Protein–RNA interactions for Protein: Q14B46

Rtkn2, Rhotekin-2, mousemouse

Predictions only

Length 604 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rtkn2Q14B46 Gm5812-201ENSMUST00000061073 957 ntBASIC28.44■■■□□ 2.14
Rtkn2Q14B46 Cited4-201ENSMUST00000094814 1249 ntAPPRIS P1 BASIC28.44■■■□□ 2.14
Rtkn2Q14B46 Mypop-203ENSMUST00000131087 1951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.43■■■□□ 2.14
Rtkn2Q14B46 Nudt3-203ENSMUST00000114886 996 ntTSL 2 BASIC28.43■■■□□ 2.14
Rtkn2Q14B46 Upp2-202ENSMUST00000071543 2150 ntTSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
Rtkn2Q14B46 H2-Q5-202ENSMUST00000172979 998 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.42■■■□□ 2.14
Rtkn2Q14B46 Gipc1-201ENSMUST00000019577 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
Rtkn2Q14B46 Acvr2b-201ENSMUST00000035093 1729 ntTSL 5 BASIC28.41■■■□□ 2.14
Rtkn2Q14B46 Htatsf1-202ENSMUST00000114751 1128 ntTSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
Rtkn2Q14B46 Hdgf-201ENSMUST00000005017 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
Rtkn2Q14B46 Etfa-201ENSMUST00000034866 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
Rtkn2Q14B46 Tm2d2-201ENSMUST00000033961 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
Rtkn2Q14B46 Crls1-201ENSMUST00000028835 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
Rtkn2Q14B46 Cyp2r1-202ENSMUST00000119712 917 ntTSL 5 BASIC28.37■■■□□ 2.13
Rtkn2Q14B46 Suv39h2-202ENSMUST00000060618 1831 ntTSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
Rtkn2Q14B46 Gfra4-206ENSMUST00000110240 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
Rtkn2Q14B46 Hnrnpul1-202ENSMUST00000108401 1240 ntTSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
Rtkn2Q14B46 Hecw2-202ENSMUST00000097741 1132 ntTSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
Rtkn2Q14B46 Pdcd4-203ENSMUST00000165617 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
Rtkn2Q14B46 Hopx-203ENSMUST00000120827 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
Rtkn2Q14B46 Tmem127-202ENSMUST00000174288 842 ntTSL 2 BASIC28.35■■■□□ 2.13
Rtkn2Q14B46 H2afy-202ENSMUST00000045788 1933 ntTSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
Rtkn2Q14B46 Pth1r-202ENSMUST00000166716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
Rtkn2Q14B46 Gm21989-201ENSMUST00000174530 1609 ntTSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
Rtkn2Q14B46 D17Wsu92e-201ENSMUST00000075076 1470 ntTSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
Rtkn2Q14B46 Sec24d-208ENSMUST00000200333 307 ntTSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
Rtkn2Q14B46 Mapkap1-202ENSMUST00000113124 1758 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.32■■■□□ 2.12
Rtkn2Q14B46 Psip1-203ENSMUST00000107215 1898 ntTSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
Rtkn2Q14B46 Tirap-205ENSMUST00000176685 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
Rtkn2Q14B46 Vdac1-202ENSMUST00000102758 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
Rtkn2Q14B46 Faim-202ENSMUST00000112911 803 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC28.31■■■□□ 2.12
Rtkn2Q14B46 Kctd2-201ENSMUST00000103035 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
Rtkn2Q14B46 Oaz2-206ENSMUST00000153700 1843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.3■■■□□ 2.12
Rtkn2Q14B46 Gm2415-202ENSMUST00000134688 401 ntTSL 2 BASIC28.3■■■□□ 2.12
Rtkn2Q14B46 Fam89b-203ENSMUST00000161368 1160 ntTSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
Rtkn2Q14B46 Pxmp2-201ENSMUST00000031472 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
Rtkn2Q14B46 Reps1-206ENSMUST00000154718 2402 ntTSL 5 BASIC28.3■■■□□ 2.12
Rtkn2Q14B46 Tmem42-201ENSMUST00000084733 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
Rtkn2Q14B46 Dtnb-203ENSMUST00000164578 2355 ntTSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
Rtkn2Q14B46 Ipmk-203ENSMUST00000121446 1492 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.27■■■□□ 2.12
Rtkn2Q14B46 Usf1-210ENSMUST00000167546 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.27■■■□□ 2.12
Rtkn2Q14B46 Adap1-201ENSMUST00000110865 2557 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.27■■■□□ 2.12
Rtkn2Q14B46 Zc3h6-201ENSMUST00000110319 1484 ntTSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
Rtkn2Q14B46 Becn1-216ENSMUST00000170502 725 ntTSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
Rtkn2Q14B46 Ints11-202ENSMUST00000120794 1884 ntTSL 5 BASIC28.25■■■□□ 2.11
Rtkn2Q14B46 Thra-202ENSMUST00000103139 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
Rtkn2Q14B46 Fam50b-202ENSMUST00000221037 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
Rtkn2Q14B46 Foxe3-201ENSMUST00000050940 867 ntAPPRIS P1 BASIC28.23■■■□□ 2.11
Rtkn2Q14B46 Eif5a-208ENSMUST00000108611 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
Rtkn2Q14B46 Bag1-203ENSMUST00000191273 1348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
Rtkn2Q14B46 Gm29735-201ENSMUST00000209599 660 ntAPPRIS P1 BASIC28.22■■■□□ 2.11
Rtkn2Q14B46 Dexi-201ENSMUST00000038281 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
Rtkn2Q14B46 Kcnk2-205ENSMUST00000192723 1642 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
Rtkn2Q14B46 Snx21-203ENSMUST00000152471 1243 ntTSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
Rtkn2Q14B46 Dhrs11-201ENSMUST00000047560 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
Rtkn2Q14B46 Usp2-206ENSMUST00000176416 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
Rtkn2Q14B46 Pdgfa-204ENSMUST00000110897 1287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.19■■■□□ 2.1
Rtkn2Q14B46 Gm12905-201ENSMUST00000153814 658 ntTSL 2 BASIC28.19■■■□□ 2.1
Rtkn2Q14B46 Gm43592-201ENSMUST00000196922 1165 ntBASIC28.19■■■□□ 2.1
Rtkn2Q14B46 AC161180.1-201ENSMUST00000223439 933 ntAPPRIS P1 BASIC28.19■■■□□ 2.1
Rtkn2Q14B46 Coprs-201ENSMUST00000033839 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
Rtkn2Q14B46 Lsm4-201ENSMUST00000034311 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
Rtkn2Q14B46 Hist2h3c1-201ENSMUST00000176059 1820 ntAPPRIS P1 BASIC28.17■■■□□ 2.1
Rtkn2Q14B46 Hist2h3c1-202ENSMUST00000177796 1825 ntBASIC28.17■■■□□ 2.1
Rtkn2Q14B46 Pde8b-204ENSMUST00000159608 2370 ntTSL 5 BASIC28.17■■■□□ 2.1
Rtkn2Q14B46 Gm7544-201ENSMUST00000222426 828 ntAPPRIS P1 BASIC28.16■■■□□ 2.1
Rtkn2Q14B46 Tmem189-201ENSMUST00000006587 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
Rtkn2Q14B46 Spryd7-202ENSMUST00000100496 1459 ntTSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
Rtkn2Q14B46 Ntn5-203ENSMUST00000183120 1491 ntTSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
Rtkn2Q14B46 Gm15546-201ENSMUST00000122095 826 ntBASIC28.15■■■□□ 2.1
Rtkn2Q14B46 AC166358.2-201ENSMUST00000223403 734 ntTSL 5 BASIC28.15■■■□□ 2.1
Rtkn2Q14B46 St7-208ENSMUST00000115419 2194 ntTSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
Rtkn2Q14B46 Hras-202ENSMUST00000097957 1199 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.14■■■□□ 2.1
Rtkn2Q14B46 Hoxd9-201ENSMUST00000059272 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
Rtkn2Q14B46 Gxylt1-202ENSMUST00000057896 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.13■■■□□ 2.09
Rtkn2Q14B46 Sin3b-202ENSMUST00000109950 1024 ntTSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
Rtkn2Q14B46 Pdpk1-203ENSMUST00000115407 1730 ntTSL 5 BASIC28.12■■■□□ 2.09
Rtkn2Q14B46 Dynll1-202ENSMUST00000112090 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.12■■■□□ 2.09
Rtkn2Q14B46 Glrx3-201ENSMUST00000064404 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
Rtkn2Q14B46 Trappc6b-207ENSMUST00000218686 785 ntTSL 3 BASIC28.11■■■□□ 2.09
Rtkn2Q14B46 Tmem70-203ENSMUST00000177501 1636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
Rtkn2Q14B46 Gm13238-201ENSMUST00000117655 780 ntBASIC28.1■■■□□ 2.09
Rtkn2Q14B46 Gm5522-201ENSMUST00000189483 1242 ntBASIC28.1■■■□□ 2.09
Rtkn2Q14B46 Emid1-201ENSMUST00000062821 1947 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
Rtkn2Q14B46 AC117769.4-201ENSMUST00000225679 685 ntBASIC28.09■■■□□ 2.09
Rtkn2Q14B46 Runx2-211ENSMUST00000162629 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.08■■■□□ 2.09
Rtkn2Q14B46 Gng12-203ENSMUST00000114224 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.08■■■□□ 2.09
Rtkn2Q14B46 Gng12-206ENSMUST00000114227 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
Rtkn2Q14B46 Rnaset2b-201ENSMUST00000089119 1013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
Rtkn2Q14B46 B230377A18Rik-202ENSMUST00000192921 1364 ntBASIC28.08■■■□□ 2.09
Rtkn2Q14B46 Tmem11-201ENSMUST00000062677 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
Rtkn2Q14B46 Gm22567-201ENSMUST00000175542 342 ntBASIC28.07■■■□□ 2.08
Rtkn2Q14B46 Gm43566-201ENSMUST00000196851 808 ntBASIC28.07■■■□□ 2.08
Rtkn2Q14B46 Gm20208-202ENSMUST00000219905 1528 ntTSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
Rtkn2Q14B46 Tmem106c-201ENSMUST00000064200 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
Rtkn2Q14B46 Klhl25-205ENSMUST00000206019 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
Rtkn2Q14B46 Rbm45-201ENSMUST00000046389 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
Rtkn2Q14B46 Ccdc9-202ENSMUST00000118976 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
Rtkn2Q14B46 Phf2os1-201ENSMUST00000123212 498 ntTSL 3 BASIC28.05■■■□□ 2.08
Rtkn2Q14B46 Mpnd-208ENSMUST00000159996 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.05■■■□□ 2.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 64.8 ms