Protein–RNA interactions for Protein: Q3TGW2

Eepd1, Endonuclease/exonuclease/phosphatase family domain-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 569 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Eepd1Q3TGW2 Ethe1-201ENSMUST00000077191 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
Eepd1Q3TGW2 Qdpr-201ENSMUST00000015950 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
Eepd1Q3TGW2 Sike1-202ENSMUST00000119450 774 ntTSL 3 BASIC25.82■■□□□ 1.72
Eepd1Q3TGW2 Krtap28-10-201ENSMUST00000188323 957 ntAPPRIS P1 BASIC25.82■■□□□ 1.72
Eepd1Q3TGW2 Fads2-201ENSMUST00000025567 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
Eepd1Q3TGW2 Pcsk1n-201ENSMUST00000041096 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
Eepd1Q3TGW2 A830092H15Rik-201ENSMUST00000099182 1229 ntBASIC25.81■■□□□ 1.72
Eepd1Q3TGW2 Arhgap22-201ENSMUST00000111955 2148 ntTSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
Eepd1Q3TGW2 Hnrnpk-210ENSMUST00000176558 1053 ntTSL 2 BASIC25.8■■□□□ 1.72
Eepd1Q3TGW2 Ankrd28-201ENSMUST00000014640 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
Eepd1Q3TGW2 Acvr2b-201ENSMUST00000035093 1729 ntTSL 5 BASIC25.8■■□□□ 1.72
Eepd1Q3TGW2 Rab4a-202ENSMUST00000118535 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
Eepd1Q3TGW2 Ube2k-203ENSMUST00000201266 1449 ntTSL 5 BASIC25.8■■□□□ 1.72
Eepd1Q3TGW2 Ildr2-202ENSMUST00000192426 1238 ntTSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
Eepd1Q3TGW2 A030014E15Rik-201ENSMUST00000223400 796 ntAPPRIS P1 BASIC25.79■■□□□ 1.72
Eepd1Q3TGW2 Rpl35-201ENSMUST00000080861 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
Eepd1Q3TGW2 Msto1-202ENSMUST00000126245 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
Eepd1Q3TGW2 Gm5067-201ENSMUST00000170449 1009 ntBASIC25.78■■□□□ 1.72
Eepd1Q3TGW2 Gm20109-201ENSMUST00000180802 671 ntTSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
Eepd1Q3TGW2 Btf3l4-203ENSMUST00000102741 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
Eepd1Q3TGW2 Emc8-208ENSMUST00000181950 747 ntTSL 2 BASIC25.77■■□□□ 1.72
Eepd1Q3TGW2 Hecw2-202ENSMUST00000097741 1132 ntTSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
Eepd1Q3TGW2 Srsf2-206ENSMUST00000190993 1326 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.77■■□□□ 1.72
Eepd1Q3TGW2 Etfa-201ENSMUST00000034866 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
Eepd1Q3TGW2 H2afy-202ENSMUST00000045788 1933 ntTSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.72
Eepd1Q3TGW2 Srcap-211ENSMUST00000189136 1960 ntTSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
Eepd1Q3TGW2 Ube2j2-202ENSMUST00000103175 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
Eepd1Q3TGW2 Rab40c-209ENSMUST00000179998 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.74■■□□□ 1.71
Eepd1Q3TGW2 Fam149b-203ENSMUST00000090499 2370 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
Eepd1Q3TGW2 Ppp1r35-201ENSMUST00000031739 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
Eepd1Q3TGW2 Gm21989-201ENSMUST00000174530 1609 ntTSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
Eepd1Q3TGW2 Sft2d1-210ENSMUST00000154553 1049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
Eepd1Q3TGW2 Gm7276-201ENSMUST00000097520 1252 ntAPPRIS P1 BASIC25.72■■□□□ 1.71
Eepd1Q3TGW2 Mnx1-201ENSMUST00000001608 2018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.71■■□□□ 1.71
Eepd1Q3TGW2 Reep6-202ENSMUST00000105354 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
Eepd1Q3TGW2 Reep6-205ENSMUST00000105358 2208 ntTSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
Eepd1Q3TGW2 Gm10420-201ENSMUST00000121713 882 ntBASIC25.71■■□□□ 1.71
Eepd1Q3TGW2 Kctd2-201ENSMUST00000103035 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
Eepd1Q3TGW2 Gm4419-202ENSMUST00000226239 1431 ntBASIC25.71■■□□□ 1.71
Eepd1Q3TGW2 Ppp1ca-201ENSMUST00000046094 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.71
Eepd1Q3TGW2 Oaz2-206ENSMUST00000153700 1843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.7■■□□□ 1.71
Eepd1Q3TGW2 Hpf1-204ENSMUST00000146863 531 ntTSL 2 BASIC25.7■■□□□ 1.7
Eepd1Q3TGW2 Shox2-204ENSMUST00000162439 1081 ntTSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
Eepd1Q3TGW2 Pgls-201ENSMUST00000034264 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
Eepd1Q3TGW2 Rcan1-202ENSMUST00000060005 2324 ntTSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
Eepd1Q3TGW2 Terf2-203ENSMUST00000116425 2471 ntTSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
Eepd1Q3TGW2 Gm20458-201ENSMUST00000164863 1369 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.69■■□□□ 1.7
Eepd1Q3TGW2 Rbm45-201ENSMUST00000046389 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
Eepd1Q3TGW2 Upf3a-201ENSMUST00000043767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
Eepd1Q3TGW2 Ppp1r14c-202ENSMUST00000217573 2013 ntTSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
Eepd1Q3TGW2 Frat2-201ENSMUST00000059231 2161 ntAPPRIS P1 BASIC25.68■■□□□ 1.7
Eepd1Q3TGW2 Cadm1-206ENSMUST00000143026 1643 ntTSL 5 BASIC25.67■■□□□ 1.7
Eepd1Q3TGW2 5031425E22Rik-201ENSMUST00000101522 2110 ntBASIC25.66■■□□□ 1.7
Eepd1Q3TGW2 Vmac-201ENSMUST00000067931 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
Eepd1Q3TGW2 Paqr3-202ENSMUST00000112968 1875 ntTSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
Eepd1Q3TGW2 Mast2-203ENSMUST00000106485 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
Eepd1Q3TGW2 Mast2-204ENSMUST00000106486 5723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
Eepd1Q3TGW2 Irf2bp2-201ENSMUST00000054960 5080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.64■■□□□ 1.7
Eepd1Q3TGW2 Hoxd9-201ENSMUST00000059272 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
Eepd1Q3TGW2 Aldoa-214ENSMUST00000207534 741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.63■■□□□ 1.69
Eepd1Q3TGW2 Plekha3-201ENSMUST00000111920 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
Eepd1Q3TGW2 Efna2-201ENSMUST00000003154 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
Eepd1Q3TGW2 AC122428.3-201ENSMUST00000215551 2290 ntBASIC25.62■■□□□ 1.69
Eepd1Q3TGW2 Gng12-204ENSMUST00000114225 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
Eepd1Q3TGW2 Nudt6-204ENSMUST00000108118 935 ntTSL 5 BASIC25.61■■□□□ 1.69
Eepd1Q3TGW2 Gm44428-201ENSMUST00000204474 874 ntBASIC25.61■■□□□ 1.69
Eepd1Q3TGW2 Nudt6-201ENSMUST00000052645 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
Eepd1Q3TGW2 Nudt6-202ENSMUST00000099130 1070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
Eepd1Q3TGW2 Tmpo-203ENSMUST00000092219 1854 ntTSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
Eepd1Q3TGW2 Dleu7-201ENSMUST00000063169 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
Eepd1Q3TGW2 Cadm1-209ENSMUST00000152459 1784 ntTSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
Eepd1Q3TGW2 Nudt3-203ENSMUST00000114886 996 ntTSL 2 BASIC25.6■■□□□ 1.69
Eepd1Q3TGW2 Clptm1l-201ENSMUST00000022102 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
Eepd1Q3TGW2 Mef2a-201ENSMUST00000032776 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
Eepd1Q3TGW2 Usf1-210ENSMUST00000167546 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.6■■□□□ 1.69
Eepd1Q3TGW2 Hist2h3c1-201ENSMUST00000176059 1820 ntAPPRIS P1 BASIC25.59■■□□□ 1.69
Eepd1Q3TGW2 Hist2h3c1-202ENSMUST00000177796 1825 ntBASIC25.59■■□□□ 1.69
Eepd1Q3TGW2 H1fx-201ENSMUST00000056403 1217 ntAPPRIS P1 BASIC25.59■■□□□ 1.69
Eepd1Q3TGW2 Pdpk1-203ENSMUST00000115407 1730 ntTSL 5 BASIC25.59■■□□□ 1.69
Eepd1Q3TGW2 Gnaq-201ENSMUST00000025541 5644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
Eepd1Q3TGW2 Glrx3-201ENSMUST00000064404 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
Eepd1Q3TGW2 Cbln1-201ENSMUST00000034076 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.68
Eepd1Q3TGW2 Gm20208-202ENSMUST00000219905 1528 ntTSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.68
Eepd1Q3TGW2 D17Wsu92e-201ENSMUST00000075076 1470 ntTSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
Eepd1Q3TGW2 Npas1-201ENSMUST00000002053 2091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.57■■□□□ 1.68
Eepd1Q3TGW2 Zfp422-201ENSMUST00000057540 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
Eepd1Q3TGW2 Cited1-202ENSMUST00000101336 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
Eepd1Q3TGW2 Htatsf1-202ENSMUST00000114751 1128 ntTSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
Eepd1Q3TGW2 Lsm4-205ENSMUST00000210987 636 ntTSL 5 BASIC25.56■■□□□ 1.68
Eepd1Q3TGW2 Scn1b-201ENSMUST00000098548 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
Eepd1Q3TGW2 Tm2d2-201ENSMUST00000033961 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
Eepd1Q3TGW2 Galr3-201ENSMUST00000058004 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
Eepd1Q3TGW2 2310061I04Rik-202ENSMUST00000146451 2081 ntTSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
Eepd1Q3TGW2 Six3-201ENSMUST00000162695 2838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.55■■□□□ 1.68
Eepd1Q3TGW2 Ppcs-201ENSMUST00000030385 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
Eepd1Q3TGW2 Ccna1-202ENSMUST00000197238 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.54■■□□□ 1.68
Eepd1Q3TGW2 Ipmk-203ENSMUST00000121446 1492 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.54■■□□□ 1.68
Eepd1Q3TGW2 Cys1-207ENSMUST00000186602 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
Eepd1Q3TGW2 Lemd2-201ENSMUST00000055117 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
Eepd1Q3TGW2 Zc3h6-201ENSMUST00000110319 1484 ntTSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 80 ms