Protein–RNA interactions for Protein: Q31093

H2-M3, Histocompatibility 2, M region locus 3, mousemouse

Predictions only

Length 336 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
H2-M3Q31093 Gm45364-201ENSMUST00000210883 159 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
H2-M3Q31093 Ttc9-201ENSMUST00000036116 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
H2-M3Q31093 Fam212b-202ENSMUST00000098273 1868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
H2-M3Q31093 Pom121-201ENSMUST00000111171 5580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
H2-M3Q31093 Camsap1-212ENSMUST00000183461 5090 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
H2-M3Q31093 Ppp4c-201ENSMUST00000032936 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
H2-M3Q31093 Gm10499-202ENSMUST00000174778 1698 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
H2-M3Q31093 Nrsn1-201ENSMUST00000057866 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
H2-M3Q31093 Rasgef1c-203ENSMUST00000093142 2216 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
H2-M3Q31093 Egr4-201ENSMUST00000095759 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
H2-M3Q31093 Rab26-202ENSMUST00000061764 1291 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
H2-M3Q31093 Jmjd6-201ENSMUST00000047616 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
H2-M3Q31093 Hoxb3-202ENSMUST00000093944 3190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
H2-M3Q31093 Fam126a-206ENSMUST00000197617 2288 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
H2-M3Q31093 Tmem70-203ENSMUST00000177501 1636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
H2-M3Q31093 Usp12-201ENSMUST00000085614 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
H2-M3Q31093 Mad2l2-202ENSMUST00000084129 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
H2-M3Q31093 Srarp-201ENSMUST00000094544 905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
H2-M3Q31093 Ran-202ENSMUST00000111343 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
H2-M3Q31093 Pkd1-207ENSMUST00000228550 1050 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
H2-M3Q31093 H2afy-202ENSMUST00000045788 1933 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
H2-M3Q31093 Snta1-202ENSMUST00000109728 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
H2-M3Q31093 Esyt2-201ENSMUST00000100986 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
H2-M3Q31093 Efhd1os-201ENSMUST00000138844 332 ntTSL 3 BASIC22■■□□□ 1.11
H2-M3Q31093 Gm9888-201ENSMUST00000150678 965 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
H2-M3Q31093 Nelfe-202ENSMUST00000165953 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
H2-M3Q31093 Eid1-201ENSMUST00000164756 1691 ntAPPRIS P1 BASIC21.99■■□□□ 1.11
H2-M3Q31093 Znrf1-207ENSMUST00000173506 1238 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
H2-M3Q31093 Gm12818-201ENSMUST00000117562 1349 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
H2-M3Q31093 1110008P14Rik-201ENSMUST00000048792 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
H2-M3Q31093 B4galt2-201ENSMUST00000030266 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
H2-M3Q31093 Gm38287-201ENSMUST00000195193 2051 ntTSL 3 BASIC21.98■■□□□ 1.11
H2-M3Q31093 Ier5l-201ENSMUST00000065134 2683 ntAPPRIS P1 BASIC21.98■■□□□ 1.11
H2-M3Q31093 Nog-201ENSMUST00000061728 1695 ntAPPRIS P1 BASIC21.98■■□□□ 1.11
H2-M3Q31093 Dennd5a-201ENSMUST00000080437 5004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
H2-M3Q31093 Dnajc21-201ENSMUST00000136591 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
H2-M3Q31093 Azin2-203ENSMUST00000119354 1921 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
H2-M3Q31093 Slc44a1-203ENSMUST00000107646 1974 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
H2-M3Q31093 Rbm45-201ENSMUST00000046389 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
H2-M3Q31093 Lgi2-201ENSMUST00000039750 6456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
H2-M3Q31093 Aspscr1-203ENSMUST00000106158 1690 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
H2-M3Q31093 Fam220a-201ENSMUST00000067145 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
H2-M3Q31093 E130309D02Rik-201ENSMUST00000046418 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
H2-M3Q31093 Kctd6-201ENSMUST00000022272 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
H2-M3Q31093 Kctd2-201ENSMUST00000103035 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
H2-M3Q31093 Prr5-201ENSMUST00000065499 1830 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
H2-M3Q31093 Gm9812-201ENSMUST00000061934 968 ntBASIC21.95■■□□□ 1.1
H2-M3Q31093 Ube2h-201ENSMUST00000094543 975 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
H2-M3Q31093 2510046G10Rik-202ENSMUST00000187458 1052 ntBASIC21.94■■□□□ 1.1
H2-M3Q31093 AC122317.2-201ENSMUST00000218708 1248 ntBASIC21.94■■□□□ 1.1
H2-M3Q31093 Asf1a-205ENSMUST00000219282 1150 ntTSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
H2-M3Q31093 Ltb4r1-201ENSMUST00000057569 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
H2-M3Q31093 Wnt5b-203ENSMUST00000119369 2339 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
H2-M3Q31093 Sntb1-202ENSMUST00000110200 1225 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
H2-M3Q31093 Artn-201ENSMUST00000070816 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
H2-M3Q31093 Paqr6-203ENSMUST00000147948 837 ntTSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
H2-M3Q31093 Smagp-202ENSMUST00000172334 952 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
H2-M3Q31093 Gm20512-201ENSMUST00000172483 618 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
H2-M3Q31093 Dbndd2-202ENSMUST00000069385 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
H2-M3Q31093 Ankrd49-205ENSMUST00000216037 1037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
H2-M3Q31093 Gm15688-201ENSMUST00000161394 2418 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
H2-M3Q31093 Gm20208-202ENSMUST00000219905 1528 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
H2-M3Q31093 Asf1a-201ENSMUST00000020004 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
H2-M3Q31093 Tmem9b-201ENSMUST00000033333 1703 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
H2-M3Q31093 Rarres1-201ENSMUST00000054825 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
H2-M3Q31093 Trappc6b-201ENSMUST00000021380 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
H2-M3Q31093 Hook1-201ENSMUST00000030306 5517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
H2-M3Q31093 Foxn3-209ENSMUST00000177451 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
H2-M3Q31093 Fbl-201ENSMUST00000042405 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
H2-M3Q31093 Irak1-207ENSMUST00000114360 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
H2-M3Q31093 Crlf2-201ENSMUST00000044579 1323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
H2-M3Q31093 Tmem192-202ENSMUST00000079896 916 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
H2-M3Q31093 Nisch-222ENSMUST00000172142 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
H2-M3Q31093 Pan3-201ENSMUST00000031651 5048 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
H2-M3Q31093 AC153911.1-201ENSMUST00000220378 758 ntBASIC21.86■■□□□ 1.09
H2-M3Q31093 Dcun1d5-201ENSMUST00000034499 1122 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
H2-M3Q31093 Kcnk2-205ENSMUST00000192723 1642 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
H2-M3Q31093 A830010M20Rik-207ENSMUST00000162298 1408 ntTSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
H2-M3Q31093 Hoxc8-201ENSMUST00000001703 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
H2-M3Q31093 Hoxb3-201ENSMUST00000055334 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
H2-M3Q31093 Hook1-202ENSMUST00000107083 1506 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
H2-M3Q31093 Scarna2-201ENSMUST00000157560 414 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
H2-M3Q31093 A330041J22Rik-201ENSMUST00000150367 1825 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
H2-M3Q31093 Deaf1-201ENSMUST00000080553 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
H2-M3Q31093 Cdkn2c-202ENSMUST00000097921 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
H2-M3Q31093 Pdpk1-203ENSMUST00000115407 1730 ntTSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
H2-M3Q31093 Rnf39-201ENSMUST00000040498 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
H2-M3Q31093 Ndufs3-201ENSMUST00000005647 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
H2-M3Q31093 Olfm2-203ENSMUST00000215999 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.83■■□□□ 1.09
H2-M3Q31093 Gm11613-201ENSMUST00000134427 1971 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
H2-M3Q31093 Foxa2-202ENSMUST00000109964 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
H2-M3Q31093 Stambp-207ENSMUST00000206592 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
H2-M3Q31093 Gm15918-201ENSMUST00000137259 689 ntTSL 3 BASIC21.83■■□□□ 1.09
H2-M3Q31093 Crct1-201ENSMUST00000029521 718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
H2-M3Q31093 Terc-201ENSMUST00000082862 423 ntBASIC21.83■■□□□ 1.09
H2-M3Q31093 Coro1b-201ENSMUST00000008893 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
H2-M3Q31093 Olfm1-201ENSMUST00000028177 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
H2-M3Q31093 Ski-201ENSMUST00000030917 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
H2-M3Q31093 Fads2-201ENSMUST00000025567 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
H2-M3Q31093 Cic-202ENSMUST00000163320 6096 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.4 ms