ENSMUST00000116492 2111 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Echdc2Q3TLP5 Ntn5-203ENSMUST00000183120 1491 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Echdc2Q3TLP5 Srcap-211ENSMUST00000189136 1960 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Echdc2Q3TLP5 Pcsk1n-201ENSMUST00000041096 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Echdc2Q3TLP5 Gm20208-202ENSMUST00000219905 1528 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Echdc2Q3TLP5 Dexi-201ENSMUST00000038281 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Echdc2Q3TLP5 Dhrs11-201ENSMUST00000047560 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Echdc2Q3TLP5 2410017I17Rik-202ENSMUST00000090537 2053 ntTSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
Echdc2Q3TLP5 Gm12905-201ENSMUST00000153814 658 ntTSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
Echdc2Q3TLP5 Tmem11-201ENSMUST00000062677 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Echdc2Q3TLP5 Eif5a-208ENSMUST00000108611 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Echdc2Q3TLP5 B230377A18Rik-202ENSMUST00000192921 1364 ntBASIC24.46■■□□□ 1.51
Echdc2Q3TLP5 Gm43592-201ENSMUST00000196922 1165 ntBASIC24.46■■□□□ 1.51
Echdc2Q3TLP5 Gm7544-201ENSMUST00000222426 828 ntAPPRIS P1 BASIC24.46■■□□□ 1.51
Echdc2Q3TLP5 AC166358.2-201ENSMUST00000223403 734 ntTSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
Echdc2Q3TLP5 AC117769.4-201ENSMUST00000225679 685 ntBASIC24.46■■□□□ 1.51
Echdc2Q3TLP5 Coprs-201ENSMUST00000033839 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Echdc2Q3TLP5 Neurog2-201ENSMUST00000029587 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Echdc2Q3TLP5 Scn1b-201ENSMUST00000098548 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Echdc2Q3TLP5 Csnk1g2-201ENSMUST00000079773 2348 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 63 ms