Protein–RNA interactions for Protein: Q0VF58

Col19a1, Collagen alpha-1(XIX) chain, mousemouse

Predictions only

Length 1,136 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Col19a1Q0VF58 Gm43592-201ENSMUST00000196922 1165 ntBASIC25.2■■□□□ 1.62
Col19a1Q0VF58 Pdf-201ENSMUST00000055316 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Col19a1Q0VF58 Mapkap1-202ENSMUST00000113124 1758 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
Col19a1Q0VF58 Pgls-205ENSMUST00000143441 1062 ntTSL 3 BASIC25.19■■□□□ 1.62
Col19a1Q0VF58 Pcf11-204ENSMUST00000208058 461 ntTSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
Col19a1Q0VF58 1700016K19Rik-201ENSMUST00000066408 921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Col19a1Q0VF58 Dnttip1-201ENSMUST00000017443 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Col19a1Q0VF58 Ost4-202ENSMUST00000132253 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Col19a1Q0VF58 Serp2-204ENSMUST00000228055 705 ntBASIC25.18■■□□□ 1.62
Col19a1Q0VF58 A830010M20Rik-207ENSMUST00000162298 1408 ntTSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
Col19a1Q0VF58 Jdp2-201ENSMUST00000050687 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Col19a1Q0VF58 Gm20684-201ENSMUST00000176744 380 ntTSL 3 BASIC25.17■■□□□ 1.62
Col19a1Q0VF58 AC117245.1-201ENSMUST00000215481 566 ntTSL 3 BASIC25.17■■□□□ 1.62
Col19a1Q0VF58 Hdac3-201ENSMUST00000043498 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Col19a1Q0VF58 Eif4ebp1-201ENSMUST00000033880 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Col19a1Q0VF58 B4galt7-202ENSMUST00000100764 2195 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Col19a1Q0VF58 Gm44428-201ENSMUST00000204474 874 ntBASIC25.16■■□□□ 1.62
Col19a1Q0VF58 4930597O21Rik-201ENSMUST00000065878 984 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Col19a1Q0VF58 Nelfe-201ENSMUST00000097343 1607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
Col19a1Q0VF58 Ankrd49-205ENSMUST00000216037 1037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
Col19a1Q0VF58 Gm9767-201ENSMUST00000041011 1193 ntAPPRIS P1 BASIC25.15■■□□□ 1.62
Col19a1Q0VF58 Shf-203ENSMUST00000110531 1557 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.61
Col19a1Q0VF58 Phf23-201ENSMUST00000018716 2006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Col19a1Q0VF58 Ccdc85c-201ENSMUST00000136175 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
Col19a1Q0VF58 Ube2k-206ENSMUST00000201984 1449 ntTSL 3 BASIC25.13■■□□□ 1.61
Col19a1Q0VF58 Cadm1-206ENSMUST00000143026 1643 ntTSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
Col19a1Q0VF58 Hrh3-205ENSMUST00000165762 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
Col19a1Q0VF58 Ppp1ca-201ENSMUST00000046094 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Col19a1Q0VF58 Cckbr-202ENSMUST00000181339 1326 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Col19a1Q0VF58 Lsm4-201ENSMUST00000034311 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Col19a1Q0VF58 Mta3-201ENSMUST00000067826 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Col19a1Q0VF58 Fads2-201ENSMUST00000025567 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Col19a1Q0VF58 Snrpb-201ENSMUST00000103199 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Col19a1Q0VF58 March5-202ENSMUST00000112391 1293 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Col19a1Q0VF58 Dynlt1f-201ENSMUST00000179554 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Col19a1Q0VF58 Ctxn1-201ENSMUST00000053252 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Col19a1Q0VF58 Tmpo-205ENSMUST00000105293 1842 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Col19a1Q0VF58 Dazap1-201ENSMUST00000092305 1994 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Col19a1Q0VF58 Dusp15-202ENSMUST00000109811 753 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Col19a1Q0VF58 Gm18755-201ENSMUST00000218030 1099 ntBASIC25.1■■□□□ 1.61
Col19a1Q0VF58 Pgp-201ENSMUST00000053024 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Col19a1Q0VF58 Ipmk-203ENSMUST00000121446 1492 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
Col19a1Q0VF58 Ech1-201ENSMUST00000066264 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Col19a1Q0VF58 Tlx2-201ENSMUST00000089641 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Col19a1Q0VF58 Eed-201ENSMUST00000107234 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Col19a1Q0VF58 Esrra-201ENSMUST00000025906 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Col19a1Q0VF58 Gm26859-201ENSMUST00000181743 1852 ntTSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.61
Col19a1Q0VF58 Fn1-208ENSMUST00000186940 1350 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Col19a1Q0VF58 Socs1-201ENSMUST00000038099 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Col19a1Q0VF58 Kcnip3-202ENSMUST00000088538 1296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Col19a1Q0VF58 Rundc3a-201ENSMUST00000006750 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Col19a1Q0VF58 Barx1-201ENSMUST00000021813 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Col19a1Q0VF58 Ube2i-206ENSMUST00000172618 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Col19a1Q0VF58 Gm17494-201ENSMUST00000072769 1800 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Col19a1Q0VF58 Zfp346-203ENSMUST00000159278 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
Col19a1Q0VF58 Smco4-203ENSMUST00000215907 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Col19a1Q0VF58 4930527J03Rik-201ENSMUST00000094270 543 ntBASIC25.05■■□□□ 1.6
Col19a1Q0VF58 Clk2-201ENSMUST00000090927 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Col19a1Q0VF58 Msantd2-201ENSMUST00000048604 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Col19a1Q0VF58 Arhgap39-204ENSMUST00000176219 542 ntTSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
Col19a1Q0VF58 Arl8a-201ENSMUST00000027684 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Col19a1Q0VF58 H3f3a-207ENSMUST00000162814 724 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC25.03■■□□□ 1.6
Col19a1Q0VF58 Sh3gl3-201ENSMUST00000032874 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Col19a1Q0VF58 Marveld2-202ENSMUST00000163163 2187 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Col19a1Q0VF58 Tpst1-201ENSMUST00000040721 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Col19a1Q0VF58 Raly-201ENSMUST00000029120 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
Col19a1Q0VF58 Copz2-201ENSMUST00000018816 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Col19a1Q0VF58 C1qtnf5-203ENSMUST00000114818 1337 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
Col19a1Q0VF58 Ppp1r3e-202ENSMUST00000177403 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
Col19a1Q0VF58 Dmwd-201ENSMUST00000032570 2494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Col19a1Q0VF58 Fam168b-204ENSMUST00000170092 941 ntTSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
Col19a1Q0VF58 Eif5a-210ENSMUST00000108613 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Col19a1Q0VF58 Galnt10-202ENSMUST00000108846 1745 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Col19a1Q0VF58 Sac3d1-201ENSMUST00000113533 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Col19a1Q0VF58 Usp2-206ENSMUST00000176416 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Col19a1Q0VF58 Adprhl2-201ENSMUST00000102617 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Col19a1Q0VF58 Kctd6-201ENSMUST00000022272 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Col19a1Q0VF58 Nkain1-201ENSMUST00000105993 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Col19a1Q0VF58 Etf1-202ENSMUST00000180351 108 ntBASIC24.98■■□□□ 1.59
Col19a1Q0VF58 Dleu2-201ENSMUST00000180377 1165 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Col19a1Q0VF58 Ntn5-203ENSMUST00000183120 1491 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Col19a1Q0VF58 Gm14121-201ENSMUST00000121441 1380 ntBASIC24.97■■□□□ 1.59
Col19a1Q0VF58 Pfdn2-202ENSMUST00000135941 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Col19a1Q0VF58 Tmem55b-209ENSMUST00000162957 1465 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Col19a1Q0VF58 Cyp2r1-202ENSMUST00000119712 917 ntTSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
Col19a1Q0VF58 Gm35161-201ENSMUST00000221765 941 ntTSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
Col19a1Q0VF58 Cnot6l-203ENSMUST00000122003 2089 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Col19a1Q0VF58 Gmeb1-202ENSMUST00000105964 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Col19a1Q0VF58 Dtnb-211ENSMUST00000173240 2218 ntTSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
Col19a1Q0VF58 Fgf8-206ENSMUST00000111928 1056 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
Col19a1Q0VF58 Tfpt-204ENSMUST00000155592 1091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
Col19a1Q0VF58 Ptms-201ENSMUST00000032216 1149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
Col19a1Q0VF58 Hecw2-202ENSMUST00000097741 1132 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
Col19a1Q0VF58 E2f5-201ENSMUST00000029069 1779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
Col19a1Q0VF58 Ncoa7-206ENSMUST00000215725 1445 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
Col19a1Q0VF58 A230020J21Rik-202ENSMUST00000192407 1649 ntTSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
Col19a1Q0VF58 Ssbp1-203ENSMUST00000117411 933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Col19a1Q0VF58 D730045B01Rik-202ENSMUST00000186838 1543 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Col19a1Q0VF58 Phf23-205ENSMUST00000135814 2214 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Col19a1Q0VF58 Pate2-201ENSMUST00000098906 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 91.9 ms