Protein–RNA interactions for Protein: Q148B6

Spatc1, Speriolin, mousemouse

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Length 480 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Spatc1Q148B6 Mxd4-202ENSMUST00000119171 1160 ntTSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
Spatc1Q148B6 Eci1-201ENSMUST00000024946 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
Spatc1Q148B6 Rundc3b-202ENSMUST00000115378 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.43■□□□□ 0.7
Spatc1Q148B6 Prph-202ENSMUST00000047104 1865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
Spatc1Q148B6 Spsb3-205ENSMUST00000120943 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
Spatc1Q148B6 Ttc9-201ENSMUST00000036116 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
Spatc1Q148B6 Dact1-202ENSMUST00000150639 2448 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.42■□□□□ 0.7
Spatc1Q148B6 Ctage5-203ENSMUST00000170992 2785 ntTSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
Spatc1Q148B6 Hoxc8-201ENSMUST00000001703 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
Spatc1Q148B6 Ube2q1-201ENSMUST00000038356 3077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
Spatc1Q148B6 Tsen34-211ENSMUST00000205287 1375 ntTSL 5 BASIC19.42■□□□□ 0.7
Spatc1Q148B6 Drd4-201ENSMUST00000026569 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
Spatc1Q148B6 Lor-201ENSMUST00000058150 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
Spatc1Q148B6 Ptx3-201ENSMUST00000029421 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
Spatc1Q148B6 Impdh1-201ENSMUST00000078155 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
Spatc1Q148B6 Gm10499-202ENSMUST00000174778 1698 ntTSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
Spatc1Q148B6 Cacfd1-203ENSMUST00000114005 1286 ntTSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
Spatc1Q148B6 Gm11599-201ENSMUST00000118720 878 ntBASIC19.41■□□□□ 0.7
Spatc1Q148B6 Ubac1-201ENSMUST00000036509 1852 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
Spatc1Q148B6 Mxra7-201ENSMUST00000021170 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
Spatc1Q148B6 Pou4f1-201ENSMUST00000053016 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
Spatc1Q148B6 Mapk15-201ENSMUST00000089669 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.7
Spatc1Q148B6 Foxk2-201ENSMUST00000106113 5029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.7
Spatc1Q148B6 Rhou-201ENSMUST00000045487 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
Spatc1Q148B6 Kat2b-201ENSMUST00000000724 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
Spatc1Q148B6 Gm37136-201ENSMUST00000194368 194 ntBASIC19.38■□□□□ 0.69
Spatc1Q148B6 Gipc1-201ENSMUST00000019577 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
Spatc1Q148B6 Rexo2-210ENSMUST00000217037 609 ntTSL 3 BASIC19.38■□□□□ 0.69
Spatc1Q148B6 Trim3-202ENSMUST00000106789 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
Spatc1Q148B6 Fam126a-206ENSMUST00000197617 2288 ntTSL 5 BASIC19.37■□□□□ 0.69
Spatc1Q148B6 Smox-201ENSMUST00000028806 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Spatc1Q148B6 Gmeb1-202ENSMUST00000105964 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Spatc1Q148B6 Pom121-201ENSMUST00000111171 5580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Spatc1Q148B6 Prr5-201ENSMUST00000065499 1830 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Spatc1Q148B6 Gm4419-202ENSMUST00000226239 1431 ntBASIC19.37■□□□□ 0.69
Spatc1Q148B6 Phf14-203ENSMUST00000115511 3336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.37■□□□□ 0.69
Spatc1Q148B6 Upf3a-201ENSMUST00000043767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Spatc1Q148B6 Onecut3-201ENSMUST00000051773 4776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Spatc1Q148B6 Phf23-201ENSMUST00000018716 2006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Spatc1Q148B6 Hdac3-201ENSMUST00000043498 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Spatc1Q148B6 Ell2-205ENSMUST00000222194 434 ntTSL 3 BASIC19.36■□□□□ 0.69
Spatc1Q148B6 A030003K21Rik-201ENSMUST00000222600 830 ntAPPRIS P1 BASIC19.36■□□□□ 0.69
Spatc1Q148B6 Evl-202ENSMUST00000077735 2121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Spatc1Q148B6 St6galnac6-205ENSMUST00000113290 2402 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.35■□□□□ 0.69
Spatc1Q148B6 Kctd5-201ENSMUST00000017090 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Spatc1Q148B6 Flt3l-211ENSMUST00000211429 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Spatc1Q148B6 Slc16a11-211ENSMUST00000171032 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.35■□□□□ 0.69
Spatc1Q148B6 Foxo6-201ENSMUST00000102656 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Spatc1Q148B6 Dbndd2-202ENSMUST00000069385 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Spatc1Q148B6 Arpc2-203ENSMUST00000113820 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Spatc1Q148B6 Arl8a-201ENSMUST00000027684 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Spatc1Q148B6 Dedd-204ENSMUST00000111300 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Spatc1Q148B6 Fam89b-202ENSMUST00000116558 1189 ntTSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Spatc1Q148B6 Snrpe-202ENSMUST00000164574 597 ntTSL 3 BASIC19.34■□□□□ 0.69
Spatc1Q148B6 Crim1-201ENSMUST00000112498 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
Spatc1Q148B6 AW121686-201ENSMUST00000181049 2200 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Spatc1Q148B6 Tmem260-210ENSMUST00000227440 2222 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.33■□□□□ 0.68
Spatc1Q148B6 Qk-202ENSMUST00000097414 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Spatc1Q148B6 Slc17a7-201ENSMUST00000085374 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Spatc1Q148B6 Glrx3-201ENSMUST00000064404 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Spatc1Q148B6 Tmem70-203ENSMUST00000177501 1636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Spatc1Q148B6 Sox1-201ENSMUST00000180353 4832 ntAPPRIS P1 BASIC19.32■□□□□ 0.68
Spatc1Q148B6 1110008P14Rik-201ENSMUST00000048792 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Spatc1Q148B6 Lsm14b-201ENSMUST00000055485 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Spatc1Q148B6 Rcor3-207ENSMUST00000192866 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
Spatc1Q148B6 Nrxn1-213ENSMUST00000172466 2477 ntTSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
Spatc1Q148B6 Ctage5-211ENSMUST00000176322 2649 ntTSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
Spatc1Q148B6 Msl1-203ENSMUST00000107485 2091 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Spatc1Q148B6 Ltk-205ENSMUST00000140224 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Spatc1Q148B6 Ltk-206ENSMUST00000182203 2232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Spatc1Q148B6 Armc10-201ENSMUST00000072896 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Spatc1Q148B6 Cadps-201ENSMUST00000067491 5421 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Spatc1Q148B6 Gnl1-201ENSMUST00000087200 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Spatc1Q148B6 Dnajc21-201ENSMUST00000136591 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
Spatc1Q148B6 Dcaf15-201ENSMUST00000041367 2312 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Spatc1Q148B6 Scn1b-201ENSMUST00000098548 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Spatc1Q148B6 Tmbim4-204ENSMUST00000134797 486 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Spatc1Q148B6 A330041J22Rik-201ENSMUST00000150367 1825 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Spatc1Q148B6 Trafd1-201ENSMUST00000042312 2503 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Spatc1Q148B6 Ccnyl1-203ENSMUST00000187170 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
Spatc1Q148B6 D130020L05Rik-201ENSMUST00000180800 2431 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Spatc1Q148B6 Cdc42bpg-201ENSMUST00000025681 5995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
Spatc1Q148B6 Tmpo-204ENSMUST00000099355 1953 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Spatc1Q148B6 Ltk-201ENSMUST00000028759 3080 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Spatc1Q148B6 B230322F03Rik-201ENSMUST00000181932 1569 ntBASIC19.27■□□□□ 0.68
Spatc1Q148B6 Otulin-201ENSMUST00000059662 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
Spatc1Q148B6 Gm42699-201ENSMUST00000198104 1657 ntBASIC19.27■□□□□ 0.67
Spatc1Q148B6 Rasgef1c-203ENSMUST00000093142 2216 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
Spatc1Q148B6 Foxe1-201ENSMUST00000095097 2804 ntAPPRIS P1 BASIC19.26■□□□□ 0.67
Spatc1Q148B6 2310061I04Rik-202ENSMUST00000146451 2081 ntTSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Spatc1Q148B6 Ube2g2-204ENSMUST00000174510 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Spatc1Q148B6 Nrsn1-201ENSMUST00000057866 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Spatc1Q148B6 Strn3-202ENSMUST00000169503 2791 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Spatc1Q148B6 Aebp2-203ENSMUST00000095350 2575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Spatc1Q148B6 Fance-203ENSMUST00000114803 1980 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Spatc1Q148B6 Jmjd6-201ENSMUST00000047616 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Spatc1Q148B6 Gm28592-201ENSMUST00000186844 741 ntTSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
Spatc1Q148B6 6330420H09Rik-201ENSMUST00000211371 1316 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Spatc1Q148B6 Gng12-204ENSMUST00000114225 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Spatc1Q148B6 Coro1b-201ENSMUST00000008893 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 12.3 ms