Protein–RNA interactions for Protein: Q14B02

Rnf133, E3 ubiquitin-protein ligase RNF133, mousemouse

Predictions only

Length 382 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rnf133Q14B02 Fam168b-201ENSMUST00000047534 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
Rnf133Q14B02 Smurf1-201ENSMUST00000085684 5343 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
Rnf133Q14B02 Ran-202ENSMUST00000111343 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
Rnf133Q14B02 Fam220a-201ENSMUST00000067145 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
Rnf133Q14B02 Deaf1-201ENSMUST00000080553 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
Rnf133Q14B02 Efhd1os-201ENSMUST00000138844 332 ntTSL 3 BASIC20.65■□□□□ 0.9
Rnf133Q14B02 Gm16764-201ENSMUST00000138891 541 ntTSL 5 BASIC20.65■□□□□ 0.9
Rnf133Q14B02 Rpl31-203ENSMUST00000179954 630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
Rnf133Q14B02 Rab26-202ENSMUST00000061764 1291 ntTSL 2 BASIC20.65■□□□□ 0.9
Rnf133Q14B02 Gm6311-201ENSMUST00000073790 878 ntBASIC20.65■□□□□ 0.9
Rnf133Q14B02 Hoxc8-201ENSMUST00000001703 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.9
Rnf133Q14B02 Smurf1-202ENSMUST00000100461 2725 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.9
Rnf133Q14B02 Pkd1-207ENSMUST00000228550 1050 ntBASIC20.64■□□□□ 0.89
Rnf133Q14B02 Ube2h-201ENSMUST00000094543 975 ntTSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
Rnf133Q14B02 Azin2-203ENSMUST00000119354 1921 ntTSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
Rnf133Q14B02 Kcnk2-205ENSMUST00000192723 1642 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
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Rnf133Q14B02 Asf1a-201ENSMUST00000020004 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Rnf133Q14B02 Wnt5b-203ENSMUST00000119369 2339 ntTSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Rnf133Q14B02 A330041J22Rik-201ENSMUST00000150367 1825 ntTSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Rnf133Q14B02 Znrf1-207ENSMUST00000173506 1238 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.62■□□□□ 0.89
Rnf133Q14B02 Gm5987-201ENSMUST00000196433 1151 ntBASIC20.62■□□□□ 0.89
Rnf133Q14B02 Ankrd49-205ENSMUST00000216037 1037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.62■□□□□ 0.89
Rnf133Q14B02 Rnf39-201ENSMUST00000040498 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Rnf133Q14B02 Rbm45-201ENSMUST00000046389 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Rnf133Q14B02 Gm20208-202ENSMUST00000219905 1528 ntTSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Rnf133Q14B02 4930597O21Rik-201ENSMUST00000065878 984 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Rnf133Q14B02 E130309D02Rik-201ENSMUST00000046418 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Rnf133Q14B02 Nelfe-202ENSMUST00000165953 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Rnf133Q14B02 Foxa2-202ENSMUST00000109964 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Rnf133Q14B02 Fads2-201ENSMUST00000025567 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Rnf133Q14B02 Gm20512-201ENSMUST00000172483 618 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Rnf133Q14B02 Tmem9b-201ENSMUST00000033333 1703 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Rnf133Q14B02 Foxc1-201ENSMUST00000062292 5844 ntAPPRIS P1 BASIC20.6■□□□□ 0.89
Rnf133Q14B02 Slc16a11-211ENSMUST00000171032 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
Rnf133Q14B02 Coro1b-201ENSMUST00000008893 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
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Rnf133Q14B02 A830010M20Rik-207ENSMUST00000162298 1408 ntTSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.88
Rnf133Q14B02 Sh3rf1-201ENSMUST00000034060 5479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
Rnf133Q14B02 Trappc6b-201ENSMUST00000021380 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Rnf133Q14B02 1110008P14Rik-201ENSMUST00000048792 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Rnf133Q14B02 Gm15688-201ENSMUST00000161394 2418 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Rnf133Q14B02 Zswim5-201ENSMUST00000044823 5582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Rnf133Q14B02 2510046G10Rik-202ENSMUST00000187458 1052 ntBASIC20.56■□□□□ 0.88
Rnf133Q14B02 Gm42699-201ENSMUST00000198104 1657 ntBASIC20.56■□□□□ 0.88
Rnf133Q14B02 Ltb4r1-201ENSMUST00000057569 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Rnf133Q14B02 Olfm2-203ENSMUST00000215999 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.56■□□□□ 0.88
Rnf133Q14B02 Rarres1-201ENSMUST00000054825 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Rnf133Q14B02 Foxd2-201ENSMUST00000068654 2592 ntAPPRIS P1 BASIC20.55■□□□□ 0.88
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Rnf133Q14B02 Kctd15-202ENSMUST00000108069 2407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
Rnf133Q14B02 St3gal2-202ENSMUST00000117534 2177 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Rnf133Q14B02 Scn1b-201ENSMUST00000098548 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Rnf133Q14B02 Asf1a-205ENSMUST00000219282 1150 ntTSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
Rnf133Q14B02 Tmem192-202ENSMUST00000079896 916 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Rnf133Q14B02 Terc-201ENSMUST00000082862 423 ntBASIC20.54■□□□□ 0.88
Rnf133Q14B02 Stambp-207ENSMUST00000206592 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Rnf133Q14B02 Irak1-207ENSMUST00000114360 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Rnf133Q14B02 Gorasp2-205ENSMUST00000133432 1941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
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Rnf133Q14B02 Dcun1d5-201ENSMUST00000034499 1122 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Rnf133Q14B02 Ndufs3-201ENSMUST00000005647 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Rnf133Q14B02 Hook1-202ENSMUST00000107083 1506 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
Rnf133Q14B02 Kcnj6-201ENSMUST00000095873 1773 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
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Rnf133Q14B02 Foxn3-209ENSMUST00000177451 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Rnf133Q14B02 Thap8-202ENSMUST00000108187 1184 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
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Rnf133Q14B02 Ddx43-201ENSMUST00000113367 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
Rnf133Q14B02 Epb41l4b-203ENSMUST00000095076 6746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
Rnf133Q14B02 Hacd1-202ENSMUST00000091429 871 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Rnf133Q14B02 Ube2k-203ENSMUST00000201266 1449 ntTSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
Rnf133Q14B02 Hoxb3-201ENSMUST00000055334 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
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Rnf133Q14B02 Porcn-204ENSMUST00000089403 1854 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Rnf133Q14B02 Hgh1-201ENSMUST00000023213 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Rnf133Q14B02 Sntb1-202ENSMUST00000110200 1225 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Rnf133Q14B02 Fbl-201ENSMUST00000042405 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Rnf133Q14B02 Hecw2-202ENSMUST00000097741 1132 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Rnf133Q14B02 Mypop-201ENSMUST00000059331 2173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Rnf133Q14B02 Crlf2-201ENSMUST00000044579 1323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Rnf133Q14B02 Gm16286-202ENSMUST00000125127 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Rnf133Q14B02 Nisch-222ENSMUST00000172142 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Rnf133Q14B02 Cdkn2c-202ENSMUST00000097921 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Rnf133Q14B02 Sh3d21-202ENSMUST00000097891 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Rnf133Q14B02 Crct1-201ENSMUST00000029521 718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Rnf133Q14B02 Gm5784-202ENSMUST00000220896 2016 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Rnf133Q14B02 Mlycd-201ENSMUST00000098367 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Rnf133Q14B02 Fance-203ENSMUST00000114803 1980 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Rnf133Q14B02 A530095I07Rik-201ENSMUST00000070942 847 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Rnf133Q14B02 Gm9910-201ENSMUST00000195385 1550 ntBASIC20.46■□□□□ 0.87
Rnf133Q14B02 Gm21989-201ENSMUST00000174530 1609 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Rnf133Q14B02 Txndc9-207ENSMUST00000195032 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Rnf133Q14B02 Prrx2-201ENSMUST00000041659 1441 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Rnf133Q14B02 Gng3-201ENSMUST00000096259 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Rnf133Q14B02 Dnajc19-202ENSMUST00000108195 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Rnf133Q14B02 Dleu2-204ENSMUST00000182286 666 ntTSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 13.7 ms