Protein–RNA interactions for Protein: Q1W617

Shroom4, Protein Shroom4, mousemouse

Predictions only

Length 1,475 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Shroom4Q1W617 H1fx-201ENSMUST00000056403 1217 ntAPPRIS P1 BASIC37.36■■■■□ 3.57
Shroom4Q1W617 Ybx3-202ENSMUST00000087865 1684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC37.35■■■■□ 3.57
Shroom4Q1W617 Gm22567-201ENSMUST00000175542 342 ntBASIC37.34■■■■□ 3.57
Shroom4Q1W617 Hoxb3os-202ENSMUST00000147410 1945 ntTSL 5 BASIC37.34■■■■□ 3.57
Shroom4Q1W617 Zc3h6-201ENSMUST00000110319 1484 ntTSL 1 (best) BASIC37.34■■■■□ 3.57
Shroom4Q1W617 Cyp2r1-202ENSMUST00000119712 917 ntTSL 5 BASIC37.33■■■■□ 3.57
Shroom4Q1W617 Cdc14b-207ENSMUST00000221634 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC37.33■■■■□ 3.57
Shroom4Q1W617 Acvr2b-202ENSMUST00000165044 2093 ntTSL 2 BASIC37.33■■■■□ 3.57
Shroom4Q1W617 Gm20458-201ENSMUST00000164863 1369 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC37.33■■■■□ 3.57
Shroom4Q1W617 Coprs-201ENSMUST00000033839 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.33■■■■□ 3.57
Shroom4Q1W617 Cldnd1-201ENSMUST00000023426 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.32■■■■□ 3.57
Shroom4Q1W617 Fam89b-203ENSMUST00000161368 1160 ntTSL 1 (best) BASIC37.32■■■■□ 3.56
Shroom4Q1W617 Gm29735-201ENSMUST00000209599 660 ntAPPRIS P1 BASIC37.31■■■■□ 3.56
Shroom4Q1W617 Dhrs11-201ENSMUST00000047560 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.31■■■■□ 3.56
Shroom4Q1W617 Acvr2b-201ENSMUST00000035093 1729 ntTSL 5 BASIC37.31■■■■□ 3.56
Shroom4Q1W617 Dexi-201ENSMUST00000038281 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.3■■■■□ 3.56
Shroom4Q1W617 Gm4419-202ENSMUST00000226239 1431 ntBASIC37.3■■■■□ 3.56
Shroom4Q1W617 B3gat1-201ENSMUST00000115269 1665 ntTSL 1 (best) BASIC37.3■■■■□ 3.56
Shroom4Q1W617 Gal3st1-202ENSMUST00000078757 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.3■■■■□ 3.56
Shroom4Q1W617 Snx21-203ENSMUST00000152471 1243 ntTSL 1 (best) BASIC37.3■■■■□ 3.56
Shroom4Q1W617 Becn1-216ENSMUST00000170502 725 ntTSL 1 (best) BASIC37.29■■■■□ 3.56
Shroom4Q1W617 Hras-202ENSMUST00000097957 1199 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC37.28■■■■□ 3.56
Shroom4Q1W617 Tmem42-201ENSMUST00000084733 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.27■■■■□ 3.56
Shroom4Q1W617 Fam50b-202ENSMUST00000221037 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.27■■■■□ 3.56
Shroom4Q1W617 Fam92a-202ENSMUST00000108285 1639 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC37.27■■■■□ 3.56
Shroom4Q1W617 Eif5a-208ENSMUST00000108611 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.26■■■■□ 3.56
Shroom4Q1W617 Spryd7-202ENSMUST00000100496 1459 ntTSL 1 (best) BASIC37.26■■■■□ 3.55
Shroom4Q1W617 Arl2bp-201ENSMUST00000034228 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.25■■■■□ 3.55
Shroom4Q1W617 Gm21989-201ENSMUST00000174530 1609 ntTSL 1 (best) BASIC37.25■■■■□ 3.55
Shroom4Q1W617 AC161180.1-201ENSMUST00000223439 933 ntAPPRIS P1 BASIC37.25■■■■□ 3.55
Shroom4Q1W617 H2afy-202ENSMUST00000045788 1933 ntTSL 1 (best) BASIC37.24■■■■□ 3.55
Shroom4Q1W617 Ipmk-203ENSMUST00000121446 1492 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC37.24■■■■□ 3.55
Shroom4Q1W617 Ssbp4-205ENSMUST00000210369 1828 ntTSL 2 BASIC37.24■■■■□ 3.55
Shroom4Q1W617 Kctd2-201ENSMUST00000103035 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.24■■■■□ 3.55
Shroom4Q1W617 Gipc1-201ENSMUST00000019577 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.23■■■■□ 3.55
Shroom4Q1W617 Bag1-203ENSMUST00000191273 1348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC37.23■■■■□ 3.55
Shroom4Q1W617 Gm5522-201ENSMUST00000189483 1242 ntBASIC37.22■■■■□ 3.55
Shroom4Q1W617 Gsk3a-202ENSMUST00000108411 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC37.2■■■■□ 3.55
Shroom4Q1W617 Ssx2ip-202ENSMUST00000106149 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC37.19■■■■□ 3.54
Shroom4Q1W617 Pdgfa-204ENSMUST00000110897 1287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC37.19■■■■□ 3.54
Shroom4Q1W617 Etfa-201ENSMUST00000034866 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.18■■■■□ 3.54
Shroom4Q1W617 Dynll1-202ENSMUST00000112090 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC37.18■■■■□ 3.54
Shroom4Q1W617 Gm12905-201ENSMUST00000153814 658 ntTSL 2 BASIC37.18■■■■□ 3.54
Shroom4Q1W617 Gm7544-201ENSMUST00000222426 828 ntAPPRIS P1 BASIC37.18■■■■□ 3.54
Shroom4Q1W617 AC166358.2-201ENSMUST00000223403 734 ntTSL 5 BASIC37.18■■■■□ 3.54
Shroom4Q1W617 Hecw2-202ENSMUST00000097741 1132 ntTSL 1 (best) BASIC37.18■■■■□ 3.54
Shroom4Q1W617 Gm15546-201ENSMUST00000122095 826 ntBASIC37.17■■■■□ 3.54
Shroom4Q1W617 Hexdc-202ENSMUST00000106117 2149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC37.17■■■■□ 3.54
Shroom4Q1W617 Oaz2-206ENSMUST00000153700 1843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC37.16■■■■□ 3.54
Shroom4Q1W617 Usf1-210ENSMUST00000167546 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC37.16■■■■□ 3.54
Shroom4Q1W617 Pdcd4-203ENSMUST00000165617 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.14■■■■□ 3.54
Shroom4Q1W617 Usp2-206ENSMUST00000176416 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC37.14■■■■□ 3.54
Shroom4Q1W617 Ntn5-203ENSMUST00000183120 1491 ntTSL 1 (best) BASIC37.14■■■■□ 3.54
Shroom4Q1W617 Gm13238-201ENSMUST00000117655 780 ntBASIC37.13■■■■□ 3.54
Shroom4Q1W617 Gm43566-201ENSMUST00000196851 808 ntBASIC37.13■■■■□ 3.53
Shroom4Q1W617 Kdm2a-203ENSMUST00000116571 2413 ntTSL 1 (best) BASIC37.12■■■■□ 3.53
Shroom4Q1W617 Sin3b-202ENSMUST00000109950 1024 ntTSL 1 (best) BASIC37.11■■■■□ 3.53
Shroom4Q1W617 Gm43592-201ENSMUST00000196922 1165 ntBASIC37.11■■■■□ 3.53
Shroom4Q1W617 H2afj-202ENSMUST00000203982 577 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC37.11■■■■□ 3.53
Shroom4Q1W617 Phf2os1-201ENSMUST00000123212 498 ntTSL 3 BASIC37.1■■■■□ 3.53
Shroom4Q1W617 Gm960-202ENSMUST00000177696 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC37.09■■■■□ 3.53
Shroom4Q1W617 AC102554.1-201ENSMUST00000216236 537 ntTSL 5 BASIC37.09■■■■□ 3.53
Shroom4Q1W617 Gng12-203ENSMUST00000114224 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC37.08■■■■□ 3.53
Shroom4Q1W617 Gng12-206ENSMUST00000114227 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.08■■■■□ 3.53
Shroom4Q1W617 Gm6217-201ENSMUST00000222182 829 ntAPPRIS P1 BASIC37.08■■■■□ 3.53
Shroom4Q1W617 Lsm4-201ENSMUST00000034311 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.07■■■■□ 3.53
Shroom4Q1W617 Psip1-203ENSMUST00000107215 1898 ntTSL 1 (best) BASIC37.07■■■■□ 3.52
Shroom4Q1W617 Mypop-203ENSMUST00000131087 1951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC37.06■■■■□ 3.52
Shroom4Q1W617 Suv39h2-202ENSMUST00000060618 1831 ntTSL 1 (best) BASIC37.05■■■■□ 3.52
Shroom4Q1W617 Amer2-203ENSMUST00000225247 2662 ntBASIC37.05■■■■□ 3.52
Shroom4Q1W617 Vdac1-202ENSMUST00000102758 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.03■■■■□ 3.52
Shroom4Q1W617 Crls1-201ENSMUST00000028835 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.03■■■■□ 3.52
Shroom4Q1W617 Hdgf-201ENSMUST00000005017 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.02■■■■□ 3.52
Shroom4Q1W617 Gm45444-201ENSMUST00000211394 898 ntBASIC37.01■■■■□ 3.51
Shroom4Q1W617 Ak2-201ENSMUST00000030583 986 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC37.01■■■■□ 3.51
Shroom4Q1W617 Hist2h3c1-201ENSMUST00000176059 1820 ntAPPRIS P1 BASIC37■■■■□ 3.51
Shroom4Q1W617 Hist2h3c1-202ENSMUST00000177796 1825 ntBASIC37■■■■□ 3.51
Shroom4Q1W617 AC164424.2-201ENSMUST00000223281 725 ntTSL 3 BASIC36.99■■■■□ 3.51
Shroom4Q1W617 Arhgap39-204ENSMUST00000176219 542 ntTSL 5 BASIC36.98■■■■□ 3.51
Shroom4Q1W617 Kcnk2-205ENSMUST00000192723 1642 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC36.97■■■■□ 3.51
Shroom4Q1W617 Tirap-205ENSMUST00000176685 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.96■■■■□ 3.51
Shroom4Q1W617 Thra-202ENSMUST00000103139 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.96■■■■□ 3.51
Shroom4Q1W617 Mpnd-208ENSMUST00000159996 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC36.96■■■■□ 3.51
Shroom4Q1W617 Tmx4-202ENSMUST00000110119 596 ntTSL 2 BASIC36.95■■■■□ 3.51
Shroom4Q1W617 Casd1-204ENSMUST00000181734 1063 ntTSL 5 BASIC36.95■■■■□ 3.51
Shroom4Q1W617 Jdp2-201ENSMUST00000050687 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.95■■■■□ 3.51
Shroom4Q1W617 Ube2k-206ENSMUST00000201984 1449 ntTSL 3 BASIC36.94■■■■□ 3.5
Shroom4Q1W617 Syce2-202ENSMUST00000136026 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC36.92■■■■□ 3.5
Shroom4Q1W617 Gsc2-201ENSMUST00000012279 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.92■■■■□ 3.5
Shroom4Q1W617 Sarnp-203ENSMUST00000219512 953 ntTSL 3 BASIC36.91■■■■□ 3.5
Shroom4Q1W617 Tmem11-201ENSMUST00000062677 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.9■■■■□ 3.5
Shroom4Q1W617 Pcf11-204ENSMUST00000208058 461 ntTSL 5 BASIC36.89■■■■□ 3.5
Shroom4Q1W617 Nsd1-203ENSMUST00000224156 1149 ntBASIC36.89■■■■□ 3.5
Shroom4Q1W617 A930002H24Rik-201ENSMUST00000050753 492 ntAPPRIS P1 BASIC36.89■■■■□ 3.5
Shroom4Q1W617 Gm20208-202ENSMUST00000219905 1528 ntTSL 1 (best) BASIC36.89■■■■□ 3.5
Shroom4Q1W617 Upp2-202ENSMUST00000071543 2150 ntTSL 1 (best) BASIC36.88■■■■□ 3.5
Shroom4Q1W617 Dusp2-201ENSMUST00000028846 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.88■■■■□ 3.49
Shroom4Q1W617 Unc119-201ENSMUST00000002127 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.88■■■■□ 3.49
Shroom4Q1W617 Pdpk1-203ENSMUST00000115407 1730 ntTSL 5 BASIC36.88■■■■□ 3.49
Shroom4Q1W617 Rin3-207ENSMUST00000150795 937 ntTSL 1 (best) BASIC36.88■■■■□ 3.49
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